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【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子(factor) 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL(胆管癌)这套数据为例。...*","stage III/IV",stage) #将剩下的Stage I和Stage II替换成stage I/II stage=gsub("Stage....*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage) #将Stage III和Stage IV替换成stage III/IV,剩下的stageI和II保持不变 stage...参考资料: ☞【R语言】R中的因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表

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    R语言ggplot2分组箱线图添加误差线的简单小例子

    ggplot2 更改图例的顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住,每次作图都得现查,今天的推文记录一下实现代码,方便自己以后查看。...()+ stat_boxplot(geom = "errorbar", width=0.3) image.png 这样多了一个垂直线,不好看,我们把误差线的图层放到最下层...stat_boxplot()函数和geom_boxplot()函数里分别加上position = position_dodge(0.5)参数,目的是使误差线和箱子的位置对应上 如果不加这两个参数,效果如下...image.png 这里还有一个疑问是 箱线图中间的线好像是中位数,如何把这个线更改为平均值呢?...暂时没有想明白 今天推文的示例数据和代码可以直接留言20210929获取 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子

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    如何将MV中的音频添加到EasyNVR中做直播背景音乐?

    EasyNVR已经支持自定义上传音频文件,可以做慢直播场景使用,前两天有一个开发者提出一个问题:想把一个MV中的音频拿出来放到EasyNVR中去做慢直播。...经过我们的共同研究之后,终于想出一个办法,就是先将这个音乐提取出来,再添加进EasyNVR中。...我们采用的是ffmpeg命令行的方法拿到AAC数据,具体命令如下: ffmpeg -i input-video.mp4 -vn -acodec copy output-audio.aac 将获取的AAC...不得不说ffmpeg就是强大,ffmpeg是专门用于处理音视频的开源库,既可以使用它的API对音视频进行处理,也可以使用它提供的工具,如 ffmpeg,ffplay,ffprobe,来编辑你的音视频文件...如果大家对我们的开发及产品编译比较感兴趣的话,可以关注我们博客,我们会不定期在博客中分享我们的开发经验和一些功能的使用技巧,欢迎大家了解。

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    将模型添加到场景中 - 在您的环境中显示3D内容

    在本教程中,我们将学习如何检索模型并使用按钮的触发器将其呈现在场景中。一旦显示,我们将隐藏焦点方块。...约束 然后,单击Storyboard编辑器左下角的第四个图标,将新约束添加到场景视图中。定义约束以确保您的用户界面适应不同的屏幕尺寸或设备方向。设置为0的顶部,左,右和底部。...然后,让我们用一个小消息将它添加到场景中。...,将您添加的每个模型追加到数组modelsInTheScene中。...结论 经过漫长的旅程,我们终于将我们的模型添加到我们的环境中,好像它们属于它。我们在本节中也学到了其他有用的概念。我们在故事板中定制了我们的视图,并在代码中播放动画。

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    R语言可视化——ggplot图表系统中的辅助线

    在之前的推送中,曾经有过一篇介绍excel图表辅助线的制作方法,其中用到的技巧五花八门、令人眼花缭乱。 而ggplot图表系统中的辅助线添加起来却异常简单,非常易于操作。...以上柱形图中,我们如果想要了解五个公司的销售额均值以及单个公司销售额与均值的对比情况,需要在图表中添加一条平均线。...当然这种均值线在分面状态下也是可以添加的。...以上散点图没有很明显的分散趋势,不过为了演示散点图中的辅助线,我还是将散点像素画处理,给散点图加上均值十字线。...像素画处理之后,再加上均值十字线,你可以清晰地看到,数据分布形态中,左下角最为密集。 辅助线的另外一种常见的用途就是在时间序列数据中。

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    将终结点图添加到你的ASP.NET Core应用程序中

