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数据挖掘整理

数据挖掘整理 1.数据的基本描述 1.1 中心趋势度量 均值 截尾均值:丢弃高低端极端值后的均值 中位数:有序数据值得中间值 众数:集合中出现最频繁的值 中列数:最大值和最小值的平均值 1.2 数据散布...极差:最大值与最小值之差 分位数:取自数据分布的每隔一定间隔上的点,把数据划分成基本上大小相等的连贯集合 四分位数:3个数据点,把数据分布划分成4个相等的部分,使得每部分表示数据分布的四分之一...余弦相似性 欧式距离、曼哈顿距离、闵可夫斯基距离 2.数据预处理 2.1数据清洗:填写缺失值、光滑噪声数据,识别或删除离群点,并解决不一致性来“清理”数据 缺失值的处理:忽略该行、人工填写缺失值、使用一个全局常量填充...冗余和相关性分析:标称数据的卡方相关检验、Pearson相关系数、协方差 2.3数据归约:维归约和数值归约 2.4数据变换: 光滑:去掉噪声 属性构造:可以由给定的属性构造新的属性并添加到属性集中 聚集...:对数据进行汇总或聚集 规范化:把属性数据按比例缩放 离散化:label encoder 、onehot 由标称数据产生概念分层:属性层级划分

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TCGA数据整理-2

差异分析的起点:counts矩阵—reads计数 拿不到count数据如何做差异分析: • tpm:用limma做差异分析(迫不得已) • fpkm、rpkm:转换为tpm,用limma做差异分析(迫不得已...mp.weixin.qq.com/s/_DtkxSfLGQHcRju66J4yTQ • RSEM:三大R包都可 https://www.jianshu.com/p/46b048220b88 其他来源的转录组数据和...TCGA的转录组数据的差别 整理输入数据的过程不同,差异分析无差别 示例数据:GSE150392 使用数据前的要点: 下载数据 下载表达矩阵 将下面三个文件放在同一个目录下 代码如下 proj = "cov...data.table = F)# 保留symbol ,去重复,再设为行名library(stringr)b = dat$V1 %>% str_split("_",simplify = T)#24行是异常数据...PAR_Y_dat$V1 = str_remove(dat$V1,"PAR_Y_")dat$V1[24]b = dat$V1 %>% str_split("_",simplify = T)#36850以后是异常数据

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《王道》数据结构笔记整理2022级_数据结构笔记整理

2.数据元素:数据元素是数据的基本单位,通常作为一个整体进行考虑和处理。一个数据元素可由若干数据项组成,数据项是构成数据元素的不可分割的最小单位。...例如,学生记录就是一个数据元素,它由学号、姓名、性别等数据项组成。 3.数据对象:数据对象是具有相同性值的数据元素的集合,是数据的一个子集。...其值可以再分解为若干成分(分量)的数据类型。 3)抽象数据类型。抽象数据组织及与之相关的操作。 5.数据结构:数据结构是相互之间存在一种或多种特定关系的数据元素的集合。...1.2数据结构的三要素 1.数据的逻辑结构: 逻辑结构是指数据元素之间的逻辑关系,即从逻辑关系上描述数据。 逻辑结构包括: 集合结构:结构中的数据元素之间除“同属一个集合”外,别无其它关系。...趟的交换和建堆过程 swap(A[i], A[1]); //堆顶元素和堆底元素交换 HeadAdjust(A,1,i-1); //把剩余的待排序元素整理成堆

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数据帧的学习整理

事先声明,本文档所有内容均在本人的学习和理解上整理,不具有权威性,甚至不具有准确性,本人也会在以后的学习中对不合理之处进行修改。...在了解数据帧之前,我们得先知道OSI参考模型 咱们从下往上数,数据帧在第二层数据链路层处理。我们知道,用户发送的数据从应用层开始,从上往下逐层封装,到达数据链路层就被封装成数据帧。...Data:该字段是来自网络层的数据,在整理数据包时会提到。该字段最少为46字节,最大1500字节。 FCS:循环冗余校验字段,用来对数据进行校验,如果校验结果不正确,则将数据丢弃。...数据帧在网络中传输主要依据其帧头的目的mac地址。...一般主机发送数据帧有三种方式:单播、组播、广播。三种发送方式的帧的D.MAC字段有些区别。

