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    R语言ggtree画圆形的树状图展示聚类分析的结果

    今天的主要内容是实现下面这幅图 ?...image.png 做完聚类分析通常可以选择树形图来展示聚类分析的结果,之前公众号也分享过一篇文章 R语言聚类树图小例子 如果样本数不是很多,可以选择矩形的树状图。...但是样本数如果比较多,比如今天一位公众号的读者留言说他有160多个样本,这样矩形的树状图就会比较宽或者比较长。这个时候就可以选择用圆形的柱形图来展示。 那么圆形的树状图如何实现呢?...Y叔开发的ggtree包时用来可视化进化树的,我隐约记得好像也可以用来画聚类分析的树状图。...应该是需要更新到最新的ggtree版本。如何更新R包这里我没有仔细研究。

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    【R语言】如何绘制截断Y轴的柱形图

    在绘制柱形图的时候, 我们经常会遇到Y轴部分数据范围很广的情况。有些数值很大,但是有些有非常小,不在一个尺度范围内。...如果直接使用最大值作为y轴的范围,那么那些数值很小的柱子就会显得很矮,画出来的图会很难看。遇到这种情况我们该如何处理呢?今天就给大家分享一下截断Y轴的柱形图。...2,4,6,8,10),labels=c(2,4,6,800,1000)) segments(-2,7.8,1.2,8,col="white",lwd=8) 2plotrix包 library(plotrix) x<...-c(0:5,6.9,7) yx from<-33 to<-110 bp <- gap.barplot(y,gap=c(from,to),las=2) axis.break(2,from*(1...",style="slash") axis(2,at=from,las=2,bty="n") # 如果想要去掉上、右框,可以去掉gap.barplot(y,gap=c(from,to),las=2)中的

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    用好图表插件神器之先,先了解下最全的Excel图表的基本类型与选择

    散点图的x和y轴都为与两个变量数值大小分别对应的数值轴。通过曲线或折线两种类型将散点数据连接起来,可以表示x轴变量随y轴变量数值的变化趋势。...柱形图系列 注解 柱形图是使用柱形高度表示第二个变量数值的图表,主要用于数值大小比较和时间序列数据的推移。x轴为第一个变量的文本格式,y轴为第二个变量的数值格式。...柱形图系列还包括可以反映累加效果的堆积柱形图,反映比例的百分比堆积柱形图,反映多数据系列的三维柱形图等。 条形图其实是柱形图的旋转图表,主要用于数值大小与比例的比较。...两者的x轴都为第一个变量的文本格式,y轴为第二个变量的数值格式。对于多数据系列的数据一般采用折线图表示,因为多系列面积图存在遮掩的缺陷。 4....树状图适合比较层次结构内的比例,但是不适合显示最大类别与各数据点之间的层次结构级别。树状图通过使用一组嵌套矩形中的大小和色码来显示大量组件之间的关系。 7.

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    1.基础知识(3) --Matlab绘制特殊的图形

    ---- 1、指定坐标轴刻度值和标签 自定义沿坐标轴的刻度值和标签有助于突出显示数据的特定方面。以下示例说明一些常见的自定义,例如修改刻度值的放置位置、更改刻度标签的文本和格式,以及旋转刻度标签。...1.1、更改刻度值位置和标签 创建 x,将其指定为200个介于-10 和10之间的线性间隔值,创建x的余弦函数 y,绘制数据图。...x = linspace(-10,10,200); y = cos(x); plot(x,y) 更改沿 x 轴和 y 轴的刻度值位置。将这些位置指定为一个由递增值组成的向量。这些值无需等距。...对于R2014b之前的版本,应使用 set 函数设置此属性。 1.2、旋转刻度标签 创建散点图并沿每条轴旋转刻度标签。将此旋转指定为一个标量值。正值表示逆时针旋转。负值表示顺时针旋转。...1.3、更改刻度标签格式 创建针状图并将沿 y 轴的刻度标签值显示为美元值。

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    MPU6050姿态解算2-欧拉角&旋转矩阵

    注:本篇中的一些图采用横线放置,若观看不方便,可点击文章末尾的阅读原文跳转到网页版 1 IMU姿态解算 IMU,即惯性测量单元,一般包含三轴陀螺仪与三轴加速度计。...本篇的姿态解算选用的旋转顺序为ZYX,即IMU坐标系初始时刻与大地坐标系重合,然后依次绕自己的Z、Y、X轴进行旋转,这里先自定义一下每次的旋转名称和符号: 绕IMU的Z轴旋转:航向角yaw, 转动 y...角度 绕IMU的Y轴旋转:俯仰角pitch,转动 p 角度 绕IMU的X轴旋转:横滚角row, 转动 r 角度 三次旋转的示意图如下: ?...如下图,IMU在第n个时刻的姿态角度为r、p、y,其含义为IMU坐标系从初始位置,经过绕Z旋转y角度,绕Y旋转p角度,绕X旋转r角度,得到了最终的姿态,此时需要计算下一个时刻(n+1)的姿态。...看下面这个图,还是将其分解为3次旋转: ?