    让我们回到正轨上-我们现在有了一个图形生成中间件,所以让我们把它添加到管道中。这里有两个选择: 使用终结点路由将其添加为终结点。 从中间件管道中将其添加为简单的“分支”。...通常建议使用前一种方法,将终结点添加到ASP.NET Core 3.0应用程序,因此从这里开始。...UseEndpoints()方法中调用MapGraphVisualisation("/graph")将图形终结点添加到我们的ASP.NET Core应用程序中: public void Configure...将图形可视化工具添加为中间件分支 在您进行终结点路由之前,将分支添加到中间件管道是创建“终结点”的最简单方法之一。...对我来说,像这样公开应用程序的图形是没有意义的。在下一节中,我将展示如何通过小型集成测试来生成图形。

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    ARKit 简介-使用设备的相机将虚拟对象添加到现实世界中 看视频

    在本课程中,您将了解到ARKit,您将学习如何制作自己的游乐场。您将能够将模型甚至您自己的设计添加到应用程序中并与它们一起玩。您还将学习如何应用照明并根据自己的喜好进行调整。...增强现实 增强现实定义了通过设备的摄像头将虚拟元素(无论是2D还是3D)集成到现实世界环境中的用户体验。它允许用户与自己的周围环境交互数字对象或角色,以创建独特的体验。 什么是ARKit?...无论是将动物部位添加到脸上还是与另一个人交换面部,你都会忍不住嘲笑它。然后你拍一张照片或短视频并分享给你的朋友。...3Layers 跟踪 跟踪是ARKit的关键功能。它允许我们跟踪设备在现实世界中的位置,位置和方向以及现场直播。...而且,光估计可以被集成以点亮模拟物理世界中的光源的虚拟对象。

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    比较(一)利用python绘制条形图

    比较(一)利用python绘制条形图 条形图(Barplot)简介 条形图主要用来比较不同类别间的数据差异,一条轴表示类别,另一条则表示对应的数值度量。...自定义条形图一般是结合使用场景对相关参数进行修改,并辅以其他的绘图知识。...参数信息可以通过官网进行查看,其他的绘图知识则更多来源于实战经验,大家不妨将接下来的绘图作为一种学习经验,以便于日后总结。...= np.arange(len(bars1)) r2 = [x + barWidth for x in r1] r3 = [x + barWidth for x in r2] # 绘制分组条形图...、matplotlib的bar和pandas的bar快速绘制条形图,并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的条形图来适应相关使用场景。

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    R for data science (第一章) ②

    facet_wrap()的第一个参数应该是一个公式,你用〜后跟一个变量名创建(这里“formula”是R中数据结构的名称,而不是“equation”的同义词)。...要在两个变量的组合上构建绘图,请将facet_grid()添加到绘图调用中facet_grid()的第一个参数也是一个公式。 这次公式应该包含两个用〜分隔的变量名。 ?...ggplot2中的每个geom函数都有一个mapping参数。 然而,并非每一种aesthetic都适用于每个几何。 您可以设置点的形状,但无法设置线的“形状”。 另一方面,您可以设置线的线型。...在这里,geom_smooth()根据他们的drv值将汽车分成三行,描述汽车的动力传动系统。 一行描述具有4值的点,一行描述具有f值的点,并且一行描述具有r值的点。...对于这些geoms,您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。

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    60种常用可视化图表的使用场景——(上)

    12、多组条形图 多组条形图也称为「分组条形图」或「复式条形图」,是条形图的变种。...多组条形图通常用来将分组变量或类别与其他数据组进行比较,也可用来比较迷你直方图,每组内的每个条形将表示变量的显著间隔。 但缺点是,当有太多条形组合在一起时将难以阅读。...堆叠式条形图共分成两种: 简单堆叠式条形图。将分段数值一个接一个地放置,条形的总值就是所有段值加在一起,适合用来比较每个分组/分段的总量。 100% 堆叠式条形图。...轴与轴之间的网格线通常只作指引用途。每个变量数值会画在其所属轴线之上,数据集内的所有变量将连在一起形成一个多边形。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。

