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数据挖掘知识脉络与资源整理(十)–箱线图

盒式图"或叫"盒须图""箱形图"boxplot[1] (也称箱须图(Box-whiskerPlot)须图又称为箱形图,其绘制须使用常用统计量,能提供有关数据位置分散情况关键信息,尤其在比较不同母体数据时更可表现其差异...主要包含六个数据节点,一组数据从大到小排列,分别计算出他上边缘,上四分位数Q3,中位数,下四分位数Q1,下边缘,还有一个异常值。 箱线图绘制 箱形图提供了一种只用5个点对数据集做简单总结方式。...这5个点包括中点、Q1、Q3、分部状态高位低位。箱形图很形象分为中心、延伸以及分部状态全部范围 箱形图中最重要是对相关统计点计算,相关统计点都可以通过百分位计算方法进行实现。...3、在Q3+1.5IQR(四分位距)Q1-1.5IQR处画两条与中位线一样线段,这两条线段为异常值截断点,称其为内限;在Q3+3IQRQ1-3IQR处画两条线段,称其为外限。...ggplot(ToothGrowth, aes(x=supp, y=len)) + geom_boxplot() ggplot(ToothGrowth, aes(x=interaction

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箱线图N种画法

下图中标示了箱线图中每条线点所表示含义,应用到了分位数概念。...线主要表示五个数据节点,一组数据从大到小排列,分别计算出他上边缘(Maximum),上四分位数(Q3),中位数(Median),下四分位数(Q1),下边缘(Minimum)。...不在上边缘与下边范围内为异常值,用点表示。 ? 大家有没有觉得用箱型图表示显得即直观又美观呢,接下来小编介绍数种方式教你作图,总有一款适合你。 ?...03 比较流行小提琴图,内嵌箱线图扰动散点 ggplot(data, aes(Condition,Value)) + geom_violin(aes(fill =Condition), trim...02 Part 分组画箱线图 根据不同ConditionRepeat对数据分组画图 ggplot(data, aes(Repeat,Value)) + geom_boxplot(aes(fill

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【C++】OpenGL:DDA数值微分线段算法介绍与画线示例

在计算机图形学中,并没有线段概念,而是一个个像素点组成了线段。...DDA法生成线段步骤一般如下: 有了起始点(x1,y1)终点(xn,yn); ▲x=|xn-x1|,▲y=|yn-y1|; 比较▲x▲y大小; steps=▲x▲y中较大者; stepx=▲x...GL_COLOR_BUFFER_BIT); glColor3f(0.87, 0.56, 0.4); glPointSize(3); myDDA(1.5, 3.8, 189.8, 267.5); //调用DDA,定义起点终点...glutMainLoop(); return 0; } DDA画线算法效果如下: 中点画线法(简) 看它位于中点上边还是下边。...Bresenham画线算法 这种画线算法思想中点画线一致,只是在判断取哪个点时,不是看它位于中点上边还是下边,而是这两个点与直线上对应点距离进行比较,如果du>dl,取下面的点,反之则取上

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R03 绘图

geom_jitter(aes(shape = Species)) aes()函数是ggplot2包中一个重要函数,它用于变量映射到图形属性上,如颜色、形状、大小、位置等。...它主要功能包括以下三个方面: 映射变量:aes()函数可以数据框中列名或变量名映射到图形属性上,例如xy变量映射到点图x轴y轴上,或fill变量映射到柱状图填充颜色上。...例如,使用ggplot()函数aes()函数来指定数据集变量映射,然后使用geom_point()函数生成散点图。 传递参数:aes()函数可以参数传递给图形层函数,以便修改图形属性。...例如,可以color参数传递给geom_point()函数,以便修改散点图中点颜色。...总之,aes()函数是ggplot2包中非常重要一个函数,它可以帮助我们数据可视化,并控制图形属性,使得我们能够更好地理解数据。

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JS数据结构与算法-快速排序与二分查找算法

快速排序 快速排序是处理大数据集最快排序算法之一。它是一种分而治之算法,通过递归方式数据依次分解为包含较小元素较大元素不同子序列。该算法通过不断重复这个步骤知道所有数据都是有序。...①选择一个基准元素,列表分成两个子序列; ②对列表重新排序,所有小于基准值元素放在基准值前面,所有大于基准值元素放在基准值后面; ③分别对较小元素子序列较大元素子序列重复步骤①步骤...算法实现 function binSearch(arr,data) { //传入数组用快速排序算法排序一下 var arr = qSort(arr); //最后一个元素所在位置设为上边界...var upperBound = arr.length-1; //数组第一个位置设为下边界 var lowerBound = 0; while(lowerBound...,则将下边界设置为中点元素所在下标加1,也就是选取数组右半边(不包括中点元素),然后再在里面查找 if(arr[mid] < data) { lowerBound

