（本体对齐） 本体建模 基于protege开源工具（https://protege.stanford.edu/）手工构建本体，依托于protege可以搭建一个支持多人协作的online版的大型本体构建平台...protege的底层是对owl文件的增删改查，依托于owl的本体框架规范，可自行构建对owl本体文件的操作脚本，以实现海量结构化数据的增删改查，提高效率 本体工具 Jena：对于本体文件的接口框架，用于构建系统后端...TDB：Jena内置的用于存储RDF的组件 Jena提供了RDFS、OWL和通用规则推理机（http://jena.apache.org/download/index.cgi），除此之外，可以嵌入主流的对比效果更好的推理机...可以大幅度地提高本体信息的检索速度 Fuseki：Jena提供的SPARQL服务器，也就是SPARQL endpoint（http://central.maven.org/maven2/org/apache.../jena/apache-jena-fuseki/3.8.0/） 后台搭建 基于java的后台框架Springboot，SSM等 利用Jena进行本体数据处理，采用SPARQL作为检索语言 前端 基于Html
1.环境相关 我的： Java： Eclipse： Protege： Protege-5.2.0 2.项目整体逻辑 如图： 3.用本体编辑工具protege构建基础本体文件 Protege...也可以通过SWRL自定义一些规则加入本体，还可以进行查询。可见Protege能一条龙解决本体的编辑、推理、查询等问题，但本项目要求用Java调API实现功能。...编辑、推理和检索都是在构建好的基础本体文件上进行的，该本体文件就是用protege构建的。...初始化本体文件 通过protege构建好的本体文件保存为一个owl文件，接下来要对其进行编辑推理检索，这些工作通过调用OWLAPI和Jena API实现。首先读入owl文件。...8.其他 另外，在整个工程中引用了别的库，在引用外部jar的时候把该引的都引了，主要用到的有owl api、pellet、Jena这几个。
2，知识工程简介： 2.1，本体构建： 知识工程，最重要的工作就是”本体构建“。...本体构建，常用的工具是斯坦福大学的开源工具Protege。它实现了全套OWL本体文件的定义，但是它只能以序列化（N-Triples，Turtles）后的文件存储，并不支持多人协同编辑。...在工程实践中，可以按照Protege的基本功能，实现Web端管理平台编辑。...D2RQ，自定义了一套关系型数据库至OWL文件的“映射语言”，可以通过人工定义并编辑，将不同MySQL连接实例的不同字段，依照"映射语言"中的语法规则，与OWL文件中定义的本体字段互相关联，从而实现转换...4，数据操作： 使用Apache Jena Frame，实现RDF数据的操作和处理。 Jena是一整套开源的语义网技术栈操作API，包含本体推理，规则推理和自带数据库。
知识图谱旨在从数据中识别、发现和推断事物与概念之间的复杂关系，是事物关系的可计算模型。...本体论（Ontology）：本体论（Ontology）一词是从哲学领域引入到了计算机科学领域，用来刻画知识。...在RDF中，知识总是以三元组的形式出现，即每一份知识都可以被分解为：(subject, predicate, object)。...RDFS（RDF Schema） RDF Schema (RDFS) 是对 RDF 的一种扩展。 RDF是对具体事物的描述，缺乏抽象能力，无法对同一个类别的事物进行定义和描述。...包括对局部值域的属性定义，类、属性、个体的等价性，不相交类的定义，基数约束，关于属性特征的描述等。因此W3C提出了OWL语言扩展RDF(S)，作为语义网上表示本体的推荐语言。
RDF, RDFS, OWL, Protege, 本体构建。 MySQL数据库, pymysql。 D2rq, Jena, fuseki, SPARQL。...本体有点哲学的含义，在计算机领域，可以理解为一种模型，用于描述由一套对象类型（概念或者说类）属性以及关系类型所构成的世界。此处我们使用Protege进行本体建模。...规则为 数据库的表作为本体中的类（Class）。 表的列作为属性（Property）。 表的行作为实例/资源。 表的单元格值为字面量。 如果单元格所在的列是外键，那么其值为IRI，或者说实体/资源。...但实际中，我们很少使用这种方法，因为不能把RDB中数据映射到我们定义的本体上面。...现在根据我们的MySQL数据库已经生成了默认的douban_kgqa_mapping.ttl文件，然后根据douban_kgqa_ontology.owl中定义的本体修改douban_kgqa_mapping.ttl
1.2.Fuseki 与 OWL 推理实战 ------------------- 我们先下载 Jena 的最新版本（fuseki 和其他的功能模块不在同一个文件中，需要分别下载 apache-jena...将我们的本体文件 “ontology.owl” 移动到 “run” 文件夹下的 “databases” 文件夹中，并将 “owl” 后缀名改为 “ttl”。...jena版本为3.5.0，已经上传在该repo中（如果不用Docker运行demo，需要自己修改配置文件中的路径）。...* ontology.owl 通过protege构建的本体，用户可以直接用protege打开，查看或修改。...* kg\_demo\_movie_mapping.ttl 根据d2rq mapping language编辑的映射文件，将数据库中的数据映射到我们构建的本体上。
