首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

我如何使用Dask在这个“嵌套”的结构化数组上运行计算?

Dask是一个用于并行计算的灵活、开源的Python库。它提供了一种简单且高效的方式来处理大型数据集,尤其适用于嵌套的结构化数组。

在使用Dask在嵌套的结构化数组上运行计算时,可以按照以下步骤进行操作:

  1. 导入Dask库:首先,需要在Python脚本中导入Dask库,可以使用以下代码实现:import dask import dask.array as da
  2. 创建Dask数组:使用Dask的da.from_array()函数,可以将嵌套的结构化数组转换为Dask数组。该函数接受原始数组、块大小和元数据作为参数,返回一个Dask数组对象。例如:nested_array = ... # 嵌套的结构化数组 dask_array = da.from_array(nested_array, chunks=(1000, 1000))
  3. 执行计算操作:使用Dask数组对象,可以执行各种计算操作,例如求和、平均值、最大值等。这些计算操作将被自动分解为一系列小任务,并在需要时进行并行执行。例如:result = dask_array.sum() # 计算数组的总和
  4. 触发计算:Dask的计算是惰性的,意味着在执行计算操作之前,不会立即执行任何计算。为了触发计算并获取结果,可以使用compute()函数。例如:result.compute() # 触发计算并获取结果
页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

安利一个Python大数据分析神器!

官方:https://dask.org/ Dask支持PandasDataFrame和NumpyArray数据结构,并且既可在本地计算机上运行,也可以扩展到集群运行。...基本,只要编写一次代码,使用普通Pythonic语法,就可在本地运行或部署到多节点集群。这本身就是一个很牛逼功能了,但这还不是最牛逼。...觉得Dask最牛逼功能是:它兼容大部分我们已经在用工具,并且只需改动少量代码,就可以利用自己笔记本电脑已有的处理能力并行运行代码。...这些集合类型中每一个都能够使用在RAM和硬盘之间分区数据,以及分布群集中多个节点数据。...Dask使用是非常清晰,如果你使用NumPy数组,就从Dask数组开始,如果你使用Pandas DataFrame,就从Dask DataFrame开始,依此类推。

1.6K20

如何在Python中用Dask实现Numpy并行运算?

Dask数组通过分块实现并行化,这样可以多核CPU甚至多台机器同时进行计算。 创建Dask数组 可以使用dask.array模块创建与Numpy数组相似的Dask数组。...Dask会将这个数组分为多个1000x1000小块,并将每块操作任务加入到任务图中,最后通过并行执行来计算总和。...使用多线程或多进程 Dask可以选择多线程或多进程模式下运行。对于I/O密集型任务,多线程模式可能效果更佳;而对于计算密集型任务,使用多进程模式能够更好地利用多核CPU。...Dask分布式计算能力 除了本地并行计算Dask还支持分布式计算,可以多台机器并行执行任务。通过Daskdistributed模块,可以轻松搭建分布式集群,处理海量数据。...这对于需要处理超大数据集应用场景非常有用,如大数据分析、深度学习和科学模拟等。 总结 通过本文介绍,学习了如何使用Dask来扩展Numpy并行计算能力。

5510
  • 什么是Python中Dask,它如何帮助你进行数据分析?

    可扩展性 Dask如此受欢迎原因是它使Python中分析具有可扩展性。 这个工具神奇之处在于它只需要最少代码更改。该工具具有1000多个核弹性集群运行!...此外,您可以处理数据同时并行运行此代码,这将简化为更少执行时间和等待时间! ? 该工具完全能够将复杂计算计算调度、构建甚至优化为图形。...这就是为什么运行在10tb公司可以选择这个工具作为首选原因。 Dask还允许您为数据数组构建管道,稍后可以将其传输到相关计算资源。...本例中,您已经将数据放入了Dask版本中,您可以利用Dask提供分发特性来运行使用pandas类似的功能。...熟悉API:这个工具不仅允许开发人员通过最小代码重写来扩展工作流,而且还可以很好地与这些工具甚至它们API集成。 向外扩展集群:Dask计算如何分解大型计算并有效地将它们路由到分布式硬件