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R基础知识及快速检阅你数据

绘制散点图 library(ggplot2) ggplot(mtcars, aes(x= wt, y= mpg))+geom_point() #这里第一部分ggplot2创建绘图对象,数据框传递给该函数...ggplot(ToothGrowth,aes(x=supp,y=len))+geom_boxplot() #使用interaction()函数制作多变量箱线图 ggplot(ToothGrowth,aes...(x=interaction(supp,dose),y=len))+geom_boxplot() *为何ggplot2基础画图不太一样??...boxplot:当箱线图分布值长度为奇数时,箱线图下,上边缘分别为一分位三分位。若为偶数则有余数决定。只有任意n/4余数为1或者2,那么分位数等于观察值,否则则为两观察值中间数。...et al (1978, p. 16) ggplot:箱线图下边缘与上边缘分别对应着一分位与三分位(25%,75%)。

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R语言十八讲(七)

R画图功能是非常强大,这非常有利于数据可视化,对于R画图,我们一 般使用三个画图系统,分别是R自带画图系统,另外还有两个包,他们画图功能也很强大,即lattice包GGplot包,一般我们从自带系统画图功能开始学起... "  点线 type="b"点加线,或"l"只有线,或"p"只有点,或"s"梯形线 线条 lty=1或2或3 等等 线宽 lwd= 宽度值 背景色 bg="颜色名称或代码" 缩放 cex=缩放倍数值 ...cex.axis=刻度缩放,cex.lab=轴缩放,cex.main=标题缩放 字体 front= 尺寸 pin=c(宽度值,高度值) 边界 mai=c(下边界大小值,左边界大小值,上边界大小值,右边界大小值...这几幅图形,尽量把上面提到函数参数都用了一次或几次,还有的没有涉及到,读者可以自己试验,去看看它们使用方法.最后一幅图,画得比较简单,没有上色,也没有美化,读者可以根据第一幅图来美化它.当然这篇文档只是粗略介绍了一下画图...,如需要更加高级,更加多绘图知识,可以去阅读相关书籍,另外,在接下来连载中,我们也会涉及许多其他绘图函数,绘图方式.欢迎你继续阅读.

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技术贴:R语言拼图全面介绍

导语 GUIDE ╲ 说起R语言拼图,可能大家一点都不陌生,比如常用“cowplot”“patchwork”。gridExtra包也提供了一个拼图函数”grid.arrange“。...另外,南方医科大学余光创教授也开发了一个更为神奇拼图R包:aplot。本文依次对它们用法进行介绍。 准备工作 cowplot、patchwork、gridExtraaplot安装好即可。...它不但有着更为简洁易用图形语法,很容易实现众多复杂布局,还可以多张子图图例集中在一起,放到图一侧。...,展现二维属性,然后在X轴Y轴处再分别做个副图,单独展现它们一维属性。...,但仔细一看会发现进化树条形图y轴标签顺序都不对!

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Matplotlib基础全攻略

增加图形背景grid 绘图时常常会在图形背景中增添方格,以便于人们更直观地读取线条中点坐标取值以及线条整体分布范围.可以使用grid函数增加设定图形背景....前面讲到线条类型,图形颜色形状类型,可以合为一个属性,使用他们符号取值将其拼接,这个参数位置是有限制,比如在下面的代码中,它只能放在label前面,在label参数后面则会报错. plt.plot...3.4 箱线图 箱线图也是在分析数据时经常用到一种图形,正如其名,箱线图由一个矩形两条线组成,矩形上边下边分别是变量上下四分位数,中间一条线表示数变量中位数。...在矩形上下两边各延伸出一条线,每条线长度一般为1.5倍四分位距(上下四分位数之差),这两条线被视为异常值截断线,上端线为上边缘线,下端线为下边缘线,在线外面可能还会有一些点,这些点一般会被认为是异常值...fig = plt.figure(1) 在这张白纸上,我们可以选择较大区域,指画一个收盘价折线图,如果想要节约用纸或者对比两个价格序列,可以这个纸 分成两个区域,分别绘制收盘价折线图开盘价折线图。

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独特箱型图版式,你学会了吗?

