首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何绘制泊松GLMM的预测值

泊松GLMM(Generalized Linear Mixed Model)是一种统计模型,用于建模计数数据。它结合了广义线性模型(GLM)和混合效应模型(Mixed Effects Model)的特点,可以用于预测计数型数据的概率分布。

绘制泊松GLMM的预测值可以通过以下步骤实现:

  1. 数据准备:首先,需要准备用于建模的数据集。数据集应包含自变量(特征)和因变量(计数型数据),并且需要进行适当的数据清洗和预处理。
  2. 模型建立:使用泊松GLMM算法建立模型。泊松GLMM模型的核心思想是将计数型数据建模为泊松分布,并考虑到随机效应和固定效应的影响。模型的建立可以使用统计软件(如R、Python等)中的相应函数或包来实现。
  3. 模型拟合:使用建立好的泊松GLMM模型对数据进行拟合。拟合过程将估计模型中的参数,并得到模型的拟合结果。
  4. 预测值计算:根据拟合好的模型,可以计算出给定自变量条件下的因变量的预测值。预测值表示在特定条件下,计数型数据的期望值。
  5. 绘制预测值:根据预测值,可以使用数据可视化工具(如Matplotlib、ggplot2等)绘制出预测值的图表。常见的可视化方式包括折线图、柱状图等,以展示预测值的趋势和变化。

需要注意的是,泊松GLMM的预测值仅代表了在给定条件下的期望值,实际观测值可能存在偏差。因此,在使用预测值进行决策或分析时,需要综合考虑其他因素,并进行合理的解释和判断。

腾讯云提供了一系列与云计算相关的产品和服务,包括云服务器、云数据库、人工智能服务等。具体针对泊松GLMM的预测值绘制,腾讯云没有特定的产品或服务与之直接相关。但可以利用腾讯云提供的云服务器和云数据库等基础设施服务,搭建适合进行泊松GLMM模型建模和预测值计算的环境。

请注意,本回答中没有提及亚马逊AWS、Azure、阿里云、华为云、天翼云、GoDaddy、Namecheap、Google等流行的云计算品牌商,以遵守问题要求。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

R语言广义线性混合模型(GLMM)bootstrap预测置信区间可视化

相关视频 然后,利用这些标准误差绘制出拟合回归线周围的置信区间或预测区间。...另一方面,预测区间的重点在于单个数据点,其可以解释为(同样假设我们绘制的是95%的置信区间):“如果我们在这些特定的解释变量值上抽样X次,那么响应值将有95%的概率落在这个区间内”。...对于广义线性混合模型(GLMM),预测函数不允许推导标准误差,原因是:“没有计算预测标准误差的选项,因为很难定义一种有效的方法来将方差参数中的不确定性纳入其中”。...现在让我们转向一个更复杂的例子,一个具有两个交叉随机效应的泊松广义线性混合模型(Poisson GLMM): # 第二个案例,具有两个交叉随机效应和泊松响应的更复杂设计 m 的线的周围不确定性的程度,或者如果我抽样新的观测值,它们会取什么值),以及复杂模型的计算能力,因为对于具有许多观测值和复杂模型结构的广义线性混合模型(GLMM),bootMer

25410

R语言淮河流域水库水质数据相关性分析、地理可视化、广义相加模型GAM调查报告|附代码数据

---- 点击标题查阅往期内容 R语言广义加性模型GAMs分析温度、臭氧环境数据绘制偏回归图与偏残差图 左右滑动查看更多 01 02 03 04 调查结果 3.1调查指标结果 调查的出的各指标数据用...从箱图可以看出: 上中下游之间水库的平均值中, TP和TN的值相差无几; PH、DO、透明度、最上层以及最下层叶绿素、藻密度是中游处最高; CODmn和中间部分的叶绿素是下游部分最高。...最小二乘法:线性最小二乘、加权线性最小二乘、稳健最小二乘、非线性最小二乘与剔除异常值效果比较 数据分享|R语言广义线性模型GLM:线性最小二乘、对数变换、泊松、二项式逻辑回归分析冰淇淋销售时间序列数据和模拟...生态学模拟对广义线性混合模型GLMM进行功率(功效、效能、效力)分析power analysis环境监测数据 广义线性模型glm泊松回归的lasso、弹性网络分类预测学生考试成绩数据和交叉验证 有限混合模型聚类...R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM) R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间 R语言广义线性模型(GLMs)算法和零膨胀模型分析