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    数据太多展示不全?试试阿基米德螺线吧!

    背景介绍 对于长轴数据的可视化,使用常规的图形往往不能够完全展示,小编就给大家推荐一个新发布的R包-spiralize,通过阿基米德螺线来对数据进行高分辨率的可视化,能够让我们的图形更加高大上!...R包安装 install.packages("spiralize") library(spiralize) ##最新版本 library(devtools) install_github("jokergoo.../spiralize") 可视化展示 01 基本构图 不同的起始值和旋转圈数 # 左 spiral_initialize(start = 90, end = 360) spiral_track()...(1:n - 1, 0.5, 1:n, 1, gp = gpar(fill = col2(x2), col = NA)) 柱状图 x = seq(1, 1000, by = 1) - 0.5 #...quantile(abs(df$diff), 0.99) # adjust outliers df$diff[df$diff > q] = q df$diff[df$diff < -q] = -q 树状图和系统发育树

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    Self-Driving干货铺4:坐标转换

    在三轴坐标系中,一般定义绕Z轴、Y轴、X轴的旋转角度,如果用Tait-Bryan angle表示,分别为Yaw、Pitch、Roll。...即 · 绕 Z轴 旋转,称之为 航向角,使用Yaw表示 · 绕 X轴 旋转,称之为 横滚角,使用Roll表示 · 绕 Y轴 旋转,称之为 俯仰角,使用Pitch表示 2、坐标转换原理 有了上面这些基本概念我们再以一个例子来说明下坐标转换原理...一个物体的三维位姿可由含有9个分量的3*3矩阵表示(即旋转矩阵),但占空间,也可由只有三个参数的欧拉角来表示但会出现奇异值,而四元数用含有一个实部和三个虚部的形式表示,不仅省空间还可无奇异的表示各种姿态...,其形式如下: 旋转矩阵、欧拉角与四元数之间可以相互转换,其中下式表示四元数到欧拉角的转换。...基于上述理论,ROS有现成的tf库(坐标转换库—Transform Library),它会通过单层多叉树的树状结构实现了系统中任意一点在所有坐标系中的转换。

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    关于南丁格尔图的“绘后感”

    导入R前的数据整理 一、数据整理的原则 我自己总结的原则是,如果你画的是二维图,即只有X和Y轴的图,那么你的数据需要整理成核心只有两列的数据表。...假设你画的是三维图(当然,我没有画过,暂时这样预设),即有X、Y、Z轴,那么我想,你需要将数据整理成核心有三列的数据表。...这样,我们需要将x轴的数据整理成1列,将y轴的数据整理成1列,将各种分组的方式,按照需要整理的若干列,与x和y列的数据对应起来即可。...如果柱状图带着X轴的刻度标签添加极坐标图层,X轴的标签是不旋转的。即原来是水平方向放在X轴的下方,添加极坐标后,标签依然水平围绕着极坐标。...但是画柱状图的时候,默认会将x轴的分类变量自动因子化然后作图。自动因子化的时候,因子水平按照字母顺序排列,因此作图后x轴的顺序是字母顺序。因此需要手动指定因子水平的顺序。

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    灵活的热图谁不喜欢?

    导语 GUIDE ╲ 热图是一种流行的可视化高维数据的图形方法,其中一个数字表被编码为彩色单元格的网格。矩阵的行和列按顺序排列以突出显示模式,并且通常伴随有树状图。...背景介绍 热图可以说是我们在日常可视化中最常用到的图形之一了,绘制热图的R包和工具也是数不胜数,我们也介绍过许多常见的工具,比如pheatmap、complexheatmap等等,今天小编给大家介绍一个可以交互式绘制热图的...“mean”给出了我们默认从其他包中的热图函数获得的输出,例如 gplots::heatmap.2。选项“none”为我们提供了树状图,没有任何基于数据矩阵的旋转。...用户可以使用 Rowv 和 Colv 参数为热图的行/列提供自己的树状图: x <- as.matrix(datasets::mtcars) library("dendextend") row_dend...R包中的一员,heatmaply可以绘制交互式的热图,其许多参数设置也和ggheatmap、pheatmap等常用的R包有联动,在色彩的美观度上也是非常优越,通过zoom in/zoom out也可以让我们方便的查看热图的细节

