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R语言第二章数据处理(9)数据合并

========================================= 日常工作中常见的需求之一便是数据框合并,在R语言中最常用的是基于Rbasa的merge函数方法,除此之外还可以借助plyr...和dplyr包中的join函数进行数据框的合并,它们数据框合并的原理同样是数据框的合并原理是这样的:首先在A数据框某一指定列的每一行内容在B数据框表的指定列进逐行匹配,直到A中所有行匹配完为止。...first,只匹配y中的第一个记录 match,匹配y中所有记录 如何理解inne,left,right,可以看之前的博客: Python数据处理从零开始----第二章(pandas)(十)pandas...包的join函数 dplyr包是plyr包的升级,join函数在dplyr包中是个系列函数。...semi_join连接其实是在inner_join的结果中只取属于a的字段(也就是列) library(dplyr) # 单指标匹配 semi_join(data1,data2) semi_join(data1

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    R语言数据集合并、数据增减、不等长合并

    (ink1,ink2,by="id",all=F) #默认,只取两者的共有的部分 id R M 1 1 9 7 2 2 7 2 其中,all=T代表全连接,all.x=T代表左联结;all.y...=T代表右连接 2、dplyr包 dplyr包的数据合并, 一般用left_join(x,y,by="name") 以x为主,y中匹配到的都放进来, 但,y中没有的则不放过来。...rbind()按照横向的方向,或者说按行的方式将矩阵连接到一起 rbind/cbind对数据合并的要求比较严格:合并的变量名必须一致;数据等长;指标顺序必须一致。...相比来说,其他一些方法要好一些,有dplyr,sqldf中的union 5、sqldf包 利用SQL语句来写,进行数据合并,适合数据库熟悉的人,可参考: R语言︱ 数据库SQL-R连接与SQL语句执行...#————————————————————————————不等长合并 #如何解决合并时数据不等长问题——两种方法:do.call函数以及rbind.fill函数(plyr包) #rbind.fill函数只能合并数据框格式

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    左手用R右手Python系列——数据合并与追加

    今天这篇跟大家介绍R语言与Python数据处理中的第二个小知识点——数据合并与追加。...针对数据合并与追加,R与Python中都有对应的函数可以快速完成需求,根据合并与追加的使用场景,这里我将本文内容分成三部分: 数据合并(简单合并,无需匹配) 数据合并(匹配合并) 数据追加 数据合并(简单合并...横向合并:(需匹配) 在R语言中,这种操作有很多可选方案,如基础函数merge、plyr包中的join函数以及dplyr包中的left/right/inter/full_join等函数。...在R语言中,可视化朱数据追加的函数有: rbind() dplyr::bind_rows() mydata3<-rbind(df1,df2,df3);mydata3 mydata4dplyr::bind_rows...本文汇总: 数据合并(简单合并) R: cbind() dplyr::bind_cols() Python: Pandas-cancat() 数据合并(匹配和并) R: merge plyr::join

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    day6-乙醇-学习R包

    学生信为啥要学R语言:R语言拥有丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。 如何安装和加载R包 1....dplyr包的学习 五个基本函数 首先构建一个储存数据的变量 test 图片 mutate() 用于新增一列数据 select(),按列筛选 按列号筛选 按列名筛选 图片 filter()筛选行 图片...%>% (cmd/ctr + shift + M) count统计某列的unique值 dplyr处理关系数据 內连inner_join,取交集 图片 左连left_join 图片 全连full_join...图片 半连接:semi_join 图片 反连接:anti_join 图片 简单合并:相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而...自问自答:这里是因为控制台面积太小了,把它拉大,然后重新运行代码就可以了~

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    Day07 生信马拉松-数据整理中的R

    全文并非是对数据整理的实操整理,主要整理在数据整理/清洗中常用的R包介绍 library(tidyr) library(dplyr) library(stringr) library(tibble) 1...library(dplyr) inner_join(test1,test2,by="name") #交集连接 right_join(test1,test2,by="name") #右连接 full_join...数均在一行上(将上图的宽数据变为长数据) 图片 6.2实操代码 6.2.1 如何生成一个matrix set.seed(10086) #设置种子数使随机生成的数固定 exp = matrix(rnorm...) #加载数据整理需要的包 dat = t(exp) %>% #将matrix进行行列转置 as.data.frame() %>% #将matrix转为data.frame rownames_to_column...) = x$ID 7.2 一些搞文件的函数 dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt

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    R语言数据处理——数据合并与追加

    在可视化前的数据处理技巧中,导入导出、长宽转换已经跟大家详细的介绍过了。 今天跟大大家分享数据集的合并与追加,并且这里根据所依赖函数的处理效率,给出诺干套解决方案。...###纵向合并 构造数据集: ID<-c(1,2,3,4) Name<-c("A","B","C","D") Student1ID,Name) ID<-c(5,6,7,8) Name...~_~) dplyr的数据合并语句要比plyr还要精练: x连接类型中,前四个(内连接、外连接、左连接、右连接)最为常用,大家可以将dplyr和plyr以及merge函数三种连接方式进行对比记忆。...如果有点R语言基础的同学,强烈建议将这些操作放在R中操作,数据导入导出、长宽转换、横纵合并,只需修改一下代码路径、参数分分钟搞定。

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    R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

    (参考来源:R高效数据处理包dplyr和data.table,你选哪个?) ?...= select(tb, ID) from_data_table = tb[,"ID"] from_data_table = tb[,....(ID)] 三种数据筛选的方式,dplyr包、base基础包、data.table包。其中,dplyr是select语句,data.table中要注意.()的表达方式。...—————————————————————————— 五、数据合并 最常见的合并函数就是merge,还有sql的方式(常见的合并方式可见: R语言数据集合并、数据增减、不等长合并 )。...—————————————————————— 实战一:在data.table如何选中列,如何循环提取、操作data.table中的列?