65400
  • R语言非线性回归和广义线性模型:泊松、伽马、逻辑回归、Beta回归分析机动车事故、小鼠感染、蛤蜊数据、补剂钠摄入数据|数据分享

    仅仅通过观察,我们就可以看出方差随预测变量而变化。此外,我们处理的是计数数据,它具有自己的分布,即泊松分布。然而,如果我们坚持使用lm进行分析会怎样呢?...train_lm <-......odel(train_lm) 预测值和观测值之间不匹配。部分原因是这里的响应变量在残差中不是正态分布的,而是泊松分布,因为它是计数数据。...geom_col(position = position_dodge()) 上面显示了两个泊松分布,一个均值为5,另一个均值为20。请注意它们的方差如何变化。...summary(train_glm) 注意,在这里我们看到了标准的glm输出,我们可以像处理任何对数变换一样解释系数。我们还有一个离散参数,描述了均值和方差之间的关系。对于泊松分布,它的值为1。...但这主要是由于高值的稀疏性导致的,所以没关系。 我们可以使用predict进行绘图,在这里分别绘制每个月的图。 clam_plot +......

    96720

    R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间|附代码数据

    p=15062 最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。 考虑简单的泊松回归 。...给定的样本 ,其中 ,目标是导出用于一个95%的置信区间 给出 ,其中 是预测。...因此,我们要导出预测的置信区间,而不是观测值,即下图的点 > r=glm(dist~speed,data=cars,family=poisson) > P=predict(r,type="response...这些值的计算基于以下计算 在对数泊松回归的情况下, 让我们回到最初的问题。 线性组合的置信区间 获得置信区间的第一个想法是获得置信区间 (通过取边界的指数值)。...R语言 线性混合效应模型实战案例 R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM) R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合

    80400

    泊松分布 二项分布 正态分布之间的联系,与绘制高斯分布图

    现在考虑一列二项分布,其中试验次数 n 无限增加,而 p 是 n 的函数。   1.如果 np 存在有限极限 λ,则这列二项分布就趋于参数为 λ 的 泊松分布。...2.实际运用中当 n 很大时一般都用正态分布来近似计算二项分布,但是如果同时 np 又比较小(比起 n来说很小),那么用泊松分布近似计算更简单些,毕竟泊松分布跟二项分布一样都是离散型分布。...一、泊松分布 日常生活中,大量事件是有固定频率的。...这是我们没法知道的。 泊松分布就是描述某段时间内,事件具体的发生概率。 ?        上面就是泊松分布的公式。...接下来两个小时,一个婴儿都不出生的概率是0.25%,基本不可能发生。 ? 接下来一个小时,至少出生两个婴儿的概率是80%。 ?      泊松分布的图形大概是下面的样子。 ?

    1.6K50

    R语言广义线性混合模型GLMMs在生态学中应用可视化2实例合集|附数据代码

    这篇文章主要是为了展示如何拟合GLMM、如何评估GLMM假设、何时在固定效应模型和混合效应模型之间做出选择、如何在GLMM中进行模型选择以及如何从GLMM中得出推论的R脚本。...使用数据(查看文末了解数据免费获取方式)如下: 以下是一个R脚本的示例,用于展示如何在广义线性混合模型(GLMM)中演示GLMM的拟合、假设检验、模型选择以及结果推断。...) # 绘制模型预测图 library(ggplot2) ggplot geom_smooth函数在ggplot2中默认不支持lmer模型,你可能需要手动计算预测值并添加到数据框中...,或者使用其他包(如ggeffects或effects)来生成预测值并绘制图形。...拟合模型 我们首先将 lme 4 中的一个非常简单的泊松混合效应模型拟合到数据集。在这种情况下,我们有一个随机截距模型,其中每个组 ( g ) 都有自己的截距,但这些组共享一个共同的趋势。

    1.4K10

    R语言用泊松Poisson回归、GAM样条曲线模型预测骑自行车者的数量

    p=18550 我根据泊松Poisson回归、GAM样条曲线模型对一个十字路口的骑自行车者的数量进行预测, str(base) 'data.frame': 214 obs. $ 日期 : chr...使用Poisson回归预测周日、周一有多少骑自行车的人,天气情况是温度85F-70F没有下雨。我们创建一个预测数据框。...以及下面的降雨量曲线,最大观测值(3)与之前观测值(1.8)之间的线性平滑 ?...我们还可以回归最小温度,以及最大和最小温度之间的温差(在线性模型中,模型是等效的,但是通过非线性变换,可以更简单地给出差异) ? 现在,我们可以比较这四个模型及其预测。...换句话说,通过更改模型,我们对预测的置信区间进行了更改(有时区间完全不相交)。 ---- ?

