英特尔中国研究院院长 吴甘沙 我相信奇点，但是采用一种预测（prediction）的态度，而非预报（forecasting），言之凿凿说2029或2045有点那个了。...看人的智慧形成，也存在个奇点，在那之后加速进化，我看人的生理结构，DNA编码，脑和神经系统，那么精密，常常有种错觉人就是过了奇点的机器。...熙霖老师关于伦理的观点很认同，机器人三大定律对机器人的约束力是不靠谱的，所以还是得约束机器人的始作俑者——人（就像现在约束人在基因工程上的作为一样），在机器发展到奇点之前，人必须把他的智慧脐带剪断，毕竟在这地球上从没有两种可以竞争的高级物种...如果不加约束地发展，在奇点以后人的智能发展很难赶上机器。人类大脑毕竟是有局限的，而机器的运算能力、存储能力和互联能力是可以简单堆叠、（几乎）无限扩容的，它的学习能力可以不断提升。...百度深度学习研究院杰出科学家 吴韧 计算机神经网络的进化，异构计算，大数据的迭代进化速度，特别是计算智能（computational intelligence）发展的速度，让奇点成为可能。
在生命的最早期，地球上的环境充满了化学反应的可能性。科学家们一直试图解开生命是如何从无机物质演变而来的谜团。...最近，由中国武汉大学的研究团队进行的一项研究，通过计算机模拟深入探讨了早期RNA世界中的环形RNA基因组的可能性，提出了许多引人入胜的新观点。...这些非编码序列在突变后可能生成新的基因，从而促进了基因组的复杂化和功能多样化。 环形RNA的未来研究方向 这一研究不仅为RNA世界假说提供了新的证据，还为未来的研究指明了方向。...这种分工有助于解决RNA在同时担任两种角色时面临的结构性挑战。 武汉大学的这项研究为理解生命的起源提供了新的视角。...环形RNA基因组可能在早期生命进化中扮演了重要角色，其独特的结构优势使其能够在恶劣的早期地球环境中生存和繁衍。随着研究的深入，我们有望进一步揭开生命起源的神秘面纱，为生命科学的发展提供新的动力。
Date : [[2022-05-29_Sun]] Tags : #工作流/snakemake 参考： Snakemake Tutorial[1] 前言 继续介绍一些snakemake的进阶操作。...执行的时候，我们需要制定--cores 参数，设置snakemake 全部任务执行时，不超过的最大线程数。...比如当bwa 规则调用了8个线程，snakemake 则会将剩下的线程分配给其他数据执行bwa 以外的线程消耗数目较少的任务。...比起一般的bash 脚本来说，snakemake 的一个优势在于，其会充分调度线程，以确保线程充分被调度。（真是优秀员工啊！）...我们需要的是排序后的bam，那之前的bam 也确实可以删除节约空间。 而被protected 的文件，无论snakemake 流程如何执行（--forceall），文件始终不会被删除或覆写。
CV界用的还是在有监督数据上训练出来的模型，而NLP那帮家伙居然直接搞出了在无监督数据上的通用预训练模型！要知道NLP中最不缺的就是无监督的文本数据，几乎就是要多少有多少。...其中的encoder模块使用的是BiLSTM。训练好的encoder，就可以作为特征抽取器，获得任意句子中每个token的带背景词向量： ? 使用的时候，只要把 ? 和 ? 拼接起来就行。...无监督模型预训练 ELMo ELMo (Embedding from Language Models) 的目的是找到一种带背景的词向量表示方法，以期在不同的背景下每个词能够获得更准确的表示向量。...预训练模型使用的是两层LSTM+Linear，而分类模型在预训练模型的上面增加了一层带self-attention的LSTM和输出层。SiATL建议的几个策略： ?...为了让预训练的模型能对多种下游任务都有帮助，也即预训练模型要足够通用，模型就不能仅仅只学到带背景的词表示这个信息，还需要学到很多其他信息。
奇点大学公开课-颠覆你的思维 11月24日，百度百家举办第六次线下活动，邀请了奇点大学的三位讲师在太庙开公开课。...左：Raymond 中：Neil 右：Brad 有幸参加了baidu百家的奇点大学公开课，跟大家分享一下我的收获，首先是neiljacobstein 讲《人工智能重塑生活》，人工智能是我非常感兴趣的领域...organizations are ten times better, faster, and cheaperthan yours (and what to do about it)》 同样对未来持乐观态度的的还有奇点大学执行主席...关于指数思维推荐奇点大学校长kurzweil 的《奇点临近》，书中有非常详尽的论述和讨论。...我认为奇点大学意义重大，将这个时代技术发展的最大规律进行教育普及，使我们做好应对这个时代的准备。
