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    高欣/王建新课题组NAR两连发-重复序列检测算法和数据库

    重复序列在动物、植物、细菌等基因组中普遍存在。例如,人类基因组中重复序列的占比约为50%左右。大量研究表明,基因组中的重复序列在生物体的进化、遗传、变异、基因表达、转录调控、染色体重组和生理代谢等过程中都起着不可或缺的作用,并与癌症(肺癌、胰腺癌、卵巢癌)、自闭症、精神分裂症、高血压等复杂疾病的发生有着已知的密切的关联。重复序列的全面检测和精准注释是研究其在生物体生命活动中发挥的作用和探索其与复杂疾病之间的关联的重要基础。然而,由于测序技术的限制(二代测序片段精度高,但是尺寸有限;三代测序片段长,但是精度低)和检测模式设计存在缺陷,现有的检测方法在检测规模和精度方面都无法达到令人满意的程度,这严重制约了下游分析和应用的开展。

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    MySQL(二)|深入理解MySQL的四种隔离级别及加锁实现原理

    注:内容有点干,但希望你可以耐心地看完。回头我写一篇实操的文章帮助理解。 开发工作中我们会使用到事务,那你们知道事务又分哪几种吗? 以及不同事务隔离的加锁实现原理是什么? 一、首先什么是事务? 事务是应用程序中一系列严密的操作,所有操作必须成功完成,否则在每个操作中所作的所有更改都会被撤消。也就是事务具有原子性,一个事务中的一系列的操作要么全部成功,要么一个都不做。 事务的结束有两种,当事务中的所有步骤全部成功执行时,事务提交。如果其中一个步骤失败,将发生回滚操作,撤消事务开始时的所有操作。 二、事

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    spring的事务隔离级别「建议收藏」

    ⑴ 原子性(Atomicity)   原子性是指事务包含的所有操作要么全部成功,要么全部失败回滚,这和前面两篇博客介绍事务的功能是一样的概念,因此事务的操作如果成功就必须要完全应用到数据库,如果操作失败则不能对数据库有任何影响。 ⑵ 一致性(Consistency)   一致性是指事务必须使数据库从一个一致性状态变换到另一个一致性状态,也就是说一个事务执行之前和执行之后都必须处于一致性状态。   拿转账来说,假设用户A和用户B两者的钱加起来一共是5000,那么不管A和B之间如何转账,转几次账,事务结束后两个用户的钱相加起来应该还得是5000,这就是事务的一致性。 ⑶ 隔离性(Isolation)   隔离性是当多个用户并发访问数据库时,比如操作同一张表时,数据库为每一个用户开启的事务,不能被其他事务的操作所干扰,多个并发事务之间要相互隔离。   即要达到这么一种效果:对于任意两个并发的事务T1和T2,在事务T1看来,T2要么在T1开始之前就已经结束,要么在T1结束之后才开始,这样每个事务都感觉不到有其他事务在并发地执行。   关于事务的隔离性数据库提供了多种隔离级别,稍后会介绍到。 ⑷ 持久性(Durability)   持久性是指一个事务一旦被提交了,那么对数据库中的数据的改变就是永久性的,即便是在数据库系统遇到故障的情况下也不会丢失提交事务的操作。   例如我们在使用JDBC操作数据库时,在提交事务方法后,提示用户事务操作完成,当我们程序执行完成直到看到提示后,就可以认定事务以及正确提交,即使这时候数据库出现了问题,也必须要将我们的事务完全执行完成,否则就会造成我们看到提示事务处理完毕,但是数据库因为故障而没有执行事务的重大错误。

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