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    工具 | R语言数据可视化之数据分布图(直方图、密度曲线、箱线图、等高线、2D密度图)

    数据分布图简介 绘制基本直方图 基于分组的直方图 绘制密度曲线 绘制基本箱线图 往箱线图添加槽口和均值 绘制2D等高线 绘制2D密度图 数据分布图简介 中医上讲看病四诊法为:望闻问切。...“望”的方法可以认为就是制作数据可视化图表的过程,而数据分布图无疑是非常能反映数据特征(用户症状)的。R语言提供了多种图表对数据分布进行描述,本文接下来将逐一讲解。...绘制时只需将基函数的美学特征集中配置好需要分析的变量,然后创建新的直方图图层即可。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 基于分组的直方图 本例选用如下测试集: ?...密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...这个函数会给出一个基于数据的二维核密度估计,然后我们可基于这个估计值来判断各样本点的”等高”性。接下来首先给出各数据点及等高线的绘制方法,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?

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    「R」数据可视化4 : 直方图条形图

    本文作者蒋刘一琦,自嘲是一个有艺术追求的生信狗,毕业于浙江大学生物信息学专业,目前在复旦大学就读研究生,研究方向为宏基因组。 在生物信息领域我们常常使用R语言对数据可视化。...在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的图突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。 什么是直方图/条形图?...对于直方图,我们要做的第一步就是把连续性的数据分箱(bin),所谓的分箱实际上就是将数据按照一定的间隔进行分组。...因此不同组之间通常是连续的,且间隔一致。数据的连续性体现在图像上就是柱子之间并没有间隔。因此,直方图可以粗略地表示出数据分布密度,被用于密度估计。 ?...如何绘制直方图/条形图 1)需要什么格式的数据 本次我们来看一个新的R提供的数据,就是闪闪发光的钻石?Diamonds。 ?

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    《数据可视化基础》第六章:分布可视化:直方图和密度图

    每一个直方图进行可视化的时候都是分成两步的:(i) 把数据进行分组,首先把连续性的按照一定的范围进行分组,然后再统计这个范围的人数。...如果组数过多那么就会有很多条,如果组数过少则可能反应不出数据的正确的分布趋势。因此对于一个直方图的绘制,我们往往需要不断的去尝试不同的分组。 ? 对于数据分布的另外一个可视化方式则是密度图。...在密度图中,我们试图通过绘制适当的连续曲线来可视化数据的潜在概率分布。关于密度图的绘制,其实和直方图一样也是分了两步,只不过第一步的分组是分了很多小组。...这样的话,对于数据可视化而言就会产生误导。所以对于密度图的时候,其实在一次性可视化多个分布的时候是有好处的。如果是可视化一个分布的话,可能直方图更好一些。 ?...当可视化年龄分布时,通常使用这个技巧,结果图通常称为年龄金字塔。 ? 以上介绍的,都是两组分布的时候如何可视化,如果是多组的话,如果使用直方图就比较混乱了。这个时候,就应该使用密度图可能更好一些。

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    关于数据的可视化-直方图和二维频次直方图

    一维直方图主要用hist来展示,二维的关系可以用散点图、多hist叠加、hist2d或seaborn来展现,seaborn的主要数据类型是pandas,因此需要转换,又复习了一下Numpy转pandas...alpha=0.5,histtype='stepfilled', color='steelblue', edgecolor='none') plt.show() image.png # 加载sklearn的鸢尾花数据集...-随机数据 # 均值为175,方差为15,且正态分布的1000个随机值 height=np.random.normal(175,15,size=1000) # 构造体重值随机数 weight = (height...sns.jointplot(x="height",y="weight",data=pd, kind="kde"); plt.show() image.png # 两个维度的核密度 f, ax = plt.subplots...sns.kdeplot(pd['height'], pd['weight'], cmap=cmap, n_levels=60, shade=True); plt.show() image.png # 核密度中增加数据三点

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    【译文】R分析快速手册:R中数据可视化

    简介 数据可视化已经成为数据科学工作流程中一个不可或缺的部分。因此,你的主要工具需要有很强的能力来处理这两方面的操作—数据分析和数据可视化。...在过去的时间当中,你可以在你的生活中使用这样的一套工具,但只有其中一个是比较好的。 随着这些景象的变化,R之所以能变成当今的主流语言就是因为它有很强大的数据可视化处理能力。...只需要几行的代码,你可以创造一个美丽的图表和数据的故事了。R有一个很好的资源库来创造一个基本和创新的数据可视化,如条形图、直方图、散点图、热点图、马赛克图以及其它各种可视化操作。...这里是一份常用的可视化操作快速手册以用于展现数据。你可以把这份手册随身带,以便你在需要的时候使用。 那些相要拷贝相关代码的人,你可以在这里下载PDF格式的备忘录。...想要获得完整的内容,访问R中数据分析的综合指南。 如果你希望获得关于数据可视化的全部内容,访问这里数据可视化的终极指南。