流程 Snakemake简介 Snakemake是一个工作流引擎系统，提供了基于Python的可读性流程定义语言,可重现,可扩展的数据分析的工具和强大的执行环境，无需流程更改就可从单核环境迁移到集群，云服务环境上运行...snakemake workflow 由一系列的rules 组成，每个rule为一个分析步骤，用于执行特定的功能。snakemake 流程是以输出为导向的。...如果是在输出导向的snakemake 中，则需要先确定输出文件。...snakemake 是基于Python扩展的，Python原来的语法照样可以在snakmake里使用。...没有后续程序依赖的输出，而中间步骤的输出，会有snakemake自动运行生成。
奇点临近 奇点临近这本书，是一本预测人工智能和科技未来的奇书。目前人工智能处于快速发展的阶段，在很多领域中已经能够越来越多的看到人工智能产品的出现，改变着这个世界，改变着我们每一个人的生活。...在谈奇点和人工智能之前先PS一下：推荐一个我朋友的人工智能教程。零基础！通俗易懂！风趣幽默！大家可以看看是否对自己有帮助，大家可以看看是否对自己有帮助，点击这里查看【人工智能教程】。接下来进入正文。...聊聊什么是 “奇点” ，奇点 这个词是源于 数学的一个函数 Y = 1 / X , 奇点就是当X无限接近0的点，这个点是数学的禁区，这个点也给人无限遐想。...说了奇点，以及我对这个 数学函数 Y = 1 / X 的反方向理解后，在说一个奇点临近中暗含的一个思想：技术在发展的节奏极具加速，技术力量也以指数速度增长，指数级的增长是具有迷惑性的，它始于一个微小的增长...其实这样增长或者这种奇点效应在人工智能领域反应的非常明显。我也想搭上到这个快速增长的列车上，和时代共同成长，之前也了解和学习过一些人工智能相关的课程。但是自己没有能够坚持下去，最后放弃了。
RNA-seq数据分析我们分享了很多，有RNA-seq数据分析经验的小伙伴都会觉得很简单，直接把fastq格式的测序数据比对到合适的参考基因组，然后根据匹配的基因组注释文件去定量就可以拿到表达量矩阵。...对企业生产实践来说，Snakemake流程化管理各个NGS数据分析流程是一个很好的选择，恰好看到了一个最新的 Snakemake workflow, 推荐给大家。...就是：ARMOR (Automated Reproducible MOdular RNA-seq) is a Snakemake workflow, 这个流程图里面的软件我都很喜欢，在我们公众号的1.3...) 的GitHub主页哦！...软件的测序质量情况。
今年，国家陆续提出多个人工智能相关的国家级战略规划，将人工智能的发展提高到了一个前所未有的高度，在即将到来的2018年，人工智能的发展热潮还会不会继续下去？...芯片 人工智能快速发展的基础是数据量的成倍增长，而伴随的是芯片行业的蓬勃发展。...如果说2016年是人工智能的新纪元，人们对于人工智能的探讨还是基于概念的探讨和前景的展望上，那么2017年则是人工智能如何落地的关键一年。...人工智能爆发“奇点”到来的2018 政策红利 2017年，中央出台了一系列国家层面的人工智能产业发展战略规划，而2018年，预计各地将陆续出台地方政策，为AI产业的发展带来更多的利好。...2018年，人工智能爆发的 " 奇点 " 会不会到来，我们拭目以待。
导语 | 在云原生时代，研发效能治理面临新的挑战，同时也获得了新的视角。如何更好地利用云原生技术的优势，从而在根本上提升研发效能，已成为许多企业数字化转型过程中的“必答题”。...今天，我们特别邀请了 Thoughtworks 创新技术总经理、腾讯云 TVP 肖然老师 ，他将为我们解读研发云原生的效能“奇点”。...在过去 10 年时间里，带队先后为金融、保险、通信、物流、零售等核心产业的头部企业提供了长期的从战略执行到组织运营各个方面的咨询服务，以务实的工作作风得到了行业内的广泛认可，也成为了中行、招行、华为等头部企业的高管参谋...当前业界对“奇点”的讨论持续升温，由于大型模型的出现，下一代的编程方式和程序设计方式将发生颠覆性的变化，由此一些人推断未来程序员将变得不再重要，甚至应该退出历史舞台。...未来，我们将看到更多的企业逐步采用云原生技术，并从中获得更高的效率、更快的创新以及更好的业务结果。 欢迎关注「腾讯云TVP」，期待你的「在看」～