这个软件主要用于语义网中本体的构建，是语义网中本体构建的核心开发工具，现在的最新版本为5.5.0版本。...Annotations是注释栏，可以对本体添加一些信息注释或者描述。 右边Ontology metrics会显示一些本体中相关元素的统计信息。 优化显示： 下载graphviz。...在本体中，类用于描述抽象的实体对象，代表着一类具有共性的实例对象，是基本的组织单元。...protégé提供的WRL可以使用本体已定义好的概念来建立推理所使用的规则，但SWRL无法直接由推理机释义，因此要使用推理引擎将本体与规则进行转换。可以基于Jess这种规则引擎来实现推理。...安装Jess的过程，本文不进行介绍。三者的关系为： protege定义本体，SWRL编写规则，Jess将protege中的知识库和SWRL规则转化成内部格式，从而进行推理。
中文分词算法概述： 1：非基于词典的分词（人工智能领域） 相当于人工智能领域计算。一般用于机器学习，特定领域等方法，这种在特定领域的分词可以让计算机在现有的规则模型中，推理如何分词。...例：比较流行的语义网：基于本体的语义检索。 大致实现：用protege工具构建一个本体（在哲学中也叫概念，在80年代开始被人工智能），通过jena的推理机制和实现方法。...System.out.println("开始初始化字典..."); int max=1; int count=0; //读取词典中的每一个词...List list=Files.readAllLines(path, Charset.forName("UTF-8")); System.out.println("读取词典文件结束...DIC.contains(tryWord)){//如果词典中不包含该段文本 //如果长度为1 的话，且没有在字典中匹配，返回 if(tryWord.length()==1){ break;
这也很好理解，开放的世界太过复杂，用自顶向下的方法无法考虑周全，且随着世界变化，对应的概念还在增长。 领域知识图谱多采用自顶向下的方法来构建本体。...首先介绍下我们使用的工具 protégé（点击进入官网下载）: Protégé，又常常简单地拼写为 “Protege”，是一个斯坦福大学开发的本体编辑和知识获取软件。...由于其优秀的设计和众多的插件，Protégé 已成为目前使用最广泛的本体论编辑器之一（来自维基百科）。 打开 protege，看到和下图类似的界面。...在右侧窗口中移动元素，可以很直观地观察本体之间的关系。 图片 在这个小节，我们简单地介绍了如何用 protege 自顶向下地构建知识图谱的本体结构。...接下来的实践篇我们将介绍如何利用 Apache Jena，创建基于显式 RDF 数据的 SPARQL endpoint；并展示，在加入推理机后，对数据进行本体推理我们可以得到额外的信息。
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。...+ jena-fuseki 本文复现基于jena的知识推理机，并把详细过程整理如下。...遇到的主要问题是jena版本更新后有一些配置变化。 主要参考资料是原文（by simmerchan）和资料 将如下文件放入/root/xiazai/。点击可进入文件下载页面。...注意，这里使用mysql5.0+的jar包，而不是使用8.0+的，否则会报错。 另外，kg_demo_movie_mapping.ttl中的连接密码需要自行修改。本文直接使用原作者提供的ttl文件。...更新原作者的配置文件 # 值得注意的是，这里不需要原作者从protege中导出的owl文件 echo '@prefix fuseki: jena.apache.org/fuseki#>
一、前言 本文是系列博文《知识图谱实战开发案例剖析》第7部分：Protégé本体建模，第1节：Protégé环境安装部署。该系列内容已经录制成视频课程，发布在：网易云课堂。...2.3 软件下载 Protege提供桌面版和web版，两大版本，桌面版支持windows、Linux和Mac操作系统。web版包括共享版和本地安装版两个版本。...2.4 安装调试 protege桌面版下载完成以后，解压后得到的文件结构如下图所示： ?...Protege的可以通过单击run.bat进行运行，运行界面包括两部分：命令行窗口和图形可视化界面，如下图所示： ?...2.5 中文汉化 目前能够找到的Protege中文汉化版本为5.0，下载地址如下图所示： ? ? 2.6 用户手册 protege提供完善的文档内容，包括用户使用手册和开发手册两大类型的文档。
前言 Protégé是一个免费的开放源代码平台，它为成长中的用户社区提供了一套工具，以使用领域构建领域模型和基于知识的应用程序。...Protégé软件是斯坦福大学医学院生物信息研究中心基于Java语言开发的本体编辑和知识获取软件，或者说是本体开发工具，也是基于知识的编辑器，属于开放源代码软件。...这个软件主要用于语义网中本体的构建，是语义网中本体构建的核心开发工具，现在的最新版本为5.5.0版本。...Protégé有以下优点： 符合W3C标准 可自定义的用户界面 可视化支持 本体重构支持 与推理机的直接接口 高度可插拔的架构 与WebProtégé交叉兼容...1、下载和安装 官方网址： https://protege.stanford.edu/ 安装须知： 下载平台独立版本（需要Java Runtime Environment） 关于下载：
本文将介绍如何通过 Protege 构建 OWL 本体，文中使用的软件版本为 mac 上的 protege 5.5.0 桌面版。...OWL 本体的组件与 Protege 框架下的本体组件相对应，包括： Individuals：对应 Instances Properties：对应 Slots Classes：对应 Classes 1.1...与其他基于 Protege 的本体的重要区别在于，原始的 OWL 不遵循唯一命名假设（UNA），即两个不同名称的个体可能表示同一个个体，在 OWL 中，必须要明确指出个体之间是等同的还是不同的，否则其可能相同也可能不同...包含至少一个充要条件的类称为定义类（Defined Class） ? 在 protege 中，右键可以自动将原始类转换为定义类（也可以自己设置充要条件）： ?...注意要使用 or 而不是 and，否则该条件是无法满足的（因为两个 Topping disjoint）。
