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提交来自另一个模块的突变

Requests to the ChatCompletions_Create Operation under Azure OpenAI API version 2024-02-15-preview have exceeded token rate limit of your current OpenAI S0 pricing tier. Please retry after 2 seconds. Please go here: https://aka.ms/oai/quotaincrease if you would like to further increase the default rate limit.

相关搜索:Vuex:无法在模块模式中传递突变中的状态。不带axios的提交突变突变不是提交的vuex 来自另一个模块的removeChild 覆盖来自另一个模块的方法模块不工作-未知的突变类型: user/setUserInfo 如何将提交替换为来自另一个分支的提交在新模块中使用来自另一个模块的结构来自Git的Prestashop模块来自另一个模块的Powershell参数类型识别 Vuex动态模块突变中的未定义状态提交消息(来自Bootstrap的模板)节点模块获得最新的提交来自另一个模块的控制器不工作 OCaml -访问来自另一个模块的派生函数来自另一个maven模块的Quarkus Qute模板位置 Rails:来自模块的回调来自模块的PowerShell脚本路径我收到来自redux的调度之间的状态错误的突变来自Kattis提交检查器的输入我如何处理来自另一个模块的表单对象？

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几项泛癌基于突变的网络模块分析汇总

这些新的候选driver基因与其他已经确定的癌症基因一起出现。可以假设，随着更多的肿瘤基因组测序，这些模块中将出现新的低复发性突变driver。...05 测试网络分配的鲁棒性 Emerging landscape of oncogenic signatures across human cancers[5] 将突变模式和结构重排分类为彼此显著不同的模块...该工作进行了一些对照来测试模块分类的稳健性。在两个特征良好的数据集上测试了该方法，这些数据集经常用作网络模块化检测的基准。...对于这个网络，该工作的方法能够识别出网络的两模块结构，该结构与Guimerá和他同事们提出的解决方案一致，除了一名女性外，与进行这项研究的人种学家提出的主观解决方案是一致的。...通过去除不同百分比的样本和重新分类减少的数据集来评估亚型的稳健性。在每次运行时，通过将约简后的分类中的每个模块映射到最大重叠的原分类中的模块，将约简后的数据集得到的层次分层映射到原分类。

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使用 antd 的 form 组件来自定义提交的数据格式

最近使用antd UI 的表单提交数据,数据里面有的是数组，有的是对象。提交的时候还要去校验参数，让人非常头疼。...在我仔细看完文档之后，发现 antd 的 form 组件做的非常不错，这些需求通通不是问题。现在来总结一下。如图所示，提交的表单信息有需要填写多个的东西。...Form.List 现在我们来自定义一个表单属性为一个数组的表单数据。...前提是节点上有rules，提交的数据为数组格式。如图自定义表单组件，在 Form.Item 组件下使用。 Form.Item子节点的props接收两个参数：value,onChange。...，在Form.Item上添加rules，使用validator函数来自定义校验规则。

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肿瘤免疫浸润评估资源—TIMER

今天我们介绍另一个交互式web工具—TIMER，能够全面、灵活地分析TIICs并可视化。背景介绍同一类型肿瘤的不同患者的免疫浸润具有异质性，可能影响临床结果。...上四个模块分别探讨TIICs与基因表达(Gene)、总体生存(Survival)、体细胞突变(Mutation)和体细胞拷贝数改变(SCNA)的关系，以及两组基因的差异表达(Diff Exp)和相关性(...每个模块的可视化示例显示在相应的文本框中。...提交感兴趣的基因和免疫细胞类型后，将显示带有在各种癌症类型中纯度调整后spearman's rho值的热图。颜色表示显著的正/负相关。...提交后，热图显示每种肿瘤类型中每个基因差异表达的变化。单击单元格显示小提琴图（A1CF在胶质瘤中的野生型TP53和突变的TP53的差异表达水平）。 (4) Gene_Corr:基因间相关性.

