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R语言关联规则可视化:扩展包arulesViz的介绍

关联规则挖掘是一种流行的数据挖掘方法,在R语言中为扩展包arules。然而,挖掘关联规则往往导致非常多的规则,使分析师需要通过查询所有的规则才能发现有趣的规则。通过手动筛选大量的规则集是费时费力。...在本文中,我们基于探索关联规则的R扩展包arulesViz,提出几个已知的和新颖的可视化技术。...2、数据准备和arulesViz的统一接口 使用扩展包arulesViz之前,我们首先需要加载它。这个包会自动加载其他所需要的数据包,如arules。...> subrules2 <- head(sort(rules, by = "lift"), 10) arulesViz包含了一些基于图形的可视化展示,使用Rgraphviz扩展包的一些接口。...参考文件:《Visualizing Association Rules-Introduction to the R-extension Package arulesViz》

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Mac系统R语言升级后无法加载包报错 package or namespace load failed in dyn.load

p=16691 问题重现: 我需要安装R软件包stochvol,该软件包 仅适用于3.6.0版的R。因此,我安装了R(3.6.0 版本),并使用打开它 RStudio。...但是现在  ,即使我成功 使用来 安装软件包,也无法加载任何库 。具体来说,我需要加载的库是stochvol  ,Rcpp和 caret。我尝试重新安装 R, 但仍然无法正常工作。...(在升级之前,一切正常,除了我无法安装 quadprog,所以也无法安装 forecast 软件包)。  解决方案: 我了解到,升级到的新版本后,您需要重新编译旧软件包 R。...dependencies=TRUE, repos="https://cloud.r-project.org") 报错历史截图以及最后成功加载的截图。 ...---- 最受欢迎的见解 1.如何解决线性混合模型中畸形拟合(SINGULAR FIT)的问题 2.在UBUNTU虚拟机上安装R软件包 3.WINDOWS中用命令行执行R语言命令 4.R语言GGSURVPLOT

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    R语言GD包地理探测器报错、没有结果的解决

    本文介绍在利用R语言的GD包,实现自变量最优离散化方法选取与执行、地理探测器(Geodetector)操作时,出现各类报错信息、长时间得不到结果等情况的解决方案。   ...在之前的文章R语言GD包实现栅格图像地理探测器与参数离散化方法寻优中,我们介绍了基于R语言的GD包,实现地理探测器的详细方法——当时在进行前面这一篇文章所述操作的过程中,我暂时没有遇到莫名运行报错、失败的问题...2 解决方案   经过无数次的重复、尝试,终于找到了在利用R语言GD包进行地理探测器分析时,出现各类报错、卡顿问题的大致解决方案——当然,这里也提到了是“大致”的解决方案,因为这里具体出错的原因我也不是很清楚...在一开始第一次用GD包进行地理探测器分析时,我当时的分析数据共有十几列,行数高达几十万行;而后来开始遇到这些报错问题的时候,我的分析数据列数没有变,但是样本数量变少了,大概只有几千行,少数甚至只有几百行...包,大家可以参考栅格数据实现地理探测器:基于R语言geodetector包。

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    迄今为止最强大的upset plot R包,没有之一!

    这些包各有各的特色,基本用法差不多,在一些组合图形方面各有不同,大家可以翻看之前的文章。...今天再介绍一个画upset plot的R包(感觉有点像收集龙珠了),这个包不得了,官方宣传:具有UpsetR的所有优点,且完全支持ggplot2语法!...和其他同类型R包的比较 安装 数据集 基础使用 挑选交集 交集选择模式 展示所有集合 添加图形 调整交集条形图(intersection size) 调整标签外观 增加颜色映射 调整高度比例 隐藏intersection...size 展示集合比例 使用ggplot2继续调整 和其他同类型R包的比较 UpsetR:画upset plot的强大工具和先锋,但是不支持ggplot语法,且很久没更新了; ggupset:支持ggplot...plot R 包!

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    看起来全部的报错但是R包居然是安装并且成功加载

    给一个学员设置R语言安装以及R包环境,遇到了一个超级有意思的现象,首先呢,在中国大陆网络设置太难了,不出意外GitHub在线安装失败: > if (!...GitHub包的压缩包文件网络传递给学生。...下载GitHub包的压缩包文件本地安装 前面的 install_github 命令,这个时候替换成 install_local 命令即可: > install_local('carmonalab-UCell-v1.1...因此不会被安装 将程序包安装入‘C:/Users/win10/Documents/R/win-library/4.1’ (因为‘lib’没有被指定) 尤其是: 有二进制版本的,但源代码版本是后来的:...It probably needs manual configuration ********************************************** 但是居然不影响它的成功安装和加载

