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数据挖掘知识脉络与资源整理(十)–箱线图

如图所示,标示了图中每条线表示的含义,其中应用到了分位值(数)的概念。...箱形图的绘制步骤: 1、画数轴,度量单位大小和数据批的单位一致,起点比最小值稍小,长度比该数据批的全距稍长。 2、画一个矩形盒,两端边的位置分别对应数据批的上下四分位数(Q1和Q3)。...3、在Q3+1.5IQR(四分位距)和Q1-1.5IQR处画两条与中位线一样的线段,这两条线段为异常值截断点,称其为内限;在Q3+3IQR和Q1-3IQR处画两条线段,称其为外限。...相同值的数据点并列标出在同一数据线位置上,不同值的数据点标在不同数据线位置上。至此一批数据的箱形图便绘出了。统计软件绘制的箱形图一般没有标出内限和外限。...= ToothGrowth) #当一个为分类型,一个为连续型绘制成箱线图 boxplot(len ~ supp + dose, data = ToothGrowth) #二个分类型,箱线图,图中有离群点

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【绘图】高维数据可视化必备图形-平行坐标图

正如在这个图形中,可以清晰的看到,某些观察值随着组别的变化而产生的变化。不过,随着基因组大数据的不断发展和应用,在很多科研绘图场景中,高维数据的处理变得越来越重要。很多时候我们接触到的数据。...如此高维的数据,如果我们想要观察他们的变化趋势,应该使用何种图形呢? 在上面的这张图形中,仅仅有两条线。如果有几十条、几百条折线,或者多个分组呢?不知道大家有没有考虑过这样的问题。...对于这个问题,如果单纯为了比较不同分期基因表达的差异。我们可以用箱线图,或者小提琴图,但是这些图形体现的仅仅是不同分组之间的差异。同一个基因是如何随着时间变化而变化的,貌似只能够通过折线图来进行展示。...在平行坐标轴中,它和普通折线图最大的一个区别就是它含有多条坐标轴。每一个坐标轴都代表了不同的维度,所以说坐标轴的排列方式和归一化的方式可能会影响观察者对数据的理解。...可是,有些数据相差太大或者太小,在图中如果用原始的数值进行绘制的话,图形有可能就完全重叠在一起了。 为了避免这个问题,我们对图形数值进行标化。

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    从零开始学机器学习——K-Means 聚类

    箱型图箱型图由五个重要的数值点构成,分别是最小观察值(下边缘)、25%分位数(Q1)、中位数、75%分位数(Q3)以及最大观察值(上边缘)。...这些统计指标能够有效地概括数据的分布特征,帮助我们了解数据的集中趋势和离散程度。在分析数据时,如果存在离群点,即异常值,它们的数值会超出最大或最小观察值的范围。...而对于箱型图中其他的数值点,如分位数和中位数,目前我们可以暂时不做过多关注,重点放在识别和处理这些离群点上,以确保数据的质量和聚类分析的有效性。...这一转折点被称为“肘部”,它标志着增加 K 值所带来的收益逐渐减小,从而帮助我们识别出最佳的簇数。接下来,我们将绘制肘部图,以便直观地展示这一过程。...inertia 是 KMeans 类的一个属性,表示所有簇内的距离平方和,越小表示聚类效果越好。在成功绘制肘部图之后,如图所示,我们可以清晰地观察到 WCSS 随着 K 值变化的趋势。

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    独家 | 如何比较两个或多个分布形态(附链接)

    分组的数量是武断的。 我们可以通过stat选项来解决第一个方法,绘制density而非计数,将common_norm选项设置为False来分别对每个直方图进行归一化。...Q-Q图将两个分布的分位数相互绘制出来。如果分布相同,就会得到45度的直线。 Python中没有本地的Q-Q图函数,虽然statmodels包提供了一个qqplot函数,但它相当麻烦。...计算R和U的直观方法是:如果第一个样品的值都大于第二个样品的值,那么R₁= n₁(n₁+ 1)/2,因此,U₁将为零(可得到的最小值)。...我们如何解释p值?这意味着数据中的均值差大于1-0.0560 =94.4%的排列后样本均值差。 我们可以通过绘制测试统计值与样本值之间跨排列的分布来可视化测试。...试验统计量如下: 卡方检验统计量,图片来自作者 其中,组别由i索引,O是第i个组中观察到的数据点数量,E是第i个组中期望的数据点数量。

