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【R语言】rep函数生成差异表达分组变量

前面给大家介绍了☞【R语言】rep函数的使用,今天我们来举几个数据分析中的应用,例如差异表达分析时,样本类型变量,我们就可以使用rep函数来生成。...我们在☞GEO芯片数据差异表达分析 中分析的GSE68840这套数据,一共有7个样本,分别是 "plx4032 sensitivity: Sensitive" "plx4032 sensitivity:...】因子在临床分组中的应用 我们不用敲完整的样本类型名字,用数字来代替,然后再用factor转回来。...方法三、登堂入室,活学活用 我们联合使用,strsplit函数+factor函数 在方法二中,我们相当于还是要用c()先创建一个数值向量,逗号还是要敲的。...参考资料: ☞【R语言】rep函数的使用 ☞ GEO芯片数据差异表达分析 ☞【R语言】R中的因子(factor) ☞【R语言】因子在临床分组中的应用

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笔记︱虚拟变量回归=差异显著(方差分析)+差异量化(系数值)

虚拟变量作为自变量,放在回归方程中在教科书里面讲的都很多,笔者以前在学习的时候觉得虚拟变量较之方差分析,还有更多惊喜。...同时,虚拟变量+交互项,效果更是惊人,关于交互项可以参考: 笔记︱横截面回归模型中的两大方向(交互效应+随机性) ——————————————————————————————————————————...如何把虚拟变量放入方程中,可是一门大学问。 如果是名义变量转化过来的要注意截距项的有无、共线性问题: 名义变量转化的一个例子就是大学四年级。...—————————————————————————————————————————— 2、虚拟变量回归中的参照组的选择与截距项的含义——差异量化 Y~b0+b1D1+b2D2+b3D3 这个中D4...b1将两个年级的差异进行量化。 同时b1的T检验,代表着,D1-D4,一年级与四年级平均值差异的显著性。跟方差分析差不多。

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    JavaScript中声明变量的差异和对比:var、let和const

    var 、 let 和 const 的差异主要体现在作用域、变量提升、重复声明、重新赋值以及在循环中的行为等。 1. var 作用域: var 声明的变量具有函数作用域或全局作用域。...在函数内部声明的变量只在函数内部有效,而在函数外部声明的变量在整个函数外部都有效。 变量提升:在变量声明之前就可以使用,但值为 undefined 。...在 {} 内部声明的变量只在该块内部有效。 变量提升:不会发生变量提升,如果在声明之前访问变量会报错。 重复声明:不允许在同一作用域内重复声明同一个变量,会报错。...而在第二个循环中, let 声明的变量具有块级作用域,每次循环都会创建一个新的作用域,因此 setTimeout 回调函数中可以访问到当前循环的 j 的值。...在实际开发中,推荐优先使用 let 和 const 来声明变量,以避免潜在的问题。

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    中美:消费的差异

    消费、投资、出口是经济的三架马车,消费作为作为重要的组成部分,也是宏观经济研究的重要对象之一。...经济学家提出过很多消费函数:如:凯恩斯的绝对收入假说、杜森贝的相对收入假说、弗里德曼的持久收入假说、莫迪利尼亚的生命周期假说及现代的消费函数。...1,消费函数的选择 本次我们将借助前辈莫迪利尼亚的生命周期假说的消费函数来对比中美消费模型的差异性。...同理,我们可以求解出美国的消费函数: 4,中美消费函数估计对比 注释,本文为了学习目的,对网络中数据质量存在质疑,不一定能反映真实的情况,仅供参考,不喜勿碰。...中国居民也更看重上期的收入。 不过中国的消费强依赖于居民的可支配收入,而美国有最低的消费保障,体现美国的福利保障优于我国。 如果有美国最近几年的数据就更有对比性了

