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Python如何使用Networkx实现复杂的人物关系图?

1 简单引入 日常工作、生活中我们经常会遇到一些复杂的事务关系,比如人物关系,那如何才能清楚直观的看清楚这些任务关系呢?...比如我们从网上搜索1个人物关系图,大家看看: 声明:以下图片来源于网络,如果涉及版权问题,请联系作者删除。本文仅供学习,不做他用。 那我们如何使用Python来实现类似的人物关系图呢?...2 关于Networkx 2.1 Networkx简单说明 NetworkX是一个用于创建、操作和研究复杂网络的 Python 库; 可以创建、分析和可视化各种类型的网络,例如社交网络、Web图、生物网络等...; NetworkX可以用来创建各种类型的网络,包括有向图和无向图; 提供各种方法来添加、删除和修改网络中的节点和边; NetworkX还提供许多图的算法和分析工具; NetworkX还提供多种方式来可视化网络...If dim<2, a ValueError is raised. 2.3 Networkx一个示例 比如一个几个节点的有向图: # -*- coding: utf-8 -*- import subprocess

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    Python如何使用Networkx实现复杂的人物关系图?

    1 简单引入 日常工作、生活中我们经常会遇到一些复杂的事务关系,比如人物关系,那如何才能清楚直观的看清楚这些任务关系呢?...比如我们从网上搜索1个人物关系图,大家看看: 声明:以下图片来源于网络,如果涉及版权问题,请联系作者删除。本文仅供学习,不做他用。 那我们如何使用Python来实现类似的人物关系图呢?...2 关于Networkx 2.1 Networkx简单说明 NetworkX是一个用于创建、操作和研究复杂网络的 Python 库; 可以创建、分析和可视化各种类型的网络,例如社交网络、Web图、生物网络等...; NetworkX可以用来创建各种类型的网络,包括有向图和无向图; 提供各种方法来添加、删除和修改网络中的节点和边; NetworkX还提供许多图的算法和分析工具; NetworkX还提供多种方式来可视化网络...If dim<2, a ValueError is raised. 2.3 Networkx一个示例 比如一个几个节点的有向图: # -*- coding: utf-8 -*- import subprocess

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    图嵌入中节点如何映射到向量

    图嵌入就是从图中的数据中准确学习这种映射的一种形式。 图嵌入的目的 图嵌入的目标是找到图中每个节点的向量表示,该向量的映射代表节点的网络结构,而不是考虑节点的相关特征。...图被描述为一个二维邻接矩阵,节点的直接祖先是一个向量。在每个距离级别上探索节点的上下文有多个选择,必须决定如何遍历这些选择。...不是着眼于密切的关系,而是寻找节点的结构角色:例如,它是如何嵌入到更大的社区环境中。这个度量称为结构等价。 可以使用这两种方法来查找节点的上下文——也可以将它们组合在一起。...node2vec的数学原理 通过下面的例子来详细了解node2vec是如何工作的: V:图中所有节点 N_S(u):由样本策略S确定的u的邻域 F (u):节点u到向量的映射函数 目标是找到V中所有节点...结合 node2vec 中的节点和边嵌入,可以推导出更通用图嵌入,它能够将相互关联的数据映射到向量表示。 总结 本文介绍了如何找到映射 f(u) 以将图的节点映射到向量空间,从而使相似的节点接近。

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    如何批量给自己的文件重命名

    应用Windows日常办公,很多时候为了更快识别自己文件夹的文件,我们常需要对文件进行重命名自己偏好习惯,个位数的文件重命名,无非就是耗费自己一两分钟的时间,点点鼠标,然后重命名,输入文件名即可。...前面分享了:Linux命令行,菜鸟报错之隐藏在换行中的字符^M,我们下载下来的文件,那么好了,现在问题是我需要对下列500+文件进行个性化重命名,要在每个文件 前加上数据收集的年份区间, 比如2007_...而且,中间还不能出错喔,万一年份搞错了,那 排查起来,可又是想跳楼的心都有。 那么,有没有更好的方法? 听过Jimmy老师的课的都知道啦,解决问题的能力,就是编程的能力。...tmp <- tmp[tmp$`Data File` %in% xpt$mainNames,] ##构建最后重命名的文件名称...file.rename(tmp$`Data File`,tmp$fileRename) 最后,文件重命名为: ? 完美!!这样看起来,极大利于后续处理了。任务完成!!!