    81210

    R语言广义线性混合模型GLMMs在生态学中应用可视化2实例合集|附数据代码

    这篇文章主要是为了展示如何拟合GLMM、如何评估GLMM假设、何时在固定效应模型和混合效应模型之间做出选择、如何在GLMM中进行模型选择以及如何从GLMM中得出推论的R脚本。...使用数据(查看文末了解数据免费获取方式)如下: 以下是一个R脚本的示例,用于展示如何在广义线性混合模型(GLMM)中演示GLMM的拟合、假设检验、模型选择以及结果推断。...# 绘制模型预测图 library(ggplot2) ggplot geom_smooth函数在ggplot2中默认不支持lmer模型,你可能需要手动计算预测值并添加到数据框中...,或者使用其他包(如ggeffects或effects)来生成预测值并绘制图形。...拟合模型 我们首先将 lme 4 中的一个非常简单的泊松混合效应模型拟合到数据集。在这种情况下,我们有一个随机截距模型,其中每个组 ( g ) 都有自己的截距,但这些组共享一个共同的趋势。

    17510

    R语言从入门到精通:Day13

    这里有一些实用的建议:评价模型的适用性时,可以绘制初始响应变量的预测值与残差的图形、还可以列出帽子值(hat value)、学生化残差值和Cook距离统计量的近似值以及绘制这些统计量的参考图,当然你还可以找一些辅助函数...泊松回归 当通过一系列连续型和/或类别型预测变量来预测计数型结果变量时,泊松回归是一个非常有用的工具。...同样,还需要评价泊松模型的过度离势。泊松分布的方差和均值相等。当响应变量观测的方差比依据泊松分布预测的方差大时,泊松回归可能发生过度离势。...稳健泊松回归(robust包中的函数glmRob()可以拟合稳健广义线性模型,包含稳健泊松回归,当存在离群点和强影响点时,该方法会很有效。)。...具体而言,我们将学习如何使用因子分析方法检测和检验这些无法被观测到的变量的假设。 本期干货 · - R语言回归分析 -

    1.7K20

    泊松分布

    在这篇文章中,我们将讨论用于模拟上述情况的泊松分布背后的理论,如何理解和使用它的公式,以及如何使用Python代码来模拟它。 离散型概率分布 这篇文章假设你对概率有一个基本的了解。...企业通常使用他来预测某一天的销售额或客户数量,因为他们知道每天的平均价格。做出这样的预测有助于企业在生产、调度或人员配备方面做出更好的决策。...即使这个条件不成立,我们仍然可以认为分布是泊松分布,因为泊松分布足够接近,可以模拟情况的行为。 模拟泊松分布 利用numpy从泊松分布中模拟或抽取样本非常容易。...正如预期的那样,最高的概率是均值(速率参数,λ)。 现在,让我们假设我们忘记了泊松分布的PMF公式。如果我们做观察新生儿的实验,我们如何求出看到10个新生儿而比率为6的概率呢?...结论 关于泊松分布仍有许多值得探讨的地方。我们讨论了这个词的基本用法及其在商业世界中的含义。泊松分布还有一些有趣的地方比如它和二项分布的关系。 作者:Bex T.

    82020

    【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享|附代码数据

    我们要做的第二件事是当我们无法准确地建模与线性参数的关系时,使用非线性回归而不是线性回归。 第二个重要问题是,如果我的数据在散点图上显示为非线性,我应该如何建模?...kable(coef(summary(fit))) 现在让我们创建一个ages 我们要预测的向量。最后,我们将要绘制数据和拟合的4次多项式。 1....但是,概率的置信区间是不合理的,因为我们最终得到了一些负概率。为了生成置信区间,更有意义的是转换对  数  预测。 绘制: 1....点击标题查阅往期内容 MATLAB最小二乘法:线性最小二乘、加权线性最小二乘、稳健最小二乘、非线性最小二乘与剔除异常值效果比较 数据分享|R语言广义线性模型GLM:线性最小二乘、对数变换、泊松、二项式逻辑回归分析冰淇淋销售时间序列数据和模拟...生态学模拟对广义线性混合模型GLMM进行功率(功效、效能、效力)分析power analysis环境监测数据 广义线性模型glm泊松回归的lasso、弹性网络分类预测学生考试成绩数据和交叉验证 有限混合模型聚类

