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问与答112:如何查找一列中的内容是否在另一列中并将找到的字符添加颜色?

Q:我在列D的单元格中存放着一些数据,每个单元格中的多个数据使用换行分开,列E是对列D中数据的相应描述,我需要在列E的单元格中查找是否存在列D中的数据,并将找到的数据标上颜色,如下图1所示。 ?...A:实现上图1中所示效果的VBA代码如下: Sub ColorText() Dim ws As Worksheet Dim rDiseases As Range Dim rCell...End If Loop Next iDisease Next rCell End Sub 代码中使用Split函数以回车符来拆分单元格中的数据并存放到数组中...,然后遍历该数组,在列E对应的单元格中使用InStr函数来查找是否出现了该数组中的值,如果出现则对该值添加颜色。...Bug:通常是交替添加红色和绿色,但是当句子中存在多个匹配或者局部匹配时,颜色会打乱。

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    SqlAlchemy 2.0 中文文档(七十九)

    属性事件可以选择是否有责任返回一个新值。 几个系统现在基于新的事件 API 进行构建,包括新的“可变属性” API 以及复合属性。...先前使用mutable=True的方法不提供更改事件 - 相反,ORM 必须在每次调用flush()时扫描会话中存在的所有可变值,并将它们与原始值进行比较以检测更改,这是一个非常耗时的事件。...先前使用mutable=True的方法不提供更改事件 - 相反,ORM 必须在每次调用flush()时扫描会话中存在的所有可变值,并将它们与原始值进行比较以检测更改,这是一个非常耗时的事件。...#1897 Table.c / MetaData.tables稍作调整,不允许直接变异 另一个领域,一些用户在进行尝试时,并不按预期工作,但仍然存在极小的可能性,即某些应用程序依赖于这种行为,Table...向.c添加列涉及使用Table的append_column()方法,这确保了事物以适当的方式与父Table关联;同样,MetaData.tables与存储在此字典中的Table对象有合同,还有一点新的簿记

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    Todesstern:一款针对注入漏洞识别的强大变异器引擎

    强烈建议广大研究人员在将其用于真实场景之前,使用Portswigger Labs进行学习和练习,以更好地使用Todesstern。...引擎配置 在使用该工具之前,我们需要根据实际情况修改config.ini配置文件,文件中提供的默认配置是进行Web应用程序安全测试时的标准测试值,但我们也可以进行调整,下面给出的是支持自定义的参数选项:...canary:默认值为「canary」,该值用于搜索输出结果以供分析使用,该值会添加在变异字符串的开头和结尾,例如「canaryhelloworldcanary」; input_string:进行变异操作的字符串...,如果设置为high,引擎会将变异Payload作为输入发送至另一个变异循环中; mutation_rate:默认为0.2,该值设置范围为0-1,0表示几乎没有变异,1表示变异程度最高,当设置为1时,...在结果表中,将能够查看到下列信息(主要是Payloads和canary(.*?)canary列): 工具使用演示 许可证协议 本项目的开发与发布遵循MIT开源许可证协议。

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    Nat Comm:如何推断结构变异癌细胞分数

    图2b. ground truth CCF与最佳SV和SNV结果相对于代表性的三、四和五聚类混合物 给定ground truth,这些数据还使作者能够确定用于确定变异是否为亚克隆的最佳每个变异临界值(...第一列显示群集号错误(Cluster number error,三个推断的群集号)和平均CCF错误(Mean cluster CCF error),其中真实群集和推断的群集根据其顺序进行匹配。...其中,SVclone的性能使用SV的两个端点或单个端点在三集群的计算机硅混合物上运行。第一列显示群集号错误(三个推断的群集号)和平均CCF错误,其中真实群集和推断的群集根据其顺序进行匹配。...第二列显示了与基本真实CCF相比的平均变异CCF和多重误差。第三列使用变异的样本成员资格显示亚克隆的分类敏感性和特异性(即如果混合物的两个样品中均存在变异,则将其分类为克隆,否则为亚克隆)。 ?...其中,SVclone的性能使用克隆背景拷贝数状态或克隆加亚克隆状态跨越三簇计算机模拟混合物。第一列显示群集号错误(三个推断的群集号)和平均CCF错误,其中真实群集和推断的群集根据其顺序进行匹配。

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    RNA-seq 详细教程:Wald test(10)