    2.8K20

    猫头虎 分享:Python库 Dask 简介、安装、用法详解入门教程

    最近有粉丝问我:“猫哥,当我处理大量数据时,Python pandas 性能瓶颈让头疼,能推荐个好用并行处理工具吗?” 今天猫头虎就来聊聊如何Dask 高效解决问题。...Dask 简介与优势 Dask 是一个灵活并且易于使用 并行计算库,可以小规模计算机上进行大规模数据处理。它核心组件包括: Dask Arrays:与 NumPy 类似,但支持计算超大数组。...如何使用 Dask 处理数据:核心用法 接下来猫哥带大家看看 Dask 核心功能如何帮助我们更快处理数据。...3.2 使用 Dask Array 替代 NumPy Dask Arrays 提供了类似于 NumPy 操作界面,但能够处理远超内存容量超大数组。...常见问题解答 (QA) Q1: 猫哥, Dask 任务运行很慢,怎么办? A: 首先检查是否适当地设置了 chunks 大小,以及是否有过多小任务。

    18110

    【Python 数据科学】Dask.array:并行计算利器

    为了处理超大型数据集,我们可以使用Dask.distributed来搭建一个分布式集群,并使用Dask.array分布式集群执行计算。...)) # 使用分布式集群客户端执行计算 result = arr * 2 result = result.compute() 在这个例子中,我们使用Dask.array分布式集群执行计算,从而实现了并行计算...8.2 使用原地操作 Dask.array中,原地操作是一种可以提高性能技巧。原地操作指的是进行数组计算时,将计算结果直接存储原始数组中,而不创建新数组。...总结与展望 本文中,我们深入探讨了Dask.array功能与用法,以及如何利用Dask.array进行大规模数据集并行计算。...同时,我们还介绍了如何使用Dask.distributed来搭建分布式集群,并在分布式集群执行计算,以处理更大规模数据集。

    94550

    NVIDIApython-GPU算法生态 ︱ RAPIDS 0.10

    John Zedlewski: ---- 记得以前每天要 花好几个小时等待大型集群机器学习工作批量完成,所以每次看到台式机能够几秒钟内完成如此大型工作都很高兴!...Dask DaskHPC和Kubernetes系统实现了标准化部署,包括支持与客户端分开运行调度程序,从而使用户可以本地笔记本计算机上轻松地启动远程集群计算。...图1:cuGraph PageRank不同数量边缘和NVIDIA Tesla V 100上计算所用时间 下图仅查看Bigdata数据集、5000万个顶点和19.8亿条边,并运行HiBench端到端测试...RAPIDS社区 用户对生态贡献是最大。BlazingSQL刚刚发布了V0.4.5,该版本GPU运行速度更快,并且加入了新基准测试。...如何在GPU实例使用RAPIDS加速库 关于如何在阿里云GPU实例基于NGC环境使用RAPIDS加速库,请参考文档:《GPU实例使用RAPIDS加速机器学习任务》。

    2.9K31

    1000+倍!超强Python『向量化』数据处理提速攻略

    当然有可能 ,关键在于你如何操作! 如果在数据使用for循环,则完成所需时间将与数据大小成比例。但是还有另一种方法可以很短时间内得到相同结果,那就是向量化。...如果我们Series添加了.values ,它作用是返回一个NumPy数组,里面是级数中数据。...你可以使用.map()向量化方法中执行相同操作。 3、日期 有时你可能需要做一些日期计算(确保你列已经转换为datetime对象)。这是一个计算周数函数。...为了解决这个问题,我们对Pandas中一个series使用.shift()将前一行移到相同级别。一旦它们被转移到相同级别,就可以使用np.select()执行相同条件向量化方法了!...DaskPandas API中工作一个不错选择。能够跨集群扩展到TB级数据,或者甚至能够更有效地一台机器处理多核数据。 6 总结 向量化可以极大地加快速度!

