新冠病毒感染之后，病毒寄生在人体细胞内。目前的技术条件下无法对病毒进行分离培养。...由于新冠病毒为单链 RNA 病毒，在提取过程中得到是 RNA 产物，最终得到的 RNA 样本其实属于一个混合样本，是宿主与病毒的混合样本。...由于人基因组大小约为 30 亿个碱基对，而新冠病毒基因组大小约为 3 万个碱基，二者长度相差 10 万倍，因此，提取到的染色体中人基因组占据绝大部分。...因此对于新冠病毒染色体提取过程中最重要的步骤就是如何对病毒进行富集，目前只能通过 PCR 扩增富集的方法，或者是宏基因组的方法将混合物直接进行测序，在 NCBI 下载新冠病毒测序数据的时候描述部分会有...更多内容可以查看各个平台的相关介绍，一些平台有单独的新冠病毒专题。
背景 目前新冠病毒的鉴定可以采用抗体抗原反应的快速鉴定，荧光定量 PCR 以及宏基因组测序等方法。这里我们主要介绍宏基因组测序的方法如何来鉴定新冠病毒。...该方法无需扩增，通过测序的方法直接测序新冠病毒序列，可以得到全基因组序列，准确性更高。但该方法受限于成本，目前主要用于科学研究中。...对于宏基因组测序的新冠病毒样本，可以直接进行物种分类鉴定。将测序数据与物种分类数据库直接比对即可。这里选择使用 centrifuge 工具进行物种分类鉴定。...宏基因组测序分析新冠流程图 Centrifuge 是一款快速有效的宏基因组物种组成分类的软件，采用了结合 BWT 变换（Burrows-Wheeler transform，BWT）和 FM...对于新冠病毒鉴定，官方提供了一个 h+v+c 的数据库，该数据库里面包含了人基因组+病毒基因组+106 株SARS-CoV-2 基因组 下载新冠病毒比对数据库： mkdir centrifuge_h
与他一样，如今仍然有很多人挣扎在新冠带来的后遗症中，其中最常见的症状之一就是极度疲倦。 如今他成立了新冠后遗症帮扶小组，也很关心其他不幸被这种病症长期折磨的患者。...他认为，很多人低估了新冠后遗症的严重性。 新冠后遗症是什么？ 在贾克发出感慨后，也有一些网友出来说自己的遭遇。 我现在24岁，困于新冠后遗症之中。...比如梅西就在采访中提到，新冠病毒使他的肺部留下了后遗症，后来甚至一个半月都不能跑步。 所以，新冠后遗症到底是什么？...在2021年8月，《柳叶刀》上一篇文章直言： 新冠后遗症是现代医学的一大挑战。 那么，为什么会出现新冠后遗症？...虽然目前还没有办法避免或治疗新冠后遗症，但有学者提出了一些可以预测后遗症的参考方法。
Delta 毒株突变 Delta 毒株目前是全球流行的主要新冠病毒变异株。SARS-CoV-2 表面布满凸起的 S 蛋白可分为三部分，顶部的受体结合域 (RBD)、S1 亚基和 S2 亚基。...Lambda 毒株突变 除了德尔塔，拉姆达也开始“发力”了，据全球共享流感数据倡议组织 (GISAID) 的数据显示，美国有 1000+ 例由“拉姆达”毒株引起的新冠肺炎病例。...新冠病毒是怎样在宿主中肆意横行的呢？简单点说，就是入侵 (病毒受体结合) →进攻 (释放自己基因组) →发扬壮大 (不断合成并排除异己) →再进攻。...新冠毒株就有这样的操作：病毒基因组被释放到宿主细胞质后，会被翻译成病毒复制酶蛋白，这些蛋白最后被切割成单独的非结构蛋白质 (NSPs)。...我国目前受新冠影响较大的省份，感染病例多为 Delta 毒株，下面内容以针对 Delta 展开。 目前报道的确诊病例中，接种过新冠疫苗的不在少数，疫苗的有效性受到高度关注。
