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肿瘤外显子测序后的突变与否矩阵也可以模仿转录组的表达量矩阵分析吗

在实际应用中,表达量矩阵可能会包含成千上万的基因和样本,并且数据通常存储在文件中,如CSV、TXT或专用的生物信息学文件格式。...可以使用一个简单的r代码,作为非常简单的表达量矩阵示例,它包含了5个基因在3个样本中的表达量数据。这个矩阵可以用作差异表达分析或其他类型的基因表达分析的基础。...不过,绝大部分情况下,我们是直接下载网络的表达量矩阵,或者读取自己的txt或者csv文件啦,不需要上面的每个基因在每个样品的手动创建!...在实际应用中,突变矩阵可能包含更多的样本和基因位点,并且数据通常来源于生物信息学分析流程,如变异检测工具(如GATK、MuTect等)的输出。...肿瘤外显子测序后的突变与否矩阵也可以差异分析吗 大部分情况下, 大家都会从公司那边拿到了,肿瘤外显子测序后的突变与否信息,可能是MAF和VCF格式。

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米老鼠版权到期,可以用在我的游戏里吗?

[i] 如今著作权到期,是否意味着米老鼠从此成为所有人共享的财富,可以任意发掘和使用呢?...法律赋予著作权人在一定期限内对自己创造的智慧成果(即“作品”)的控制权,使得著作权人可以获得相应的报酬与奖励;同时又规定在一定期限届满后,相应的作品将进入公有领域,成为社会共有的财富,人们可以在这些作品的基础上自由地进行进一步创作...(我国著作权法有关作品保护期的规定总结) 二、著作权到期的作品是否可以被任意使用?...信息网络传播权,即以有线或者无线方式向公众提供,使公众可以在其选定的时间和地点获得作品的权利; 10. 摄制权,即以摄制视听作品的方法将作品固定在载体上的权利; 11....例如,在著作权法的范围内,游戏公司可以在不经迪士尼公司许可的情况下,自由制作以公域米老鼠为外观的游戏角色皮肤并发布在游戏中;电影公司可以在不经迪士尼公司许可的情况下,使用公域米老鼠制作动画电影。

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    我也是可以开发安卓蓝牙应用的男人了

    手机端大家通常会用LightBlue或者Nordic的nRF Connect软件做测试,但是作为干嵌入式的攻城狮,我相信肯定有不少人会有兴趣想自己弄一个可以修改的软件,难不成今天要介绍安卓编程了吗?...不,因为我不会!我觉得也没必要专门为了这个去学安卓,毕竟我们也不是专门从事安卓开发的。...如果手机通过USB连接电脑的话,点击运行,手机端就会提示你安装应用程序。当然也可以把编译后生成的apk放到手机里安装,编译生成的apk在如下目录: ?...,我把他的公众号原文也放到这里:Qt编程实例:基于Android的BLE通信软件,文中有代码的解释,感谢小哈哥的分享,让我很快实现了自己的想法。...为了证明我也干了一点事情,我实际上做了几处小小的改动: 1. 修改UUID。因为原作者用的蓝牙模块和我不一样,不改动是没法正常使用的。

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    Mac可以读取FAT32的u盘吗 Mac电脑能识别什么格式的u盘

    下面我们来看看Mac可以读取FAT32的u盘吗,Mac电脑能识别什么格式的u盘的相关内容。一、Mac可以读取FAT32的u盘吗 在Mac电脑和其他操作系统之间进行文件传输是日常工作中的常见需求。...1.为什么Mac可以读取FAT32格式的U盘1.1FAT32格式的通用性图1:FAT32FAT32是一种通用的文件系统格式,适用于各种设备和操作系统。...这种格式不仅在Windows系统上广泛使用,也可以在Mac上进行完全兼容的读取和写入操作。...因此,当您将FAT32格式的U盘连接到Mac电脑时,系统可以轻松识别并进行读取操作。1.3跨平台交互性许多用户需要在不同操作系统之间共享文件。...2.注意事项虽然Mac可以读取FAT32格式的U盘,但也有一些需要注意的事项:图3:U盘2.1文件大小限制FAT32格式有文件大小限制,单个文件最大可达4GB。

    61010

    【玩转 EdgeOne】我的个人酷炫3D博客可以用EO加速吗?