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    macOS无法打开未验证安装包的解决方案:无法打开‘XXX.pkg’,因为无法验证其是否包含可能危害Mac安全或泄漏隐私的恶意软件

    macOS无法打开未验证安装包的解决方案:无法打开‘XXX.pkg’,因为无法验证其是否包含可能危害Mac安全或泄漏隐私的恶意软件 在macOS Ventura及以上版本中,系统安全性进一步加强,默认情况下不允许运行未验证或未签名的应用程序...当我们尝试安装一些未被官方验证的安装包(如“XXX.pkg”)时,可能会看到如下提示: “无法打开‘XXX.pkg’,因为无法验证其是否包含可能危害Mac安全或泄漏隐私的恶意软件。”...第二步:找到拦截的安装包提示 在隐私与安全页面的“安全性”部分,您会看到如下提示: 已阻止“XXX.pkg”以保护Mac安全。 这是macOS提示您该程序无法通过验证,阻止其运行。...如何确保安装包安全? 确保安装包来源于官方渠道或可信第三方。 对下载的安装包进行SHA256或MD5校验,以验证文件完整性。 3. 必须信任所有来源吗? 不需要!...与此同时,确保安装包来源可靠,是避免安全问题的根本。 如果本文对您有所帮助,请收藏并分享!让更多用户轻松解决macOS无法验证安装包的困扰!

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    NBT:单细胞转录组新降维可视化方法PHATE

    生物医学数据通常非常嘈杂,例如PCA和Isomap之类的方法无法显著消除噪声以进行可视化,从而导致无法识别细颗粒度的局部结构。 其次,非线性可视化方法(例如t-SNE)通常会扰乱数据中的全局结构。...第三,许多降维方法(例如,PCA和diffusion maps)无法针对二维(2D)可视化进行优化,因为它们不是专门为可视化设计的。...其实从图中就可以看出PATHE能反映局部和全局结构,并且并没有像umap在一定情况下会出现图像的变形。 运行示例 为了在R中使用PHATE,还必须安装Python解释器和包管理工具。...安装软件包 # 先安装Python包 pip install --user phate # 再安装R包 install.packages("phateR") if (!...Rmagic)) install.packages("Rmagic") 如果从未使用过MAGIC,则还应该从命令行安装MAGIC,如下所示: pip install --user magic-impute 加载软件包

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    camcorder优雅生成GIF动态图

    ❝本节来介绍如何使用「camcorder」包来将「ggplot2图形转换为GIF动画文件」,下面小编就来通过几个案例做演示,希望各位观众老爷能够喜欢。...更多详细内容请参考作者官方文档❞ 官方文档 https://thebioengineer.github.io/camcorder/ 关注下方公众号下回更新不迷路 加载R包 library(tidyverse...(mtcars, aes(x = mpg, y = hp)) + geom_smooth() + geom_point(aes(color = disp)) + scale_color_viridis_c...(mtcars, aes(x = mpg, y = hp)) + geom_smooth() + geom_point(aes(color = disp)) + scale_color_viridis_c...示例表示结果将保存到桌面上一个名为 "plot" 的文件夹内,文件名为 "diamonds.gif" first_image_duration: 第一帧图像在GIF动画中显示的时间,单位是秒。

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    【错误记录】Ubuntu 安装软件报错 ( 下列软件包有未满足的依赖关系:E: 无法修正错误,因为您要求某些软件包保持现状,就是它们破坏了软件包间的依赖关系。 )

    git 软件 , 报如下错误 : root@octopus:~/ijkplayer# root@octopus:~/ijkplayer# sudo apt-get install git 正在读取软件包列表...完成 正在分析软件包的依赖关系树 正在读取状态信息... 完成 有一些软件包无法被安装。...如果您用的是 unstable 发行版,这也许是 因为系统无法达到您要求的状态造成的。该版本中可能会有一些您需要的软件 包尚未被创建或是它们已被从新到(Incoming)目录移出。...下列信息可能会对解决问题有所帮助: 下列软件包有未满足的依赖关系: git : 依赖: liberror-perl 但无法安装它 E: 无法修正错误,因为您要求某些软件包保持现状,就是它们破坏了软件包间的依赖关系...root@octopus:~/ijkplayer# 二、解决方案 ---- 点击右下角的菜单按钮 , 选择 " 软件和更新 " 功能 , 在 " 软件和更新 " , 的 " 更新 " 选项卡上 ,

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    关联分析(3):Apriori R语言实现

    在关联分析(1):概念及应用中我们介绍了关联分析的基本概念及应用场景,关联分析(2):Apriori产生频繁项集我们介绍了Apriori算法的原理,本篇文章我们将进行关联分析的R语言演示。...R语言实现 我们对UCI机器学习库上下载的美国众议院议员投票记录数据,进行关联分析。在R中,可以直接调用arules包中的apriori()函数训练模型。 导入包与数据。...arulesViz包可以将关联规则进行可视化输出,“header=F”设置读入数据时,首行不作为列名。...library(arules) library(arulesViz) data<-read.csv("D\\voting-records.csv", header=F) 训练模型和性能评估。...lift为提升度,表示前件存在后件发生的概率,是前件不存在但后件发生的倍数。

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    一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D