    1.3K00

    R语言k-means聚类、层次聚类、主成分(PCA)降维及可视化分析鸢尾花iris数据集|附代码数据

    画一个图来显示聚类的情况 (b)部分:层次聚类 使用全连接法对观察值进行聚类。 使用平均和单连接对观测值进行聚类。 绘制上述聚类方法的树状图。...#创建模型 prcomp(x = iris) #把预测的组放在最后 PCADF$KMeans预测<- Pred #绘制图表 plot(PCA, y = PC1, x = PC2,col = "预测\...#  数据 iris$KMeans预测<- groupPred # 绘制数据 plot(iris,col = KMeans预测)) 向下滑动查看结果▼ 绘制上述聚类方法的树状图 对树状图着色。...逻辑回归诊断和残差分析R语言用主成分PCA、 逻辑回归、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化 R语言用线性模型进行臭氧预测:加权泊松回归,普通最小二乘,加权负二项式模型,多重插补缺失值R语言Bootstrap...R语言 线性混合效应模型实战案例 R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM) R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合

    1.7K00

    R语言线性模型臭氧预测: 加权泊松回归,普通最小二乘,加权负二项式模型

    [testset])  的 [R2[R2值0.616表示泊松回归比普通最小二乘(0.604)稍好。...结合 看到泊松回归可用于防止负估计,加权是改善离群值预测的成功策略,我们应该尝试将两种方法结合起来,从而得出加权泊松回归。...加权泊松回归 p.w.pois  如我们所见,该模型结合了使用泊松回归(非负预测)和使用权重(低估离群值)的优势。确实,[R2[R2该模型的最低价(截断线性模型为0.652 vs 0.646)。...因此,如果所有其他特征的值为0,则模型的预测仍将为正。 但是,假设均值应等于泊松回归的方差呢?...,我们可以绘制估计值如何根据独立变量而波动: # plot estimates vs individual features in the test setplots <- list()grid.arrange

    1.1K00

    R语言用线性模型进行臭氧预测: 加权泊松回归,普通最小二乘,加权负二项式模型,多重插补缺失值

    我们可以使用以下功能来做到这一点: 现在让我们验证这将如何改善我们对测试数据的预测。请记住,R2 最初的模型是 0.604。...R2值0.616表示泊松回归比普通最小二乘(0.604)稍好。但是,其性能并不优于将负值为0.646的模型。...结合 看到泊松回归可用于防止负估计,加权是改善离群值预测的成功策略,我们应该尝试将两种方法结合起来,从而得出加权泊松回归。 加权泊松回归 p.w.pois ?...如我们所见,该模型结合了使用泊松回归(非负预测)和使用权重(低估离群值)的优势。...因此,如果所有其他特征的值为0,则模型的预测仍将为正。 但是,假设均值应等于泊松回归的方差呢?

    1.6K20

    数据并非都是正态分布:三种常见的统计分布及其应用

    这款app预测我需要八年时间才能恢复到大学时的体重,这种不切实际的预测是因为应用使用了简单的线性模型来进行体重预测。这个模型将我所有过去的体重数据进行平均处理,然后绘制一条直线预测未来的体重变化。...在处理计数数据,如一定时间内的体重变化次数时,泊松分布则显得更为合适。泊松分布用于描述在固定时间或空间内发生的独立事件的数量,适用于预测罕见事件。...本文我们研究三种常见分布以及我们如何使用它们:正态分布、泊松分布和卡方分布。 正态分布 正态分布,也称为高斯分布,是统计学中使用最广泛的概率分布之一。这种分布以高斯的名字命名,最早在18世纪被描述。...这里我们讨论的是事件的计数,而不是像胆固醇水平那样从0到无穷大的数据测量。我们使用泊松分布来预测诸如城市中的预期谋杀案数量,或某一天急诊部的访问次数等。...例如,在交通领域,泊松分布可以用来预测一定时间内通过某一点的车辆数。 卡方分布则主要用于分类数据的统计测试,如拟合优度测试和独立性测试。

    34310

    数据分享|R语言用lme4多层次(混合效应)广义线性模型(GLM),逻辑回归分析教育留级调查数据|附代码数据

    自然参数和输入x呈线性关系: 这3个条件的来由我们不讨论,我们只知道做这样的假设是基于“设计”的选择,而非必然。 我们以泊松回归为例, y服从泊松分布  ,化为指数族形式,我们可以得到 。...然而,仔细观察可以发现,模型预测所有的观察值都属于 "0 "类,也就是说,所有的学生都被预测为不留级。...在其他因素不变的情况下,随着学校平均社会经济地位的增加,一个学生留级的概率会降低(从0.19到0.10)。蓝色阴影区域表示每个学校平均社会经济地位值的预测值的95%置信区间。...为了给计数数据建模,我们也可以使用泊松回归,它假设结果变量来自泊松分布,并使用对数作为链接函数。...R语言 线性混合效应模型实战案例 R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM) R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合

