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不同的GWAS软件如何如何计算SNP的解释百分比(PVE)?

这里,分享一下常用GWAS软件,比如GAPIT,GEMMA,GCTA是如何计算显著SNP解释百分比(PVE)的。 1....GEMMA如何计算PVE,GCTA如何计算PVE,EMMA如何计算PVE的各种问题,可以休矣。...讨论 读到此,你是否有一种豁然开朗的感觉,GWAS分析中显著SNP如何计算解释百分比(PVE)的相关问题,终于解决了。...当然,相对于GLM的PVE计算(也就是R语言的单标记回归计算R-squared),MLM的计算方法重复估计偏低一点。...最后,如果想要更严谨的计算多个SNP的解释百分比,或者一个区段内显著SNP的解释百分比(PVE),可以将该区段作为随机因子,在LMM模型中估算其方差组分,然后计算Vsnp/Vtotal的比值,这应该会降低假阳性

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poj3819 Coverage (求直线与圆的交占直线的百分比 )

题意:给你一条直线和若干个圆,求圆与直线相交的长度占整条直线的比例 解题思路:通过定比分点的方法求出圆与直线的交占圆的比例。...第一步:(确定投影的方向是x轴还是y轴) (1)当直线的line.s(x, y), line.e(x, y)的line.s.x与line.e.x不同一时候,这条直线能够等同于起点为line.s.x..., line.e.x; (2)不满足(1)时(即line.s.x==line.e.x时),当直线的line.s(x, y), line.e(x, y)的line.s.y与line.e.y不同一时候...圆占整条直线的比例为0; 第二步:(将圆投影到第一步得到的直线上) 求出圆在直线上的投影的范围; 第三步: 求出全部圆的并。将圆的并除以线段的长度。...求圆与线段的交占线段的百分比; #include #include #include #include #include

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    Q1:如何用 C# 计算相对时间 ?

    问: 给定一个 DataTime 值,如何计算如下时间?比如说: 2 小时前? 3 天前? 1 个月前?...答: 我在 DateTime 类上做了一个扩展方法,你可以给它传递未来或者过去的时间,还可以给他传一个 approximation 选项来指定更精细的信息描述,参考如下代码: using System.Text...sb.Length == 0) return "right now"; sb.Append(suffix); return sb.ToString(); } github 上有一个非常流行的...DateTime 帮助类,可以非常精细化的满足你的要求,参见网址:https://github.com/FluentDateTime/FluentDateTime , 比如下面这些例子: var dateTime1...= 2.Weeks().FromNow(); var dateTime6 = 40.Seconds().FromNow(); 纯手工封装,用 SortedList 预先做一个映射,应该还是能够满足你的需求

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    PowerBI: 条件格式中百分比的计算原理

    最近在使用条件格式中的图标功能时,发现存在一个百分比的名词。...通过查阅资料,发现百分比的计算是基于如下公式: 其中 Xn代表计算依据字段的当前取值,Xmin 是依据字段的最小值,Xmax 是依据字段的最大值。...公式的分母是整个区间的最大变动范围,数学上称之为极差,或全距。 基于上述百分比的计算公式,可以理解上图第4行货号STY0487对应的是半角。...销售金额的最大值是63111,最小值是0,所以百分比 = (39337 - 0)/ (63111 - 0)= 62%,对应的是半角的区间(33% ~ 67%)。...://learn.microsoft.com/zh-cn/power-bi/create-reports/desktop-conditional-table-formatting) [2] 条件格式中百分比的计算原理

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    云计算耗电惊人占全球用电量的8%

    2012年,戴尔与艾普宽带共同建立的“云计算中心”正式启动上线运营。...“云计算”目前已经应用于许多企业,尤其是一些高科技企业,以谷歌、亚马逊等科技巨头为例,数据存储在数据中心里数以千计的“云端”服务器中。尽管最近数年服务器的硬盘空间大幅增长,但云计算仍然面临挑战。...未来数年,伴随着云计算需求的快速增长,能耗也将水涨船高。 云计算电能消耗大 据中国日报网报道,惠普首席技术官马丁·芬克在接受采访时说,“当前的能源消耗方式是不可持续的,因为未来数年数据量将快速增长。...美国互联网巨头亚马逊上个月被绿色和平组织称作是“最肮脏的”云计算服务厂商之一。在亚马逊的云计算服务AmazonWeb Services的能耗中,清洁能源只占15%,其余来自煤炭、核电和天然气。...特斯拉居然比汽油车的二氧化碳排放还要高。因此,在中国,特斯拉不属于节能环保车型。 占世界用电量8% 近日,国家能源局原局长张国宝在一次活动上表示,当前非常流行的云计算模式,属高能耗项目。

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    当AI与量子计算赤裸相对,即是无尽的“诱惑”

    近期,在数博会的人工智能和量子计算演讲中,国内量子计算大拿杜江峰详细地为我们解释了量子计算和人工智能的关系,让平时对量子计算的一脸懵逼的互联网人士,恍若从梦想走进现实—— 一听到量子,好多人搞不清楚量子...今天会议的主题是大数据 ,为什么前面加一个大,因为这是是一个动态的工作,信息量越来越大的时代,如何从浩瀚的东西中得到有利生活质量的东西,首先要对这个数据进行描述。...现在是2000个CPU,300个GPU,提升的计算能力,使得处理学习或者智能的能力得到比较大的增强,不过现在问题是,如何过渡到量子这块?计算能力能否无限提升? ?...利用相干叠加的方式,实现了计算,无法比拟的超级计算能力,可以把复杂度的NP计算问题,就可以变成P问题。...在计算数据处理里面是一个基本的方式,如果用一个亿亿次的经典计算需要一百年,但是把速度可以降下来,只用一个万亿次的量子计算可能就0.01秒的时间。 ?