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    R语言 数据(集)合并与连接匹配 | 专题2

    数据(集)处理是数据分析过程中的重要环节,今天特别整理数据(集)合并、增减与连接的相关内容,并逐一作出示例。...rbind行合并 总结:按行合并,需要注意数据集需要有相同的列字段名 > #生成测试数据student1 > ID <- c(1:4) > score <- c(8,22,7,33) > student1...数据连接/匹配 数据连接主要涉及到merge函数和dplyr包中的*_join等函数,另外sqldf函数(SQL)亦可以实现数据连接功能。...实现内连接、外连接、左连接和右连接 dplyr包中的inner_join、left_join、right_join、full_join语法 inner_join(x, y, by = NULL, copy...其中,通过by控制连接字段,通过dplyr::*_join中的“*”控制连接形式。

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    不用SQL,也可以实现数据集的合并和连接

    数据(集)处理是数据分析过程中的重要环节,今天特别整理数据(集)合并、增减与连接的相关内容,并逐一作出示例。...rbind行合并 总结:按行合并,需要注意数据集需要有相同的列字段名 > #生成测试数据student1 > ID <- c(1:4) > score <- c(8,22,7,33) > student1...数据连接/匹配 数据连接主要涉及到merge函数和dplyr包中的*_join等函数,另外sqldf函数(SQL)亦可以实现数据连接功能。...实现内连接、外连接、左连接和右连接 dplyr包中的inner_join、left_join、right_join、full_join语法 inner_join(x, y, by = NULL, copy...其中,通过by控制连接字段,通过dplyr::*_join中的“*”控制连接形式。

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    两个神奇的R包介绍,外加实用小抄

    这里涉及的几个给列填充数值的函数有 rep,重复,括号中填要重复的字符和重复次数。 paste,连接两个字符串,括号要填两个代连接字符并指定分隔符(sep),没有分隔符就填sep=“”。...就是某些单元格有空值的情况。 三种处理方式:删除整行,根据上下文(瞎)蒙一个,同一列的空值填上同一个数。 ?...这是根据相同的列名进行合并,当在两个表格中列名不一样时,需要在括号内加 by=c("col1"="col2") 其中col1和2分别是在两个表格中的需合并的列名 semi_join,anti_join...•semi_join只保留第二个表格中包含的id ? 只是把表1中的gene4去掉了,但并没有加上表2的annotion列。 •anti-join只保留第二个表格中不包含的id ?...哦,忘记说了,这些R包是有对应的小抄的,如果你还不懂什么是小抄,请出门自行谷歌了解一下哈! 在我们生信技能树后台回复 小抄 或者 cheatsheet 即可获取哈。

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    生信星球Day4 学习R包

    今日学习内容:如何安装R包?...认识dplyr,函数、功能等---安装和加载R包镜像设置方法一:手动设置,Tools→Packages→Primary CRAN repository方法二:自动运行教程来自:https://www.jianshu.com.../p/861224f4251aoptions() 设置R运行过程中的一些选项设置options()$repos 查看使用install.packages安装时的默认镜像options()$BioC_mirror...查看使用bioconductor的默认镜像R最重要的两个配置文件: 一是.Renviron,能够设置R的环境变量; 二是.Rprofile,如果启动时找到这个文件,那么就替我们先运行一遍(这个过程就是在启动...(x= ,y= ,by="某列") 半连接,返回能够与y表匹配的x表所有记录anti_join(x= ,y= ,by="某列") 反连接,返回无法与y表匹配的x表所有记录简单合并bind_rows(

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    R数据框如何取交集

    这里需要注意,限定的软件越多,得到的结果会越少,也有可能完全得不到结果,所以这个需要根据自己数据的实际情况确定。 那么我们怎么利用R代码来对miRNA预测结果取交集呢?...a","b","c") b=c("b","c","g") intersect(a,b) #[1] "b" "c" a=1:4 b=3:7 intersect(a,b) #[1] 3 4 那么如果想对R里面的数据框取交集该如何操作呢...下面给大家介绍三种对R数据框取交集的方法 方法一、我们将各列的信息合并成一个字符串,然后取交集 #将各列的信息用_连接起来 combine1=apply(df1,1,function(x) paste...(x,collapse = "_")) combine2=apply(df2,1,function(x) paste(x,collapse = "_")) #查看合并后的字符串向量1和字符串向量2的交集....txt",result1,quote=F,row.names = F,sep="\t") 方法二、利用dplyr包里的intersect函数 #加载dplyr包 library(dplyr) #直接利用

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    使用R或者Python编程语言完成Excel的基础操作

    数据格式设置:了解如何设置数据格式,包括数字、货币、日期、百分比等。 条件格式:学习如何使用条件格式来突出显示满足特定条件的单元格。 图表:学习如何根据数据创建图表,如柱状图、折线图、饼图等。...条件格式 高亮显示特定数据:在“开始”选项卡中使用“条件格式”根据条件自动设置单元格格式。 13. 合并与拆分单元格 合并单元格:选中多个单元格,点击“合并与居中”。...掌握这些技能可以显著提升使用Excel的能力。 在R编程语言中 处理表格数据通常依赖于dplyr和tidyr这样的包,它们提供了强大的数据操作功能。...通过dplyr和tidyr包,我们可以轻松地对数据进行复杂的操作。 在R语言中,即使不使用dplyr和tidyr这样的现代包,也可以使用基础包中的函数来完成数据操作。...在不使用Pandas的情况下,合并数据需要手动实现连接逻辑: # 假设 data1 和 data2 是两个已经加载的列表,我们要按 'common_column' 合并 data1_common =

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