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maftools需要的文件如何自己整理

今天给大家演示下如何用自己的数据完成maftools的分析,主要是snp文件和临床信息的制作,其实很简单,但是网络上的教程都说的不清楚。...,需要自己整理,如果你还不知道怎么整理,请看这篇内容: TCGA的maf突变文件不能下载了?.../TCGA-colrectum/colrectal_clin.rdata") maftools包添加临床信息的方式非常简单,只要两个文件都有Tumor_Sample_Barcode这一列且对得上就行。...所以我们还要对snp文件和临床信息进行一些简单的处理。...对于两个文件中的Tumor_Sample_Barcode这一列,我们只要前12个字符即可 临床信息中有一些是Normal的样本,需要去除 只选择在snp文件中有的样本 # 只要前12个字符 colrec_snp

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    Python如何处理大文件(知识整理

    可将大文件拆分成小块按块读入后,这样可减少内存的存储与计算资源 read()方法或read(100) ? 但是,当完成这一操作时,read() 会将整个文件加载到内存中。...在文件较大时,往往会引发 MemoryError(内存溢出)。 那么,如何避免这个问题? ---- ---- ---- 读每行readline() ?...,他并非一次性将全部的文件内容载入到内存中,而是在迭代的时 候,循环到了哪一行才将哪一行读入到内存。...现在我们只需要知道,第二种方法是文本文件读取的最佳选择,它简单、且对任意大小的文件都有效,因 为他不会一次性把整个文件都载入到内存中,相反第一种方法存在内存压力过大的问题。...with 语句句柄负责打开和关闭文件(包括在内部块中引发异常时),for line in f 将文件对象 f 视为一个可迭代的数据类型,会自动使用 IO 缓存和内存管理,这样就不必担心大文件了。

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    如何对超大JS文件混淆加密?

    有些时候,我们会有一些很大的JS文件代码需要混淆加密,例如: 这个3.4MB的JS文件,通常来说是不容易一次性完成混淆加密的。因为代码量太大。...因此,对这样量极的JS代码进行混淆加密,在线的JS加密工具,是不允许的,不接受这样大的文件,或需要高权限。 如果我们要处理这样大的文件,需要些技巧。...如果打包或编译前的源码也是JS,那么,可以对未打包前的原始JS代码文件混淆加密,会比较轻松,先混淆加密,然后再打包编译。...方法二、 如果原始代码是非JS语言,比如,可能是TS,那就无法对原始代码混淆了。只能处理这个大的JS文件。 处理方式,也不太复杂。以上面给出的文件为例。...如何分块呢,比如,先复制一部分代码,可以是一个或多个函数,等。(注:取完整的函数或代码块,保证复制的这部分代码是整体、不会破坏函数体完整性)。

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    Python自动整理文件

    一、前言 今天我们就带大家来实现一下文件自动整理的操作。在我们日常生活中,文件总是杂乱无章的,这个时候就需要我们整理一下。...但是文件太多的话整理起来是非常麻烦的,因此我们今天就来用Python实现文件的自动整理。 二、遍历文件整理文件,我们首先需要遍历文件。这里用两种方法,一种是直接获取指定目录下的所有文件文件夹。...而我们整理文件的操作就是按照一定规则移动文件。 四、自动整理文件 整理图片的操作是多种多样的,对于不同的人,整理要求也不一样。因此这里只是说一些可能需要的一些整理操作。...3、获取文件属性 其它文件整理操作这里就不说了,我们再来说一下获取文件属性的操作。...这样我们在拿到这些信息后就可以更准确地整理文件了。比如我们可以把最近一天修改的文件整理出来,这样我们就可以找到我们想用的文件了。

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    python整理桌面文件

    可能桌面就会变成下面这副场景了,实在受不了,你可能就会开始收拾这个桌面了,有很多现成的工具可以帮助我们解决这个问题,但是作为一个爱编程的人,我们是不是也想试一试自己通过编程去解决这个问题,并且定制化程度还可以很高——想怎样整理就怎样整理...我的整体思路是这样的: 1.列出当前文件夹下的所有文件。 2.判断是目录文件夹还是个体文件。 3.如果是目录文件夹,那么判断是空的还是非空的,空的就删除掉,非空就不处理。...4.如果是个体文件,把这些文件进行分类:图片,文档文件等。 5.创建两个文件夹分别是存放文档文件和图片文件,把对应的文件移动到对应的文件夹,这样基本上就实现一个简单的整理功能了。...2.判断是目录文件夹还是个体文件。...5.创建文件移动图片 创建两个文件夹分别是存放文档文件和图片文件,把对应的文件移动到对应的文件夹,这样基本上就实现一个简单的整理功能了。

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    如何使用Node.js编辑XML文件

    由于XML仍然继续用作数据交换格式(主要是在企业应用程序中),因此了解如何以编程方式操纵XML文件的内容可能非常有用。...在 之前的文章中,我们研究了如何通过使用开源 xml2js模块将XML文件转换为Node.js中的JSON对象。 今天,您将学习如何使用Node.js编辑XML文件。...基本设置 首先,通过在终端中键入以下命令,将xml2js模块添加到您的Node.js应用程序中: $ node install xml2js --save 接下来,创建一个名为index.js的新JavaScript...这是一个需要更新的XML文件的示例: databases.xml <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?...运行上面的代码,您应该在与Node.js脚本文件相同的目录中看到一个由更新的XML生成的新XML文件

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