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RNA结合蛋白数据库

那么今天小编就来给大家推荐一个可用于RNA结合蛋白预测的数据库:RBPDB(http://rbpdb.ccbr.utoronto.ca/)。...该数据库是RNA结合实验的数据库,包括人、小鼠、蝇和蠕虫4类物种,总共包含272个RBPs的结合数据,包括71个具有位置权重矩阵格式的基序的结合数据,以及36组免疫沉淀实验获得的体内结合转录本序列。...搜索RNA结合实验 这里我们可以通过RBP,RBD,物种,实验类型或以上任意组合来搜索RNA结合实验。...可以发现,在结果页面中显示该数据库内所有RBP的信息,及通往其他数据库的超链接,可以查看和导出实验数据。单击列标签可以按降序或升序对列进行排序。...总的来说,该数据库的第三项功能用的较多。特别是想探究一个lncRNA可能的结合蛋白时,就派上用场啦。

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miRcode:人类miRNA结合图谱数据库

TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好。...为了更加方便的进行miRNA的研究,针对人类中的miRNA, miRcode的开发者预测了miRNA与多种类型的RNA的相互作用,比如mRNA, lncRNA等,并将结果整理成了数据库,方便大家的使用与学习...对于预测到的miRNA结合位点所在区域,也提供了相关的注释,首先根据46个脊椎动物的比较基因组学结果,定义了结合位点在不同物种间的保守性,并划分了不同类别;其次提供了结合位点在转录本上的分布信息,将转录本划分成了...通过检索功能可以方便的检索数据库中的信息,检索框如下所示 ? 可以根据基因类别,结合位点保守性以及在转录本上的分布对结果进行过滤和筛选,检索结果示意如下 ?...随着Gencode, targetscan等数据库的不断更新,目前看来,该数据库中的内容显得过于老旧,但是其分析的思路仍然值得借鉴。 ·end· —如果喜欢,快分享给你的朋友们吧—

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    SpringBoot 结合 Mybatis 实现创建数据库

    SpringBoot 结合 Mybatis 实现创建数据库表 目录 博主介绍 前言 为什么要通过应用实现创建表的功能 准备创建表的 SQL 语句 实现通过 MyBatis 创建数据库表示例 在 Maven...中引入相关依赖 在 SpringBoot 配置文件中添加数据库配置 创建测试的 Mapper 接口类 创建与 Mapper 关联的 XML 文件 创建用于测试的 Controller 类 创建 SpringBoot...ENGINE = InnoDB AUTO_INCREMENT = 9 CHARACTER SET = utf8mb4 COMMENT ='用于测试的用户表'; 实现通过 MyBatis 创建数据库表示例...目的就是解决通过 MyBatis 执行创建表的语句,从而实现创建数据库中的表的功能,实现代码如下: 在 Maven 中引入相关依赖 在 Maven的 pom.xml文件中,引入 SpringBoot、...tableName=user 执行完接口后,再进入数据库,输入下面命令观察库中是否创建包成功: mysql> use test; Database changed mysql> show tables

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    Qt数据库与QTableWidget结合的增删改查

    之前和大家简单介绍过Qt Sqlite数据库的使用,不过过于简单,这次结合QTableWidget一起再次介绍下。 一、 基础知识 1....二、 程序功能简介 程序先添加数据库、设置数据库名称,之后判断‘student’table 是否存在,不存在则创建;创建后添加数据作为QTableWidget的初始化显示。...程序中数据库与QTableWidget结合,实现增、删、改、查等基础功能。 QTableWidget实现了动态添加Item的小功能。 三、 各模块程序功能介绍 1....检查连接、添加数据库驱动、设置数据库名称。...setDatabaseName()的参数是数据库文件名。如果数据库不存在则自动创建;如果存在,则之后的操作会在已有的数据库上进行。 用户名,密码可以随便取,也可以省略,本例子中省略。

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    数据库索引(结合B-树和B+树)

    数据库索引,是数据库管理系统中一个排序的数据结构以协助快速查询、更新数据库表中数据。索引的实现通常使用B树及其变种B+树。...为表设置索引要付出代价的:一是增加了数据库的存储空间,二是在插入和修改数据时要花费较多的时间(因为索引也要随之变动)。 ?   上图展示了一种可能的索引方式。...索引的优点: 第一,通过创建唯一性索引,可以保证数据库表中每一行数据的唯一性。 第二,可以大大加快数据的检索速度,这也是创建索引的最主要的原因。...根据数据库的功能,可以在数据库设计器中创建三种索引:唯一索引、主键索引和聚集索引。   ...数据库系统的设计者巧妙利用了磁盘预读原理,将一个节点的大小设为等于一个页,这样每个节点只需要一次I/O就可以完全载入。

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    Spring Security 登陆表单案例,结合数据库认证

    这篇文章,我们将集合数据库 mysql。...在这篇 Spring Security 文章中,我们将学习怎么使用 Spring Security 和 MySQL 数据库进行数据库认证,并应用在自定义的登陆表单中。...在这个数据库认证案例中,用户在登陆的表单输入登陆凭证,比如用户名和密码,然后点击登陆。接着,我们在数据库表单中对用户输入的凭证,即用户名和密码进行验证。...配置 MySQL 数据库 首先,我们使用下面的命令行在 MySQL 服务器中创建一个数据库: create database login_system 因为我们使用 MySQL 作为我们的数据库,所以我们需要配置数据库的...URL, username 和 password,以便在数据库启动时 Spring 可以和它建立联系。

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    AngularJS如何与SQL结合,实现与后端数据库的交互

    然而,在某些情况下,我们可能需要与后端数据库进行交互,以实现数据的存储和检索。在这种情况下,结合AngularJS和SQL可以提供一种强大的解决方案。什么是SQL?...SQL(Structured Query Language)是一种专门用于管理和操作关系型数据库的语言。它允许我们通过使用各种命令和操作,对数据库中的数据进行查询、插入、更新和删除。...RESTful API一种常见的方法是通过RESTful API与后端数据库进行通信。通常,后端服务器会提供一组API端点,用于处理与数据库的交互。...ORM(对象关系映射)ORM是一种将对象模型与数据库模型进行映射的技术。在AngularJS中,我们可以使用ORM库来简化与SQL数据库的交互。...总结AngularJS与SQL结合使用可以为我们提供一种强大而灵活的方式,以实现与后端数据库的交互。

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    Windows系统安装MongoDB并结合内网穿透实现公网访问本地数据库

    前言 MongoDB是一个基于分布式文件存储的数据库。由C++语言编写。旨在为WEB应用提供可扩展的高性能数据存储解决方案。...MongoDB是一个介于关系数据库和非关系数据库之间的产品,是非关系数据库当中功能最丰富,最像关系数据库的。它支持的数据结构非常松散,是类似json的bson格式,因此可以存储比较复杂的数据类型。...Mongo最大的特点是它支持的查询语言非常强大,其语法有点类似于面向对象的查询语言,几乎可以实现类似关系数据库单表查询的绝大部分功能,而且还支持对数据建立索引。 简单几步实现MongoDB远程访问。...安装数据库 打开MongoDB官网https://www.mongodb.com/try/download/community,这里以windows版本为例。...内网穿透 本地连接没问题后,目前该数据库只能在局域网内被访问,不过我们可以使用cpolar内网穿透工具,将内网的MongoDB数据库映射到公网上,实现远程访问,不需要公网IP,也不用设置路由器。

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