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    Chrome如何清除单个域名的缓存

    这明显是因为chrome的缓存引起的问题,但是我不想删除所有的缓存,只想删除这个网址的缓存,应该怎么做呢?这篇文章就来解决这个问题。...需要清除某网站缓存时 F12 打开开发者工具就会自动清除这个网站的缓存,而不必清除所有网站的缓存了。 但是实际上并没有解决问题,特别是你开了强制HTTPS的时候,么有用。...site data,具体如下: chrome F12 - application - Clear storage ,Clear site data CMD : ipconfig/flushdns 其他的清除缓存方法...还可以用CTRL+F5  强制刷新页面 CTRL+SHIFT+DELETE  清除所有缓存 5、最后 如果是只是清除单个网站的缓存,那么我们用Clear site data即可清除,如果你是你开启了强制...最后,可以打开win系统的cmd命令输入ipconfig/flushdns,这个通常是刷新本地DNS缓存。

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    利用Python绘制精美网络关系图

    小世界网络图 上面这张图片是我绘制的社交关系图,其中蓝色节点代表的是度最高的节点,就是社交关系最复杂的节点。...安装其他包的时候,将networkx改成其他包名即可。 三、NetworkX基础知识 1.创建图 首先我们需要创建一个没有边和节点的图形,说白了就是先拿出一张白纸,我们准备在白纸上作画了。...常用的就是第一种图了 2.添加节点 这一步的作用就是在图中添加节点,我们可以一次添加一个节点,也可以添加一个节点列表 G.add_node()#添加节点1 G.add_nodes_from([,...])#添加节点2,3 两个命令是不一样的需要注意一下哦 3.添加边 当然边也可以单个添加和多个添加 G.add_edge('x', 'y') # 添加一条边起点为x,终点为y G.add_edges_from...如果大家感觉Networkx不能满足大家的需求,绘制网络图的python库还有DGL,PyG。

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    关联线探究,如何连接流程图的两个节点

    如果你用过流程图绘制工具,那么可能会好奇节点之间的连接线是如何计算出来的: 不要走开,跟随本文一起来探究一下吧。...平行时,计算一条垂直线与经过另一个点的伪点的水平线 的节点 if (!...在开始算法之前需要先实现如何找出一个点周边的点,如果是在网格中,那么很简单,一个点周边的点就是x、y坐标加1或减1,但是我们这些点彼此之间的距离是不确定的,所以只能根据坐标进行搜索,比如要找一个点右边最近的点...A*算法的所说的节点优先级是由两部分决定的: f(n) = g(n) + h(n) g(n)代表节点n距离起点的代价。 f(n)代表节点n到终点的代价,当然这个代价只是预估的。...,两个点的曼哈顿距离指的就是这两个点的水平和垂直方向的距离加起来的总距离: 对于我们的计算,也就是当前节点到终点的曼哈顿距离: // 计算代价h(n) computedHCost(point) {

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    用于小型图形挖掘研究的瑞士军刀:空手道俱乐部的图表学习Python库

    实际上,这意味着目的相同的算法使用相同的数据类型进行模型训练。详细如下: 基于邻域和结构节点的嵌入技术使用单个NetworkX图作为拟合方法的输入。...属性节点嵌入过程将NetworkX图作为输入,并将要素表示为NumPy数组或SciPy稀疏矩阵。在这些矩阵中,行对应于节点,列对应于特征。...图级嵌入方法和统计图指纹将NetworkX图的列表作为输入。 社区检测方法使用NetworkX图作为输入。...行索引对应于单个图在输入图列表中的位置。同样,列代表嵌入维数。 调用get_memberships()方法时,社区检测过程将返回一个字典。节点索引是键,与键对应的值是顶点的社区成员。...我们假定NetworkX图是无向的,并且由单个强连接的组件组成。所有算法都假定节点的索引是连续的,并且起始节点索引为0。

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    如何批量查询单个基因的功能通路?