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OpenAI的大模型有“人类思想”那味了

研究团队认为，用传统遗传算法修改代码VS人类程序员自己动手，在效率上还有两点差距：一个是软件越来越复杂，人类可以搞模块化的代码复用来应对，而目前最先进的遗传算法也无法在人类使用的编程语言上做到这一点。...另一个是几乎所有遗传算法靠的都是随机突变（mutation），而人类程序员每一次修改代码都带有目的，或者是增加功能、或者是改进效率、又或者是修复bug。...commit描述配合上提交前后代码对比的diff数据，就是AI绝佳的学习材料。研究人员筛选出一些描述意图明确、修改的代码量不大的提交数据来训练一个GPT-3架构的AI模型。...团队介绍这项研究的团队成员均来自OpenAI。论文一作是Joel Lehman，是一位机器学习科学家。其聚焦的领域包括人工智能安全、强化学习和开放式搜索算法。...GP中的突变功效现在可以通过ELM大幅提高，这将激发出一系列广泛的新应用和研究方向。那么这项研究是否也对你产生了新的启发呢？

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Nature：肆虐全球的「奥密克戎」到底怎么来的？

Omicron 的另一个奇怪特征是，从基因组的角度来看，它由三个不同的亚谱系（称为 BA.1、BA.2 和 BA.3）组成，它们似乎都是在同一时间出现的。...德尔塔毒株与奥密克戎毒株刺突蛋白突变对比图尽管研究人员已向 GISAID 基因组数据库提交了近 750 万个 SARS-CoV-2 序列，但尚未对来自全球 COVID-19 患者的数亿个病毒基因组进行测序...目前，南非对其已知 COVID-19 病例的不到 1% 进行了测序，而从坦桑尼亚到津巴布韦和莫桑比克的许多邻近国家向 GISAID 提交的序列不到 1,000 个。...宾夕法尼亚州费城坦普尔大学的计算进化生物学家谢尔盖庞德说：“这不是 19 世纪，在那里你需要六个月的时间乘帆船从一个点到另一个点。”...另一种可能，就是Omicron可能根本不是来自于人。 SARS-CoV-2 是一种混杂病毒：目前已经传播到野豹、动物园的鬣狗和河马，以及宠物雪貂和仓鼠身上。

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Vue.js 状态管理：Pinia 与 Vuex

：状态、动作和突变。...状态返回当前的todoListItems，动作提交一个突变来创建一个新项目，最后，突变创建新项目并将其添加到列表中。...当你构建一个更大的应用程序时，你可能会意识到动作和突变相对相似，导致冗余代码，因为每个状态变化都需要一个样板。 Pinia 使用 Pinia 简单 API，您可以消除突变和冗余代码。...使用 Pinia，我们删除了突变并将其直接更新到我们的动作中。注意：在上面的代码示例中，当我们将项目直接提交给我们的操作时，我们不需要跟踪我们的项目。...Pinia 和 Vuex 的优缺点 Pinia 和 Vuex 是控制应用程序状态的优秀工具，但其中一个必须具有另一个所没有的某些功能。让我们来看看它们是什么。

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体验impute.me基因检测分析结果

彩色云显示了来自一大群人的真实高度和遗传高度分数的比较。从这两个你可以找到你估计的实际高度。 ? 细节：垂直条显示您在X轴上的遗传高度。...这是因为这些引起罕见疾病的SNP难以估算，并且只有来自23andme的微阵列类型具有定制修改以便测量它们。 ? 基因突变基因组中的大多数SNP实际上并未在基因中发现：它们是“基因间的”。...如果您将ID代码提供给此模块，则会显示所有测量的错义和无意义突变的表格。对表格的解释可以通过多种方式完成，与其他模块不同，这并不能给出“一个真正的答案”。...提供的另一个帮助是polyphen和SIFT – 分数，可以指示结果。最终，这样做的目的是满足人们对功能基因状态的好奇心。...许多只能通过测序检测，例如来自无数的遗传学。然而，通过插补分析可以获得数十种额外可能的感兴趣突变。以下列出了直接测量的三个23andme-SNP以及两个基因中错误或无意义的所有其他推测SNP的基因型。