⽅法（如： Statistical Relational Learning） 基于符号逻辑的推理——本体推理 传统的符号逻辑推理中主要与知识图谱有关的推理手段是基于描述逻辑的本体推理。...基于符号逻辑的推理 本体概念推理 图谱中基于RDF来作为资源描述语言，RDF是Resource Description Framework的简称。 ?...基于逻辑编程改写的方法 本体推理的局限: (1) 仅支持预定义的本体公理上的推理 (无法针对自定义的词汇支持灵活推理) (2) 用户无法定义自己的推理过程 因此，引入规则推理 (1) 可以根据特定的场景定制规则...基于Jena实现演绎推理 ?...• 不一致检测, jena的另一个常用推理就是检验data的不一致。
参考链接： 从列表中移除满足Java中给定谓词元素 目录 本体知识推理简介与任务分类 OWL本体语言 知识推理任务 OWL本体推理 实例化(materialization)的一个例子:...,检测实例Allen是否在Woman中? ... 拒绝Herbrand模型,就是拒绝了本体的所有模型,因此该本体一定是不可满足的 无法拒绝Herbrand模型,那么该模型本身就是本体的一个模型;只要本体有模型,那么一定是可满足的 相关工具简介... 规则推理 本体推理的局限: (1) 仅支持预定义的本体公理上的推理(无法针对自定义的词汇支持灵活推理) (2) 用户无法定义自己的推理过程 引入规则推理 (1) 可以根据特定的场景定制规则...只进行规则推理 实践展示: 使用Jena进行知识推理 使用Jena完成示例图谱知识上的上下位推理、缺失类别补全和一致性检测等 构建本体 其本质上就是Jena中的知识库结构 Model
假如你使用如下所示的代码，进行GitHub网站的文件读取： readr::read_csv('https://raw.githubusercontent.com/rfordatascience/tidytuesday...rfordatascience 用户名 tidytuesday 仓库名 master 分支名 data/2020/2020-07-28/penguins.csv 文件名及其路径 你之所以无法访问...-07-28/penguins.csv 可以复制粘贴这个 url 到你的浏览器，下载这个csv文件就很容易啦，当然，这个时候你的R语言读取它也不是问题。...再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理： 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门...Linux(2019更新版)》 把R的知识点路线图搞定，如下： 了解常量和变量概念 加减乘除等运算（计算器） 多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子） 多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表） 文件读取和写出
下载Apache Jena Fuseki 先从apache官网下载fuseki压缩包。然后解压到目标文件夹。...apache官网：http://jena.apache.org/download/ 这里我选择的是apache-jena-fuseki-3.14.0.zip (SHA512, PGP) 下载完后解压...启动Apache Jena Fuseki服务 打开文件夹，找到fuseki-server.bat，单击运行 访问地址：http://localhost:3030，可以看fuseki服务界面 点击Add...选择本体文件，点击打开导入。这里我用的是owl文件。除此之外还支持RDF，xml，ttl等。 点击upload all上传。我们在cmd窗口可以看到详细信息。...Related Posts 基于本体体系的知识图谱构建知识图谱的构建是当下的一大研究热点，其主流的存储方式主要可分为图数据库存储和RDF存储两大体系。
为记录自己编程学习过程和帮助别人少走弯路而写博客 这是我的 github https://github.com/Qiuner ⭐️ gitee https://gitee.com/Qiuner...如果本篇文章帮到了你 不妨点个赞吧~ 我会很高兴的 (^ ~ ^) 想看更多 那就点个关注吧 我会尽力带来有趣的内容 u盘无法被自己的电脑上读取 硬盘插入没有任何显示 插入别人电脑硬盘能正常用
注意：读取到静态属性中 springboot无法通过给静态变量赋值，在对应字段的set方法去掉static即可。
本人在使用jacoco做用例的代码覆盖率的时候遇到一个问题，就是按照文档配置的build.xml中的class文件路径和源码文件路径，但是在第一次尝试成功之后，我为了区分各个项目源码，做文件路径做了修改...，就一直不成功了，经过N次的错误尝试，终于发现了文档中缺失的部分，就是class文件路径并没有严格的要求，包括java启动参数里面的include参数也没有严格的要求，但是特么源码路径就必需得配置到com...--生成覆盖率报告的路径--> 中的覆盖率数据为空。...--report任务: 根据前面配置的源代码路径和.class文件路径， 根据dump后，生成的.exec文件，生成最终的html覆盖率报告。
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