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代谢组数据分析一:从质谱样本制备到MaxQuant搜库

在有机小分子检测领域,该技术凭借其高分辨率和强选择性的特性,能够有效分离和检测复杂样品中的有机小分子,为化学研究、药物开发和环境监测等领域提供有力支持。...DIA数据非依赖采集,在一级图谱扫描过程不对碎裂母离子做筛选,而是设置窗口(窗口大小依据仪器和软件设定),落在该窗口内的母离子全部进入二级碎裂得到二级图谱。优点:全面获取所有离子的碎片信息。...、漏切等;母离子或子离子质量偏差;搜索引擎的打分无法区分谱图对应的正确肽段和错误肽段,因此需要评价肽段鉴定的可靠性,搜索引擎才能根据鉴定到的可信肽段序列进行蛋白质推断。...该数据库整合了蛋白质的所有信息,为全世界的研究者提供服务。自定义数据库:除了选择公共数据库外,研究者还可以根据实际需求自行添加数据或从头开始构建蛋白质数据库。...在设置完所有参数后,点击上面File选择保存parameters files,方便下次重复运行。 完成保存设置参数文件后,最左下方提供选择CPU数目,一般设置电脑total(CPU) -1的数目。

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代谢组数据分析(一):从质谱样本制备到MaxQuant搜库

在有机小分子检测领域,该技术凭借其高分辨率和强选择性的特性,能够有效分离和检测复杂样品中的有机小分子,为化学研究、药物开发和环境监测等领域提供有力支持。...DIA数据非依赖采集,在一级图谱扫描过程不对碎裂母离子做筛选,而是设置窗口(窗口大小依据仪器和软件设定),落在该窗口内的母离子全部进入二级碎裂得到二级图谱。优点:全面获取所有离子的碎片信息。...比如错切、漏切等; 母离子或子离子质量偏差; 搜索引擎的打分无法区分谱图对应的正确肽段和错误肽段,因此需要评价肽段鉴定的可靠性,搜索引擎才能根据鉴定到的可信肽段序列进行蛋白质推断。...输入数据是MaxQuant结果文件的txt; 运行createReport(txt_folder); 结果: proteoQC R包 数据库 关于蛋白质数据库的选择与构建,可以归纳为以下几点: 常用数据库...该数据库整合了蛋白质的所有信息,为全世界的研究者提供服务。 自定义数据库:除了选择公共数据库外,研究者还可以根据实际需求自行添加数据或从头开始构建蛋白质数据库。

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    这期Nature封面「雪崩」了!

    接下来,在激发态吸收(ESA)步骤中,激发离子吸收更多的光,从而进入更高能量的激发态。光频率的选择是为了确保这种激发的光被强烈吸收。 ? 光子雪崩的机制。...这需要高浓度的镧系离子为CR提供足够的邻居。然而,镧系离子浓度过高会阻碍雪崩的发生(这个问题被称为浓度淬火)。因此,以前产生光子雪崩在纳米晶体中,使用的镧系物浓度仅为1-2摩尔%8。...但这些浓度太低,无法维持真正的光子雪崩。 研究人员现在已经在纳米晶体中获得了光子雪崩,这些纳米晶体中含有比以前研究中更高比例的镧系离子。...报道的上变频的极端非线性为应用提供了机会。...作者的成像设置是简单的相比,其他超分辨率技术2,10,只需要一个单一的激光波长和不到十分之一的激光功率。

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    谷歌实现量子霸权的超导量子比特,或将败于光子量子比特

    与上述声明无关,值得注意的是,谷歌以及其批评者IBM都选择了相同类型的硬件作为量子计算工作的基础。还有一家规模较小的竞争对手Rigetti也是如此。...每个量子比特由一个电子组成,这个电子由于氮无法与第四个碳原子结合而挂在那里。这个电子是用光学寻址(设置和读取)的。因此,第一个问题是在晶体中搜索少数可以单独处理的孤立空位。...事实上,该位置是由光学定义的,聚焦于用于设置和读取量子态的光。 从本质上讲,量子比特状态是由与晶体内的许多离子相互作用的光脉冲设置的。要产生更多的量子比特需要相当复杂的光学装置。...成本为王 我们最终会采用一种技术来统治它们吗?我认为在很大程度上是的,一种技术将会占据主导地位。而且,我认为光子量子计算机将会胜出,即使超导量子比特目前占据统治地位。...是的,光子电路在设计上面临着挑战,但一旦克服了这些挑战,光子电路的成本将大大降低。冒着听起来像未来主义者的风险,我认为前两到三代将是超导量子比特和离子计算机的混合体,然后光子量子计算机将大干一场。