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数据库知识整理

1、数据库隔离级别有哪些,MYSQL默认的隔离级别是是什么? Read uncommitted:读未提交,顾名思义,就是一个事务可以读取另一个未提交事务的数据。...幻读 : 是指当事务不是独立执行时发生的一种现象,例如第一个事务对一个表中的数据进行了修改,这种修改涉及到表中的全部数据行。 同时,第二个事务也修改这个表中的数据,这种修改是向表中插入一行新数据。...悲观锁就是在操作数据时,认为此操作会出现数据冲突,所以在进行每次操作时都要通过获取锁才能进行对相同数据的操作,这点跟 java 中的 synchronized 很相似,所以悲观锁需要耗费较多的时间。...D(durabilit):持久性,已经提交的事务对数据库所做的更新必须永久保存。即便发生崩溃,也不能被回滚或数据丢失。 13、某个表有近千万数据,CRUD比较慢,如何优化。...【1】、使用自增主键对数据库做分库分表,可能出现一些诸如主键重复等的问题。 【2】、数据库导入的时候,可能会因为主键出现一些问题。

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TCGA-miRNA数据整理

引言 之前介绍过 如何使用TCGAbiolinks下载TCGA数据整理 , 那么如果手动整理又该如何呢? 下面以 miRNA 数据整理为例示范....因此就可以使用 R 对已下载数据做简单处理. R代码整理 配置工作环境 # !...处理json文件 之后使用代码对json文件做处理得到所需读入文件名和样本 TCGA Submitter Id 之间的对应关系, 代码来源于 TCGA数据库:miRNA数据下载与整理(2) | 夜风博客...如 TCGA数据库:miRNA数据下载与整理(2) | 夜风博客 文中所说, miRNA的前体可能对应多个成熟的miRNA, 因此还需要使用miRBaseVersions.db包对miRNA_region...本文的完整代码可在公众号回复关键词获得(请复制粘贴): TCGA-miRNA数据整理 引用 TCGA数据库:miRNA数据下载与整理(2) | 夜风博客 Codeium

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Excel数据整理与分析

Excel数据整理与分析 应用层工作流程 知识点部分 需要掌握以下基本知识点: Excel的基本工作流程及工作簿、工作表、行与列、鼠标状态、单元格的相关参数。为后面章节打牢基础!...基本工作流程 数据的存储—-》 数据的处理———》数据的分析———》数据的呈现 名词解析 enter image description here 工作簿 即一个Excel文件; 工作表 分为当前活动工作表和非活动工作表...image description here 可对一个区域命名; 鼠标三大状态 选挥柄: 用于选择单元格区域 移动柄: 用于移动或配合ctrH键盘复制单元格区域 填充柄: 复制、填充单元格区域,包括数据...向下拖动 Alt text 二.快速复制属性 单元格 回顾笔记整理 1、Excel的基本 工作流程是数据存储数据整理-数据分析-数据呈现 2、一个工作簿默认最多能建255个工作表,内存大的可以更多...双击填充柄快速填充需要临近列有数据。 下一节我们将学习1.2 Excel规范制表之经典的三表结构

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数据结构整理

2.737708686 s LoopQueue,time: 0.011393786 s 单向链表封装 之前的动态数组,栈,队列都是底层依托静态数组,靠resize()解决固定容量问题,而链表是真正的动态数据结构...O(n) contains(value) O(n) 由于链表中对链表头的各操作都是O(1)的,对应于栈这种数据结构...链表映射封装 映射是一种表示key,value键值对的数据结构 接口 public interface Map { void add(K key,V value); V remove...字典树封装 字典树是一种查询每一个条目的时间复杂度,和字典中一共有多少条目无关的数据结构。而其时间复杂度为O(w),w为查询单词的长度。...并查集封装 并查集是解决连接问题的一种数据结构。我们认为在同一个集合中,两个元素是必然连接的,而不同的集合是不连接的。在并查集中,类似于线段树,同样不考虑并查集的增加、删除元素的操作。

