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R画图y轴范围太大时,如何局部压缩坐标轴?

用 R 画图的时候,如果 y 轴存在个别非常大或非常小的值,或者当中的数值存在非常大差异的时候,画出的图很容易产生误导效果,使人忽略当中某一部分信息。...图中存在非常多显著的 SNPs,当中最显著的 -log10(P) 甚至达到了 150 左右。不过,这样画图的话,红线附近会有很多显著的 SNPs 会因为 y 轴太大而显得不怎么显著。...针对这种 y 轴范围太大、有一部分点与其他点差距非常大的情况,可以考虑压缩/压扁 y 轴。删除 y 轴中没有点的部分也是可以,但个人更倾向于直接对 y 轴进行缩放,把偏离比较大的区域压扁。...value)) + geom_point() 得到的图是这样的,不同组别的值差别非常大,y 轴范围很大: 接下来构建一个 squash_axis 函数来实现坐标轴压缩功能,这个函数需要使用 scales...(y = squash_axis(5, 95, 10)) 这样画出的图,就能看清每个组别中各个点的分布: 把 1 到 99 范围的 y 轴压缩 30 倍: ggplot(shiyanhe,aes(x

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    如何随意截断ggplot2图像的y轴?

    gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...一顿野路子代码操作,beta版出来了:gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割,而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线

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    R语言建模入门:如何理解formula中y~.和y~x:z的含义?

    背景:2019年的某月末日,三路人开局,兴趣所致组建了“花儿少年”:一个有组织、有纪律的R语言入门交流学习组织。自此,开启了一段小白&大师的成长史。...01 — 如何理解formula中y~.和y~x:z的含义? y~. 和 y~x:z 是一个简单的formula。~和 : 是formula中的运算符,但它们与通常理解的数学运算符存在一定的差距。...以下是formula中其他一些运算符的含义: ~ :~连接公式两侧,~的左侧是因变量,右侧是自变量。 + :模型中不同的项用+分隔。注意R语言中默认表达式带常数项,因此估计 只需要写y~x。...- :-表示从模型中移除某一项,y~x-1表示从模型中移除常数项,估计的是一个不带截距项的过原点的回归方程。此外,y~x+0或y~0+x也可以表示不带截距项的回归方程。...02 — 参考来源 《R语言实战》 https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/formula.html

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    R中坐标轴截断的不同实现方式

    本文在做学术论文中,正好想做一下把y轴一些数据进行截断的效果。通过网上检索,整理了一下两种方式构建坐标轴截断图。...plotrix包 利用gap.barplot()进进行绘制,将gap参数设置为90,420进行y轴截断,可加入参数axis.break()对截断形状进行修改。...; axis.break(2,90*(1+0.02),breakcol="black",style="slash")##在左侧Y轴把gap位置换成slash; axis.break(4,90*(1+0.02...),breakcol="black",style="slashuah")##在右侧Y轴把gap位置换成slash; ?...首先随机构造一个数据,,我们想把y为7~17的数数据进行截断。思路是:构造一列:type,把小于7的命名为“samll”,大于17的命名为“big”,然后利用facet效果构建图。

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    本文在做学术论文中,正好想做一下把y轴一些数据进行截断的效果。通过网上检索,整理了一下两种方式构建坐标轴截断图。...plotrix包 利用gap.barplot()进进行绘制,将gap参数设置为90,420进行y轴截断,可加入参数axis.break()对截断形状进行修改。...),breakcol="black",style="slashuah")##在右侧Y轴把gap位置换成slash; ?...首先随机构造一个数据,,我们想把y为7~17的数数据进行截断。思路是:构造一列:type,把小于7的命名为“samll”,大于17的命名为“big”,然后利用facet效果构建图。...参考资料: R语言作图——坐标轴截断画图 http://blog.sina.com.cn/s/blog_6a4ee1ad0102x5at.html ggplot坐标轴截断 https://www.jianshu.com