    6.7K41

    (数据科学学习手札150)基于dask对geopandas进行并行加速

    今天文章中,将为大家简要介绍如何基于dask对geopandas进一步提速,从而更从容应对更大规模GIS分析计算任务。...2 dask-geopandas使用   很多朋友应该听说过dask,它是Python生态里非常知名高性能计算框架,可以针对大型数组、数据框及机器学习模型进行并行计算调度优化,而dask-geopandas...就是由geopandas团队研发,基于dask对GeoDataFrame进行并行计算优化框架,本质是对dask和geopandas封装整合。...,我们来比较一下其与原生geopandas常见GIS计算任务下性能表现,可以看到,与geopandas计算比较中,dask-geopandas取得了约3倍计算性能提升,且这种提升幅度会随着数据集规模增加而愈发明显...,因为dask可以很好处理内存紧张时计算优化:   当然,这并不代表我们可以在任何场景下用dask-geopandas代替geopandas,常规中小型数据集dask-geopandas反而要慢一些

    1.1K30

    Python大规模数据处理与分析中应用:全面解析与实战示例

    持续优化:利用分布式计算除了单个计算机上处理大规模数据外,Python还可以利用分布式计算框架,如Apache Spark,来处理更大规模数据集。...下面是一个简单示例,展示了如何使用PySpark进行大规模数据处理。...()通过使用PySpark,我们可以轻松地处理分布多个节点大规模数据集,充分利用集群计算资源,加快数据处理和分析速度。...随后,我们通过具体代码示例展示了如何处理不同类型大规模数据,包括结构化数据、文本数据和图像数据,并使用Python进行统计分析、情感分析和图像分类等任务。...最后,我们还介绍了如何利用分布式计算框架,如PySpark,来处理更大规模数据集。

    28120

    NumPy 1.26 中文官方指南(三)

    例如:Dask 数组 Dask 是 Python 中用于并行计算灵活库。Dask Array 使用分块算法实现了 NumPy ndarray 接口子集,将大数组切分成许多小数组。...但其他库,如PyTorch和CuPy,可以使用这个协议 GPU 上交换数据。 数组接口协议 数组接口协议定义了类似数组对象重复使用对方数据缓冲区方式。...例:Dask 数组 Dask 是 Python 中用于并行计算灵活库。Dask 数组使用分块算法实现了 NumPy ndarray 接口子集,将大数组切割成许多小数组。...这允许使用多个核心对大于内存数组进行计算Dask 支持__array__()和__array_ufunc__。...示例:Dask 数组 Dask 是 Python 中用于并行计算灵活库。Dask Array 使用分块算法实现了 NumPy ndarray 接口子集,将大数组切分为许多小数组

    34710

    为什么说 Python 是数据科学发动机(二)工具篇(附视频中字)

    这个命名为py2.7,这表明需要Python版本。一旦激活该环境,你将有一个全新可执行Python,以及全新一组核心包可执行。 常常使用计算机上大概有70或80个类似项目。...如果在大型数据数组编写循环,存在更快方法来实现代码。 标注数据 我们说过了pandas是如何开创了PyData时代,pandas库基本Python实现了数据框和关系运算符。 ?...Dask所做是,能够让你做相同事情,但不需进行实际计算。保存了定义计算任务图。当你将数组乘以4时,它会保存起来构建出类似这样图。...因此底部我们得到数据和数组五个不同核心 我们将数据乘以4,取当中最小值。当然最小值中最小值,即为最小Dask知道这些操作和聚合关联性,最后你得到该任务图,但没有进行任何计算。...然后你可以把任务图转换成任何内容,可能是你计算机上多个内核,可能是簇多个机器,可能亚马逊云或者Azure云内容,最后你可以进行计算。 在数据科学领域使用Dask可以实现很多有趣内容。

    1.4K100

    让python快到飞起 | 什么是 DASK

    Dask 由两部分组成: 用于并行列表、数组和 DataFrame API 集合,可原生扩展 Numpy 、NumPy 、Pandas 和 scikit-learn ,以大于内存环境或分布式环境中运行...Dask 集合是底层库并行集合(例如,Dask 数组由 Numpy 数组组成)并运行在任务调度程序之上。...对于可并行但不适合 Dask 数组或 DataFrame 等高级抽象问题,有一个“延迟”函数使用 Python 装饰器修改函数,以便它们延迟运行。...| BlazingSQL BlazingSQL 是一个 GPU 运行速度超快分布式 SQL 引擎,也是基于 Dask-cuDF 构建。...开发交互式算法开发者希望快速执行,以便对输入和变量进行修补。在运行大型数据集时,内存有限台式机和笔记本电脑可能会让人感到沮丧。Dask 功能开箱即用,即使单个 CPU 也可以提高处理效率。