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你真的理解体细胞突变吗？

在大型或历史性数据集研究中，经典的"肿瘤-正常"的工作流程是非常具有挑战性（额外的测序成本或参考材料供应有限）。白血病则是另一个挑战，因为血液不能用作参考物质。...所有允许单个提交者添加数据的数据库都容易出错。 Lek等人证明了外显子组的多样性，他分析了60,706个不同种族的个体，发现平均每外显子组的八个碱基中就有一个变异。...提供最高水平的证明是可预测对食品药品监督管理局批准的疗法的反应或耐药性的生物标志物，以及来自专业诊断和预后指南的突变。...仅在一个数据集中甚至一名患者中发现了超过2,000个基因发生了突变。当前的指南，例如来自AMP的指南，都是基于特征基因。因此，Kaur等人认为乳腺癌更适合使用panel测序方法。...另一个方面源于对种系易感性的认识不断提高，例如：骨髓增生异常综合征中具有SAMD9 / SAMD9L突变的患者，如果提供了家庭背景和参考材料，则可以调整检测。（2）其次，数据库是变异解释的基石。

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【经典高分文章】T细胞受体的空间异质性反映肺癌中突变景观

在模型1（零模型）中，TCR计数是从一个泊松分布中提取的，其均值等于所有区域的均值。在模型2中，TCR计数来自混合分布，其中一个或多个区域不具有TCR，其概率为1，其余区域来自泊松分布。...在观察到的混合的类中，通常绝大多数的TCRs来自于一个或另一个患者。聚合重组（convergent recombination），即不同的核苷酸序列编码相同的CDR3氨基酸序列。 8....普遍型和区域型突变的分类选择了非同义突变进行进一步分析，加上所有引入或移除终止密码子或引入框移的突变。分布呈双峰，一个峰在非常低的频率，另一个峰的模态为1。...转录模块和RNA-seq 测量基因模块中转录活性的方法在Pollara等人的文章[ref.56]中有详细描述。首先定义一组识别细胞类型或功能状态（例如IFN反应）的基因。...这个平均值定义了每个模块的转录活性，然后与该样本中检测到的普遍型或区域的TCRs的数量相关联。 14.

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爆肝整理肿瘤生信数据库（收藏贴一）

它既有来自公共资源的高度整合的DNA甲基化、癌症相关基因、突变和癌症信息，也有来自大规模测序的CpG岛(CGI)克隆。MethyCancer分析和介绍了不同数据类型之间的相互连接。...也可以提交自己的数据。...大约14%的数据没有在其他地方公布。这些数据可以直接检索。并且有在线提交工具，允许科研人员直接将新数据输入到MethDB。...除了EPICO外，这种方法还需要存储空间来创建数据库，获取原始数据的连接，以及接收查询和发送结果的模块。...此外，还构建了一个名为“Motif”的新模块，该模块提供了修饰motifs的可视化logos和位置权重矩阵(PWMs)。还构建了一个新的模块“modRBP”来研究RNA修饰和RBPs之间的关系。

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肿瘤药敏多组学数据库(GDSC)的数据介绍和获取

在第一期的GDSC数据总览中，我们根据数据库的模块进行总体的介绍。今天我们再深入了解GDSC所包含的数据及其获取的方法，也就是GDSC的数据下载模块。...GDSC数据下载的模块，分为4个模块，分别是ANOVA results、drug data、genetic features和bulk data。...根据基因特征下载页面，可以下载不同细胞系中的突变特征。但是这里涉及到的基因突变特征较少，不建议从该页面下载基因突变特征。 4. bulk data下载 ?...参考此文献：（A）基于11289个来自患者肿瘤识别到的CFEs（癌症功能事件：肿瘤基因的突变、拷贝数变异和甲基化事件）；（B）结合1001个来自COSMIC中的人肿瘤细胞系基因组学数据；（C）筛选出人肿瘤细胞系中的...（注意区分肿瘤数据和细胞系数据）：基因突变数据、拷贝数数据、甲基化数据、表达数据、药物筛查结果和多种数据类型的组合分析结果（如体细胞突变与拷贝数突变数据的组合）。

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DriverDBv3：一站式解决肿瘤多组学分析的“炫酷”神器