比如，正在打HPV疫苗或者其他疫苗，能不能接种新冠疫苗呢？ 理论上是可以的，但要间隔14天，避免发生理赔而不确定谁来负责。
SysML图中词汇 SiNW-FET Silicon nanowire field-effect transistors，硅纳米线-场效应晶体管 更多信息可参见： 用于新冠检测的场效应晶体管生物传感器
金磊 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI 就在刚刚，AI大牛吴恩达发布推文： 我的新冠病毒检测呈阳性。
两位科学家的突破研究使 Covid-19 mRNA 疫苗得以被快速研发，新冠全球大流行中，mRNA 疫苗拯救了千千万万的生命。
Wolfram 新冠研究论坛：https://wolfr.am/coronavirus Wolfram 医学研究论坛：https://wolfr.am/MedicalSciences 该文章（https
大部分新冠重症患者在六个月后依然会有较为严重的呼吸系统后遗症，比如肺活量下降等。...因此，新冠呼吸系统后遗症是否源于肺部损伤，需要进一步研究。...CT中肉眼不可见的异常，并进一步证明了这些异常与新冠呼吸后遗症有极强的相关性。..., R3 lower）在很多情况下对新冠呼吸后遗症有最强的解释力。...文章从尚未解决的医学问题入手，和医学专家一起，开发了DLPE算法，发现了新冠呼吸系统后遗症与长期肺损伤有很强的关联，是计算机专家和医学专家合作的好例子。
新冠疫情爆发后，世界各国广告业面临的局面大同小异：居家生活需求增加，外出娱乐需求减少；网络线上媒体使用增加，户外媒体接触减少；云经济需求上升，线下需求减少。...由于每个国家和地区都处于不同的应对新冠肺炎的阶段，电视节目的参与度也各不相同。但是有一点是一致的: 每个观众看新闻和娱乐节目的时间正在上升。 ?...而广告投放数量正在减少 由于新冠肺炎的爆发，主要产品部门的投资大幅削减，今年全球广告支出将下降8.1%，降至5630亿美元。 在产品类别层面，某些行业大幅削减。...2.我的品牌如何与新冠肺炎下人们的经历和感受相联系？ 有趣的是，直到3月8日，意大利的新广告还在宣传一项列车服务，广告中的人们互相拥抱，这显然会让消费者对品牌产生反感甚至是厌恶情绪。...新冠肺炎对我们的媒体生态系统构成了严重威胁。据Digiday的调查报告，74%的广告商为了减少广告空缺已经采取行动，将CPM的价格下调了10%-20%。
背景 目前新冠病毒的基因组拼接主要采用与参考序列比对，生成一致性序列的方法。所以，参考序列就非常重要，那么参考序列从何而来，参考序列是否准备，遇到新物种如何构建参考序列？...目前普遍使用的新冠病毒参考序列为 NC_045512.2，该序列为 2020 年 1 月 18 日第一株公布出来的新型冠状病毒序列。...测序数据样本来自于一个 41 岁男性患者，测序为宏基因组测序，里面除了包含新冠病毒序列，宿主人基因组之外，还包括其他一些微生物。...本案例中，想要直接拼接得到新冠病毒的全基因组序列。根据以往经验，病毒基因组由于序列读长短，深度高，杂合度高，很难拼接出来，即使是病毒纯培养测序微生物，也很难拼接出完整基因组。...不过该案例中只通过一次拼接，就拼出了一条完整的新冠病毒序列。
比赛链接：https://tianchi.aliyun.com/competition/entrance/231776/introduction?spm=517...