    P-valuesp 值是用于确定是否有证据拒绝原假设的概率值。较小的 p 值意味着有更强有力的证据支持备择假设。然而,因为我们正在对每个单独的基因进行测试,所以我们需要更正这些 p 值以进行多次测试。...在使用其他工具时,请务必遵循预过滤步骤,如 Bioconductor 上的用户指南中所述,因为它们通常表现得更好。5. Fold change结果中的另一个重要列是 log2FoldChange。...对于每个基因,绘制了两种不同小鼠品系(C57BL/6J 和 DBA/2J)中每个样本的表达值。两个基因对于两个样本组具有相同的平均值,但绿色基因在组内几乎没有变异,而紫色基因具有高水平的变异。...倍数变化的收缩是为了帮助下游评估结果。例如,如果您想根据倍数变化对重要基因进行子集化以进行进一步评估,您可能需要使用收缩值。...如上所述,可以通过在 lfcShrink() 函数中添加参数类型来更改默认值。对于大多数最新版本的 DESeq2,type="normal" 是默认值,并且是早期版本中的唯一方法。

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    RNA-seq 详细教程:Wald test(10)

    P-values p 值是用于确定是否有证据拒绝原假设的概率值。较小的 p 值意味着有更强有力的证据支持备择假设。...然而,因为我们正在对每个单独的基因进行测试,所以我们需要更正这些 p 值以进行多次测试。 结果中的 padj 列代表针对多重检验调整的 p 值,是结果中最重要的一列。...Fold change 结果中的另一个重要列是 log2FoldChange。对于大量的基因列表,很难提取有意义的生物学相关性。为了帮助提高严格性,还可以添加倍数变化阈值。...倍数变化的收缩是为了帮助下游评估结果。例如,如果您想根据倍数变化对重要基因进行子集化以进行进一步评估,您可能需要使用收缩值。...如上所述,可以通过在 lfcShrink() 函数中添加参数类型来更改默认值。对于大多数最新版本的 DESeq2,type="normal" 是默认值,并且是早期版本中的唯一方法。

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    这个发表在 Nature Genetics的水稻全基因组关联数据库 RHRD,很赞!!!

    Dataset分为三类All、Indel和SNP,如下图所示,用户可根据需求选择,仅支持单选; Figure 2.5: 简单的用户自定义选项进行数据筛选。...该工具的复杂版本在我们开发的另一个网站[https://www.cmnpd.org/]有展示,支持逻辑组合筛选。...Figure 2.10: 变异展示表格采用特定的可变表格列宽(前 4 列)+ 固定表格列宽(后面所有列)的形式最大限度的利用网页空间呈现更多和更紧凑的突变信息。...表格中未显示全的 indel 信息,鼠标悬浮可显示全部信息。 第三部分:展示不同population在相同基因组位点的基因频率。以堆积柱状图的形式展示,可以清楚的看到不同population的差异。...饼图展示了不同单倍型的分布,表格中展示了每种单倍型的major allele(红色标记)。 Figure 2.12: 多位点框选是这部分的一个特色功能,如何快速选择多个位点进行单体型分析。

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    全基因组 - 人类基因组变异分析 (PacBio)(6)-- ANNOVAR

    ANNOVAR能够利用最新的数据来分析各种基因组中的遗传变异。...给定一个包含染色体,起点,终点,参考核苷酸与检测核苷酸序列, ANNOVAR可以进行如下的功能注释: 基于基因的注释Gene-based annotation:主要针对SNP或CNV是否引起蛋白编码改变进行注释...基于筛选的注释Filter-based annotation:鉴定在特定数据库中记录的变异,例如一个变异是否在dbSNP数据库中有报道,1000基因组计划、NHLBI-ESP 6500外显子或Exome...鉴定特定数据库中记录的变异,例如,该变异位点是否在dbSNP中有报道,在千人基因组计划中的等位基因频率如何等等 (3)。 二....将ANNOVAR的压缩包annovar.latest.tar.gz上传至服务器,解压并将路径添加到环境中 (图2)。

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    ANNOVAR gene-based annotation

    在进行注释之前,首先需要下载物种对应的数据库,以human为例,命令如下 annotate_variation.pl -downdb -buildver hg19 -webfrom annovar refGene...1. variant_function 这个文件在输入文件的前面,新加了两列,第一列代表变异位点在基因上的区域,比如外显子,内含子,基因间区等;第二列给出对应的基因。...1Kb以内的区域;downstream指的是转录终止位点下游1kb以内的区域;intergenic值的是基因间区。...-buildver hg19 -hgvs ex1.avinput humandb 添加这个参数之后,exonic_variant_function文件的第三列示例如下 IL23R:NM_144701...因为只需要输入文件的前5列,当我们只有基因区间文件,比如bed格式的文件时,可以将4,5列用0填充,这样的格式annovar也是可以识别的,这样就可以对基因组上的区间进行基因相关的注释了。

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    打造次世代分析型数据库(四):几十张表关联?小Case!