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    图形编辑器开发:网格与网格吸附

    网格,指的是渲染在画布上的,按照特定间距绘制垂直和水平直线,所构成的网格。 作用是让用户可以较 直观 地观察到图形的距离和大小关系,以及实现网格吸附。...网格绘制 考虑到性能,我们 只绘制视口范围内的网格线。其他超出的部分不同绘制出来。因为是重复图案(可以视作两条线组成的 L 形的平铺),可以考虑用纹理平铺渲染以提高性能。...gridSpacingX 和 gridSpacingY 的值理论上应该相等(加上限制)。但也可以不相等,比较少见,但此时格子从正方形变成了长方形。...找到某个值距离最近的 spacing 整数倍值的方法: const getClosestTimesVal = (value, spacing) => { const n = Math.floor(value...通常吸附间距应该和网格渲染间距相同,这样吸附到网格上的界面就比较符合直觉。 但实际上是可以不一样的。尤其是网格密度过大时如果使用了动态改变网格间距的方案。 结尾 网格比较重要的大概就是这些。

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    高维数据可视化必备图形-平行坐标图

    正如在这个图形中,可以清晰的看到,某些观察值随着组别的变化而产生的变化。不过,随着基因组大数据的不断发展和应用,在很多科研绘图场景中,高维数据的处理变得越来越重要。很多时候我们接触到的数据。...如此高维的数据,如果我们想要观察他们的变化趋势,应该使用何种图形呢? 在上面的这张图形中,仅仅有两条线。如果有几十条、几百条折线,或者多个分组呢?不知道大家有没有考虑过这样的问题。...对于这个问题,如果单纯为了比较不同分期基因表达的差异。我们可以用箱线图,或者小提琴图,但是这些图形体现的仅仅是不同分组之间的差异。同一个基因是如何随着时间变化而变化的,貌似只能够通过折线图来进行展示。...可是,有些数据相差太大或者太小,在图中如果用原始的数值进行绘制的话,图形有可能就完全重叠在一起了。 为了避免这个问题,我们对图形数值进行标化。...之后才有可能去完成部分基础的数据统计分析和可视化。如果是要专门从事数据分析和建模方向的相关人员则还需额外学习一门甚至数门编程语言(如 MATLAB、R 和 Python )。

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    canvas学习总结五:线段的端点与连接点

    上一章我们还提到线宽与像素边界的内容主要为:  如果你在某2个像素的边界处绘制一条1像素宽的线段,那么该线段实际会占据2个像素的宽度; 因为当你在像素边界处绘制一条1像素宽度的垂直线段时,canvas...线段的连接点(lineJoin) 在绘制线段或者矩形时,我们可以控制两条线段连接处的拐点,也就是线段的连接点。 在canvas绘图环境中线段的连接点是由 lineJoin属性控制的。...round:额外填充一个圆弧,圆弧为两条线段拐角的外边缘的点用圆弧连接而成, bevel:额外填充一个三角形,三角形为两条线段拐角的外边缘的点用直线连接而成。...从图中我们可以看出,如果两个线段的夹角很小的话,那么斜接线的长度有可能会变的非常长,它与二分之一线宽的比值就会超出你所指定的miterLimit的属性值, 这时候浏览器会将以bevel的方式来绘制线段的连接点...总结 Canvas绘图环境中线段的相关属性 属性 描述 值 默认值 lineWidth 以像素为单位的线段宽度 非零的正数 1 lineCap 绘制线段的端点样式 butt,round,square