十三 发自 凹非寺 量子位 报道 | 公众号 QbitAI 一种新姿势，可以改善新冠肺炎患者呼吸困难问题。...最近，一项由东南大学附属中大医院、金银潭医院等国内外众多机构共同研究表明：严重的新冠肺炎患者，脸部朝下趴着(俯卧位)，可以改善他们的肺功能。 ?...他们发现，大多数(67-85%)入住ICU的新冠肺炎患者，都出现了急性呼吸窘迫综合征 (ARDS)。...中大医院副院长、论文作者之一邱海波表示： 这项研究首次对需要机械通气(呼吸机)，并承受正压的严重新冠病毒患者的肺部行为进行了描述。...研究人员提出了一种新的基于力学的指标——Recruitment-toInflation ratio，简称R/I比。 ? 通过这一指数，来衡量肺部对压力的反应。
今年的科学界，疫情研究依旧是重要话题，有3位学者因此入选，他们在追踪预测新冠病毒变异、关注新冠后遗症、研究猴痘上有突出贡献。 其中一位是北大曹云龙，他被Nature评为新冠病毒“预言家”。...自疫情发生以来，他参与了新冠中和抗体药物研制、疫苗加强第三针有效性评估和奥密克戎株免疫逃逸等重要研究。...其中，DXP-593已完成I期和II期新冠患者治疗临床试验，DXP-604是国际上为数极少的对所有变异株特别是奥密克戎株有效的中和抗体，目前已完成安全性正在进行治疗临床试验，有望成为新冠特效药的“黑马”...新冠后遗症发声人 新冠后遗症今年也引发全民关注。 Lisa McCorkell便是最早呼吁关注新冠后遗症的学者之一。 她现在是一名研究生，2020年曾感染新冠，但是康复后仍被一些症状困扰。...之后还发布了一份记录了200多种症状的新冠后遗症研究报告。 如今该组织已设立了一个480万美金的基金，来开展新冠后遗症方面的研究，并且会根据患者的需求，来重点开展相关方面的研究。
新智元报道 来源：Sciencemag等 编辑：张佳、啸林 【新智元导读】日前，西湖大学周强实验室的一项关于新冠病毒的研究登上了最新一期Science封面，该研究利用冷冻电镜技术成功解析了此次新冠病毒的受体...该成果最终将对研发精准的新冠肺炎诊断、治疗手段起到关键作用。 中国研究又登上了Science杂志封面! 日前，西湖大学周强实验室的一项关于新冠病毒的研究登上了最新一期Science封面。 ?...Rosen称该研究在理解新冠病毒如何侵染人体细胞方面取得了重要进展，相关研究成果最终将对研发精准的新冠肺炎诊断、治疗手段起到关键作用。...RBD是新冠病毒S蛋白受体结合结构域，相当于病毒的S蛋白伸出来抓ACE2的那根小手 进一步分析，研究人员可以看到新冠病毒表面的S蛋白到底是由哪些氨基酸与ACE2相互作用。...本研究也为理解新冠病毒侵染细胞提供了很多有趣的线索： 比如，ACE2的二聚体与新冠病毒S蛋白的三聚体是否可以发生更高层级的交联，从而促进病毒与宿主细胞膜的融合或者内吞？
背景 一些分析需要与数据库进行比对，例如 blast 比对，物种分类鉴定等，这里我们下载两个数据库，一个是 NCBI 提供的一个用于 blast 比对的新冠病毒库，另外是利用 centrifuge...软件进行宏基因组测序鉴定新冠病毒的库。...tar.gz 循环解压 for i in *.tar.gz;do tar -zxvf $i;done; 二、物种分类数据库 该数据库包含人类全基因组，病毒基因组以及 106 个新冠病毒基因组
这是由全球健康药物研发中心(GHDDI)发起的关于COVID-19/SARS/MERS药物发现社区公共信息共享门户和数据存储库。GHDDI和清华大学药学院联合启...
比尔•盖茨周二表示，他的新冠病毒检测结果呈阳性。 这位微软联合创始人在推特上宣布了病情，声称自己“出现了轻微症状，现正听从医疗专家们的建议进行隔离，直到恢复健康为止。”...周日盖茨在CNN上发表讲话，讨论了新冠疫情如何导致数字服务呈爆炸式增长，客观上帮助人们和公司无需在附近就能相互联系和互动。他认为，在新冠疫情之后，数字工具使用增加的现象不会消失，而是会永久存在。...5月初，盖茨与BBC讨论了他与许多新冠病毒阴谋论之间的关系，这有时会导致人们在大街上对他大喊大叫。 盖茨说：“想想就让人发笑，因为那实在太疯狂了。”
相关数据采集、预测仓库地址 项目背景 2020年开年爆发的新型冠状病毒，新的一年相信对于大家来说都是地狱模式开局，对于我本人也是如此，打乱了很多计划，有些不知所措，但是灾难面前，唯有同舟共济，对此我个人是乐观的
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