    在数据库优化器中,路径搜索算法通常有三种:自底向上、自顶向下和随机方法。根据连接表数量的不同,CDW PG的优化器中使用了自底向上的动态规划和随机的遗传算法两种方法。...; 交叉和变异:对染色体进行交叉和变异操作,产生新的染色体加入到种群; 淘汰染色体:对新染色体进行适应度计算,淘汰种群中不良的染色体。...Shard分布是指表中的数据按某一列或某几列的值,经过函数计算后选择不同的存储节点,其特点是分布键值相同的数据必然存储在同一个节点上,所有节点存储的数据总和为一份全量的表数据;Replication分布是指表在所有存储节点上都存储着一份全量的表数据...在CDW PG中,不同分布类型的表在连接选择时,除了扫描路径、连接类型和连接顺序外,还需要根据分布键和连接键的匹配情况,选择对应的数据重分布路径,以保证连接结果正确性。...表Replication分布 当连接两侧的表中,有一侧表是Replication分布时,不管另一侧表的分布键和连接键是否匹配,当前不需要进行数据重分布就可以进行连接操作。

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    跟着存档教程动手学RNAseq分析(四):使用DESeq2进行DE分析的QC方法

    执行样本级QC还可以识别任何样本离群值,这可能需要进一步研究,以确定它们是否需要在DE分析之前删除。 img 当使用这些非监督聚类方法时,标准化计数的log2转换可以提高可视化的距离/聚类。...我们可以通过表示数据(PC2)中第二大变化量的数据绘制另一条线,然后计算分数,然后是第三条线,以此类推,直到数据集中的样本总数。...这将表明可能进行样品交换,并应进行调查,以确定这些样品是否确实是标记的菌株。如果我们发现存在(错误的)交换,我们可以交换元数据中的样本。...但我们仍然没有发现,治疗是否是strain和性别后变异的主要来源。所以,我们探索PC3和PC4来看看治疗是否驱动了这些PC所代表的变化。...由于大多数基因没有差异表达,所以样本之间的相关性一般较高(值大于0.80)。低于0.80的样品可能表明你们的数据中存在异常值和/或样品污染。 层次树可以根据归一化的基因表达值指出哪些样本彼此更相似。

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    数据处理第2节:将列转换为正确的形状

    就像第1部分中的select()函数一样,mutate()有变种: *mutate_all()将根据您的进一步说明改变所有列 *mutate_if()首先需要一个返回布尔值的函数来选择列。...如果确实如此,那么将对这些变量进行mutate指令。 *mutate_at()要求你在vars()参数中指定要进行变异的列。...两个选项之间的主要区别是:funs()版本是一行代码少,但是将添加而不是替换列。 根据您的情况,两者都可能有用。...如果要添加另一个数据框的信息,可以使用dplyr中的连接函数。...连接本身就是一个章节,但在这种特殊情况下你会做一个left_join(),即保持我的主表(在左边),并从另一个向右添加列。 在by =语句中,您指定哪些列相同,因此连接知道要添加的位置。

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    用GPT生成《超级马里奥》游戏关卡,近9成关卡可玩

    如图 3 所示,NS-MarioGPT 从生成的关卡档案中反复采样和变异,这些关卡由在 MarioGPT 样本中随机选取的大小为 1400(100 列)的 Prompt 的初始化生成。...为了达到这个目的,研究者将行为特征表示为预测路径坐标的归一化平均值,从而使路径的特征变得平滑(图 4)。因此,单一块之间的差异的重要性被降低了,变异后的关卡更难被添加到种群中。...变异:本文介绍的基于 LLM 的变异操作(图 3)在随机 prompt 的引导下,将一个随机挑选的关卡切片(40-80 列之间的切片)与一个新的 MarioGPT 预测进行转换。...这种能力对于现在的情况来说是非常理想的,MarioBert 被用来在采样的图像片段的内部进行绘制,以平滑地连接变异的片断和关卡中其余的画面。这可以在图 3 的 "变异过程" 的第二步中观察到。...此外,研究者发现这些可以通关的关卡中只有一个需要使用 A* agent 再次运行一次。研究者进一步地测试模型生成的路径是否与 A* agent 的路径匹配,以评估其可行性。

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    我编写了一个应用程序来告诉你区块链是如何运作的

    (起始块(Genesis Block)有一个索引0) 哈希值(Hash): 块是否有效? 前一个哈希值(Previous Hash): 前面的块是否有效?...时间戳(Timestamp): 块是什么时候添加的? 数据(Data): 块中存储了什么信息? 随机数(Nonce): 在我们找到一个有效的块之前, 经历了多少次迭代?...你是否注意到区块哈希值的四个前导0? 四个前导0是一个有效散列值的最低要求....在我们的例子中, 一个有效的散列值至少有四个前导0. 寻找与有效散列值相对应的随机数的过程就是挖矿. 随着难度的增加, 可能的有效散列值数量会减少....区块C的哈希值将发生改变,因为区块B的哈希值用来参与计算区块C的哈希值. 区块C变得无效, 因为它的哈希值不再具有四个前导0. 让区块变异的唯一方法是再次挖出该块, 然后再挖掘所有块.