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    用Python演绎5种常见可视化视图

    通过本篇文章,你将学到: 视图的分类,从哪些维度进行分类 5种常见视图的概念,以及如何在Python中进行使用,都需要用到哪些函数。...比如“身高”和“年龄”,你可以理解是同一个人的两个参数,这样在同一张图中可以看到每个人的“身高”和“年龄”的取值,从而分析出来这两个变量之间是否存在某种联系。...当然kind还可以取其他值,这个我在后面的视图中会讲到,不同的kind代表不同的视图绘制方式。 好了,让我们来模拟下,假设我们的数据是随机的1000个点。 ?...在Matplotlib中,我们使用plt.hist(x, bins=10)函数,其中参数x是一维数组,bins代表直方图中的箱子数量,默认是10。...通过seaborn的heatmap函数,我们可以观察到不同年份,不同月份的乘客数量变化情况,其中颜色越浅的代表乘客数量越多,如下图所示: ?

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    从零开始的异世界生信学习 GEO数据库数据挖掘--GEO背景知识简介

    箱形图的绘制步骤: 1、画数轴,度量单位大小和数据批的单位一致,起点比最小值稍小,长度比该数据批的全距稍长。 2、画一个矩形盒,两端边的位置分别对应数据批的上下四分位数(Q3和Q1)。...3、在Q3+1.5IQR和Q1-1.5IQR处画两条与中位线一样的线段,这两条线段为异常值截断点,称其为内限;在Q3+3IQR和Q1-3IQR处画两条线段,称其为外限。...相同值的数据点并列标出在同一数据线位置上,不同值的数据点标在不同数据线位置上。至此一批数据的箱形图便绘出了。统计软件绘制的箱形图一般没有标出内限和外限。...分组向量中的表达矩阵中的每一个样本需要一一对应;同一个分组对应一个关键词。...图片 PCA图中,图中不同颜色代表不同分组,图上的一个小点表示一个样本,点与点之间的距离表示样本间的相似程度。离得近就更相似,离得远差异大。

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    这样酷炫的Python图表谁能不爱?

    引言 色彩搭配对图表的第一印象至关重要,合理的设置对图表的颜值提升有着很大的帮助,本期推文结合一个具体例子对图表颜色搭配进行讲解。 02....2.2 数据插值 默认数据绘制的折线图可能不是那么的平滑,当然,这也是和我们选择较少的数据有关,要想达到平滑效果,需要对原始数据进行插值处理(Excel中选中图表右击,点击设置数据系列格式,选择最后的平滑线...ax.fill_between(x_new, y_new,alpha=.15,lw=.1,zorder=2) # 填充两条线间的颜色 这里设置填充面积的线边框宽度为0.1,会使得填充边框不那么明显。...效果如下: 如果不设置线宽lw,图中红色圆圈内将会有明显的横线效果,影响美观。...2.4 颜色选择 记得好多小伙伴后台留言或者直接和我沟通 关于色彩搭配的设置,其实,我也是一名学习者,可能就是看的色彩搭配网站以及精美可视化作品比较多,还是那句话多模仿 多练习 对比不同色系对同一幅图表所展示的效果

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    使用Matlab计算两条线的交点及三角形垂心

    : 2、下面计算每两条线之间的交点(即上图所示的1,2一组,3,4一组,5,6一组计算其交点) 两条直线相交,必然需要求出两条直线的表达式,每条直线的表达式可以用 y = ax + b来表示,下面用...+ b(2*i-1, 1)) - (a(2*i, 1) * x + b(2*i, 1)); % 两个直线方程之差函数值为0时的x值,由得到的x值计算y值 points(i, 1...,下面对这三个垂线进行绘制,按照上面的方程计算出两个点,两个点的横坐标一个选择很小,一个选择很大,这样可以保证画出来的直线足够长,方便观察(这个方法似乎有些简单粗暴~~~~~~~~,不过还是能够绘制出来的...) % 设置预绘制直线的两个端点的X值 verticalLinePoints = zeros(6, 2) for i = 1: 3 verticalLinePoints(2*i-1, 1) =...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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    通过空气质量指数AQI学习统计分析并进行预测(上)