    如下图: 图片 2.原理分析 在没有应用 CDN 时,我们使用域名访问某一个站点时的路径为: 用户提交域名→浏览器对域名进行解释→DNS 解析得到目的主机的IP地址→根据IP地址访问发出请求→得到请求数据并回复...应用 CDN 后,DNS 返回的不再是 IP 地址,而是一个 CNAME (Canonical Name) 别名记录,指向 CDN 的全局负载均衡 CNAME 实际上在域名解析的过程中承担了中间人(或者说代理...配置缓存策略的操作方法,请参见缓存配置。 4.什么样的网站适合用 CDN? 我有一个微信小程序,可以用 CDN 加速吗? 我有一个分享图片的个人摄影作品网站,可以用 CDN 加速吗??...我有一个...... 可以用 CDN 加速吗??? 想要知道一个网站或者 APP 或者小程序能不能用 CDN 加速? 首先,要明白我们网站内容是什么类型。...5.下一步后会推荐你一些配置,需要根据自己的情况进行配置,我是加速博客所以选择了第一个。

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    你在网上的信息属于你吗?再想想,他们可以读取你的密码,旅行计划、想法和一切

    收到许多用户的犀利吐槽后,印象笔记撤回了这项隐私政策,规定只有当用户选择性加入他们为平台创建的新服务时才会读取用户内容。 实际上,他们总是能够读取用户内容。...几乎互联网上的每项服务都可以做到这一点,以前可以,以后也会这么做。大多数服务的商业模式,如脸书、推特和谷歌,都依赖于读取用户内容,因此他们的服务条款明确允许他们这么做。...Web服务和应用程序行业是如何做到随意访问用户内容,而几乎无需承担任何后果或责任呢? 应用程序架构的内置功能 Web应用程序的设计是为了每时每刻读取用户内容。...这种威胁出自上文提及的公司的许多高管之口,因为他们的业务生计取决于用户是否关心隐私。 软件开发也是世代相传的 现今,大多数学习开发应用程序的开发人员针对Web服务(而不是桌面应用程序)也是这么做的。...我父亲那一代用大型机编码,我以前在个人电脑上编码,现在我儿子在网上编码。

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    味觉可以被识别吗?脑机接口在味觉感知中的新应用

    利用计算机辅助软件应用程序,以提高记录ERP的时间精确性,同时应减少所有可能的噪声源以获得高质量数据。...三种神经信号监测方法的采集过程和典型的信号输出形式 EEG、fMRI和MEG信号处理步骤 3 BCI技术在味觉识别中的应用 当这些BCI技术应用于实际味觉识别时,有研究结果表明,当顾客在不知道自己喝的咖啡是什么牌子时...除了fMRI,MEG也被广泛应用于评价年龄以及性别差异导致的味觉感知能力差异,研究结果表明,年龄的增长会增加触觉反应,减少味觉反应。...BCI传感技术的应用过程。...BCI技术还能将感官分析扩展到婴儿领域,可以促进婴儿食品的精准开发,另外在健康食品的研发,食品口感改善方面都提供了一种高效的手段,甚至对食品影响大脑情感体验提供了参考,这或许可以扩展味觉刺激治疗在临床的应用

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    iScience|不确定性量化问题:我们可以相信AI在药物发现中的应用吗?

    评估UQ方法的质量比较困难,因为这与应用场景和用户的目标相关。但总的来说,UQ方法的排名和校准能力是被关注最多的两个方面。排名能力旨在表征不确定性与误差之间的相关性。...本文将回顾UQ在当前药物设计和发现范式中的概念、方法和应用,更加关注UQ的具体应用案例,并解释所用方法的基本原理,希望能为在药物设计中部署可信的AI模型提供见解和实践指导。...为了增加化学多样性,他们采用了混合AL查询策略,该策略结合了预测的对接分数和不确定性,以指导迭代过程中的样本选择,这是UQ在AL应用中的独特方法。...Han等人最近提出了GNN-SNGP,通过将高斯过程和光谱归一化应用于模型架构,可以减少过度自信的错误预测。...对于不同的下游任务和任务场景,最合适的UQ方法并不一致。许多UQ方法并不容易使用,但需要针对每个应用程序场景进行定制。