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    一种改进的深度极限学习机预测锂离子电池的剩余使用寿命

    为了解决粒子过滤器(PF)无法在预测阶段更新粒子重量和粒子退化的问题,使用F分布粒子过滤器和核平滑算法来预测飞机锂离子电池的剩余使用寿命。...基于锂离子电池熵估计的新型实用生命周期预测方法,其准确度至少为94%。为了降低循环寿命测试的成本,使用深度强化学习来预测锂离子电池的长期退化趋势。...基于一种新的混合Elman LSTM方法,该方法将经验模型分解算法与长期和短期记忆以及Elman神经网络相结合,用于剩余电池寿命预测。基于Transformer的神经网络,以完成锂离子剩余寿命的预测。...然而,DELM超参数的选择影响其预测效果,超参数的不当选择会导致预测精度差。...最后,将CGWO-DELM与BP、DELM、SVR和LSTM预测方法进行了比较,并通过与公开可用的预测数据的比较分析验证了CGWO-DDELM的优异性能。

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    等离子刻蚀技术

    在今天没有一个集成电路芯片能在缺乏等离子体刻蚀技术情况下完成。刻蚀设备的投资在整个芯片厂的设备投资中约占10%~12%比重,它的工艺水平将直接影响到最终产品质量及生产技术的先进性。   ...等离子刻蚀的原理可以概括为以下几个步骤: ● 在低压下,反应气体在射频功率的激发下,产生电离并形成等离子体,等离子体是由带电的电子和离子组成,反应腔体中的气体在电子的撞击下,除了转变成离子外,还能吸收能量并形成大量的活性基团...由于电子在磁场和电场的共同作用下将作圆柱状回旋运动而不是电场下的直线运动,磁场的存在将直接导致反应气体电离截面的增加,磁场的引进会增强离子密度,并使得等离子刻蚀技术可以在更低气压下得以运用(离子密度的增加,撞击表面的离子能量也可以在不降低刻蚀速率的情况下被降低,从而提高刻蚀选择比。...目前在高端芯片生产中的导电体刻蚀基本上都采用ICP反应腔体技术,其优点是可以用上下两组电极分别控制离子的密度和能量以达到最优化的组合,这也是MERIE系统所无法比拟的。

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    小型等离子清洗机结构组成

    小型等离子清洗机结构要点 传统的电容耦合式等离子清洗机结构,即内平行极板。...系统由三大部分组成包括真空系统、放电系统和控制系统 在容性耦合等离子产生装置下,电子密度与极板间距成正比例关系,平均电子温度与极板间距成反比关系,其均匀性与极板间距成正比关系即随着间距的增大均匀性变好...卧室电容耦合等离子清洗机,可以直接将工件放在下电极上,但是研究发现,等离子体密度最大区域,是在等离子区域2-8cm 之间,因此可以使用一个高度为3cm的支座,支座的放置也便于工件的取放。...因为支座要放置在极板上,极板温度在放电过程中会持续增高,所以在支座材料选择上面选择了不易氧化的材料。 为了满足不同工艺的需求,需要向反应腔体内部充入不同的气体。...电容耦合式等离子清洗机反应室本身为不锈钢管构成,电容极板位于真空室内, 因为金属本身对于辐射具有很好的屏蔽效果,所以不需要在对装置设置单独的屏蔽 装置,辐射和干扰都非常小,不会对控制系统造成干扰。

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    原创 | codeforces 1425E,一万种情况的简单题