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    小站R包gg.gap正式上线CRAN|随意截断ggplot2图像的y轴~

    gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...一顿野路子代码操作,beta版出来了:gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割,而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线

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    在Pandas中更改列的数据类型【方法总结】

    先看一个非常简单的例子: a = [['a', '1.2', '4.2'], ['b', '70', '0.03'], ['x', '5', '0']] df = pd.DataFrame(a) 有什么方法可以将列转换为适当的类型...例如,上面的例子,如何将列2和3转为浮点数?有没有办法将数据转换为DataFrame格式时指定类型?或者是创建DataFrame,然后通过某种方法更改每列的类型?...理想情况下,希望以动态的方式做到这一点,因为可以有数百个列,明确指定哪些列是哪种类型太麻烦。可以假定每列都包含相同类型的值。...软转换——类型自动推断 版本0.21.0引入了infer_objects()方法,用于将具有对象数据类型的DataFrame的列转换为更具体的类型。...']}, dtype='object') >>> df.dtypes a object b object dtype: object 然后使用infer_objects(),可以将列’a’的类型更改为

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    网络字体@font-face 如何处理网页中的特殊字体

    HTML5学堂:随着网页的发展,网页中出现了越来越多的字体种类,网页自带的微软雅黑、宋体、黑体已经越来越难以满足设计的需要,那么,如何在网站中使用比较特殊的字体,又不会下载太大的字体文件,来装饰我们网站的部分呢...如何在网站中使用比较特殊的字体 随着网页的发展,网页中出现了越来越多的字体种类,原有的微软雅黑以及宋体早就无法满足设计的需要,那么,如何在网站中使用比较特殊的字体(如“华文行楷”)来装饰我们网站的部分呢...第一步设置的是font-family的名字,在这里设置好之后。网页中哪个部分需要使用这种字体,就输入font-family(对应的名字)即可。...format是用于提示该资源 URL 所引用的字体格式,如果浏览器在本地没有找到这种字体,那么会将url中设置的字体加载到页面当中。设置自定义网络字体,必须设置src以及font-family。...4)新建一个字体库,并把多余的字删掉,之后在空白处点击右键选择添加,生成一个空白的字体存放单元,ctrl+c完整字库中需要添加的汉字,选择新字库中新建的空白字体存放单元,ctrl + v粘贴,覆盖即可

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    快速上手matplotlib画图

    其实对于每一个弹出的小窗口就是一个Figure对象,那么如何在一个代码中创建多个Figure对象,也就是多个小窗口呢?...▲更改后的坐标名称 那么如果我想把坐标轴上的字体更改成数学的那种形式: #在对应坐标处更换名称 plt.yticks([-2,-1,0,1,2],[r'$really\ bad$',r'$b$',r'$...▲将单位改成数学的字体格式 注意: 我们如果要使用空格的话需要进行对空格的转义"\ "这种转义才能输出空格; 我们可以在里面加一些数学的公式,如"\alpha"来表示 如何去更换坐标原点,坐标轴呢?...▲更改坐标轴位置 d legend图例 我们很多时候会在一个figures中去添加多条线,那我们如何去区分多条线呢?这里就用到了legend。...>'这个是箭头的类型,connectionstyle="arc3,rad=.2"这两个是描述我们的箭头的弧度以及角度的。

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    OpenCV 各数据类型中的行与列,宽与高,x与y

    在IplImage类型中图片的尺寸用width和 height来定义,在Mat类型中换成了cols与rows,但即便是这样,在C++风格的数据类型中还是会出现width和 height的定义,比如Rect...总的来说就是: Mat类的rows(行)对应IplImage结构体的heigh(高),行与高对应point.y Mat类的cols(列)对应IplImage结构体的width(宽),列与宽对应point.x...这个不难理解,opencv的坐标系原点在左上角,但是还是水平轴是x,垂直轴是y 1.新建一个mat类型 Mat MoveImage(SrcImage.rows,SrcImage.cols,CV_...注意因为at(y,x),而不是at(x,y) 3.Point类型 常用于表示2维坐标(x,y)。...(10, 8); 等同于: cv::Point pt; pt.x = 10; pt.y = 8; 4.Size类型 模板类Size可表示一幅图像或一个矩形的大小。

