2回答
我已经使用nibabel工具加载了一个nifti图像文件，并且我已经使用了一些属性。但我不知道如何计算单个体素的体积(单位为mm³)。
浏览 46提问于2020-06-04得票数 1
2回答
我使用python实现的vtk将nifti文件转换为vtk。主要功能为vtkMarchingCubes。contour=vtk.vtkMarchingCubes() nifti的vtk转换是改变顶点的坐标，还是以某种方式“重置”它们？
浏览 0提问于2020-03-05得票数 1
回答已采纳
6回答
好吧，我知道体素基本上是像素的体积版本。谷歌不提供任何教程，我在任何地方都找不到一本书，我甚至找不到任何与体素的基本概念有关的东西。我对C++库有很多了解，并且了解OpenGL的基本知识。编辑:我想我只是对如何实现它们感到困惑吧？抱歉，我很痛苦，只是我真的找不到任何我能轻易联系到的东西.我想我是在想象一个与向量相关的体素</
浏览 4提问于2011-10-04得票数 14
回答已采纳
我对ITK非常陌生，因此几乎没有使用它的经验。我的问题是：
我有两个nifti图像:一个医学图像和一个表示感兴趣的体积的二进制图像。我只想从医学图像中提取感兴趣的体积区域。我想把这个区域的强度值存储在一个多维数组中。到目前为止，我读取了图像和掩码，并将它们的值存储在一个多维数组中。我现在可以逐
浏览 1提问于2017-06-14得票数 0
1回答
我正在读一篇论文“TileGAN:大规模非均匀纹理的合成”( 这里 )，在题为GANS的特定应用(即生成对抗性网络的应用)一节中，他们声称最近在计算机图形学中的论文将GANs应用于：快速搜索这个词不会对这个词的定义产生很好的结果“体积建模”一词是什么意思？
浏览 0提问于2020-02-29得票数 1
回答已采纳
2回答
在阅读有关体积渲染的文章时，我发现体素渲染被提到了很多。我知道体积数据有体素，但这两个术语是可互换的，还是它们完全不同？
浏览 2提问于2011-08-19得票数 4
回答已采纳
我正在改变一些3D体积的体素大小。如何编辑pixdim字段并计算新的affine 我有一些MR体积是各向异性的，体素大小是，比如说，0.5 x 0.5 x 3 mm。我有一些代码来将它们插入到各向同性(如0.5 x 0.5 x 0.5 mm体素大小)体积中。问题是当我需要保存文件时，我必须计算仿射来将ijk空间中现在更密集的体素映射到引用xyz空
浏览 26提问于2019-04-20得票数 1
1回答
我有一个3D形状，它由一个点云(图片中的蓝点)表示。具体地说，我正在处理MRI数据，其中每个点都是一个具有特定分割标签的体素。此云由两个彼此平行的平面相交。我想找出由两个平面之间的点形成的形状的体积(图片中的橙色)。 我最初的方法是“计算平面之间的点”，即所有至少部分包含的体素，但这并不是一个精确的体积
浏览 32提问于2021-08-19得票数 0
对于我正在做的一个项目，我想写一个脚本，可以计算nifti格式(.nii扩展)的核磁共振图像的总脑体积。我不知道怎么做的是循环遍历所有独立的体素，并提取其中的整数数据。有人知道怎么做吗？这是我用来在Python中加载特定nifti图像的代码： import nibabel as nibimport os
浏览 10提问于2019-01-04得票数 0
1回答
因此，我正在用.nii (NIFTI1格式)为医学图像编写自定义数据集，但有一种混淆。
我的数据采集器返回形状torch.Size (1,1,256,256,51)。但是NIFTI卷使用的是解剖轴，不同的坐标系，所以改变轴是没有任何意义的，我通常会用2D图像组成的体积，每个2D图像分别存储在本地驱动器中，有51片图像(或深度)，因为Conv3D遵循惯例(N,C,D
浏览 2提问于2020-06-07得票数 0
回答已采纳
2回答