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    我的机器学习线性代数篇观点向量矩阵行列式矩阵的初等变换向量组线性方程组特征值和特征向量几个特殊矩阵QR 分解(正交三角分解)奇异值分解向量的导数

    image.png 正交向量:内积为零 应用 向量组和特征向量 矩阵 定义:描述线性代数中线性关系的参数,即矩阵是一个线性变换, 可以将一些向量转换为另一些向量。...通常用到的行列式是一个数 行列式是数学的一个函数,可以看作在几何空间中,一个线性变换 对“面积”或“体积”的影响。...如果A不存在逆矩阵,那么A称为奇异矩阵。A的逆矩阵记作:A-1 ? image.png 矩阵的初等变换 矩阵的初等列变换与初等行变换统称为初等 变换. ?...image.png 奇异值分解 可以看作是对称方阵在任意矩阵上的推广。 ?...image.png 后记: 才疏学浅,慢慢学习,慢慢更新,与诸君共勉 你可能感冒的文章: 我的机器学习numpy篇 我的机器学习matplotlib篇 我的机器学习微积分篇

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    你觉得你的web应用只可以响应得更快一点吗——让上传速度加快10倍!

    (轻松的意思是指“我知道这该怎么做”,而不必是“这是小菜一蹀”)。...还是说它可能只是一个高度隐藏的潜在问题?那么网络分发内容(CDN)这篇文章可以是你需要的。 web应用一般不会因为用户设备而运行慢,因为几乎所有设备都可以运行能够提供相当好体验的浏览器。 ?...举个例子,在我们上传文件之前,你可以通过这行命令来压缩数据: `**var** compressed_file = pako.deflate(input_file);` 这不是很简单吗?...(在这个点上我应该向你展示一个关于时间和文件大小的对比图表,但是后来我觉得也许让你自己去实践获得的对比效果会更好) 你只需要传一个level选项就可以改变pako的压缩档次,就像下面语句: `**var...在最后我从网上随机地抽取一些人。 为什么你不去实践一下 我准备了一个很小的demo应用 来让你决定是否能在你的项目中使用。

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    python转置矩阵代码_python 矩阵转置

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 用python怎么实现矩阵的转置 只能用循环自己写算法吗 自带函数有可以算的吗 或者网上的算法可以用的 python矩阵转置怎么做?...讨论: 你需要确保该数组的行列数都是相同的.比如: arr = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7,8, 9], [10, 11, 12]] 列表递推式提供了一个简便的矩阵转置的方法:...’,’第几个sheet’, header = False) #读取文件 比如 df = pd.read_excel(‘C:/your_data.xlsx’,0, header = False) df_T...= df.T #获得矩阵的转置 df_T.to_excel(‘要 matlab里如何实现N行一列的矩阵变换成一行N列的矩阵 就是说A=1 2 3 4 如何使用函数将A变成 B=1 2 3 4 5 有两种方法可以实现...: 转置矩阵: B = A’; 通用方法:reshape()函数 示例如下: 说明:reshape(A,m,n) 表示将矩阵A变换为m行n列的矩阵,通常用于矩阵形状的改变,例如下面代码将原来的1行4列矩阵转换为

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    为什么我打开一些网站会提示:将此站点作为应用安装,我的网站要怎么样才可以和他一样

    要使您的网站在用户访问时出现“将此站点作为应用安装”的提示,您需要为网站添加一个名为“manifest.json”的文件。这个文件包含了网站的基本信息,如名称、图标等。...接下来,您需要在网站的HTML文件中的标签内添加以下代码,以引用manifest.json文件: 完成以上步骤后,当用户访问您的网站时,他们的浏览器将显示“将此站点作为应用安装”的提示。...如果提示没有出现,可以尝试以下方法进行排查: 确保manifest.json文件正确放置在网站根目录中。 确保HTML文件的标签内正确引用了manifest.json文件。 清除浏览器缓存并刷新网页。...有时浏览器会缓存旧的网页内容,导致更新不及时。 使用浏览器的开发者工具检查是否有错误。在Chrome浏览器中,可以按F12打开开发者工具,然后点击“应用”选项卡,查看“清单”部分是否有错误提示。...如果问题仍然存在,请提供更多关于您的网站的详细信息,例如使用的框架、浏览器类型等。这将有助于我为您提供更具体的解决方案。

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    从零开始一起学习SLAM | 为啥需要李群与李代数?