    一个震撼的交互型3D可视化R包 - rayshader 作者:张虎 协和 编辑:陈同 生信宝典 ? 虽然3D的plot见得比较多了,但是看见这样的R包,我的心还是砰了一下,这个简直不能再好看了!...敲黑板,这个R包超简单!!!对于刚学习R语言的同学们来说,会被圈粉哒! 该包的主要功能就是将ggplot2画出来的2D图像变为3D图像,不说废话,直接上代码。...# 如果缺失sf包,建议先安装 library(sf) nc = st_read(system.file("shape/nc.shp", package="sf"), quiet = TRUE) #加载包自带的数据...gg_nc = ggplot(nc) + # 加载North Carolina地图 geom_sf(aes(fill = AREA)) + # 绘制地理数据模型,sf对象,全称Simple feature...#该数据是我们常见的R中的模拟数据 head(mtcars) mtcars_gg = ggplot(mtcars) + geom_point(aes(x=mpg,color=cyl,y=disp)

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    SCI写作:色盲友好色板

    相对于普通人群,红绿色盲患者对红色和绿色的分辨能力很差,但对黄、蓝色的辨别则没有问题。...R语言中,有一些配置好的色盲友好色板,例如在ggplot2中常用的viridis色板,其使用方法如下所示: library(ggplot2) library(gcookbook) ggplot(uspopage...magma(a)、地狱inferno(b)、血浆plasma(c)和翠绿viridis(d),如下所示: 以上为离散颜色,如果为连续颜色,可加载viridis包,如下所示: library(viridis...="D") 当绘制好论文配图后,在Adobe Illustrator(AI)中可以检验色盲视野下颜色对比情况,方法为:视图—校样设置—选择色盲类型,例如上图红色色盲校样颜色如下: 更多资料可参考《R...Graphics Cookbook》,电子书网站为: https://r-graphics.org/

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    Python可视化 | xarray 二维绘图配色方案设置

    默认配色方案viridis 更改配色方案可需更改参数cmap(colormaps). xarray 绘图模块默认对全正/负数据采用viridis(顺序配色)配色方案,而对含正和负的数据采用RdBu_r(...配色方案:Spectral 若颠倒配色方案颜色顺序,需在参数cmap配色方案中的名称后部添加_r,如Spectral_r. ds.Tair.isel(lon=1).plot( x="time",...Matlibplot 2.0 之前的版本曾将jet作为默认的配色方案,但该配色方案很容易出现因图形亮度接近而致使颜色无法分辨的问题。 ?...import seaborn as sns seaborn 包的配色方案如下。 感知统一顺序配色方案 rocket ? rocket_r(下同) ? mako ? flare ? crest ?...获取子配色方案 绝大多数 CMasher 内置顺序配色方案的亮度范围是从黑至白的,因为在这样的亮度变化下可获得最佳的色彩感知效果,但有时候并非我们想要的。

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    比Python绘制散点密度图还方便?!怎么选?当然全都要...

    但是也有同学一直使用R语言进行可视化绘图,所以今天这篇推文就给大家推荐R语言快速绘制散点密度图的方法。...(ps:Python和R我全都要) R语言中虽然可以使用ggplot2中的geom_density_2d()函数完成散点密度图的绘制,但在参数的设置上稍显复杂,所以我们今天给大家推荐一个非常好用的拓展工具包...-「ggpointdensity」 简单介绍 ggpointdensity是一个R语言中用于创建散点密度图的可视化工具包。...参数效果 当然,分面绘图和修改散点的形状等操作,都是可以完成的,可视化效果如下: facets分面 修改散点形状 更多关于ggpointdensity包的用法和案例,可参考ggpointdensity包官网...除了上面介绍到的原因之外,无门槛的微信群难免会鱼龙混杂,问题和质量都无法得到保证,而且一些关键问题经常被淹没,且没有沉淀价值。

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    gguidance优雅的自定义图例

    欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍一款R包「gguidance」,其主要可以用来自定义设置图例及刻度条,在实际操作中非常的实用,下面小编来简单介绍几个案例来做展示,希望各位观众老爷能够喜欢,更多详细文档请参考作者官方文档...❞ 官方文档 ❝https://github.com/teunbrand/gguidance ❞ 加载R包 install.package("pak") pak::pak("tidyverse/ggplot2...colour = class) + guides(colour = "legend_string") 设置图例两端形状 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c...(guide = "colourbar_cap") 设置图例为小提琴 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c(guide = guide_colour_violin...(density = mpg$cty)) 设置图例为直方图 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c( guide = guide_colour_histogram

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    空间地理数据可视化之 ggplot2 包及其拓展

    点击下方公众号,回复资料分享,收获惊喜 前言 上次 R 可视乎主要讲述了《Geospatial Health Data》[1]一书中关于空间地理数据可视化用 R 包制作地图的基础内容,参见 R可视乎|空间地理数据可视化...本篇将继续介绍空间地理数据可视化的 R 包和函数。..., scale_*_distiller()、 scale_*_brewer() 使用 RColorBrewer 包的颜色(Neuwirth 2014),scale_*_viridis 使用 viridis...下图是用 viridis 包中的 scale_*_distiller() 函数和 ggplot() 函数绘制的 1974 年北卡罗来纳州婴儿猝死的地图: 例子 : library(viridis) map...4.2 plotly 包 R 的 plotly 包是一个基于浏览器的交互式图表库,它建立在开源的 JavaScript 图表库 plotly.js 之上。

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