首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

基于张量分解和关系约束的多种类型的MicroRNA-疾病预测

作者创新性地将miRNA-disease-type三元组表示为一个张量,引入张量分解的方法来预测多种类型的miRNA-disease的关联,并进一步提出了一种新的张量分解方法——关联约束张量分解法(TDRC...表示张量的范数,C,P,F是相对于miRNA、疾病和类型模式的因子矩阵,通常被认为是对应模式的潜在表征, ? 是其的重构张量。 3.2 TDRC方法 标准的CP模型只利用关联信息。...图2 用张量表示数据以及TDRC的模型体系结构 引入投影矩阵和,分别将疾病(P)和类型模式(C)的因子矩阵,转换为疾病语义相似矩阵和miRNA-miRNA功能相似矩阵,根据正则化,得到TDRC的目标函数...HMDD v2.0根据遗传学、表观遗传学、循环和miRNA靶点相互作用的证据,这些关联被分为四种类型。...对于测试集中的每对miRNA-disease,都对其所有关联类型的预测进行排序,计算出最高的precision、recall和F1测度。

78540
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    变量类型(cpugpu)

    PyTorch中的tensor又包括CPU上的数据类型和GPU上的数据类型,一般GPU上的Tensor是CPU上的Tensor加cuda()函数得到。通过使用Type函数可以查看变量类型。...① 基本类型如图所示,下面是cpu和gpu版本的张量(Tensor)的基本类型,一共是8种。?torch.FloatTensor(2, 2) 构建一个2*2 Float类型的张量?...2, 2) 构建一个2*2 Char类型的张量torch.ShortTensor(2, 2) 构建一个2*2 Short类型的张量torch.IntTensor(2, 2) 构建一个2*2 Int类型的张量...torch.LongTensor(2, 2) 构建一个2*2 Long类型的张量官网还介绍了从python的基本数据类型list和科学计算库numpy.ndarray转换为Tensor的例子:>>> torch.tensor...Numpy.ndarray –> Tensor 可以使用torch.from_numpy(data),其中data的类型为numpy.ndarray。

    1.9K20

    【Python】已解决TypeError: unsupported operand type(s) for ...报错方案合集

    前言 一、可能的错误原因 二、错误代码示例 三、解决方案 方案一:检查变量是否为None 方案二:使用异常处理 方案三:提供默认值 方案四:检查操作数类型 总结 前言 在Python编程中,TypeError...本文将通过一个具体的错误示例——TypeError: unsupported operand type(s) for *: ‘int’ and ‘NoneType’——来分析问题背景、可能出错的原因、提供错误代码示例和正确代码示例...TypeError 错误发生在尝试对不支持的操作符使用不兼容的数据类型时。例如,当你尝试将整数与None类型进行乘法操作时,就会遇到这种错误。...,因为value是None 或者不支持的操作符和类型,比如尝试对不支持的操作数类型执行操作。...方案四:检查操作数类型 在执行操作前,添加类型检查,确保操作数类型符合预期。

    2.2K10

    解决问题has invalid type , must be a string or Tensor

    经过一番研究和实践,我找到了解决方法,现在将与大家分享。问题描述当我尝试将NumPy数组输入到深度学习框架中进行处理时,出现了上述错误信息,提示我输入的类型不正确。...原因分析这个问题的根本原因是深度学习框架要求输入的数据类型必须是字符串(string)或者张量(Tensor),而我错误地将一个NumPy数组作为输入传递给了框架。...字符串(string)和张量(Tensor)是在编程中经常使用的数据类型,它们在不同的场景和任务中有着不同的用途和特性。字符串(string)字符串是由字符组成的序列,通常用于表示文本数据。...在机器学习和深度学习中,张量是存储和进行数值计算的基本数据结构。不同的深度学习框架(如TensorFlow、PyTorch)提供了丰富的张量操作,使得高效的数值计算和神经网络训练成为可能。...通过张量,可以组织和处理大量的数值数据,进行各种数值计算,并训练复杂的深度神经网络模型。 总结起来,字符串和张量是在不同领域中经常使用的数据类型。

    28910

    PyTorch中张量的创建方法的选择 | Pytorch系列(五)

    在这篇文章中,我们将仔细研究将数据转换成PyTorch张量的主要方法之间的区别。 ? 在这篇文章的最后,我们将知道主要选项之间的区别,以及应该使用哪些选项和何时使用。言归正传,我们开始吧。...张量和PyTorch张量之间的抽象概念的区别在于PyTorch张量给了我们一个具体的实现,我们可以在代码中使用它。 ?...这称为类型推断(type inference)。dtype 根据传入的数据来推断。请注意,也可以通过给 dtype 指定参数来为这些调用显示设置 dtype。...这种共享仅仅意味着内存中的实际数据存在于一个地方。因此,基础数据中发生的任何更改都将反映在两个对象中,即torch.Tensor和numpy.ndarray。...如果在numpy.ndarray对象和张量对象之间进行大量来回操作,则as_tensor() 的性能提高会更大。但是,如果仅执行一次加载操作,则从性能角度来看不会有太大影响。

    2K41

    Python进阶:利用NotImplemented优化你的对象交互逻辑,让Python对象间的操作更加智能与灵活

    这样做允许Python解释器尝试调用另一个操作数的相应特殊方法,以实现操作符的重载或跨类型的操作。...跨类型操作:在自定义类型之间进行操作时,如果某个操作在当前类型上未定义,但可能在另一个类型上有定义,返回NotImplemented可以允许Python自动尝试使用另一个操作数的实现。...而NotImplemented则用于操作符重载和跨类型操作的上下文中,以指示某个操作在当前对象上无法执行。...NotImplemented和NotImplementedError的区别 Python中的NotImplemented和NotImplementedError虽然听起来相似,但实际上它们在用途、类型和行为上都有着显著的区别...我们通过返回NotImplemented来表明当前对象不支持与另一个操作数的直接加法,这样Python会尝试调用另一个操作数的__radd__方法(如果它存在的话)。

