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Nucleic Acids Res. | AlphaFold DB:大规模扩展蛋白质序列空间的结构覆盖范围

今天向大家介绍DeepMind团队发表在Nucleic Acids Research上的一篇Breakthrough文章“AlphaFold Protein Structure Database: massively expanding the structural coverage of protein-sequence space with high-accuracy models”。作者在文章中介绍了一种名为AlphaFold DB的蛋白质数据库(https://alphafold.ebi.ac.uk),它是一个可公开访问的高精度蛋白质结构预测数据库。在 DeepMind提出的AlphaFold v2.0模型的支持下,它使已知蛋白质序列空间的结构覆盖范围实现了前所未有的扩展。该数据库提供了可编程访问及交互式可视化功能,包括预测的原子坐标、每个残基和成对模型置信度的估计,以及预测的对齐误差。AlphaFold DB的初始版本包含21种模型生物蛋白质组中的360,000多个预测结构,很快将扩展到涵盖UniRef90数据集中的大部分代表性序列(超过1亿个)。

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