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    云计算已经步入相对成熟的产业发展时期

    21日在北京开幕第六届中国云计算大会透露出的信息显示,全球包括中国的云计算已经步入相对成熟的产业发展时期,去年中国云计算产业规模已经达到1000亿元。...首先是业界对云计算的认识更加准确到位;其次是云计算的运用规模和实践深度不断的扩展,尤其是新兴的公用云服务,如云存储服务用户规模已经超过了四千万。”...中国云计算技术与产业联盟理事长,中国电子学会名誉理事长,原邮电部、信息产业部部长吴基传在论坛上表示。    他表示,中国云计算产业正在逐步的完善,有关云计算的标准,服务的规则开始研究。...在市场需求和技术创新的推动下,中国的云计算生态系统初步建立。    记者了解到,当前由云计算、大数据等引发的新一轮电子信息服务业调整、重组与转变正在上演。...中国电信云计算分公司总经理王峰则透露,目前技术和环境的发展给中国电信云计算领域发展带来机遇。

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    如何设计相对安全的图形验证码?

    验证码(CAPTCHA)即“Completely Automated Public Turing test to tell Computers and Humans Apart”(全自动区分计算机和人类的图灵测试...)的缩写,是一种区分用户是计算机还是人的公共全自动程序。...四、如何设计出一个相对安全的图形验证码呢? 设计上: 1)验证码字符集合和长度应可配置,至少四位,不允许单独使用英文字符或数字。...3)验证码生成过程中不仅要使用安全随机函数还要确保种子绝对随机的,保证每次生成验证码的唯一性和不可预测性,防止重放攻击。 4)针对一次请求生成的验证码只能用一次,用完立即过期。...7)后台系统中验证码的验证逻辑要先于口令的验证,只有通过验证码的验证后才能进行用户名、口令等其他身份信息的验证过程。

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    WPF 如何计算矩形内一个坐标相对另一个矩形的坐标

    ,也就是 rect 使用 originRect 的左上角作为原点的坐标系,此时的坐标系和 point 的坐标系相同,也就是计算在相同坐标系的一个点相对于矩形的点 方法通过将点减去矩形的左上角...vector = point - rect.TopLeft; point = new Point(vector.X, vector.Y); 此时计算的 point 点就是相对于...那么假设每个矩形都是左上角都是原点只是因为叠加了矩阵变换才到了当前的坐标,这样就可以应用矩阵计算 开始之前请先复习一下 WPF 的矩阵变换,在 WPF 中变换的矩阵时一个 3*3 矩阵,其中最后一列是占坑的不开放修改...a 的列数等于 b 的行数的时候才能相乘,这就是占坑的数的意义 ai1 * b1j + ai2 * b2j + ... aik * bkj 也就是按照 a 的每一行和 b 的每一列相乘计算 按照这个方法可以计算出矩阵乘法之后的值...的矩阵,也就是将 rect 的矩阵乘以 -1 再乘以 point 坐标 point * (-1 * rectMatrix) 这样通过矩阵就可以计算在 originRect 里面的点相对于另一个矩形坐标

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    人工智能常见知识点⑥

    :0.2,选择次数:1个体编号:2 (1, 3) 适应度:29 占总数的百分比:0.11,选择次数:0个体编号:3 (6, 3) 适应度:99 占总数的百分比:0.39,选择次数:2个体编号:4 (1,...:0.35,选择次数:1个体编号:2 (4, 3) 适应度:59 占总数的百分比:0.19,选择次数:1个体编号:3 (7, 3) 适应度:125 占总数的百分比:0.4,选择次数:2个体编号:4 (3...:0.44,选择次数:2个体编号:2 (6, 3) 适应度:99 占总数的百分比:0.22,选择次数:1个体编号:3 (5, 1) 适应度:53 占总数的百分比:0.12,选择次数:0个体编号:4 (6...:0.14,选择次数:1个体编号:2 (2, 3) 适应度:35 占总数的百分比:0.08,选择次数:0个体编号:3 (1, 7) 适应度:149 占总数的百分比:0.35,选择次数:1个体编号:4 (...:0.27,选择次数:1个体编号:2 (0, 7) 适应度:147 占总数的百分比:0.27,选择次数:1个体编号:3 (6, 3) 适应度:99 占总数的百分比:0.18,选择次数:0个体编号:4 (