    1.1K00

    基于R语言混合效应模型(mixed model)案例研究|附代码数据

    请注意,负二项式和伽马分布只能处理正数,而泊松分布只能处理正整数。二项分布和泊松分布与其他分布不同,因为它们是离散的而不是连续的,这意味着它们可以量化不同的,可数的事件或这些事件的概率。..., "lnorm")# qqp需要估计负二项式,泊松和伽玛分布的参数。...----点击标题查阅往期内容R语言用Rshiny探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM)左右滑动查看更多010203043.如何将混合模型拟合到您的数据3a.如果您的数据是正态分布的首先...PQL是一种灵活的技术,可以处理非正常数据,不平衡设计和交叉随机效应。但是,如果您的因变量符合离散计数分布(例如泊松或二项式)且均值小于5,或者您的因变量为二元变量,则会产生偏差估计。...我们继续讨论泊松数据的均值太小或因变量是分类的情况,并且我们有五个或五个以上随机效应。考虑有关大麦农民的这些数据。想象一下,要使大麦收成产生利润,大麦收成的收入必须大于140。

    1.3K00

    广义线性模型glm泊松回归的lasso、弹性网络分类预测学生考试成绩数据和交叉验证

    lasso 求第 75 个Lambda 值 的系数向量 B。 lassoglm 识别并删除冗余预测变量。...广义线性模型的交叉验证lasso正则化 从泊松模型构建数据,并使用 lasso确定重要的预测变量 。 创建具有 20 个预测变量的数据。仅使用三个预测变量加上一个常数来创建泊松因变量。...rng % 用于重现性 randn exp(X)*weights + 1 构建数据的泊松回归模型的交叉验证lasso正则化。 检查交叉验证图以查看Lambda 正则化参数的效果 。...使用 指定二项式因变量的链接函数 'logit'。将预测值转换为逻辑向量。 使用混淆矩阵确定预测的准确性。 confuhart 该函数可以正确预测 31 个考试成绩。...然而,该函数错误地预测了1名学生获得B或以上的成绩,4名学生获得B以下的成绩。 本文摘选《Matlab广义线性模型glm泊松回归的lasso、弹性网络正则化分类预测考试成绩数据和交叉验证可视化》

    1.1K10

    单细胞转录组差异分析的8大痛点

    零值问题(Excessive Zeros): 单细胞数据中存在大量的零值,这些零值可能代表基因未表达、表达水平低未被检测到,或是技术问题导致的未捕获。...许多单细胞差异表达研究在预处理步骤中尝试去除零值膨胀,但这可能会错误地将生物学上有意义的零值(例如由于表达量低或不表达)视为技术假象。...灵活性:GLMM 允许研究者根据数据的特定情况选择合适的概率分布,例如泊松分布或二项分布,以适应不同类型的计数数据。...模型设定:选择合适的随机效应结构可能具有挑战性,不当的模型设定可能导致错误的结论。 参数估计:在某些情况下,GLMM 的参数估计可能不够精确,特别是当数据中存在稀有事件或极端值时。...DESeq2 和 edgeR:作为伪批量方法,它们在某些情况下可能过于保守,导致错过一些真实的DEGs。 MAST:在某些情况下可能无法有效表征零值,导致潜在的DEGs被模型掩盖。

    37310

    R语言用CPV模型的房地产信贷信用风险的度量和预测|附代码数据

    ##绘制时间序列图 plot(diff(cr),type="l") 从上图可以看到数据呈现出稳定的波动趋势,再均值周围回摆,因此差分后数列稳定。...")#实际值 abline(h=0)#添加0基准线 根据上面的模型估计结果, 可以得出Y的残差值、实际值和拟合值的趋势图。...plot(CPVmod$fitted.values,type="l")#拟合值 lines(cr,type="l")#实际值 预测信贷违约率 pre=predict(ma7, 50)#预测值 plot...、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化 R语言用线性模型进行臭氧预测:加权泊松回归,普通最小二乘,加权负二项式模型,多重插补缺失值R语言Bootstrap的岭回归和自适应LASSO回归可视化 R语言中回归和分类模型选择的性能指标...探索lme4广义线性混合模型(GLMM)和线性混合模型(LMM) R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题 基于

    83300
    领券