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    mysql中更改密码的首选语句_MySQL如何更改用户密码?(代码实例)「建议收藏」

    在MySQL中,可以使用3种不同的语句更改用户帐户密码:UPDATE statementSET PASSWORD statementALTER USER statement....但在更改帐户密码之前,应记住两件非常重要的事情: -要更改密码的用户帐户详细信息。...-要更改密码的用户正在使用该应用程序,因为如果在不更改应用程序的连接字符串的情况下更改了密码,则该应用程序将无法连接到数据库服务器。...现在让我们学习如何使用上面提到的三个SQL语句在SQL中更改用户密码: 1.使用SET PASSWORD语句更改MySQL用户密码 要使用SET PASSWORD语句更改用户密码,第一个要求是该帐户至少需要具有...FLUSH PRIVILEGES语句用于从mysql数据库中的grant表重新加载权限。

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    如何在 Eclipse 中更改注释块的 @author 版权信息?

    文章目录 前言 一、打开需要进行版权标注的类 二、进入配置页面 三、编辑配置信息 四、测试 总结 ---- 前言 我们在使用 IDE——Ecilpse 进行开发,需要注明版权信息的时候,如果不更改默认设置的话...,在注释块 @author 的内容就是电脑系统默认的,例如下图所示。...---- 一、打开需要进行版权标注的类 打开 Ecilpse 需要备注一个类或者是方法的开发者信息,默认是系统用户,如下我的就是 Lenovo,如下图所示: ?...说明:${user}属性默认取值是我们本地管理员的 user 信息。 例如联想电脑默认取 lenovo。我们将${user}属性更改为我们需要标注的作者信息即可。 ?...---- 总结 本文我们掌握了如何在 Eclipse 中修改注释的版权信息,这样我们就无需每次手动去调整了。那么同学,你是否会在 IDEA 里面修改注释的版权信息呢?

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    Python可视化库Matplotlib绘图入门详解

    在此matplotlib教程中,我们将绘制一些图形并更改一些属性,例如字体、标签、范围等。 首先,我们将安装matplotlib,然后开始绘制一些基本的图形。...在此示例中,2,2,1表示2行2列,会在索引1处进行绘制。类似地,2,2,2表示2行2列,索引会在2处绘制。 ? 字体大小 ? 我们可以借助一个名为rc()的函数来更改绘图的字体大小。...= sizeInt 上面语法中的字体是用户定义的词典,用于指定文本的权重、字体系列、字体大小等。...plt.rc('font',size = 30) 这会将字体更改为30,输出将是: ? ? 轴范围 ? 可以分别使用pyplot的xlim()和ylim()函数来设置x和y轴的范围或限制。...labeltext是标签的文本,是一个字符串,labelfont描述了标签文本的字体大小、粗细、字体类型。

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    微软 Outlook 如何修改邮件列表中的字体或字号

    因为电脑的操作系统是默认英文的,默认的字体实在是太难看了。 解决方案 我们是可以对字体进行修改的。 例如修改成下面的方案。 选择视图 首先,先选定顶部的视图。...然后在当前的视图下,选择视图设置。 随后在弹出的窗口中,选择其他设置。 设置字体 然后在弹出的界面中,对字体进行选择。...当前,我们选择的字体为 Open Sans,这个字体是 Google 的字体,但是这个字体不能支持简体中文,也不能支持 CJK。...如果需要选择支持中文的字体,可以选择 Noto Sans 这个字体。 这个字体是能够支持中文的(CJK)。 Noto Sans Noto Sans 这个字体的中文名称为:思源黑体。...在部分缺失某些字体的Windows、Linux等系统中,无法显示的字符会变成方块“□”,一般惯称为“tofu”,即“豆腐”之意。

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