    3.3K122

    有比Pandas 更好替代吗?对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

    为了验证这个问题,让我们中等大小数据集探索一些替代方法,看看我们是否可以从中受益,或者咱们来确认只使用Pandas就可以了。...即使单台PC,也可以利用多个处理核心来加快计算速度。 Dask处理数据框模块方式通常称为DataFrame。...Dask对排序几乎没有支持。甚至官方指导都说要运行并行计算,然后将计算结果(以及更小结果)传递给Pandas。 即使尝试计算read_csv结果,Dask测试数据集也要慢30%左右。...但在相对较小数据使用Spark不会产生理想速度提高。 Vaex 到目前为止,我们已经看到了将工作分散更多计算机核心之间以及群集中通常有许多计算机之间平台。...还尝试过单个内核(julia)和4个处理器内核(julia-4)运行Julia。 ? 通过将环境变量JULIA_NUM_THREADS设置为要使用内核数,可以运行具有更多内核julia。

    4.7K10

    你每天使用NumPy登上了Nature!

    这样可以生成简洁代码,使用户可以将精力集中分析,而NumPy则以近乎最佳方式处理数组元素循环。例如,考虑到最大程度地利用计算快速缓存。...数组扩展和互操作性 NumPyCPU提供内存中多维、同构类型(即单指针和步幅)数组。它运行在从嵌入式设备到世界最大超级计算机器,性能接近编译语言。...PyTorch [38],Tensorflow [39],Apache MXNet [40],JAX 数组都具有以分布式方式CPU和GPU运行能力,并使用惰性评估来进行其他性能优化。...由于有了这些发展,用户现在可以使用Dask计算从一台机器扩展到分布式系统。协议组合也很好,允许用户通过嵌入Dask数组CuPy数组分布式多GPU系统大规模重新部署NumPy代码。...在此示例中,Dask数组上调用了NumPymean函数。调用通过分派到适当库实现(本例中为Dask),并产生一个新Dask数组。将此代码与图1g中示例代码进行比较。

    3.1K20

    更快更强!四种Python并行库批量处理nc数据

    前言 当前镜像:气象分析3.9 资源:4核16g 注意分开运行,不然会爆内存 阅读本文你将学到: 远超循环批量处理nc文件效率技巧 四种并行库基本使用与区别 wrf变量极值经纬度索引 Dask...它提供了高级数据结构,如分布式数组Dask Array)和数据帧(Dask DataFrame),使得用户能够分布式内存中处理数据,就像操作常规NumPy数组或Pandas DataFrame一样...Dask能够自动将计算任务分解成小块并在多核CPU或分布式计算集群执行,非常适合处理超出单机内存限制数据集。Dask还提供了一个分布式任务调度器,可以管理计算资源,优化任务执行顺序。...四种Python并行库批量处理nc数据 运行Fork查看 若没有成功加载可视化图,点击运行可以查看 ps:隐藏代码【代码已被隐藏】所在行,点击所在行,可以看到该行最右角,会出现个三角形,点击查看即可...小结 以上测试均为七次循环求平均 获胜者为joblib 当然只是这里任务比较特别,要是涉及到纯大型数组计算可能还是dask更胜一筹 简单说一下,当资源为2核8g或者数据量较小时,并行可能并无优势,可能调度完时循环已经跑完了