    还有一个特殊的性质就是这些离子之间带有连带关系,默认的连带关系是第i个离子与第i+1个离子连带。当i离子跃迁的时候,即使i+1的离子没有吸收能量也会发生跃迁。其中第N个离子无法建立连带关系。...第三行同样是N个整数 ,是这N个离子跃迁需要的能量。 ? 在样例当中我们将5离子的纽带改变成1离子,激活离子5,这样我们一共可以让1-5离子都进行跃迁。...比如我们看这张图,当离子a的连带对象从a+1修改成b之后,其实意味着我们将a节点的next指向了b。这样当我们遍历的时候,a的下一个位置就是b。...虽然我们跳转了两次,但是所有的离子都没有浪费。 我们利用递推的思想可以发现,只要K >= 2,就可以保证将所有的离子都纳入囊中。所以我们很容易发现,我们只需要选择代价最小的i就行了。...情况1成立是有前提的,前提就是我们选择的激活的离子不能是最后一个,因为最后一个离子没有连接。很有可能前面N-1个离子的代价都大于收益,只有第N离子的收益是正的。

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    锂离子带给动力电池的「爱与恨」

    作者/ George.W 现在很多人放弃选择电动汽车的原因,是其续航或补能设备无法满足消费者需要。...由于纽扣电池的不锈钢外壳会限制X射线等探测手段,桑迪亚纳米级成像科学家凯蒂·荣约翰(Katie Jungjohann)使用激光来为探测信号开路。...这些副产品形成的硬堆积物会撕裂隔膜,为锂枝晶的生长提供空间,从而形成短路。...SEI层为金属锂电极与电解质发生反应,产生了覆盖于电池表面的钝化层,它可以允许某些分子通过并阻拦另一些分子。...在短时间内,锂离子电池枝晶问题可能还是无法解决,锂金属电池距离商业化应用也还有很长的距离,但是可以确定的是,锂在电池行业的地位仍无法被取代,而且会在技术日新月异的今天被一步步修正短板。

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    海豚扒问离子链开发者:完美融合图灵完备智能合约和POS共识机制

    比如,离子链就计划将物联网和区块链相结合,以释放消费级物联网的能量,成为物联网的赋能者 。今天我们很高兴请到了离子链的两位重量级嘉宾,冯总和吴总,来为我们做一次精彩的分享。...比如说,当使用a品牌摄像头的时候,其实你无法通过它的人像识别功能,去打开b品牌的智能门锁。当然,你可以选择购入同一品牌或者平台下的产品全家桶,但这其实是大大限制了消费者的选择范围。...那么,将这些闲置的资源加以利用,让其去完成部分,甚至是大部分的计算任务,无疑是一个更合理的选择。 如果对上述的业务模型进行推敲,你会发现,这其实产生了一个新的,数据存储在哪里的问题。...但在物联网设备当中,由于它的模式非常复杂,如果我们依然套用这种价值创造和转移相统一的方式,那肯定是无法满足要求的。所以我们发明了离子链中的电离算法。...第二,就是对技术方向的选择,以及目前技术进度的掌控和把握。第三,我们还需要对离子链的技术社区进行一个完整的建设。 其实对于离子链来说,最重要的其实是理念问题。

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    「人造太阳」精准放电!DeepMind实现AI可控核聚变新突破

    DeepMind最新研究用RL算法,将等离子体形状精度提升65%,为「人造太阳」精准放电指明道路。 AI可控核聚变,指日可待。...等离子体形状和位置无法直接测量,必须通过磁场测量实时间接估算。 尤其是等离子体的形状,必须使用平衡重构代码进行实时估算。...从最优控制范式到强化学习的直接转换是,为每个要最小化的误差项设置一个奖励分量,其中每个分量都被映射为一个标量值。 然后将这些值合并为一个标量奖励值。...窄化奖励:将参数更新为good = 0和bad = 0.025。 这些参考值产生了一个更为严格的奖励函数。...该设置将奖励信号集中在较低的误差值,甚至对于小的误差值也提供了引导信号,鼓励在控制形状时提高准确性。 3.

