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Python学习 Day 1-简介 安装 Hello world

Python(英语发音:/ˈpaɪθən/), 是一种面向对象、解释型计算机程序设计语言,由Guido van Rossum于1989年底发明,第一个公开发行版发行于1991年,Python 源代码同样遵循 GPL(GNU General Public License)协议[1] 。Python语法简洁而清晰,具有丰富和强大的类库。它常被昵称为胶水语言,能够把用其他语言制作的各种模块(尤其是C/C++)很轻松地联结在一起。常见的一种应用情形是,使用Python快速生成程序的原型(有时甚至是程序的最终界面),然后对其中有特别要求的部分,用更合适的语言改写,比如3D游戏中的图形渲染模块,性能要求特别高,就可以用C/C++重写,而后封装为Python可以调用的扩展类库。需要注意的是在您使用扩展类库时可能需要考虑平台问题,某些可能不提供跨平台的实现。

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全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) (3)-- SQANTI3 v5.2

Functional IsoTranscriptomics (FIT) 是美国弗罗里达大学(University of Florida)Ana Conesa 教授团队(Genomics of Gene Expression Lab, ConesaLab)开发的在转录本isoform水平上进行生物信息学分析的流程,旨在提供一个全长转录组end-to-end的解决方案 (图1)。SQANTI 3 构成了FIT流程的第一个模块,其设计目的是使长读序列定义的转录组的质量控制和过滤成为可能,这些转录本通常含有artifacts和假阳性。因此,对全长转录组进行校正是进行FIT分析的前提,且对产生可靠的、在生物学上合理的结论/假设至关重要。SQANTI 3 是SQANTI 工具(发布)的最新版本,该版本合并 SQANT 1 和 SQANTI 2 中的功能并加入了新的功能 ,更好的对全长转录本进行深度表征 。

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