    这样我们就可以通过对李代数求导来间接的对变换矩阵求导了。 小白:原来如此啊!不过刚才说了那么多概念,都是什么意思啊? 李群怎么理解? 师兄:不急,我一个个说。我先说说李群吧,额,不,先说说群吧。...对了,比如旋转矩阵和乘法就构成了旋转矩阵群,变换矩阵和乘法也构成了变换矩阵群。对了,你说,旋转矩阵和加法能构成群吗? 小白:额。。刚才好像说不行吧? 师兄:嗯,不行的 ,他们不满足封闭性。...如果你一般旋转一边移动它,也是连续的或者说光滑的运动,所以变换矩阵群SE(3)也是李群。 李代数是李群的亲戚吗? 小白:嗯,师兄,那李代数呢,它和李群都姓李,他们什么关系?...师兄:可以这么理解,你可以去看一下十四讲中65-66页那部分的推导,我们只关注两个结论就行了 第一个结论: 看下面的公式,我们发现旋转矩阵的微分是一个反对称(也叫斜对称)矩阵左乘它本身,也印证了我前面说的...,qx,qy,qz,qw 是四元数表示的旋转部分,请完成数据读取部分的代码,绘制部分代码已经给出。

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    机器学习应该准备哪些数学预备知识?

    一样,我也走过并继续在走很多弯路,就说说我的感受吧,大家一起探讨探讨。 1 理解矩阵变换 矩阵变换简单的说就是x->Ax,A矩阵把原空间上的向量x映射到了Ax的位置,看似简单实在是奥妙无穷。...1.1 A可以是由一组单位正交基组成,那么该矩阵变换就是基变换,简单理解就是旋转坐标轴的变换,PCA就是找了一组特殊位置的单位正交基,本质上就是基变换。...1.2 A可以是某些矩阵,它们在某些特殊的方向上只对x做了收缩拉伸变换而没有改变方向,简单来说就是,这些特殊的方向x就是特征向量,而就是收缩拉伸的量,描述了这些特殊的方向上的变换后,其实我们很容易画出这种矩阵变换的几何图解...对称矩阵特征分解可以直截了当的导出矩阵对角化的公式,而对协方差矩阵的对角化又是PCA的核心数学知识 理解PCA的数学基础:协方差矩阵对角化,基变换矩阵。...问题二, 你有发现解方程时对矩阵的操作,与消元法解方程的对应关系吗? 你有发现行列式的定义和性质,与消元法解方程的对应关系吗? 你有发现求逆矩阵与消元法解方程的对应关系吗?

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    从GPU的内存访问视角对比NHWC和NCHW

    NHWC和NCHW之间的选择会影响内存访问、计算效率吗?本文将从模型性能和硬件利用率来尝试说明这个问题。...卷积作为GEMM GEneral Matrix to Matrix Multiplication (通用矩阵的矩阵乘法) 卷积可以使用基于变换的方法来实现,如快速傅立叶变换,它将卷积转换为频域的元素乘法...每个接受域按列堆叠,得到特征映射变换矩阵。同时还将滤波器矩阵逐行平摊和叠加,形成滤波器变换矩阵。滤波变换和特征映射变换矩阵经过矩阵乘法运算,形成扁平化的输出矩阵。...这里的变换矩阵是一个中间矩阵,只是数值重排,与频域变换没有关系。...例如,如果我们的输入特征是128 x 128 x 32。无论使用1x1还是3x3内核,我们都可以读取位置(1,1)的所有通道。

