我们的目标是在ppi网络数据集中找到类似的基因，该数据集以加权边缘列表的形式存在。在我们使用图聚类算法之后，我们如何衡量这些聚类的相似性？我们的数据集的一个样例行： Gene1 Gene2 Weight10040 57679 0.1244 提前谢谢。
浏览 19提问于2020-12-21得票数 0
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我有一个包含10,000个基因的数据集，如下所示 1 0 1 1asian每一行都意味着一个人的DNA中是否有一个基因。我们正试图根据上述数据对不同的族裔群体进行分类。但是首先，我们想要使用一些聚类算法来可视化集群对于不同种族群体的样子。我们不打算使用这种<e
浏览 0提问于2017-10-07得票数 7
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Logistic回归的替代方案
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我也有一个专栏，显示他们是否有健康状况(在大约20%的受试者中)。我现在想分析一下对健康状况影响最大的因素。这方面的通常检验是Logistic回归分析。然而，这假设这些关系是线性的。
浏览 0提问于2018-04-07得票数 6
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我正在使用k均值对一些基因表达数据进行聚类，在缩减的PCA空间中，现在我想要提取最能描述每个聚类的不同特征。这些特性在每个集群中都有很高的表达。我在下面发布了一个可重复的例子，以展示我的逻辑和我已经停止的地方。现在，我想对热图中的每个星系团提取高表达的基因名称。编辑
我们如何定义高表达？这一点我不太确定，并希望得到一些洞察力。也许比较所有细胞中每个基因的平均水平，
浏览 2提问于2016-07-20得票数 1
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所以我基本上是在处理后续的帧，每个帧代表一个一维数据集。聚类背后的直觉是由与集群内其他点相似的点组成集群，这些点可以自然地连接起来。利用光谱聚类的能力，根据点的连通性而不是绝对位置进行聚类，并通过距离的非线性变换来设置rbf核。然而，在某些帧中，该算法会导致非自然分配。random_state = 42,
gamma = 5 / (X.max() - X.mi
浏览 0提问于2019-12-25得票数 6
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我正在比较两种在R中用树状图创建热图的方法，一种是用made4的heatplot，另一种是用gplots of heatmap.2。适当的结果取决于分析结果，但我试图理解为什么缺省值如此不同，以及如何使两个函数得到相同的结果(或非常相似的结果)，以便我能够理解进入这个过程的所有“黑匣子”参数。heatplot使用平均链接和相关距离，因此我们可以将其输入heatmap.2以确保使用类
浏览 2提问于2013-07-29得票数 30
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如何在飞行中索引附近的3D点？
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NxN，它描述了是否应该计算每一行和列粒子之间的交互作用，其中：b.如果任何一对点位于一个以上的瓷砖中，则只将其标记为在布尔数组中计算最多一个瓷砖(不重复)，
更新步骤:如果点的位置变化很小(远小于d)，请以最快的方式更新瓷砖列表此外，保持一个完整的(四叉树或类似的)指数的所有粒子位置可能
浏览 4提问于2021-11-18得票数 1
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在人工智能和机器学习方面，监督学习和无监督学习有什么区别？你能用一个例子提供一个基本的，简单的解释吗？
浏览 10提问于2009-12-02得票数 290
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我一直在研究数据科学课程，并且已经被一门适当的数据科学课程所包含的大量学科所淹没了。仅举几个例子:自然语言处理、机器学习、R、Python、SQL、NoSQL、概率、统计、数值方法、算法和列表。
浏览 0提问于2015-08-29得票数 6
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等簇大小K-均值算法变异
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我正在寻找最快的算法，根据距离将地图上的点分组成大小相等的组。看起来很直截了当，很有希望，但并没有产生同样规模的团队。
浏览 30提问于2011-03-27得票数 58
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在，有人试图做类似的事情
是一个看起来几乎实现了这一点的程序，但是我不想删除副本，我想要将最高质量的副本复制到目标文件夹中。
浏览 8提问于2020-05-02得票数 7
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希望有人能为如何计算一串散列的成对汉明距离提供指导，然后对它们进行聚类。我不在乎表现，而是从我正在做的事情和我想做的事情来看，不管是什么，它都是缓慢的，而不是反复重复的事情。对成对距离进行聚类，使类似的图像可以一起查看，以辅助手动清理。我需要指导的是如何完成以下工作：
对于每个图像比较，只保留最相似的hamming距离。将结果输入到枕叶分层聚
浏览 1提问于2016-04-09得票数 0
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如何实现数据可视化？
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数据可视化， 特别是基于Web的数据可视化的时代已经到来了。类似JavaScript的可视化库如D3.js, Raphaël, 以及Paper.js, 以及最新浏览器所支持的如Canvas和SVG， 以及使得那些过去只能由计算机专家和专业设计人员开发的复杂的可视化变得越来越简单了。
浏览 3349提问于2018-10-24
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我试过这个代码：image = cv2.imread("sample.jpg")print pixel
浏览 0提问于2017-03-30得票数 54
我将war部署在22-1-2012 (带有一些打印消息)，它正常工作，第二天，我做了一些更改，删除了一些消息，并重新部署了file...In我的webapps文件夹，它显示了我的war文件“最后一次修改对相同项目的JSP页面的任何更改都会得到反映，但servlet类不变
在尝试了这么多之后，我刚才在部署WAR文件时观察到，WAR中不包括非just类文件，当我
浏览 11提问于2012-01-24得票数 8
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