    2.9K81

    克隆排序和进化可视化R包:ClonEvol

    ClonEvol可以产生多种可视化效果,包括: ①Bell绘图来呈现随时间推移的克隆动态(基于Fishplot建立) ②使用细胞球来表示样本的克隆亚群 ③对以节点为基础和分枝为基础的树进行注释,以表示样本间的克隆关系和种子模式...如果只使用二倍体杂合子变异,可以使用sciClone算法进行聚类,在ClonEvol中也可以使用VAF。如果使用拷贝变异variants,则应该使用拷贝数识别工具(如Pyclone)来进行聚类。...clusters(如具有少量变异的clusters)、潜在的合并clusters(如具有在多个样本中变异的VAF从零延伸到非零值,以进一步分裂成多个clusters)和噪声clusters(如在样本之间显示非常相似和低的...对于AML1样本,is.driver指示该变量是否为(潜在的)driver事件。将使用gene列中的基因名称来注释树中的变异。...根据不违反sum rule的概率对树进行排序,因此是ymatchedmerge .trees[[1]]是最好的得分树。几个重要的列包括: • lab: 克隆的标签,与cluster标签匹配。

    2.7K43

    vcf文件

    从比对生成的 bam 文件中,将潜在变异信息筛选出来,就是 vcf 格式。vcf 是一种列表格式,里面包含很多的内容。需要掌握每一列的信息,并能使用相对应的软件对 vcf 进行处理。...,主要分为三部分,第一部分为双井号注释的部分,为文件头信息,主要介绍文件内容以及 INFO 部分的详细解释; 第二部分单井号注释,为表头信息,基本内容分为 8 列,对于多样品可以继续添加列。...FS:FS 是一个通过 Fisher 检验的 p-value 转换而来的值,它要描述的是测序或者比对时对于只含有变异的 read 以及只含有参考序列碱基的 read 是否存在着明显的正负链特异性(Strand...如果测序过程是随机的,比对是没问题的,那么不管 read 是否含有变异,以及是否来自基因组的正链或者负链,只要是真实的它们就都应该是比较均匀的,也就是说,不会出现链特异的比对结果,FS 应该接近于零。...3、不同软件生成的 vcf 文件,INFO 部分会有很大的不同,在使用过程中要根据具体的内容修改代码。

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    遗传算法工具箱约束怎么输入_遗传算法中怎么添加约束条件

    __version__) 下面切入主题: 自然界生物在周而复始的繁衍中,基因的重组、变异等,使其不断具有新的性状,以适应复杂多变的环境,从而实现进化。...“套路”写在一个函数里面,而经常要变的部分:变量范围、遗传算法参数等写在这个函数外面,对于要求解的目标函数,由于在遗传进化的过程中需要进行调用目标函数进行计算,因此可以把目标函数、约束条件写在另一个函数里面...注意:遗传算法中可以进行“实值编码”,即可以不用二进制编码,直接用变量的实际值来作为染色体。这个时候,个体的染色体数值上是等于个体的表现型的。...这个选择过程对应的是生物学中的” 自然选择”。它可以是显性地根据适应度(再次注意:适应度并不等价于目标函数值)来进行选择的,也可以是隐性地根据适应度(即不刻意去计算个体适应度)来选择。...在遗传算法模板里,我们根据遗传算法的“套路”,进行:初始化种群、目标函数值计算、适应度评价、选择、重组、变异、记录各代最优个体等操作。

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    R绘图 | 表达矩阵画箱线图

    箱式图用于多组数据平均水平和变异程度的直观分析比较。每组数据均可呈现其最小值、最大值、平均水平,最小值、最大值形成间距都可以反映数据的变异程度。 主要函数为geom_boxplot()。...本期我们以表达矩阵为例来做箱式图。 1 原始数据 常规的表达矩阵每一行为一个基因,每一列为一个样本,如果拿到的数据不符合上述规则,首先需要对数据进行调整。...如果每一行为一个样本,每一列为一个基因则需要使用t()进行转置。...library(tidyr) library(tibble) library(dplyr) dat = t(exp) %>% # “%>%”为管道符,相当于linux中的“|” as.data.frame...分面 最后也可以采用我们上期提到的ggThemeAssitant进行美化。

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