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    课后笔记:ggplot2优雅的显示WB结果

    我们担心学员没那么快hold住R语言可视化高级技巧,所以介绍了两个小白神包: 新手绘图一站式R包ggstatsplot 新手绘图一站式R包之ggpubr 但是学生的表现实在是太超出我意料了,能超脱于现有的工具...✦ 数据(Data),最基础的是可视化的数据和一系列图形映射(aesthetic mappings),该映射描述了数据中的变量如何映射到可见的图形属性。...✦ 统计转换(Statistical trassformations, stats)是对数据进行某种汇总,例如将数据分组创建直方图,或将一个二维的关系用线性模型进行解释。...「width:」 条形图的宽度,是个比值,默认值是0.9 「color:」 条形图的线条颜色 「fill:」 条形图的填充色 基本演示 读取ImagJ数据及转换 #读取ImageJ dat=read.csv...image.png 数据调整及误差线增加 在ggplot2中可以直接结合stat_summary函数快速进行数据统计->链接 所以stat可以设置为summary,将柱状图的高度设置为各组的均值并联合stat_summary

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    数据视化的三大绘图系统概述:base、lattice和ggplot2

    R语言不仅提供了基本的可视化系统graphics包,简单的图+修饰,例如:plot、 hist(条形图)、 boxplot(箱图)、 points 、 lines、 text、title 、axis(坐标轴...:将每个条件变量产生的图形叠加到一起,在同一幅图中展示,只需要将条件变量放到绘图函数中的group声明中即可。...Split/position 数值型向量,在一页上绘制多幅图形 Type 字符型向量,设定一个或多个散点图的绘图参数,(如p=点,l=线,r=回归,smooth=平滑曲线,g=格点) xlab/ylab...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数,因此需要将图形存储到对象中,然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法,将第一幅图放置到第二幅图的上面...:第一个plot()函数把页面分割为一列两行的矩阵,并将图形放置到第一列第一行中;第二个plot()函数将图形放置到第一列第二行中,由于plot()函数默认启动新的页面,因此使用newpage = FALSE

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    可视化图表样式使用大全

    条形图的离散数据是分类数据,针对的是单一类别中的数量多少,而不会显示数值在某时间段内的持续发展。...多组条形图 ? 多组条形图也称为「分组条形图」或「复式条形图」,是条形图的变种。...多组条形图通常用来将分组变量或类别与其他数据组进行比较,也可用来比较迷你直方图,每组内的每个条形将表示变量的显著间隔。 但缺点是,当有太多条形组合在一起时将难以阅读。...堆叠式条形图共分成两种: 简单堆叠式条形图。将分段数值一个接一个地放置,条形的总值就是所有段值加在一起,适合用来比较每个分组/分段的总量。 100% 堆叠式条形图。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。

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    常用60类图表使用场景、制作工具推荐!

    条形图的离散数据是分类数据,针对的是单一类别中的数量多少,而不会显示数值在某时间段内的持续发展。...多组条形图 多组条形图也称为「分组条形图」或「复式条形图」,是条形图的变种。 多组条形图通常用来将分组变量或类别与其他数据组进行比较,也可用来比较迷你直方图,每组内的每个条形将表示变量的显著间隔。...堆叠式条形图共分成两种: 简单堆叠式条形图。将分段数值一个接一个地放置,条形的总值就是所有段值加在一起,适合用来比较每个分组/分段的总量。 100% 堆叠式条形图。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。...在绘制记数符号图表时,将类别、数值或间隔放置在同一个轴或列(通常为 Y 轴或左侧第一列)上。每当出现数值时,在相应的列或行中添加记数符号。

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    「R」ggplot2数据可视化

    对条形图来说,'dodge'将分组条形图并排,'stacked'堆叠分组条形图,'fill'垂直地堆叠分组条形图并规范其高度相等。对于点来说,'jitter'减少点重叠。...分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...Salaries by phd.png 最后,我们可以用一个分组的条形图按学术等级和性别来可视化教授的人数(三种条形图方式): ? Number by Rank1.png ?...theme()函数中的选项可以让我们调整字体、背景、颜色和网格线等。主题可以使用一次,也可以保存起来应用到多个图中。...将多个ggplot2包的图形放到单个图形中最简单的方式是使用gridExtra包中的grid.arrange()函数。我们需要事先安装这个包。 让我们创建3个ggplot2图并把它放在单个图形中。

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