    我们的马拉松授课最后一周给大家讲解了KEGG和GO数据库的网页版本的单个基因与多个基因的功能注释,还讲解了功能注释与功能富集的区别。富集其实就是显著注释到的功能通路。...然后上课有个学员跟着实际操作演练,发现他的基因在KEGG数据库网页中没有找到通路: KEGG 网页对某个基因的注释操作为: 学员的查询结果: 然后我验证了一下他的操作,真的没有找到!...下面来看看其他的方法! 批量代码版本注释一个基因 学员的基因我们就不放了,我们随便找一个基因比如 EPCAM,一个上皮细胞的经典基因。...我们上面讲了,基因的注释与富集含义是一样的,只不过富集是显著注释的通路,通过卡一个pvalue或者其他的阈值挑选得到,那我们第一种方法就用功能富集的方式拿到这个基因注释到的通路: 这里需要注意参数的设置...(ggplot2) library(tidyverse) # 单个基因查询 # GO通路 ego_ALL <- enrichGO(gene="EPCAM", OrgDb= 'org.Hs.eg.db'

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    Cytoscape制作带bar图和pie图节点的网络图

    作者:中科院微生物所 陈亮博士 本教程旨在告诉大家如何使用cytoscape根据Node信息表格制作带有barplot信息节点的网络图。以安装文件夹下的样例数据为例。...采用Network Analyzer产生一些节点或边的统计量。...若想制作pie图,此处选择pie chart选项。 ? 7. 现在你可以根据自己需要来选择Node table中要展示的数据了。Available Columns窗口展示了所有可以用于作图的数据。...修改结点颜色和形状 从图上可以看出圆形的节点并不适合展示bar plot图,因此我们可以将节点的形状改为正方形,填充颜色改为白色。...并选择上面工具栏中Zoom selected region放大查看细节(点击旁边的Zoom out挖扭退回查看完整网络),也可以根据节点名字从右上方的搜索框搜索感兴趣的节点。 ? 11.

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    Python - 使用 Matplotlib 可视化在 NetworkX 中生成的图形

    一旦定义完成,图的结构就是这样,程序就会继续使用“networkx”框架中的“draw()”函数可视化图。“draw()” 方法接收图形 'G' 作为变量,并生成网络的可视输出。...方法 方法 1:使用节点标签和边缘权重可视化图形 方法 2:使用子图可视化大型图形 方法 1:使用节点标签和边缘权重可视化图形 例 import networkx as nx import matplotlib.pyplot...现在是时候用节点填充我们的图形了。为了将单个节点添加到图中,我们使用 add_node() 函数。每个节点都有一个唯一的标识,我们还可以通过使用自定义属性为节点提供标签。...此函数生成一个简单的路径图,其中包含 5 个以线性方式连接的节点。 为了组织可视化,我们使用 Matplotlib 的 subplots() 方法来构建子图。...我们设置它的标题并使用索引 1 访问它。我们还使用 NetworkX 的 spring_layout() 函数计算节点位置,该函数以美观的方式排列节点。

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    networkx之图遍历和图绘制

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 networkx之图遍历和图绘制 文章目录 networkx之图遍历和图绘制 图数据读取后默认标签(labels)为索引,如何使用编号id?...图数据读取后,如何得到节点集和边集? 如何绘制多样的图? 图数据读取后默认标签(labels)为索引,如何使用编号id?...例如在读取football数据时,其labels都是节点的英文名称,这样在处理图数据时不是很方便,往往报错,我们通常习惯处理节点的编号从1开始,可以建立label-id的反向索引,如果处理图数据时只需要编号...读取gml图文件,有两个问题影响使用 ---- 图数据读取后,如何得到节点集和边集?...在图数据读取后,我们在算法中处理数据时往往会对图的节点集和边集进行处理,下面提供几种遍历方式: ---- 如何绘制多样的图?

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    图对比学习 | 结合图的结构信息和节点特征的图对比学习

    最近,对比学习(CL)已成为一种无监督的图表示学习的非常热门的方法。大多数图CL方法首先在输入图上进行随机扩充,得到两个视图,并使两个视图的表示一致性最大化。...尽管图CL方法得到了长足的发展,但图增广方案(CL中的关键组成部分)的设计仍然很少被探索。 本文认为,数据扩充方案应保留图的内在固有结构和属性信息,这使得模型对不重要的节点和边的扰动不敏感。...在本文中,作者提出了一种新的具有自适应增强的图对比表示学习方法,该方法结合了图的拓扑和语义方面的各种先验。 具体来说,在拓扑级别,本文基于节点中心性度量设计增强以突出重要的连接结构。...拓扑属性考虑了: degree centrality eigenvector centrality PageRank centrality 在节点属性级别上,通过向不重要的节点特征添加更多噪声来破坏节点特征...具体的方法参考:椒盐噪声 本文对各种真实的数据集进行了广泛的节点分类实验。实验表明,提出的方法始终优于现有的最新方法,甚至超过了一些监督学习的对应方法,这证明了采用自适应增强的对比框架的有效性。 ?