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数据术语入门整理

1.什么是大数据? 2.什么是数据分析? 3.什么是数据挖掘? 4.什么是数据可视化? 这些概念我们都熟悉,但是他们具体是什么含义?...十三:结构化数据 结构化数据(即行数据,存储在数据库里,可以用二维表结构来逻辑表达实现的数据)而言,不方便用数据库二维逻辑表来表现的数据即称为非结构化数据,包括所有格式的办公文档、文本、图片、标准通用标记语言下的子集...因为数据仓库中的数据是面向某一主题的数据的集合,这些数据从多个业务系统中抽取而来而且包含历史数据,这样就避免不了有的数据是错误数据、有的数据相互之间有冲突,这些错误的或有冲突的数据显然是我们不想要的,称为...不符合要求的数据主要是有不完整的数据、错误的数据、重复的数据三大类。数据清洗是与问卷审核不同,录入后的数据清理一般是由计算机而不是人工完成。...二十二:数据可视化 英文名:Data visualization 数据可视化技术的基本思想是将数据库中每一个数据项作为单个图元元素表示,大量的数据集构成数据图像,同时将数据的各个属性值以多维数据的形式表示

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遥感数据获取网站整理

最近想整理一下浏览器书签,并且上午正好又有朋友问到遥感影像的下载网址;因此决定将一些与GIS相关的数据获取网站好好整理一下。...目前准备将GIS相关领域的数据(例如遥感数据、气象数据、农业数据等)获取网站都整理在博客的一篇文章中,随时更新;而公众号这里就按照领域划分,一个领域一篇推文。今天就从遥感影像开始。   ...,具有Sentinel系列遥感数据,是下载Sentinel数据的首选网站。   ...pid=1&rootid=1   地理空间数据云是中国科学院计算机网络信息中心下属数据平台,具有包括Landsat、MODIS、EO-1、Sentinel等常见遥感数据,也包括高分一号、高分四号等国产数据...1.4 海洋卫星数据 1.4.1 中国海洋卫星数据服务系统 •网址[9]:https://osdds.nsoas.org.cn/#/   中国海洋卫星数据服务系统是国家卫星海洋应用中心下属数据平台,具有海洋水色卫星

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【Excel系列】Excel数据分析:数据整理

直方图的功能 “直方图”分析工具可计算数据单元格区域和数据接收区间的单个和累积频率。此工具可用于统计数据集中某个数值出现的次数,其功能基本上相当于函数FREQUENCY。...因此可根据最小分值差确定上限,如“0-59.5,…”,更强大的数据整理工具可使用“数据透视表”工具。 2. 直方图工具的使用 例:对图中的数据按组数10进行等距分组,利用直方图工具统计频数。 ?...统计分组观测值数据 操作步骤: (1)先确定组上限 利用工作表函数在H1和H2单元格求得最大和最小值;H3求得全距R,H4为确定的组数,H5计算组距。...标志:如果数据源区域的第一行或第一列中包含标志项,请选中此复选框。 输出区域:在此输入对输出表左上角单元格的引用,可在当前工作表中输入结果。...直方图统计分组结果 备注: 数据文件:https://pan.baidu.com/s/1gfgKasF

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综合GIS数据下载网站整理

本文为“GIS数据获取整理”专栏(https://blog.csdn.net/zhebushibiaoshifu/category_10857546.html)中第九篇独立文章,按规矩本文全部标题均应由...本文对目前主要的综合GIS数据(即一个网站中,拥有例如遥感、气象等两个或两个以上GIS领域数据)获取网站加以整理与介绍,若需其它GIS领域方向的专门数据(如遥感影像数据、气象数据、土地土壤数据、农业数据等...GIS分析数据的网站。...其具有气候、降雪、冰川等数据,主要数据范围为中国境内。...(厦门市大数据管理局)指导,厦门市信息中心负责建设运营的数据开放平台,具有各类综合数据,尤其在共享单车、地铁等交通GIS数据获取方面较为方便。

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