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    恒电流间歇滴定法GITT测试教程-测试狗科研测试

    以锂离子电池为例(图1),电子通过外电路传输至材料表面,离子通过内电路扩散至材料内部,最终活性材料、电子和离子发生电化学反应,实现电能和化学能之间的相互转换。...D,其中L为材料的特征长度,D为离子的扩散系数;b)弛豫时间t2必须足够长,使Li+在活性物质内部充分扩散达到平衡状态,以电压基本保持稳定为判定标准。...图6 新威恒电流充放电测试仪操作软件图7 新威恒电流充放电测试仪主界面(2)选择一个测试通道,右键进入测试程序编辑界面。...为了恒电流间歇式作用于测试电极(图8),将测试工步按照图9(正极)和图10(负极)设置工步。...图8 GITT测试电流-时间曲线图9 典型正极材料的设置程序图10 典型负极材料的设置程序GITT测试时“先放电还是先充电” 应与恒流充放电测试一致,如S、V2O5、FePO4正极材料与Li配对时,需要先放电才能进行充电

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    等离子清洗工艺在芯片键合前的应用

    氧气氧离子在反应仓内与有机污染物反应,生成二氧化碳和水。清洗速度和更多的清洗选择性是化学等离子清洗的优点。氢气氢离子发生还原反应,去除工件表面氧化物。...物理等离子清洗工艺模式采用的仓体压力较小。物理等离子清洗工艺要求被激发的离子轰击工件表面。...加大等离子体射频功率是增加等离子的离子能量来加强清洗强度。离子能量是活性反应离子进行物理工作的能力。...射频功率的设置主要与清洗时间达到动态平衡,增加射频功率可以适当降低处理时间,但会导致反应仓体内温度略有升高,所以有必要考虑清洗时间和射频功率这两个工艺参数。...如图所示为铜引线框架在等离子体清洗前后使用接触角检测仪进行测量的接触角对比,清洗前接触角在49°~60°,清洗后接触角在 10°~20°,满足了工件表面处理需求。

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    冬季如何做好高速激光熔覆设备的防冻措施

    为了防止激光器、熔覆头、水冷器内的水管等设备冻裂,应根据天气情况采取以下防冻措施:  1.在冷水机组的水箱中添加防冻液,防冻液的选择和添加比例参考以下三条:  (1)在最低温度为0℃至5℃的地区,可使用...9.1%的乙醇防冻液,比例可调整为1: 9左右{10%乙二醇,90%纯净水};  (2)在最低温度为-5℃至-15℃的地区,可使用28%的乙二醇防冻液,比例可调整为3: 7左右{30%乙二醇,70%纯净水...出于节能的考虑,低温系统和高温系统的水温可以设置为5℃到10℃(单温冷水机组也是如此),以保证冷媒在循环,水温不低于冰点。  ...(如果冷却液因环境限制无法排出,请确保冷却液在循环,且水温不低于冰点)。  5.如果放水的水冷器在加水后第一次启动,由于管道中的空气导致的低流量,可能会出现水流量报警。...注意:      没有防冻液可以完全代替去离子水,不能长期使用。入冬后,必须用去离子水或纯净水清洗管道,并再次使用去离子水或纯净水作为冷却液。

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    MTK65XX平台充电调试总结

    二、 电池温度检測与充放电算法原理 1.电池温度检測 温度检測等效电路 l 将Vbat_on转化为NTC的电阻值; l 利用线性插值法通过表格将NTC的电阻值转化为温度值。...那么选择RTC中保留电量为合法。这么做有两个目的,一个是推断是否为同一块电池,还有就是保证同一块电池在开机前后电量不会出现大的波动。电池管理驱动程序在执行的时候,会随时更新电量值。...充电IC中DPM功能影响 使用的BQ24158,BQ24296芯片中都会有一个DPM功能,这个DPM功能是在充电过程中,当输入源输入功率无法提供支持设置的或者默认的充电电流时,会减少VBUS的电压。...当VBUS减少到Vin_dpm下面时,又及时调整充电电流保证VBUS电压不至于太低导致无法识别。 因为这个DPM设置不合理导致的问题就是插入USB的时候,“正在充电”的过程持续一会立刻消失了。...这就是因为因为电脑提供的USB最大充电电流为450mA,而Vin_dpm和USB充电电流设置过大。导致电脑的USB接口提供的功率不足。于是充电IC的DPM功能发挥作用。