我目前正在研究光线投射和体素，这是一个很好的组合。塞巴斯蒂安·肖尔茨的体素渲染器很好地实现了这一点，但也使用了OpenGL。我想知道他的公式是如何工作的；你如何将OpenGL与光线投射和体素一起使用？光线投射的想法不是为每个像素(或Doom中的直线)投射一条光线，然后绘制结果吗？
浏览 3提问于2011-06-26得票数 3
回答已采纳
1回答
我正在尝试配准两个大脑图像体积(每个包括2D切片)。第一个体积(目标体积或移动体积)的切片厚度和间距分别为1.5和1.5。对于第二个值(参考体积)，这些值分别为4和0.9375 0.9375。此外，切片的数量也不同。第一卷有96个切片，第二卷有44个切片。
我的一个朋友建议使体素各向同性，但我不知道如何做到这一点。我可以看到第一个体积是各向同性的，但第二个不是。我
浏览 3提问于2015-08-15得票数 4
1回答
我在试着获取小脑的网状结构。问题是mri体积没有足够高的分辨率来实现不同子结构的可靠识别，所以我正在做的是解析组织学染色幻灯片描绘的svg文件，并将它们转换为填充掩膜，就像在mri体积的一个切片上使用多边形工具后得到的那样。我是否可以在snap中加载标记的体积，其中每个体素都使用与某些结构相对应的id进行标记，并且每个结构都有自己的</e
浏览 6提问于2020-04-23得票数 0
3回答
我想生成一个二进制掩码，其中一个体积内的所有体素为1，一个体积外的所有体素为0。体积由围绕一组3D坐标(<100；某些坐标在体积内)的凸包定义。
我可以使用得到凸包，但如何将其转换为二进制掩码？如果没有好的方法可以通过凸壳，你有任何其他想法，我可以创建二进制掩码？
浏览 0提问于2010-05-05得票数 4
回答已采纳
我正在尝试训练一个模型，其中一组数据包含特定的pixDim，而另一组数据包含不同的pixDim。我想对体素分辨率和执行进行归一化。我们可以使用nibabel或任何其他python库来更改体积数据(如.nifti.gz或.mgz文件)的pixDim维度吗？作为参考，我在下面的图像中高亮显示的体积文件的标题中讨论pixDim。
浏览 8提问于2019-06-12得票数 0
2回答
我正在尝试获取一些DICOM堆栈，并将它们转换为Nifti文件。当我进行转换并在3D查看器中打开新的Nifti文件时，体积在z方向上被粉碎在一起。Nifti文件不知道切片之间的间距。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？<code>A2</code>我正在使用<code>D3</code>并设置我的体素间距，但当我在
浏览 12提问于2020-08-05得票数 0
回答已采纳
我是新来的。目前，在Python上学习医学成像数据，并考虑是否能够识别NIFti图像的正确方向，以及如何进行转换。我在网上查了一下，找到了一些算法，可以通过一定角度的仿射变换来“旋转”成像数据(主要是JPG格式)，但是没有关于如何在nifti图像上“旋转”并通过nibabel将其保存为新的nifti图像的文档。来说明我的意思。我
浏览 6提问于2021-02-16得票数 1
我是NiBabel的新手。我想知道如何使用这个库从Nifti图像中获得强度矩阵。我使用以下脚本来获取体素：example_img = ni.load('myImage.nii')
一开始我认为数据包含体素的强度，但当我打印它时，我看到了负值，在图像中有负强度似乎很奇怪，你不这样认为吗？我需要在nifti
浏览 3提问于2017-07-14得票数 3
1回答
我有一个脑MRI，其中包含来自角度的切片。我在玩注册工具的脑部核磁共振，叫做。该代码也可用于
现在，魔法已经发生了。将第一个MRI作为注册工具的输入，最后这个MRI作为参考MRI结果是，注册工具(Flirt)的输出是一个MRI，其中切片具有这样的角度：因此，注册工具似乎从输入
浏览 0提问于2020-05-30得票数 0
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
云直播活动推荐
腾讯云开发者