提交后，可以发现一个总结的菜单和突变、CNV、甲基化、生存分析、miRNA五个分析菜单。而分析的数据集来源是TCGA。 ?...蛋白或基因互相作用分析来自三个数据库：BioGRID，IntAct和STRING，分别进行可视化。 ? ? ?...02 肺腺癌驱动基因突变分析 TOP30基因的可视化，左图是瀑布图，展示突变在样本中的分布及突变位置。右图是TOP30基因突变样本的数量。 ?...二、基因分析首先选择“HGNC symbol”，例如输入“EGFR”，点击提交。 ?...在下图E-mail address中输入邮箱地址，提交即可。 ? 最终展示结果，可以获得OncoPrint突变图，Kaplan-Meier图，基因表达的箱线图等。

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Neuro-Oncology：对脑胶质瘤IDH突变状态进行分类的一种新型的基于MRI的全自动深度学习算法

每一层layer都与那个dense block中的每一层layer相连。这种密集连接是通过将来自一层的特征映射与来自该密集块的每一层的特征映射连接起来实现的。...图2 （A）对IDH突变状态进行体素级别的分类，分别生成两个volume（一个volume标记了IDH突变型的体素，另一个volume标记了IDH野生型的体素）。...，通过连接模块内的所有特征图实现特征的复用，提高特征使用效率；（f）Transition down模块用于实现特征图的下采样，实现高级语义特征的提取；（g）Transition up模块用于对低分辨率的特征图进行上采样...对来自T2-net和TS-net三折交叉验证中分别重复该步骤，共得到6条来自交叉验证的ROC曲线(T2-net 3条，TS-net 3条)。...可以解释本文的网络实现更高性能的另一个因素是，以前的方法需要多模态输入，这可能由于较长的检查时间和运动造影剂的需要从而导致的患者运动而受到影响。

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Drug Discov Today｜基于AI的蛋白质结构数据库有可能加速罕见病研究

图1 来自AlphaFoldDB的人源Alsin模型与之前的同源建模(HM)工作相比。(a)域颜色编码的人类Alsin模型。(b) (a) 中的域编码和序列位置。...另一个模型评估指标是预测对齐误差 (PAE)，以x , y矩阵的形式表示为预期位置误差 (Å) ，其中每个残基x与每个残基y的位置对齐。这对于评估域间预测精度很有用。...在患者中发现的另一个缺失是Δ861-T904 23（图2c）。该突变体缺少结构域DH/PH的最后一个α-螺旋，如红色突出显示。...因此，我们将此Alsin结构提交给网络服务器HDock ( http://hdock.phys.hust.edu.cn/ )。...一旦获得合适的二聚体结构，本文旨在预测与图4a中模型一致的四聚体组件。我们提交了获得的VPS9 交互二聚体与ClusPro对接(www.cluspro.org)。

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NGS基因测序（panel）报告解读数据库汇总

dbSNP中的数据有两种主要类型：由用户提交，可以通过“提交的SNP”(ss)标识符来识别；由多个提交的数据和来自其他来源的数据组合而成的数据，可以通过“reference SNP” (rs)标识符识别...gnomAD（v2.1.1）基于GRCh37，其中短变异数据集涵盖了125,748个外显子和15,708个基因组，这些基因组来自作为各种疾病特异性研究和群体遗传研究的一部分的不相关的个体，总计141,456...1000 Genomes（https://www.internationalgenome.org/)1000 Genome Project 的目标是发现在人群中频率大于1%的变异位点，对来自不同人群的大量样本进行测序...COSMIC是一个在人类癌症中发现的体细胞获得性突变的在线数据库。体细胞突变是在非生殖细胞中发生的，不是由儿童遗传的。...(2)纳入数据库的数据来自癌症基因组计划进行的癌症样本的全基因组重测序研究。真的是非常多生活很好，有你更好

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肿瘤信号通路生信分析如何发12分的NC

PCAWG汇总了来自38种肿瘤类型的2,658例癌症的全基因组测序数据，作者对PCAWG项目编辑的来自27种肿瘤类型的2,583个整个癌症基因组中的非编码区域突变进行了多方面的途径和网络分析，并成功进行了途径和网络分析而确定了蛋白质编码基因中的稀有突变的动机...编码和非编码突变的模块化组织作者确定了特定的PPI子网络和生物学途径，这些子网和途径被编码突变，非编码突变或两种突变的组合所改变。...如图4a，图4是包含PID-C和PID-N基因的途径和网络模块。...其中，图4a的节点代表PID-C和PID-N基因，边缘显示来自ReactomeFI网络的功能相互作用(灰色)，来自BioGRID网络的物理PPI(蓝色)或两个网络中记录的相互作用(紫色)。...丰富度由每个途径模块名称和PID基因名称附近的圆圈概述。空心圆表示途径模块包含的途径比单独的PID-C和PID-N结果显著丰富了PID-C和PID-N基因的并集。