    4.1.2 缺失值处理 对于缺失值,我们可以使用如下的方式处理: ? 均值填充: 如果是正态分布用均值填充也可以,但是如果是右偏分布就不可以用均值填充了,因为会受到极值的影响。...注意:箱线图中的上限(最大值)和下限(最小值)不是数据集中的最大值和最小值,指的是合理范围之内的最大值和最小值,合理范围是什么呢?...如果一个异常值比Q1-1.5IQR还要小的话,或者它比Q3+1.5IQR还要大的话,就把这样的值看成异常值。...5.3.1 数量统计 我们首先来统计下临海城市与内陆城市的数量。...以上柱形图中的两条线指的是什么?指的是置信区间,默认为95%的置信度,总体均值在95%的概率下是不会超过线(置信区间)的。

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    【统计学基础】从可视化到统计检验,比较两个或多个变量分布的方法总结

    直方图将数据分组到同等宽的容器(bin)中,并绘制出每个容器中的观察数据的数量。...由于两组的观察次数不同,因此两个直方图不具有可比性 bin的数量是任意的 我们可以使用 stat 选项来绘制密度而不是计数来解决第一个问题,并将 common_norm 设置为 False 分别对每个直方图进行归一化...但是一个重要的问题仍然存在:bin的大小是任意的。在极端特殊的情况下,如果我们将数据更少分组,最终会得到最多只有一个观察值的 bin,如果我们将数据分组更多,我们最终会只得到一个 bin。...在 x 轴(收入)的每个点,我们绘制具有相等或更低值的数据点的百分比。...如果两个分布相同,我们会期望每个 bin 中的观察频率相同。这里重要的一点是需要在每个 bin 中进行足够的观察,以使检验有效。

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    如何比较两个或多个分布:从可视化到统计检验的方法总结

    直方图将数据分组到同等宽的容器(bin)中,并绘制出每个容器中的观察数据的数量。...但是一个重要的问题仍然存在:bin的大小是任意的。在极端特殊的情况下,如果我们将数据更少分组,最终会得到最多只有一个观察值的 bin,如果我们将数据分组更多,我们最终会只得到一个 bin。...在 x 轴(收入)的每个点,我们绘制具有相等或更低值的数据点的百分比。...如果两个分布相同,我们会期望每个 bin 中的观察频率相同。这里重要的一点是需要在每个 bin 中进行足够的观察,以使检验有效。...生成与对照组中收入分布的十分位数相对应的bin,然后如果两个分布相同,我计算实验组中每个bin中的预期观察数。

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    如何比较两个或多个分布:从可视化到统计检验的方法总结

    直方图将数据分组到同等宽的容器(bin)中,并绘制出每个容器中的观察数据的数量。...但是一个重要的问题仍然存在:bin的大小是任意的。在极端特殊的情况下,如果我们将数据更少分组,最终会得到最多只有一个观察值的 bin,如果我们将数据分组更多,我们最终会只得到一个 bin。...在 x 轴(收入)的每个点,我们绘制具有相等或更低值的数据点的百分比。...如果两个分布相同,我们会期望每个 bin 中的观察频率相同。这里重要的一点是需要在每个 bin 中进行足够的观察,以使检验有效。...生成与对照组中收入分布的十分位数相对应的bin,然后如果两个分布相同,我计算实验组中每个bin中的预期观察数。

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    Python-matplotlib 绘图配色设计