    1.6K20

    新的Feren OS做得更好

    它附带了一个过渡工具,可以将2019.12快照版本中更新的系统组件滚动到修改后的KDE桌面中。 过渡工具为当前用户提供了一个选项,可以保留许多现有的肉桂设置。结果是一个外观和感觉,类似肉桂设计。...对于死硬的肉桂用户来说,在Feren OS Classic和新的Feren OS之间选择KDE桌面可能是一个艰难的选择。修改后的等离子设计可能会软化一些谁否则不喜欢等离子环境肉桂桌面的损失。...我对KDE等离子桌面环境并不陌生,我更喜欢它而不是等离子——至少到现在为止。我花了相当多的时间配置每一个,以反映设置几乎相同的可能有一个直接的比较桌面。 我在第二台电脑上翻滚成等离子时遇到了麻烦。...我选择保留肉桂安装的兼容设置。当第二台计算机重新启动时,其外观和感觉与第一台计算机几乎相同。正如预期的那样,添加了以KDE为中心的应用程序。相当多的基于GNOME的应用程序消失了。...因为我熟悉Plasma环境,所以我在重新调整软件选择方面取得了领先。如果你不熟悉KDE软件家族或等离子桌面,你可以期待更长的学习曲线。 另一个主要的问题是我花了大量的时间来浏览大量的设置面板。

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    钠离子电池商业化正在加速,宁德时代这一次又赌对了?

    事实上,钠离子电池的原理与锂离子电池几乎相同,只不过将参与氧化还原反应的金属,从锂变成了钠。 因此,在上世纪八十年代,钠离子电池几乎与锂离子电池同步研究。...,无疑是一个不错的选择。...从宁德时代公布的资料来看,这一代钠离子电池在材料上选择了不同于石墨的硬碳材料,这样就可以顺利完成钠离子的正负极流通,从而实现充放电功能。...所以,无论是从宁德时代自身或者全国能源战略的角度出发,发展钠离子电池都是至关重要的一步。 随着国家政策的引导,钠离子电池在国内将迎来一次突破。...无论对于企业还是行业而言,这不失为一个值得拓展的方向。 如今,汽车厂商的竞争已经不单单整车厂之间的明争暗斗,上游资源厂商的竞争才是真正“无声的战场”。

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    研究团队打破了高温、电磁场等技术限制,在空气中创造出等离子环 | 黑科技

    我们可以将物质分为四类:固体、液体、气体和等离子体。等离子体是由带正、负电荷的离子和电子,也可能还有一些中性的原子和分子所组成的集合体。...在工业中,现有的应用都是基于等离子体发生器产生的部分电力等离子体来完成的。...据了解,实验中,研究人员让水流通过特殊设计的喷嘴喷出,喷出的水流直径为85微米、水压为9000psi(约合612标准大气压),它以约304.8米/秒的速度冲击水晶片。...在水流冲击物质的选择上,研究团队对石英和铌酸锂晶片都进行了实验,实验发现,两种晶片都可以引起摩擦起电效应,在这种效应中,材料在摩擦过程中产生电荷。...从切面看,流体撞击表面并向外流,电子效应使电子通过水流流到表面,这种电子流使离子表面附近的气体中的原子和分子离子化,形成直径为几十微米、在显微镜下散发可见光的等离子体圆环。

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    脑机接口基础之神经科学(更新)

    轴突长而分枝少,为粗细均匀的细长突起,常起于轴丘,其作用是接受外来刺激,再由细胞体传出。轴突除分出侧枝外,其末端形成树枝样的神经末梢。末梢分布于某些组织器官内,形成各种神经末梢装置。 ?...这种细胞膜可以选择性地让一些特定类型的离子通过(离子通过的通道叫离子通道,它是一些嵌入细胞膜中的蛋白质)。神经元存在于水介质中,细胞内外都有大量的离子,比如钠离子、钙离子,氯离子、钾离子等。...electrode:记录电极;Membrane potential:膜电位) 由于锋电位有固定的的波形,它快速上升至0mV以上,又快速下降回到处初值,然后在稳定的电流刺激下又上升至约-40mV的阈值处,此时细胞将再次放电...将电极放在活体脑组织细胞之间的空间,上述两种形式的电位都可以被记录到。...说实话单个神经元的偶极子太小了,我们是无法从远距离的头皮电极记录到它。幸运的是,在一定的条件下,来自多个神经元的偶极子是可以叠加的。这样我们就有可能在头皮测量到结果电压。

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