时值2025 MWC前夕，我们不妨做一个大胆的判断——2025年将是移动网络与AI融合的“奇点”时刻，将为全球数字化转型注入新的动力。...当前的智能助理还算不上“全能选手”，左右其“智商”的不单单是模型参数，还涉及多模态“感知能力”。一个直接的例子，目前多模态AI Agent的响应时间普遍为5-8秒，远不及类人交互400毫秒的标准。...相对乐观的是，物联网是数字孪生世界构筑的基础，而5G-A的无源物联技术为数字孪生提供了低成本、广连接的网络基础，并且已经在环境监测、智能工厂、安防监控等领域，实现生产过程的全面监控和优化。...2025 MWC：见证AI与移动网络融合的“奇点时刻”世界移动通信大会（MWC）一直是全球科技发展的风向标，2025年大会将以“汇聚·连接·创造”为主题，聚焦AI、5G-A、物联网等前沿科技。...可以预见，AI与移动通信的深度融合将成为本届大会的核心议题。我们正站在科技爆发的“奇点”前夕。AI与移动网络的融合，不只是技术进步的故事，而是一场重新定义生产力和社会运行方式的革命。
在观看Youtube视频的时候，你会不会像我一样，觉得没有字幕很不爽？ 现在有人就制作了一个网站YouTube Subtitle Editor，专门为Youtube加字幕。...你可以先看一段动画片《蜘蛛人》的主题歌，体验一下效果。 所有的字幕都是由用户自行添加的。整个过程同普通的添加字幕过程没有区别，都需要输入文字和同步时间轴等步骤，但是全部都在网上完成。...具体做法可以参考它的说明页。所有步骤都很符合直觉，只有两点需要注意： 1）每段字幕最长不超过2行，最多不超过40个字符。...2）同步时间轴的时候，只需要在每句话开始和结束之间，一直按住字母"T"即可。 今天早上，我为它添加了第一段中文字幕，强悍的《新华保险公司增员操》，欢迎观赏。
ionic3自带的ToastController创建的toast比较简单，不支持图标，且点击toast时是没有事件回调的…… 这个时候，如果想扩展这些功能，一是修改源码，二是自己实现，然而这两种方法都比较麻烦...，比较好的解决方案是利用现有的开源代码，搜索ionic的相关组件寥寥无几，这个时候转换下思路，搜索angular的相关组件会发现有几个，经过比较后觉得ngx-toastr较为适合。...image.png ionic3集成使用ngx-toastr 根据Github上的文档说明，进行如下步骤： 安装组件 npm install ngx-toastr --save npm install...它其实对应着第一步安装的@angular/animations，动画的导入早期也是import * from ‘@angular/animations‘，只是后期把animations抽离后就变成了import...; } } 防止污染ionic自带的toast样式 ngx-toastr的样式刚好和ionic都用到了.toast-container的class，所以会影响，此时，把toastr.min.css中的
本期内容主要以整理Snakemake的简单介绍[1]视频为主。 1啥是Snakemake Snakemake 是一个基于Python3的用于构建和管理数据分析工作流程的免费工具。...当你整理好流程以后，只需简单替换几个参数，就能快速开始分析一个新的数据。 Snakemake 的另一个强大特性是它的并行处理能力。...当我们运行snakemake ds1_plot.pdf时，它会从规则的output中找到能与ds1_plot.pdf匹配的。当{dataset}为ds1时，二者成功匹配。...snakemake ds1_filtered_plot.pdf 按照入门演示的内容，它首先会从Snakefile中定义的规则中自上而下的进行匹配，这个时候将{dataset}匹配为ds1_filtered...如果我们修改了数据，程序会识别文件的修改时间判定其为一个新文件，进而重新运行命令。 3Snakemake 参数 Snakemake的参数非常多，常用的有以下几个： -p：打印运行的shell命令。
原型图 图片.png 重要的实现代码 var getMemo = function(pageNo,name){ $('#dataDiv').html(""); $.ajax({