    可以看出,图中无论折线、散点还是刻度等的设置都是比较粗糙的,和"美观"一点都挂不上钩 ? 。下面就从数据处理、填充面积以及色彩选择三个方面进行处理,来使这幅图变得高大上起来 ? ? 。...2.2 数据插值 默认数据绘制的折线图可能不是那么的平滑,当然,这也是和我们选择较少的数据有关,要想达到平滑效果,需要对原始数据进行插值处理(Excel中选中图表右击,点击 设置数据系列格式,选择最后的平滑线...ax.fill_between(x_new, y_new,alpha=.15,lw=.1,zorder=2) # 填充两条线间的颜色 这里设置填充面积的线边框宽度为0.1,会使得填充边框不那么明显。...如果不设置线宽lw,图中红色圆圈内将会有明显的横线效果,影响美观。...2.4 颜色选择 记得好多小伙伴后台留言或者直接和我沟通 关于色彩搭配的设置,其实,我也是一名学习者,可能就是看的色彩搭配网站以及精美可视化作品比较多,还是那句话 多模仿 多练习 对比不同色系对同一幅图表所展示的效果

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    C++ Qt开发:Charts折线图绘制详解

    如果颜色名有效,返回 true。 bool setRgb(int r, int g, int b, int a = 255) 设置颜色的RGB值和可选的透明度。如果值有效,返回 true。...bool setRgba(qreal r, qreal g, qreal b, qreal a = 1.0) 设置颜色的RGB浮点值和可选的透明度。如果值有效,返回 true。...,以及QValueAxis坐标轴类,此处如果读者需要绘制其他的图形,比如折线图中有另一种光滑折线图,则就需要使用QSplineSeries类,根据不同的图表需要使用不同的绘制类,此处我们就以普通折线图为例...=(const QPen &other) const 比较两个画笔是否不相等。 这些方法允许你设置和获取画笔的各种属性,如颜色、风格、宽度、样式等。QPen 类用于定义在绘图中如何绘制线条和边框。...qreal min() const 返回轴的最小值。 qreal max() const 返回轴的最大值。 int tickCount() const 返回轴上的刻度数量。

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    【算法】机器学习算法实践 K均值聚类的实用技巧

    在这种情况下,我们就可以通过监督学习的技术,如逻辑回归,来绘制一个明确的决策边界,并分离出各类T恤。...它包括4个简单重复的步骤,迭代地评估对每个观察值有最近(平均)距离的簇。 因此,如果一组观察结果彼此接近,它们可能属于一组簇。 让我们逐步细细了解该算法。...那些分组在一起的观察值将被聚类,这样的话它们可以在输入中共享相似性(如由它们对同一聚类中心所表现出的接近度),你也为你的数据找到了一组合适的聚类方式。 你使用了多少组簇?...当你不清楚非结构化数据集的标签或者分类时,需要无监督学习的方式(如K均值聚类)来辅助。 因此,数据本身不会告诉你,簇的正确数量(或标签)是多少。 那么,你该如何衡量自己数据用多少组簇呢?...通过绘制数据相对于你初始化的簇的数量的误差,你可以发现误差变化率最尖锐的点。 图3中似乎是在两个簇的地方,表明我们应该可能去划分为小和大两种。

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    Python用正则化Lasso、岭回归预测房价、随机森林交叉验证鸢尾花数据可视化2案例

    复杂模型,如随机森林、神经网络和XGBoost,更容易出现过度拟合。简单模型,如线性回归,也可能出现过度拟合——这通常发生在训练数据中的特征数量多于实例数量时。如何检测过度拟合?...我们的随机森林模型在训练集上有完美的分类错误率,但在测试集上有0.05的分类错误率。这可以通过散点图上两条线之间的间隙来说明。另外,我们可以通过改进模型来对抗过度拟合。...它涉及采取与梯度相反方向的步骤,以找到目标函数的全局最小值(或非凸函数的局部最小值)。要用数学方式表达梯度下降的工作原理,假设N是观测值的数量,Y_hat是实例的预测值,Y是实例的实际值。...然后,在每次迭代之后,更新模型的权重,更新规则如下:其中Δw是一个包含每个权重系数w的权重更新的向量。下面的函数演示了如何在Python中实现不带任何正则化的梯度下降优化算法。...用线性回归预测股票价格9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

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