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    CCPP中的malloc和new的差异

    差异是什么? malloc和new的差异 malloc 第一条指令是把数值4赋给寄存器edi,为后面的函数调用准备参数,详细分析见CPU里的参数传递。...第二条指令是调用malloc函数,可以猜出这是要申请4个字节大小的内存块,这样看来malloc是一个单纯的函数,输入所需的内存的大小就可以帮我们申请想要大小的内存块。...new 前两条指令跟malloc十分相似,第一条指令是传递参数值8,因为类A仅有2个int类型的成员变量,所以A的大小是8个字节, 到目前为止注意类对象还需要调用构造函数进行初始化。...下面两条指令,第一条指令:把申请到的内存地址传递给寄存器rdi(调用构造函数也是需要传递this指针的) 完成了this指针的传递就可调用类A的构造函数了,及最后一条指令。 至此new操作全部完成。...free和delete的差异 free free是malloc的反向操作,也是一个纯函数接口。它的用途是释放归还刚才申请的内存。

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    寻找差异的feature

    在生物学上,经常会遇到找control和treat的差异基因或者任意两个或者两个以上处理条件下,最差异的变化,比如我有这样一个数据,几千个细胞分为处理过的和没处理过的,然后通过拍照记录了他们的形态大小等几十个特征...,我想知道哪个特征产生了最大的变化。...coef=1, n=Inf) DEfeature<-DEfeature[order(abs(DEfeature$logFC),decreasing = T),] head(DEfeature) 前几个差异最大的...image.png 可以明显看到两群细胞分为不同的分布方向,所以查看较大特征值和特征向量 #show the feature library(factoextra) # Visualize variable...image.png 我们可以看到三种方式的结果几乎是差不多的,说明差异最显著的feature是在不同的方法计算方式都是稳定的。

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    差异分析|DESeq2完成配对样本的差异分析

    本文为群中小伙伴进行的一次差异分析探索的记录。...前段时间拿到一个RNA-seq测序数据(病人的癌和癌旁样本,共5对)及公司做的差异分析结果(1200+差异基因),公司告知用的是配对样本的DESeq分析。...考虑到平时limma和DESeq2包进行差异分析时没有特别注明是否配对,这配对和非配对有啥区别呢? 于是分别尝试使用limma和DESeq2包的非配对分析,发现得到的差异基因和公司的差距很大。...可以看到常规的DESeq2分析比limma voom分析多了一些差异基因,但是和公司给的1200+的差异基因还是差远了。...剩下的事情就简单了,依此修改后,DESeq2包成功做出了配对差异分析,复现了公司的结果。好了,下面就是使用DESeq2包完成配对差异分析的代码了,自取! ?

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    不同写法的性能差异

    达到相同目的,可以有多种写法,每种写法有性能、可读性方面的区别,本文旨在探讨不同写法之间的性能差异 len(str) vs str == "" 本部分参考自: [问个 Go 问题,字符串 len...(也说明变量并不是声明了,就有初始化动作....编译出来的汇编代码是完全一致的,可以明确 Go 编译器对此做了优化(应该是直接比对了) ----- EOF选看: ----- 生成pprof: go test -bench=".*" -cpuprofile...中整数转字符串[2] ---- 几种 字符串拼接 写法的性能差异 将两个字符串 "hello"和"world",拼接为"hello,world" package shuang import ( "...string变量, 而strings.Builder 通过*(*string)(unsafe.Pointer(&byteSli))直接将底层的[]byte转换成了string类型返回了回来,省掉了申请空间的操作

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    数据科学在各行各业中的差异

    另外,三项数据科学技能的熟练度在不同行业中存在显著的统计学差异。与其他行业相比,专业服务行业的数据科学家在所有三项数据科学技能方面,都拥有最高的熟练度。...此外,不同行业在数据科学家类型、技能熟练度以及项目结果满意度方面,也存在差异。 数据科学在各行业所扮演的角色大为不同。在十个行业中,有六个行业的数据科学家以研究人员为主。...在其余行业中,则以另外三个角色为主。这种差异反映了各个行业所需要数据科学家完成的工作量和工作类型的不同。...然而,在满意度最低的三个行业中,有两个行业也是研究人员占比较高的行业。 接下来看看教育水平。...我们需要进一步的研究才能更好地理解,究竟是什么导致各行业在项目结果的满意度方面存在上述差异。 虽然数据科学家从事于各行各业,但他们中的很多人都来自少数几个行业。行业不同,其数据科学家的类型也不同。