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    OpenGL矩阵变换的数学推导

    说起OpenGL的矩阵变换,我是之前在我们的项目天天P图、布丁相机中开发3D效果时才比较深入地研究了其中的原理,当时一开始时,也只是知道怎么去用这些矩阵,却不知道这些矩阵是怎么得来的,当出现一些莫名其妙的问题时...什么是OpenGL的矩阵变换 我们先来看一张经典图: [g19314w146.jpeg] 这张图相信很多同学在学习OpenGL的过程中都看到过,它比较直观地展示了OpenGL矩阵变换的过程,下面我详解一下其中的含义...还没有,大家可以想像一下,我把一个东西放在世界坐标系的某个地方,我可以从近处看观察它,也可以从远处观察它,还可以从上下左右观察它,甚至还可以倒着观察它,因些还需要确定我们观察它的状态。...: [jnld1f89l0.jpeg] 完成投影变换就需要靠投影矩阵,即图中的PROJECTION MATRIX 我看可以从图中看到经过投影变换后就到了裁剪坐标系CLIP SPACE,什么?...这里强调一个细节,投影矩阵仅帮我们完成投影变换,不会归一化,上面的x2、y2、z2指的是投影后归一化前的值,还记得前面计算的xn和yn吗?

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    OpenGL矩阵变换的数学推导

    说起OpenGL的矩阵变换,我是之前在我们的项目天天P图、布丁相机中开发3D效果时才比较深入地研究了其中的原理,一直想写这篇文章,由于很忙(lǎn),拖了很久,再不写我自己也要忘了。...什么是OpenGL的矩阵变换 我们先来看一张经典图: 这张图相信很多同学在学习OpenGL的过程中都看到过,它比较直观地展示了OpenGL矩阵变换的过程,下面我详解一下其中的含义: 首先OpenGL有个世界坐标系...还没有,大家可以想像一下,我把一个东西放在世界坐标系的某个地方,我可以从近处看观察它,也可以从远处观察它,还可以从上下左右观察它,甚至还可以倒着观察它,因些还需要确定我们观察它的状态。...就要靠投影变换,OpenGL提供正交投影和透视投影,正交投影没有近大远小的效果,不管在什么距离上看,都一样大,透视投影则有近大远小的效果,也是符合我们实际生活的一种效果,透视投影应用得比较多,可看下面这张经典图...Matrix)的数学推导,可以看到里面的变换还是很精彩的,原来神秘的矩阵变换过程已经清晰可见,希望能对大家有帮助!

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    【转载】理解矩阵(三)

    现在到了关键的一步。看上去矩阵就是由一组向量组成的,而且如果矩阵非奇异的话(我说了,只考虑这种情况),那么组成这个矩阵的那一组向量也就是线性无关的了,也就可以成为度量线性空间的一个坐标系。...结论:矩阵描述了一个坐标系。 “慢着!”,你嚷嚷起来了,“你这个骗子!你不是说过,矩阵就是运动吗?怎么这会矩阵又是坐标系了?” 嗯,所以我说到了关键的一步。...我并没有骗人,之所以矩阵又是运动,又是坐标系,那是因为—— “运动等价于坐标系变换”。 对不起,这话其实不准确,我只是想让你印象深刻。准确的说法是: “对象的变换等价于坐标系的变换”。...我刚才说,“固定坐标系下一个对象的变换等价于固定对象所处的坐标系变换”,那个“固定对象”我们找到了,就是那个向量。但是坐标系的变换呢?我怎么没看见?...换句话说,你不是有一个坐标系M吗,现在我让它乘以个\(M^{-1}\),变成\(I\),这样一来的话,原来M坐标系中的a在\(I\)中一量,就得到b了。

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    十二.图像几何变换之图像仿射变换、图像透视变换和图像校正

    图像分类、目标检测应用。...通常图像的旋转加上拉升就是图像仿射变换,仿射变换需要一个M矩阵实现,但是由于仿射变换比较复杂,很难找到这个M矩阵....OpenCV提供了根据变换前后三个点的对应关系来自动求解M的函数——cv2.getAffineTransform(pos1,pos2),其中pos1和pos2表示变换前后的对应位置关系,输出的结果为仿射矩阵...)构造矩阵M,其中pos1和pos2分别表示变换前后的4个点对应位置。...十年啊,近700篇文章,确实可以说一句:这就是我20到30岁的青春,这里既有技术博客,也有娜璋珞一家的故事,我们的爱情史,也见证了一个自幼受贵州大山熏陶的学子慢慢成长,让我认识了许许多多的博友。

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