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    R语言二手车汽车销售数据可视化探索:预处理、平滑密度图、地理空间可视化

    但总的来说,发布汽车的人的位置通常与他们试图出售车辆的城市相同。 我们可以通过使用 alpha 参数来控制绘图点的透明度,从而更好地查看密度和渗入其他区域的情况,从而对该图进行进一步改进。...请注意,在下面的点图中,不同面板中的分布几乎相同,但分布在中间列中显示出一些变化,其中fuel type = "gas"....在后轮驱动车辆中,手动档比例确实高于轿跑车和敞篷车的其他车型,这是有道理的,因为轿跑车和敞篷车往往是跑车。在四轮驱动中,越野车比例更高。...比较“老爷车”与所有汽车的价格分布,“老爷车”似乎密度更高,价格更高。 idx = (vpts$prie >= 500 & vpos$rce <= 100000 & !...is.na(vpst$ge)) 问题 #15 我省略了这个数据集中的一个重要变量。你认为那是什么?我们可以从其他变量中得出这个吗? 在网站上搜索汽车时,通常是年份、品牌和型号,按顺序排列。

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    R中的概率分布函数及可视化

    对于非数学专业的人来说,并不需要记忆与推导这些公式,但是需要了解不同分布的特点。对此,我们可以在R中调用相应的概率分布函数并进行可视化,可以非常直观的辅助学习。...R中拥有众多的概率函数,既有概率密度函数,也有概率分布函数,可以调用函数,也可以产生随机数,其使用规则如下所示: [dpqr]distribution_abbreviation() 其中前面字母为函数类型...为概率分布名称的缩写,R中的概率分布类型如下所示: 对于概率密度函数和分布函数,其使用方法举例如下:例如正态分布概率密度函数为dnorm(),概率分布函数pnorm(),生成符合正态分布的随机数rnorm...R也可以产生多维随机变量,例如MASS包中的mvrnorm()函数可以产生一维或者多维正态分布的随机变量,其使用方法如下所示: mvrnorm(n=1, mu, Sigma...)...()函数根据二维坐标来估计数据点的分布密度,并画出等密度线(可以使用contour(K4, lwd=1,add=T, xlim, ylim...)函数添加边界线并标注数据比例),然后自定义颜色并并填充进去形成图像

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    R语言可视化——ggplot图表中的线条

    今天跟大家分享的是ggplot图表中的一类重要元素——线条。...R语言中ggplot函数系统中涉及到线条的地方有很多,最常见的场景就是我们做geom_line()(折线图)、geom_path()(路径图),以及图表的绘图区(panel)、图表区、网格系统(grid...我们使用过ggplot内内置数据集验证我们的猜想。...以上使用了一个时间序列数据,很顺利的完成了折线图的制作。 那么针对离散变量的折线图到底如何来做呢,我们可以通过group指定分组的形式来达到目的。...除了折线图(以及路径图,等图层中的线条之外),在theme系统中存在大量的关于线条的属性设置(网格系统、图表边框、轴线、图例系统),均可以参照以上参数进行设置。

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    R语言计算一组数据的置信区间并画密度图进行可视化展示的简单小例子

    本来B站可以直接看StatQuest的视频的,今天看到B站的up主发消息说StatQuest的原作者准备入驻B站了,所以他把原来获得授权的那些视频全都删掉了。所以要在B站看这些视频还要等一阵子了。...具体概念先不介绍了,主要还是实际操作 今天的主要内容来自 How to Calculate Confidence Interval in R : Statistics in R : Data Sharkie...计算置信区间用到的函数是CI()函数,来自R语言包Rmisc R语言包Rmisc第一次使用需要先安装 install.packages("Rmisc") 计算某组数据均值95%的置信区间 x的均值越接近总体的均值,所以均值的置信区间就会越窄 正好昨天的推文是画密度图是给指定的区间填充颜色 ggplot2画密度分布图按取值范围填充不同的颜色 下面使用ggplot2画密度图展示并且展示均值...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本

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    R语言中测序数据的可视化

    对于DNA数据和蛋白质数据的分析和可视化一般大家都不会考虑R语言,但是还是有学者开发了在R语言的DNA和蛋白质数据的分析和可视化。那就是R包seqinr。...这个包包含的函数数量也是我见过的最多的了,当然啦,人外有人,天外有天,更多的我还没见过。今天我们就来介绍下这个庞大的R包。...我们就不去挨个讲解每个函数的功能了,我们今天主要看下其中的可视化部分。...蛋白质中氨基酸的一个物理化学分类可视化图的绘制 函数AAstat()主要是对氨基酸的统计,统计主要是通过其理化性质的分类进行分类。...那么,我们下面这个函数就是用来评估基准值的函数: baselineabif(rfu, maxrfu = 1000) 通过baseline()我们可以确定基准值,接下来就是实现对数据的一个可视化,我们就以