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    对于 JavaScript 中循环之间的技术差异概述

    我们来看一下对authors变量的操作: typeof authors // 打印的是 “object”,因此我们可以使用`for ..in` 乍一看感觉有点奇怪,但必须注意,数组是一种特殊的对象,它以索引为键...同时,如果实现 for.. of 构造的迭代器,则它将在每次迭代中循环遍历该值。...ForEach 和 map 方法 尽管可以使用forEach和map方法来实现相同的目标,但是它们的行为和性能方面存在差异。 基础层面上,当函数被调用时,它们都接收一个回调函数作为参数。...[2,4 ,8, 16, 32]; const scoresMap = [2,4 ,8, 16, 32]; const square = (num) => num * num; 我们逐一列出其操作上的一些差异...与forEach不同的是,我们并不总是需要执行一次更改来获得想要的结果,在forEach中,我们需要对newscore变量进行更改。在每次运行时,当提供相同的输入时,map函数将产生相同的结果。

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    对于 JavaScript 中循环之间的技术差异概述

    我们来看一下对authors变量的操作: typeof authors // 打印的是 “object”,因此我们可以使用`for ..in` 乍一看感觉有点奇怪,但必须注意,数组是一种特殊的对象,它以索引为键...同时,如果实现 for.. of 构造的迭代器,则它将在每次迭代中循环遍历该值。...ForEach 和 map 方法 尽管可以使用forEach和map方法来实现相同的目标,但是它们的行为和性能方面存在差异。 基础层面上,当函数被调用时,它们都接收一个回调函数作为参数。...[2,4 ,8, 16, 32]; const scoresMap = [2,4 ,8, 16, 32]; const square = (num) => num * num; 我们逐一列出其操作上的一些差异...与forEach不同的是,我们并不总是需要执行一次更改来获得想要的结果,在forEach中,我们需要对newscore变量进行更改。在每次运行时,当提供相同的输入时,map函数将产生相同的结果。

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    NginxZooKeeper 负载均衡的差异

    Nginx是著名的反向代理服务器,也被广泛的作为负载均衡服务器 ZooKeeper是分布式协调服务框架,有时也被用来做负载均衡 那么他们的区别是什么?如何选择呢?...下面从实际场景看下他们的关系 Nginx的负载均衡配置非常简单,把多个web server配置到nginx中,用户访问Nginx时,就会自动被分配到某个web server upstream backend...到这里还是没有感觉有使用ZooKeeper的必要,因为使用Nginx完全没问题 但随着整个系统的演进,服务的数量会增加、每个服务集群中的服务器数量会增加 ?...这时就会有一些小麻烦,例如 (1)配置维护的成本变高,因为节点太多 (2)单点故障的风险增加了,因为热点服务的访问量很高,如果这个服务集群内的负载均衡服务出现问题,这个服务将失效 第一个问题,可以通过自己开发程序解决...机制等特性,把ZooKeeper作为服务的注册和变更通知中心,解决了Nginx负载均衡方案带来的问题

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    XFI和SFI的差异

    ,从此角度来说,可以认为为XFI和SFI推荐的最大走线长度是相同的。...不同点 眼图模板 B点处的眼图模板对比 可以看出B点处的眼图模板,XFI比SFI的要求更宽松,这是因为XFP光模块内部接收端集成的CDR,它可以承担宽松的代价~,即通过CDR实现波形再生。  ...C点处的眼图模板对比  可以看出C点处的眼图模板,SFI比XFI的要求更宽松,这是因为XFP光模块内部发送端集成了CDR,既然XFI这么棒,对它严格要求即可~ 通道损耗 XFI总的通道损耗预算为9.6dB...预加重和均衡 SFI主机侧发送有预加重(在最初的信号中加入额外的高频分量),接收有均衡(事先去掉一些低频分量),来克服PCB和外部介质的影响,简单来说就是解决高频衰减大、低频衰减小导致的波形畸变的问题。...注:在2160手册中XFI也有发送均衡的说法,但XFI协议中未看到发送均衡的描述。

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