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    泊车必备 | 一文详解AVM环视自标定

    3.1 什么是欧拉角 欧拉角是坐标系旋转的表示,针对于相机坐标系可定义为(相机坐标系如下): 相机坐标系 绕相机x轴旋转,得到俯仰角pitch 绕相机y轴旋转,得到航偏角yaw 绕相机Z轴旋转,得到滚转角...其中z轴为相机光轴,朝向相机正前方;x轴朝向相机右侧;y轴朝向正下方。因此绕x轴旋转为俯仰角,绕y轴旋转为航偏角,绕z轴旋转为滚转角。...进一步地,在原始XYZ相机坐标系下观察旋转后的xyz坐标系的表征如下,其中 y 表示yaw角 相机绕x轴旋转(pitch) 上图中相机坐标系XYZ绕X轴旋转pitch角,其中X轴为垂直与YOZ平面朝外...相机绕y轴旋转(yaw) 相机绕x轴旋转(pitch) 这回懂了吧,网上csdn、某户、github上经常看见这个矩阵里面的元素有正有负,大家写的都不一样。...相机坐标系与道路坐标系的转换关系可以理解成相机坐标系先绕x轴旋转某个pitch角度,再绕y轴旋转某个yaw角度,最后绕z轴旋转某个roll角度;也可以理解成先绕x轴旋转某个pitch角,再绕z轴旋转某个

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    Android 动画:手把手教你使用 补间动画 (视图动画)

    ); // 步骤3:播放动画 效果图 下面展示轴点为(50%,50%) & 轴点为(20%,30%)的情况 ?...// 5. pivotXType:缩放轴点的x坐标的模式 // 6. pivotXValue:缩放轴点x坐标的相对值 // 7. pivotYType:缩放轴点的...="50%" // 旋转轴点的x坐标 android:pivotY="0" // 旋转轴点的y坐标 // 轴点 = 视图缩放的中心点 // pivotX pivotY,可取值为数字,百分比...:旋转轴点的x坐标的模式 // 4. pivotXValue:旋转轴点x坐标的相对值 // 5. pivotYType:旋转轴点的y坐标的模式 // 6....从上图可以看出: 以屏幕底边为X轴,屏幕左边为Y轴; 当Activity在X轴 = -100%p时,刚好完全超出屏幕到左边(位置1) 当Activity在X轴 = 0%p时,刚好完全在屏幕内(位置2)

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    【教程】详解相机模型与坐标转换

    相机坐标系:单位m,原点是光心,x和y轴与像素坐标系u轴和v轴平行,z轴为相机的光轴。光心到像素平面的距离为焦距f。相机坐标系上的点和成像平面坐标系上的点存在透视投影关系。...【我们这里是 => 右手坐标系+旋转坐标系本身】 旋转顺序:外旋(z->y->x)、内旋(x->y->z) 根据每次旋转是绕旋转之后的轴旋转,还是固定轴旋转,将欧拉角分为内旋(intrisic roatation...)和外旋(extrinsic rotation) R外=R(Z)R(Y)R(X) R内=R(α)R(β)R(γ) 姿态的变换是相对模型本体的,是内旋,这是不容置疑的,即为偏航-俯仰-滚转。...$q$和$\epsilon$由无人机的姿态、相机的方位角和仰角决定。   在图4中,$M_1$和$M_2$分别表示图像平面和物平面。...\gamma , \theta )$为摄像机坐标系到无人机坐标系的旋转矩阵,$R o t _ { B } ^ { W } ( \phi , \gamma , \theta ) $为无人机坐标系到世界坐标系的旋转矩阵

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    Direct3D 11 Tutorial 5: 3D Transformation_Direct3D 11 教程5:3D转型

    图1.平移的影响 ? 在3D中,空间通常由原点和来自原点的三个唯一轴定义:X,Y和Z.计算机图形中通常使用多个空间:对象空间,世界空间,视图空间,投影空间和屏幕空间。...图2.在对象空间中定义的立方体 ? 旋转 旋转是指围绕穿过原点的轴旋转顶点。 三个这样的轴是空间中的X,Y和Z轴。 2D中的示例是逆时针旋转矢量[1 0] 90度。 旋转的结果是向量[0 1]。...0 0 1 图6显示了围绕Y轴旋转以原点为中心45度的立方体的效果。...图3.围绕Y轴旋转的效果 ? 缩放 缩放是指沿轴方向放大或缩小矢量分量的大小。 例如,矢量可以沿所有方向按比例放大或仅沿X轴按比例缩小。...下图显示了沿X轴缩放2并沿Y轴缩放0.5的效果。 图4.缩放的效果 ? 多重转换 要将多个变换应用于矢量,我们可以简单地将矢量乘以第一个变换矩阵,然后将得到的矢量乘以第二个变换矩阵,依此类推。

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