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    R语言可视化——ggplot图表系统中的形状

    今天跟大家分享ggplot图表系统中形状。 在ggplot函数系统中,形状是一类重要的映射属性,如同颜色一样,它可以被赋予给变量,当然也可以直接指定实际的形状类别。...ggplot函数的图层理念中,修改局部图层的元素,需要在局部图层内进行设定,这里需要在geom_point()函数内部进行形状设定。 R绘图系统中存储着的形状符号多达25种: ?...颜色变量是所有属性中为数不多的既可以使用离散型变量、又可以使用连续性变量进行映射的属性 二、关于制定属性映射时shape、size、colour(fill)的位置问题。...如果属性是指定给数据集中的变量(无论是连续性还是离散型)的话,那么一定要包含在美学属性之内(aes()):因为只有包含在aes()中,软件才能通过在数据集中调用对应变量进行映射。...(比如本例中同时作用于折线图和散点图的数据集、x轴y轴变量以及分组变量等) 以上是个人学习ggplot函数过程中所获得的一些体会和心得,希望能够帮助大家在学习R语言可视化过程中少走一些弯路,限于个人能力和水平

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    描述数据分布特征的五种可视化图形

    "望"的方法可以认为就是制作数据可视化图表的过程,而数据分布图无疑是非常能反映数据特征(用户症状)的。R语言提供了多种图表对数据分布进行描述,本文接下来将逐一讲解。...绘制时只需将基函数的美学特征集中配置好需要分析的变量,然后创建新的直方图图层即可。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 03 基于分组的直方图 本例选用如下测试集: ?...密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...这个函数会给出一个基于数据的二维核密度估计,然后我们可基于这个估计值来判断各样本点的"等高"性。接下来首先给出各数据点及等高线的绘制方法,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?...也可以通过设置密度函数美学特征集中的colour参数来给不同密度的等高线着色,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 08 绘制2D密度图 本例选用如下测试集: ?

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    【R语言】5种探索数据分布的可视化技术

    "望"的方法可以认为就是制作数据可视化图表的过程,而数据分布图无疑是非常能反映数据特征(用户症状)的。R语言提供了多种图表对数据分布进行描述,本文接下来将逐一讲解。...绘制时只需将基函数的美学特征集中配置好需要分析的变量,然后创建新的直方图图层即可。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ? 03 基于分组的直方图 本例选用如下测试集: ?...密度曲线表达的意思和直方图很相似,因此密度曲线的绘制方法和直方图也几乎是相同的。区别仅在于密度曲线的横轴要绑定到连续型变量,另外绘制函数的名字不同。R语言示例代码如下: ? 运行结果: ?...这个函数会给出一个基于数据的二维核密度估计,然后我们可基于这个估计值来判断各样本点的"等高"性。接下来首先给出各数据点及等高线的绘制方法,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ?...也可以通过设置密度函数美学特征集中的colour参数来给不同密度的等高线着色,R语言实现代码如下: ? 运行结果: ? 8.绘制2D密度图 本例选用如下测试集: ?

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    r语言有限正态混合模型EM算法的分层聚类、分类和密度估计及可视化|附代码数据

    p=23825最近我们被客户要求撰写关于有限正态混合模型EM算法的研究报告,包括一些图形和统计输出。简介本文介绍了基于有限正态混合模型在r软件中的实现,用于基于模型的聚类、分类和密度估计。...此外,还包括将基于模型的分层聚类、混合分布估计的EM和贝叶斯信息准则(BIC)结合在一起的功能,用于聚类、密度估计和判别分析的综合策略。其他功能可用于显示和可视化拟合模型以及聚类、分类和密度估计结果。...EM的初始化是使用从聚类层次结构聚类中获得的分区来进行的。​...1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现3.matlab中的偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)4.R语言泊松Poisson回归模型分析案例...5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现7.在R语言中实现Logistic逻辑回归8.python用线性回归预测股票价格

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    Python可视化 | Seaborn教你一行代码生成数据可视化

    处理一组数据时,通常要做的第一件事就是了解变量的分布。本文会介绍seaborn中用于可视化单变量的一些函数。..._subplots.AxesSubplot at 0x7fd493fa0390> 直方图 直方图将数据分成bin(s),然后绘制条形以显示落在每个bin中的数据数量,来表示数据的分布。...像直方图一样,KDE根据一个轴上数据的密度,在另一个轴上显示高度。 sns.distplot(x, hist=False, rug=True) 双变量分布可视化 在seaborn中可视化双变量的方法是jointplot()函数,该函数创建一个多面板图形,该图形同时显示两个变量之间的双变量...该图适用于相对较大的数据集。可通过matplotlib plt.hexbin函数使用,也可以在jointplot()中作为样式使用。

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