    2.6K70

    快速获取子图根节点的属性

    @TOC[1] Here's the table of contents: •一、问题背景•二、构建样例多子图数据•三、实现根节点的属性查找•四、将子图查找的GQL封装为一个函数•五、总结 快速获取子图根节点的属性...子图查找匹配是一个非常复杂的问题,主要有确定模式的子图匹配和不确定模式的子图匹配【例如:通过图模式相似性进行查找】。...已知子图查找问题可以使用APOC中的过程来实现,apoc.path相关输入输出查询[2];指定节点之后获取节点所属的子图,然后从子图中提取出ROOT节点的属性。...其中指定a节点为ROOT节点即子图的根节点。...,并返回根节点的subname属性' ); RETURN custom.subGraphRootName('e') AS rootSubName; 五、总结 本文通过一个非常简单的场景,介绍了一个子图分析的方法

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    cdn节点是什么?如何理解cdn节点的作用?

    当人们在网络上遨游的时候,可能很难想象在这其中有多少服务器在为实现网络访问而繁忙不休,而cdn节点就是一种能够帮助用户提升网站访问速度的服务,那么cdn节点是什么?如何理解cdn节点的作用呢?...cdn节点是什么 虽然在网络世界中似乎并没有物理距离的问题,访问任何网站对于用户而言都只是输入一串字符,但其实不同的网站都是建立在真实的服务器中的,如果用户距离网站数据保存服务器的距离过远,那么用户访问该网站时就会出现网络延迟...而cdn节点就是映射了网站内容的边缘服务器,能够根据用户的地域为其提供距离其最近的服务器中所保存的网站内容。...cdn节点的作用 很多人对于cdn节点是什么都不是十分清楚,更不用说如何理解cdn节点的作用。...其实这种网络概念对于行业外用户而言,想要完全解释清楚是比较困难的,不过目前的cdn节点大多属于自动为用户分配的,因此对于绝大多数用户而言,只需要知道这是一种能够提升网络访问速度的服务就已经足够。

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    Networkx:Python的图论与复杂网络建模工具

    同时,Networkx 也在不断地发展和改进,以满足用户的需求和期望。 在这篇文章中,我将向大家介绍 Networkx 的一些主要特性,以及如何使用 Networkx 进行网络分析。...我还会分享一些在使用 Networkx 时可能遇到的常见问题,以及如何解决这些问题。希望这篇文章能对你有所帮助。...如何安装 Networkx 在使用 Networkx 之前,我们需要先安装这个库。...install -c anaconda networkx 安装完成后,我们可以通过 import 命令将其导入到我们的 Python 环境中: import networkx as nx 如何使用 Networkx...这里的 G 是你的图,ax 是你的子图,pos 是节点的位置,node_size 是节点的大小,node_color 是节点的颜色,alpha 是透明度,with_labels 决定是否显示标签。

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    NetworkX使用手册

    import networkx as nx G = nx.Graph() 根据图的定义,一个图包含一个节点集合和一个边集。...在NetworkX中,节点可以是任何哈希对象,像一个文本字符串,一幅图像,一个XML对象,甚至是另一个图或任意定制的节点对象。(注意,Python中的None对象是不可以作为节点的类型的。)...节点  图G可以通过好几种方式生成。NetworkX包含了许多图的产生函数和一些读写图的工具。...因此我们应该好好思考如何构建我们的应用程序才能使我们的节点是有用的实体。当然我们可以在图中使用一个唯一的标识符或者使用一个不同的字典的键来标识节点信息。...如果被指定的是单个节点,则返回一个对应的单一的值,如果被指定的是一个nbunch,则返回一个字典: >>> nx.degree(G,1) 2 >>> G.degree

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