如果在使用Snakemake时指定了--drmaa-log-dir参数,但该目录不存在或无法访问,则Snakemake作业将失败。
Snakemake是一个用于构建和运行数据分析工作流的工具。它使用Python编写,并提供了一种简洁的方式来描述工作流中的任务和它们之间的依赖关系。Snakemake可以自动化地管理任务的执行顺序,并根据输入和输出文件的状态来决定是否需要重新运行任务。
--drmaa-log-dir参数用于指定Snakemake作业的DRMAA日志目录。DRMAA(Distributed Resource Management Application API)是一种用于与集群调度系统交互的API。通过指定--drmaa-log-dir参数,Snakemake将会将作业的DRMAA日志输出到指定的目录中。
如果指定了--drmaa-log-dir参数,但该目录不存在或无法访问,Snakemake将无法将作业的DRMAA日志输出到指定的目录中,从而导致作业失败。因此,在使用--drmaa-log-dir参数时,需要确保指定的目录存在并且具有适当的访问权限。
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