无法在R中安装shiny包 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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BiocManager无法安装R包

但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，如下所示： ?...其实真正的问题还是在联网上面！也就是说options(download.file.method = 'libcurl')并没有完全解决问题。...='libcurl') 果然，现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧使用管理员打开R哦，然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn

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R语言 shiny包中的交互调用函数renderUI

本次展示shiny的功能有： 1、读取本地数据； 2、交互展示数据（view） 3、动态交互作图（自动读取上传数据的列名）体验网址：https://yanshenli.shinyapps.io.../Desktop/ library(shiny) library(ggplot2) ui <- fluidPage( navbarPage("User Interface:",tabPanel("...x = input$variableNames_x, title = "ggplot") } }) } shinyApp(ui, server) 一个完整的shiny...，在ui中通过*input调整数值参数、上传数据等，并将数据传递给server进行相应计算；然后，Server对数据进行计算、绘图，并将计算结果（图片、表格等）返回给ui 最后，通过ui中的*output

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「R」Windows R 安装包显示无法锁定目录怎么搞？

今天笔记本电脑装包反反复复出现下面错误： Error in install.packages : ERROR: failed to lock directory ‘D:\Tool\R_Library’...for modifying Try removing ‘D:\Tool\R_Library/00LOCK’ 尝试下解决方案： install.packages("Rcpp", dependencies...= TRUE, INSTALL_opts = '--no-lock') 把 Rcpp 改成要装的包名。...不行的话把报错文件删了： unlink("D:/Tool/R_Library/00LOCK", recursive = TRUE) 参考：https://stackoverflow.com/questions.../questions/14382209/r-install-packages-returns-failed-to-create-lock-directory

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ChAMP R包安装中的事故

ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...(now), ...): 无法载入共享目标对象‘D:/work/R-3.4.3/library/mvtnorm/libs/x64/mvtnorm.dll’：: `已达到了DLL数目的上限......dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统，R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！

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「R」安装和使用 R 包

方案如果你正在使用支持 R 的图形界面软件，应该存在通过菜单栏方式安装 R 包的选项（例如，常用的 Rstudio 中，可以点击菜单栏 Tools 中的 Install Packages… 进行 R...这里主要介绍如何用命令行来安装 R 包，如下所示： install.packages("reshape2") # reshap2为包名在一个新 R 线程中使用该包之前，你必须先导入它。...library(reshape2) 如果你在一个脚本中使用该包，将这一行输入脚本中。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本，使用以下命令： update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ，管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包，由于普通用户没有更改权限...，显示所有已安装的包中具有新版本的包 new.packages 返回一个矩阵，包含所有已安装的新包 download.packages 下载一系列R包到本地目录 install.packages 从资源库下载安装一系列

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R包的安装

2、作用：实现特定的功能，你需要什么功能，安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机，需要使用微信与人聊天，你就按照微信APP，需要上腾讯视频看电视剧，你就安装腾讯视频APP。...3、在哪可以找R包：（1）官方网站CRAN网站下载，使用“install.packages（）”函数来安装（2）Bioconductor网站下载，主要是生物生信相关的...R包，使用 “BiocManager::install()来安装（3）github网站，是R包作者写的，没有经过审核，使用”devtools::install_github...几乎不使用，使用时需要写明R包的作者，就是指明选择谁写的R包。...说人话，智能手机安装的腾讯视频，只要你不卸载，就一直在你的手机里，需要看电视剧是打开APP，看完电视了你退出APP，再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。

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在UBUNTU虚拟机上安装R软件包

安装某些软件包时可能会出现一些问题。一个窍门是打开终端然后使用sudo命令安装一些软件包，（输入密码后）。...apt-get install r-cran-plyr r-cran-xml r-cran-reshape r-cran-reshape2 r-cran-rmysqlsudo apt-get install...r-cran-rjavasudo apt-get install r-cran-glmnetsudo apt-get build-dep r-cran-bootsudo apt-get build-dep...r-cran-classsudo apt-get build-dep r-cran-clustersudo apt-get build-dep r-cran-codetoolssudo apt-get...apt-get build-dep 然后，在RStudio中，输入 install.packages("RCurl")install.packages("xml")install.packages("

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在Ubuntu下安装单细胞3大R包

查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说，很多R包的安装对R版本是有要求的，比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0)，但是并不需要最新版R语言。...r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包这里只是举例，我比较常用的包，安装非常耗时，一般来说小半天就过去了。...','shinydashboard','stringr','DT','ggplot2'),ask = F,update = F) 安装shiny-server及Rstudio-server https...安装我们的主角-3大R包从代码的角度来看，很简单： options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn...web/packages/Seurat/index.html http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.html R包安装失败通常是

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Bioconductor 中的 R 包安装教程(续一)

这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇，完整的文章可以点击阅读原文查阅。...以 DiffBind 包为例，DiffBind==3.4.0 是基于 Bioconductor==3.14（对应 R-4.1）开发的；我们在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中执行...BiocInstaller 安装我们以在 R-3.4（Bioconductor==3.6）中安装最新版本的 clusterProfiler 为例。...在 Aanconda2 环境 R==3.4.3 中安装 clusterProfiler，发现package ‘clusterProfile’ is not available (for R version...），从而导致无法正常安装。