功能展示 ##帮助econodist图例添加到ggplot2绘图 add_econodist_legend() ##创建一个可以与econodist图表一起使用图例grob econodist_legend_grob...://cinc.rud.is") library(ggeconodist) 02 基本箱型图绘制 首先让我们来看一下正常用geom_boxplot()绘制箱型图geom_econodist()绘制箱型图有什么区别...hwy)) + theme_ipsum_rc() ##geom_boxplot改为geom_econodist即可用ggeconodist绘制箱型图 (p + geom_boxplot()) +...(p + geom_econodist(width = 0.25)) + plot_layout(ncol = 1) 03 颜色设置 旋转一下图片,设置上下边颜色看看效果 #图片转为横向 (...使用R中自带数据集看看ggeconodist基本功能吧 ##普通boxplot boxplot(Petal.Width~Species,iris,col="#b07aa1") ##使用ggeconodist

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R in action读书笔记(22)第十六章 高级图形进阶(下)

split选项页面分割为一个指定行数列数矩阵,然后图形放置到该矩阵中。...对于直线图,colo将把线条颜色与变量水平联系起来,对于密度图箱线图,fill将把填充颜色与变量联系起来。...表达式改为y ~poly(x, 2)生成二次拟合。注意表达式使用是字母xy,而不是变量名称对于method = "gam",一定要记得加载mgcv包。...playwith()函数允许用户识别标注点、查看一个观测所有的变量值、缩放旋转图形、 添加标注(文本、箭头、线条、矩形、标题标签)、修改视觉元素(颜色、文本大小等)、应用先前存储图形风格,以及以多种格式输出图形结果...这些点将会被突出显示,而其他图形窗口中相应观测点也将会变成红色。  按住Ctrl键不动,鼠标移动到某幅图形中点、条、箱线图或线上,该对象详细信息将会在一个弹出窗口中显示出来。

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24种R语言新手入门之箱线图(二)

以下主要是用boxplotgeom_boxplot 二、初阶画图 2.1 基础语法 boxplot(x, data, notch, varwidth, names, main) #x:向量或公式 #data...设置为true以绘制与样本大小成比例宽度 #names:打印在每个箱线图下组标签 #main:用于给图表标题 2.2 简单箱线图 #内置数据集 ToothGrowth$dose <- as.factor...(notch=TRUE) 图片 #修改离群值、颜色、形状大小 ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(outlier.colour...图片 2.4 给线条“上色” 简单上色 #根据dose列分三色 p<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, color=dose)) +...以上代码都是导入自己文件可直接运行。关注公主号生信初学者回复boxplot领取示例数据代码

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(数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述

abline()、hline()与vline()   在R基础绘图系统中我们可以在已绘制图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法: geom_abline():   ...我们主要使用两个参数控制线条位置,slope控制斜率,intercept控制截距,下面是一个简单例子,我们在散点图层上叠加截距为20,斜率为2直线: library(ggplot2) p <-...():   如果你想添加直线垂直于x轴,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入参数即为线条在x轴上位置,若传入向量则可同时添加多条线条: library..., hwy, fill=factor(class))) p + geom_boxplot() 为我们填充设置透明度,并将边框也赋以对应颜色: p <- ggplot(mpg, aes(class,...hwy, fill=factor(class), colour=factor(class)))+ geom_boxplot(alpha=0.55) p   还可以散点图与箱线图结合起来(这里施加

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跟着Nature microbiology学画图~堆积柱形图+箱线图以及组合图

image.png 重复图片是Figure1中堆积柱形图箱线图,然后将其组合 ? 需要工具及准备 本次可视化基于windows 10系统。...image.png 然而发现:背景颜色为灰色而且带着线条,难看,所以去掉背景颜色线条,即 ggplot(df,aes(x=Status,y=Relative.abundance.......发现目标图里横坐标标签存在一定角度,那么横坐标纵坐标标签用以下代码实现: ggplot(df,aes(x=Status,y=Relative.abundance.......这下就按照第一个堆积图后续修饰,删除横坐标标签: ggplot(bp, aes(x=Diet, y=Richness, fill=Diet)) + geom_boxplot()+theme(axis.title.x...各类检验适用 情况如下: ? ggsignif主要一个函数是geom_signif(),使用方法ggplot2中其他geom_***()一样,作为图层添加到图形中就可以,他主要参数为: ?

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