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    邮件营销需要追踪的5类关键数据

    打开率(Open Rate) 打开率是指电子邮件营销活动中,目标受众打开邮件的数量占整个送达总数的百分比。邮件的打开率,统计包括:邮件接收者在预览窗口或网页版本中显示图片。...【打开率的计算公式:打开率 = 邮件打开总数 ÷ 未弹回总数即成功送达的总数】,步骤如下: 第一步: 邮件打开总数 ÷ 未弹回总数 = 打开率 (转化成百分比) 第二步: 用“未弹回的Email总数”...代替 “成功发送的邮件总数 从邮件打开率是衡量出邮件营销活动效果的重要指标,所受关注和欢迎的程度如何。...请注意:没有任何链接或图片的纯文本邮件是不可追踪的。 2. 弹回率(Bounce Rate) 弹回率是被弹回E-mail数目占发送总数的百分比。...【计算公式:Email发送总数 — 弹回总数 = 未弹回的Email总数】 未弹回邮件有时用百分比表示,有时用数字表示,因为打开率的计算是基于数字的,所以数字的应用更加广泛。

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    WPF 如何计算矩形内一个坐标相对另一个矩形的坐标

    ,也就是 rect 使用 originRect 的左上角作为原点的坐标系,此时的坐标系和 point 的坐标系相同,也就是计算在相同坐标系的一个点相对于矩形的点 方法通过将点减去矩形的左上角...vector = point - rect.TopLeft; point = new Point(vector.X, vector.Y); 此时计算的 point 点就是相对于...那么假设每个矩形都是左上角都是原点只是因为叠加了矩阵变换才到了当前的坐标,这样就可以应用矩阵计算 开始之前请先复习一下 WPF 的矩阵变换,在 WPF 中变换的矩阵时一个 3*3 矩阵,其中最后一列是占坑的不开放修改...a 的列数等于 b 的行数的时候才能相乘,这就是占坑的数的意义 ai1 * b1j + ai2 * b2j + ... aik * bkj 也就是按照 a 的每一行和 b 的每一列相乘计算 按照这个方法可以计算出矩阵乘法之后的值...的矩阵,也就是将 rect 的矩阵乘以 -1 再乘以 point 坐标 point * (-1 * rectMatrix) 这样通过矩阵就可以计算在 originRect 里面的点相对于另一个矩形坐标

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    Power BI系列:为什么度量值计算的占比全是100%?

    但是很多的新手朋友们在编写表达式的时候,使用变量可能会犯这样一个错误。来看看你是不是也有这样的习惯和问题。先来看一下数据模型。 比如,要计算每个大区的订单金额占所有大区订单总金额的占比。...发现结果全是100%.如图所示: 上述公式虽然没有报错,但是其本身计算的结果是硬错误的,因为每个大区的订单金额占比都是100%,这是显而易见的。...出现这种错误的原因是,代码关于VAR变量的理解是不正确的: 变量只在定义的时候计算,不会在使用变量的时候计算结果,并且变量的计算只进行一次。...在这个例子中,已经定义的salestotal的变量不会受到CALCULATE函数的影响,即不考虑调用变量时的筛选上下文,所以后面的占比计算的时候,每一个大区返回的都是一样的值值。...所以,上述错误的代码,可以分成来写成2个度量值: 订单金额: = SUM ( 'T05_订单子表'[F_06_产品销售金额] ) 再编写金额占比的度量值,如下: 订单金额占比 =DIVIDE

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    机器学习为何重要|通过计算一个句子的音节总数证明给你看

    我们用这个看似简单实则困难的例子,计算一个句子里面音节的总数来说明机器学习的强大。 ◆ ◆ ◆ 计算一个句子里面音节的总数 解决这个难题的一个方法是从现有的列表里去寻找答案。...似乎我们可以通过简单地查字典,找出每一个词的音节数,然后把所有的词加起来就得到了总数。 这个非常直接的方法在实践中很快就失效了。...这种方法汇总一套用某种编程语言写下来的算法,或一系列的指令让计算机去遵从。只要你对问题了解得足够好,能够写下来这些算法,启发式算法则能非常有力地解决问题并能得到很好的结果。...不幸的是,它们很脆弱——计算机只会照着指令执行。...这种爆发是通过多种因素综合作用驱使的,如提高了的训练方法、逐渐增长的电脑的计算能力、巨大型“大数据”数据集中启发式显露出的缺陷、以及机器学习工具包的可用性的不断改善。

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    百分比问题,SQL给你答案

    大单数量占比=大单数量/总数 前面获得“大单”相关字段数据,就可以进行统计各字段和“大单数量的占比”(即汇总百分比的计算)。...交易表 as t1 left join 交易信息表 as t2 on t1.产品ID = t2.产品ID group by t2.产品ID,t2.产品名称'小单数量'; 【本题考点】 本题着重考察如何掌握计算百分比...,以及如何分步拆解最后解决问题的思维。...(1)考查对百分比的计算。注意掌握MySQL计算百分比计算的语法; (2)考查分步拆解的思维能力。传统百分比计算大家都会,难点在于如何使用SQL计算百分比。可以通过分步拆解题意解决最后的百分比问题。...【举一反三】 “举一反三”题目来源: 不同数据库,对于用SQL计算百分比的语法有所不同。

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