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R语言 | R包安装及向量

关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了，网上有很多相关内容，如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装问：什么是R包？...（对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象，但是没关系，我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念） 1.R包安装：第一次安装一个包，使用命令install.packages()即可。...#示例：安装ggplot2包 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是，包的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R包载入：安装完成后，想要调用这个包中的命令、数据等信息，就需要先载入这个包，需要用到的命令为library()。...2.向量元素提取：通过在方括号[ ]中给定元素所处位置的数值，我们可以访问向量中的元素。例1：通过data1[2]，将data1中处在第二位的元素返回出来。

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R包来源及安装指定版本R包方法

说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....Github 部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可通过其Github进行安装，通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R包复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装在这里也许能找到你需要的R包历史版本。...CMD INSTALL limma_1.8.10.tar.gz 但其实，在实际操作时我发现能不能装上还得看是什么R包以及你的网络情况。

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R问题｜如何本地安装R包

简介平常在各种R语言群里，总会遇到关于安装R包的问题，例如：搭载在github上的R包，由于网速（外网）原因而无法下载该怎么办？...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包，通过本地安装。网上好多解决方案都是基于R gui的，但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例：教程使用bing搜索该包，找到相应网站[1]。关键词：R包名称+R，或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧：R包名称+R 找到Downloads板块，下载对应的压缩包这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖包的包可能会很头疼，就怕安装完成，他还说你有其他包没安装，那你只能“将错就错”了！

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求解答：为什么在r-stdio,cran安装R包总出错？

R包安装方法有： 1. 自动安装（在线安装）在R的控制台,输入install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra 若要指定安装目录 (e.g....手动安装（离线安装） Windows:下载package.zip文件打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” ---- 在Rstudio...中也会经常遇到R包安装错误的提示。...以Rstudio中的安装错误为例，给大家做一个本地安装示例。最近安装tidyverse包遇到过类似的问题：包找不到啦！校验包的大小与下载的包大小不一样！...Github上的R包路径") 2.更新R包列表（Rstudio）这里仅说明Rstudio中的一键更新功能。

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centos R包 tidyverse安装

tidyverse安装失败，install.packages('tidyverse') 错误原因大概是其中有个依赖包xml2安装不上，解决办法是yum install libxml2-devel，这样就可以安装...xml2了，也可以安装tidyverse了

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R包来源及安装

说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("包名")来安装 2....部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可以在其Github上安装，通过devtools::install_github("用户名/包名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R包复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...CMD INSTALL limma_1.8.10.tar.gz 但其实，在实际操作时我发现能不能装上还得看是什么R包以及你的网络情况。

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R包安装方式以及Github包安装报错解决

写在开头最近在疯狂补数据挖掘课以及跟着生信技能树整理的#R语言在补充R语言基础知识恰好看到了无法在线下载安装GitHub包？...R包安装的方式之前在学习数据挖掘课程的时候，就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦，R包安装与使用那我们先回顾一下，基本的R包安装方法——配置好镜像，然后按照对应的来源安装需要的R包。...来自CRAN的包可到CRAN的镜像中查找CRAN.r_project（https://cran.r-project.org/） CRAN_R包 install.packages("ggplot2"...在使用remotes将R包导入Rstudio中 # 括号里填入R包所在的位置 remotes::install_local("....() #查看已安装的R包 search() #查看已载入的R包查看已经安装的R包查看已经载入的R包 R包安装成功的唯一标准：library()没有error——小洁老师

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R语言入门mac——RStudio安装➕R包安装【附安装链接】

R语言入门mac——安装【附安装链接】这里写目录标题 R语言入门mac——安装【附安装链接】一、总体安装步骤 1 安装R 2下载RStudio 二、R包安装一、总体安装步骤 1 安装R RStudio...需要R 3.0.1+ 下载链接：https://cran.rstudio.com/ 2下载RStudio 下载链接：https://rstudio.com/products/rstudio/download.../ 二、R包安装下面展示 r包安装代码 rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https

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疑难杂症-R中的Rwordseg包安装

一、通过install.packages安装步骤： 1、在R中先装rJava包 install.packages(“rJava”) 2、没有装JDK的要到这里去下载： http://www.Oracle.com...二、通过Rwordseg的zip包进行离线安装不出意外，大部分版本的R都可以通过以上方式安装好Rwordseg包。我在帮小伙伴安装的时候，也确实遇到过疑难杂症，按照步骤，依旧搞不定，不断报错。...如果您的电脑或者目前正在使用的R版本实在无法通过install.packages的在线方式安装Rwordseg包。...当然不用苦恼，有更便捷的方式，就是直接下载Rwordseg的zip包，在R中加载zip包进行离线安装，只需几秒钟即可。...方法：在程序包中选择(install packages from local files)，离线安装zip包即可。 ? 我将Rwordseg的压缩包上传至了资源中，大家可以下载进行离线安装。

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R语言入门之R包的安装

通常来说，R包的安装主要有四种方法，包括：1）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；2）从Bioconductor上下载R包并安装；3）从Github上下载R包并安装；4）手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装： 1）首先获取下载的R包的名字，比如下载metafor这个R包，可以先在官网（https://www.r-project.org/）上找到这个包，了解一下这个包的详细内容和使用说明...，接下来使用： install.packages('metafor') 即可顺利安装该R包。...3）接下来便是安装源自Github（https://github.com/）的R包了，它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github...，github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名，否则无法进行下载安装。

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