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差异共表达网络-Co-expression networks

使用来自1617个样品的心肌数据的一项研究发现已知的胎儿基因标志物在发育和患病心肌共同的基因网络中上调不是枢纽基因。...这些TF将被认为是在一个条件下是一个模块核心的中枢基因，而在另一个条件下是另一个模块的核心。差异连接的基因是在两个样品组之间具有不同共表达伴侣的基因。...另外一个前景是来于RNA-seq数据的突变检测。因为在不同的细胞中突变会随着年龄累积，这可以用于发现cell的来源。突变累积已经用来研究癌症发展和恶变来源。...在大规模单细胞RNA-seq实验中，可以基于其来源进行分离细胞，或者基于他们拥有的突变来group细胞。拥有相同的突变的细胞可以发现有共表达模式，带有特异突变的细胞模块也可以被检测。...这可以直接把图表和表达模块联系起来，有个局限就是在RNA-seq中只有编码区的突变区域才能被识别。

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在 Hiplot 中使用 Sigflow

Sigflow 是基于突变模式分析 R 包 sigminer 所构建的命令行流程软件，提供了几大突变模式分析流程，便于组学流程的对接与自动化分析。...fit：直接利用 COSMIC 突变模式数据库进行拟合分析，提供参考突变模式在样本中的贡献，输出突变模式贡献图以及相关结果。使用在 Hiplot 平台的进阶模块中，我们可以找到 Sigflow。...点击数据文件右侧的突变，可以载入示例输入文件。...一般而言，我们推荐使用标准的 MAF 格式文件作为 SBS/DBS/INDEL 突变模式提取的输入（包含同样数据信息的 CSV/EXCEL 格式文件也支持）；提取拷贝数突变模式的输入文件需要包含以下列：...NMF 运行次数：由于 NMF 算法存在起点的随机性，为了得到更好的结果，需要多次运行 NMF，一般推荐 30 到 50 左右。设定好选项后点击「提交」运行程序。 ?

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ANNOVAR 是如何注释 RS ID 的？

当 dbSNP 于 1998 年首次向公众发布时，数据库中唯一的提交都被分配了单独的 rs ID 号。...现在 dbSNP 的提交已不断完善，就对新提交的 SNP 进行评估，以查看它是否映射到与先前提交的 SNP 相同的位置；如果是，则将提交的 SNP 链接到现有参考 SNP 记录的参考集中。.../ref/alt 信息的突变，还是共享相同位置/基因座的多个突变？...在 filter-based 的注释中保持“完全匹配”功能非常重要，否则等位基因频率，功能评分等都将失去其可识别性。 另一个真实案例，rs34083643[1] 被 ANNOVAR 注释为常见突变。...因此，hg19 中的突变可能成为 hg38 中的参考等位基因（这是我的一般经验），这个突变就丢失了。但如果只是进行简单的转换，这个突变将继续存在，这当然是有问题的。

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清华AI蛋白质结构预测，连续4周夺得CAMEO第一

达成这一成就的是来自清华大学智能产业研究院（AIR）的AIRFold。...量子位：能否展开讲讲同源挖掘模块Homology Miner的技术细节和特色？...量子位：除了同源挖掘模块外，AIRFold在AlphaFold2的基础上还做了哪些改进？兰艳艳教授：除了同源挖掘模块，我们对AlphaFold2目前所存在的一些问题也进行了有针对性的探索和改进。...兰艳艳教授：AIRFold是一个自动化的平台，包括同源序列增广、同源序列筛选、特征处理、结构预测、结果分析以及自动提交等模块。...现在AlphaFold2预测突变后蛋白的能力还很有限，主要因为来自单序列的突变信息会被MSA中信息掩盖住。

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