    8000

    TypeError: Unsupported Operand Type(s) for +: ‘int‘ and ‘str‘ 完美解决方法 ️

    这个错误意味着你在执行加法操作时,两个操作数的类型是不兼容的。这类错误通常发生在数据类型不匹配或者数据类型转换未正确处理的情况下。...为了理解这个错误,我们需要从数据类型和操作符的角度来分析。 2. 解决方案 2.1 类型转换 最简单的解决方法是确保操作数的类型一致。...("不支持的操作数类型: {} 和 {}".format(type(a), type(b))) result = safe_addition(5, "10") # 将抛出TypeError 3....except TypeError as e: print("出现错误:", e) calculate_sum() QA环节 Q1: 为什么Python不支持自动类型转换?...表格总结 错误类型 产生原因 解决方法 示例代码 TypeError 操作数类型不兼容 使用类型转换或数据验证 result = 5 + int("10") 未来展望 随着Python应用场景的不断扩展

    42710

    Pytorch中张量讲解 | Pytorch系列(四)

    )指定了张量中包含的数据类型。...张量包含下面这些类型中的一种(相同类型的)数值数据: ? 注意每种类型都有一个CPU和GPU版本。关于张量数据类型需要记住的一件事是,张量之间的张量运算必须发生在具有相同数据类型的张量之间。...去掉张量属性 作为神经网络程序员,我们需要注意以下几点: 张量包含统一类型(dtype)的数据。 张量之间的计算取决于 dtype 和 device。...我们可以使用Python列表或序列,但是numpy.ndarrays将是更常见的选择,因此我们将使用numpy.ndarray,如下所示: > data = np.array([1,2,3]) > type...(data) numpy.ndarray 这为我们提供了一个简单的numpy.ndarray类型的数据。

    1.6K30

    Pytorch 基础-tensor 数据结构

    1,指定数据类型的 Tensor 可以通过传递参数 torch.dtype 和/或者 torch.device 到构造函数生成: 注意为了改变已有的 tensor 的 torch.device 和/或者...Tensor 数据类型 Torch 定义了七种 CPU tensor 类型和八种 GPU tensor 类型: torch.Tensor 是默认的 tensor 类型(torch.FloatTensor...数据类型:可通过改变 torch.tensor() 方法的 dtype 参数值,来设定不同的 tensor 数据类型。 维度:不同类型的数据可以用不同维度(dimension)的张量来表示。...这两种方法关联的 Tensor 和 numpy 数组是共享数据内存的。可以用张量的 clone方法拷贝张量,中断这种关联。...'> numpy.ndarray'> """ 2,item() 方法和 tolist() 方法可以将张量转换成 Python 数值和数值列表

    1K20

    JS最新基本数据类型:BigInt

    问题 对于学过其他语言的程序员来说,JS中缺少显式整数类型常常令人困惑。许多编程语言支持多种数字类型,如浮点型、双精度型、整数型和双精度型,但JS却不是这样。...大于2^53的BigInt不能准确地转换为数字。 由于这个限制,不可能对混合使用Number和BigInt操作数执行算术操作。...还不能将BigInt传递给Web api和内置的 JS 函数,这些函数需要一个 Number 类型的数字。...1n 无法转换的数据类型和值会引发异常: BigInt(10.2); // → RangeError BigInt(null); // → TypeError BigInt("abc"...重要的是要记住,不能使用Number和BigInt操作数的混合执行算术运算,需要通过显式转换其中的一种类型。 此外,出于兼容性原因,不允许在BigInt上使用一元加号(+)运算符。

    2.7K30

    张量 Tensor学习总结

    Tensor、float、int、bool、tuple、list和numpy.ndarray类型。...使用init初始化器构造张量 张量的属性 张量的属性包括形状、数据类型、单个元素大小、占用字节数量、维数、元素个数和每一维步长。...形状是一个tuple,数据类型是MindSpore的一个数据类型,单个元素大小是每一个元素占用字节数,占用字节数量是总字节数,维数是秩,元素个数是所有元素的个数,每一维步长是每一维所需要的字节数。...Tensor与NumPy互相转换 稀疏张量 稀疏张量是一种特殊类型的张量,其中大部分元素的值为零。在一些应用场景中,如推荐系统、分子动力学、图神经网络等,数据的特征往往是稀疏的。...CSRTensor CSR稀疏张量格式以values、indptr和indices存储非零元素的值和位置,具有高效的存储与计算优势。

    9610

    【Python报错合集】Python元组tuple、张量tensor(IndexError、TypeError、RuntimeError……)~持续更新

    c.解决方案   要解决这个错误,你需要确保输出数组和目标数组在进行广播操作时具有兼容的形状。可能的解决方案包括: 检查代码中广播操作的部分,确保输入和输出数组的形状符合广播规则。...你可能在使用某个函数或操作时,错误地传递了不匹配大小的张量作为输入。你可以检查函数或操作的文档,确保传递的张量具有正确的形状和大小。 c....RuntimeError: Only Tensors of floating point and complex dtype can require gradients   这个错误提示表明只有浮点数和复数类型的张量才能要求梯度...在你的代码中,你创建了一个整数类型的张量torch.tensor([1, 2, 3], requires_grad=True)并尝试要求梯度,这是不支持的操作。...c.解决方案   要解决这个问题,你可以将张量的数据类型更改为浮点数类型,以便能够要求梯度。你可以使用torch.float将整数张量转换为浮点数张量,然后再要求梯度。

    19310
    领券