    47310

    使用Wordbatch对Python分布式AI后端进行基准测试

    对于AI而言,对并行性需求不仅适用于单个工作站或计算节点,而且适用于编排分布可能数千个计算节点AI处理流水线。...基准测试1.单个节点分发Scikit-Learn HashingVectorizer 对于单个节点并行化HashingVectorizer简单任务,与运行单个串行进程相比,所有并行框架都获得了大致线性加速...实际应用程序将涉及大型集群更复杂管道,但这会使直接比较变得复杂,原因在于:配置调度程序选择,关于如何实现共享数据设计决策以及诸如演员之类远程类,以及如何使用GPU和其他非CPU处理器。...与Dask不同,它可以很好地序列化嵌套Python对象依赖项,并有效地进程之间共享数据,线性地扩展复杂管道。...通过GitHub创建一个帐户,为apache / spark开发做出贡献。 dask / dask https://github.com/dask/dask 具有任务调度并行计算

    1.6K30

    NumPy 高级教程——并行计算

    Python NumPy 高级教程:并行计算 并行计算多个处理单元同时执行计算任务方法,以提高程序性能。 NumPy 中,可以使用一些工具和技术来进行并行计算,充分利用多核处理器优势。...本篇博客中,我们将深入介绍 NumPy 中并行计算,并通过实例演示如何应用这些技术。 1....使用 NumPy 通用函数(ufuncs) 通用函数是 NumPy 中一种机制,它允许对数组进行逐元素操作。通用函数底层使用编译代码执行操作,因此可以实现并行计算。...使用 Dask 加速计算 Dask 是一个用于并行计算灵活工具,可以与 NumPy 结合使用,提供分布式和并行计算能力。...使用 Cython 进行编译优化 Cython 是一种将 Python 代码转换为 C 代码工具,从而提高执行速度。通过使用 NumPy 数组,可以 Cython 中实现并行计算

    1.1K10

    使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算问题

    大多数Dask API与Pandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核并行运行。它甚至可以集群运行,但这是另一个话题。 今天你将看到Dask处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...运行时值将因PC而异,所以我们将比较相对值。郑重声明,使用是MBP 16”8核i9, 16GB内存。...接下来,让我们看看如何处理和聚合单个CSV文件。 处理单个CSV文件 目标:读取一个单独CSV文件,分组值按月,并计算每个列总和。 用Pandas加载单个CSV文件再简单不过了。...你可以看到下面的总运行时间: 让我们来比较一下不同点: 这并不是一个显著区别,但Dask总体是一个更好选择,即使是对于单个数据文件。...这是一个很好的开始,但是我们真正感兴趣是同时处理多个文件。 接下来让我们探讨如何做到这一点。 处理多个CSV文件 目标:读取所有CSV文件,按年值分组,并计算每列总和。

    4.2K20

    资源 | Pandas on Ray:仅需改动一行代码,即可让Pandas加速四倍

    案例中,想在 10KB 和 10TB 数据使用相同 Pandas 脚本,并且希望 Pandas 处理这两种不同量级数据时速度一样快(如果有足够硬件资源的话)。...这是一台 8 核机器运行,由于开销因素,加速并不是特别完美。...什么时候应该调用 .persist() 将 DataFrame 保存在内存中? 这个调用在 Dask 分布式数据帧中是不是有效什么时候应该重新分割数据帧?...这个调用返回Dask 数据帧还是 Pandas 数据帧? 使用 Pandas 数据科学家不一定非得是分布式计算专家,才能对数据进行高效分析。Dask 要求用户不断了解为计算而构建动态任务图。...值得注意是,Dask 惰性计算和查询执行规划不能在单个操作中使用

    3.4K30

    一句代码:告别Pandas慢慢慢!

    例如,假设你有两个数组: array_1 = np.array([1,2,3,4,5]) array_2 = np.array([6,7,8,9,10]) 你希望创建一个新数组这个数组是两个数组和...,结果是: result = [7,9,11,13,15] Python中,可以使用for循环对这些数组求和,但这样做非常慢。...1、Swifter可以检查你函数是否可以向量化,如果可以,就使用向量化计算。 2、如果不能进行向量化,请检查使用Dask进行并行处理是否有意义: ?...https://dask.org/ 或者只使用普通Pandasapply函数,但并行会使小数据集处理速度变慢。 所以大家面对数据集大小不同时,要采取不同代码思路,否则会适得其反! ?...,你就可以用一个单词来运行padnas了!

    62030
    领券