更激进的如马斯克等人认为，奇点来临之后，超级人工智能将会出现，人类面临从属地位，Superhuman会成为对抗超级人工智能的机会。...他坚持两个主要观点：所谓的技术奇点（The singularity）将在2045年之前发生；到2030年代，纳米机器人将会栖身于我们的身体中。 ?...Superhuman：奇点临近前对抗超级智能（super AI）的另一种人类？ 马斯克神经织网的概念，是他某种意义上对人工智能全面发展终结人类的担忧，这种终结将会发生在技术奇点来临之后。...Ray Kurzweil认为技术奇点将在2045年之前发生，瑞士人工智能实验室IDSIA的负责人、“人工智能之父”JürgenSchmidhuber也在迪拜的世界政府首脑会议上认为，奇点临近大约还有30...“就像生物一样，在强大的机器和人造生命之间会出现一个重要的飞跃。虽然我们可能无法准确预测何时，但所有证据都表明奇点将会发生。” 从这儿角度来看，马斯克提出neural lace并非凭空制造概念。
无奈发现了基于python 框架的snakemake，如释重负，立马学一下。...snakemake 的工作流可以简单概括为：1）首先定义一些规则；2）设置需要的输出类型，snakemake 将会判断需要何种软件或流程以获得对应的输出类型。...我们可以仔细解读一下上面打印的snakemake 的执行过程。 第一个区块展示了执行的任务数目： Building DAG of jobs......，否则我们在调用snakemake 的时候，需要显式地设置output 对应的文件： snakemake -np results/awesome/001_R1.fq results/awesome/001...因为此时，snakemake 成功地将我们指定的文件对应到了规则中的通配符位置。
snakemake学习笔记007~slurm的cluster提交任务 主要参考 https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/snakemake-chap.html...--cluster 'sbatch --cpus-per-task={threads}' --jobs 12 -s snakemake_hpc.py 唰一下就结束了 试了下更长的命令 snakemake...snakemake学习笔记007~slurm的cluster提交任务 image.png 我的文件存储层级如上，按照之前的通配符的写法，他会组合出PRJNA001/SRR0002_1.fastq.gz...前面组合文件夹和文件的命令还是有点多的，不知道有没有简单的的方法 看到有的解决办法里还用到了lambda函数，还得仔细看一下lambda的用法 这里换成我真实的数据集后会遇到内存不够的情况，需要再snakemake...还需要仔细看snakemake的文档 我真实数据的代码 import os raw_fastq_folder = "/mnt/shared/scratch/myan/private/pomeRTD/00
自从机器人诞生之后，我们心中就存在着巨大的恐惧：奇点，当人工智能和机器人的能力超过人类时，技术发展进一步提速，文明被迫重启，人类将陷入生存恐惧。...这听起来有点恐怖又有点有趣，加州大学伯克利分校的机器人专家Ken Goldberg认为奇点之说纯属胡说八道，他表示，“我认为这会适得其反，这种说法是虚构的，也令人沮丧，实际上我们甚至没有接近过这一点。”...我们正在经历的机器人革命，实际上挺有趣的，Goldberg称其为多样性。他表示，“多样性不是科幻小说。这是现在正在发生的事情，是人类和机器一起工作的想法。”...人类则有更好的大脑，以及可以抓住一切东西的灵巧双手。而这些反差将会持续很长一段时间。” 亚马逊所做的事情就是多样性的一个典型例子。...当然，随着机器人变得越来越精密，他们将威胁要彻底取代某些人类劳动，这就是自动化的本质。但我们明天不会在机器人奇点中醒来。这种转变将会发生得更加缓慢，即便如此，也不是灾难性的。
Snakemake展现gatk4生成正常样本的germline突变数据库流程图 这是使用gatk4生成正常样本的germline突变数据库的流程图，整个流程是用Snakemake写的，这个图片也是Snakemake...好了，言归正传，本文主题为使用Snakemake搭建生信分析流程，下面开始我（熊猫）的表演！...Snakemake的使用 Snakemake是基于Python写的流程管理软件，我理解为一个框架。Snakemake的基本组成单位是rule，表示定义了一条规则。...Snakemake会自动判断一条rule的input是来自哪条rule的output，从而将一条条rule串成一个完整的流程。...这是Snakemake的一个优点，另外Snakemake支持“断点续行”，假如你的任务运行到一半因为某种原因中断了，你可以重新运行一下命令，Snakemake会机智的从中断的地方继续运行，已经成功运行的任务不会重复运行
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