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在我们的研究所(IISc班加罗尔)超级计算机中，我们使用qsub提交作业。作业将根据以下内容开始运行- (1)墙体时间(预计完工时间) (2)其在受尊重队列中的位置(小、中、大等)。因此，很难知道在完成当前正在运行的一个作业后将启动哪个作业。但qsub可能有自己的列表，根据这个列表，它是在立即完成另一个任务后开
浏览 31提问于2020-05-30得票数 0
我在bash中使用pbs交互作业，使用qsub -I启动，我想在启动后运行一些命令。在运行此命令之后，我想继续像往常一样使用交互式预订。我不知道如何做到这一点，因为就像打开交互式ssh提示一样，在远程终端完成后发出的命令，即qsub -I; hello。编辑:为了澄清，在上面的示例(qsub -I; hello)中，我希望在qsub预订中运行hello，而不是<e
浏览 0提问于2011-08-10得票数 2
可以延迟或错开通过具有qsub的作业阵列启动的作业的开始，例如qsub -t1-4 launch.pbs
我可以通过在我的pbs脚本中随机休眠一小段时间来做到这一点，但是我想知道是否有一种直接的方法可以通过qsub将其指定给调度程序
浏览 0提问于2017-06-06得票数 0
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我试图在光明计算集群上对我的学习模型进行参数调优，由于要调优的参数数量，它需要大量的作业。每一个参数的组合都需要大约162个qsub作业。大约有50个参数组合，我需要检查。这相当于运行大约162个*50个~= 8100作业。但是，在我正在使用的群集上，每个帐户有350 qsub作业限制。因此，我想知道bash脚本中是否有一种方法可以检查当前活动的qsub作业的数量，这样我就可以有效
浏览 2提问于2014-05-04得票数 0
qsub和HPCs的新手。我有三个小问题：
我想要有一种更好的方法来知道哪个作业脚本对应于哪个stderr和stdout。我知道我可以像这样手动输入作业名称及其stderr和stdout (好吧，现在我在stderr和stdout中使用$PBS_JOBNAME.$PBS_JOBID )，但是6个月后，我将很难知道从哪个作业脚本生成stderr和stdout $PBS_JOBNAME.$PBS_JOB
浏览 6提问于2016-08-03得票数 0
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我想使用我在PBS -N选项中传递给PBS脚本的参数。例如，当我运行PBS脚本时：#PBS -N job_${num}
使用它将启动一个名称为job_0的作业。使用上面的代码，创建一个名称为job_{num}的作业。当我尝试使用行#PBS -N job_$num时，我收到一个错误，指出无法创建输出文件。
有没有办法实现我想要的东西？
浏览 1提问于2014-06-28得票数 2
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将键盘命令编码到Bash脚本中
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我使用qsub通过集群提交作业的方式如下： To submit a PBS job by typing job specificationsat the command line, the user types
then types any directives有没有办法在bash脚本中<
浏览 0提问于2009-03-12得票数 1
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我想使用SGE调度程序qsub选项向cfncluster中的单个节点独占提交作业。有谁知道在cfncluster中为作业保留或使用完整实例的正确方法。qsub -l hostname=node@123 script.sh
但我不想指定主机名，因为我们不知道节点的主机名，因为它还没有启动。是否有指定节点数或cores.Thanks的选项。
浏览 3提问于2016-07-28得票数 1
有没有人有在网格引擎/ Sun网格引擎/网格引擎的儿子上运行Docker并能够的经验？问题是，当I qsub docker run ...时，容器中的实际进程是由docker守护进程而不是docker客户端运行的，这意味着进程树是不同的。SGE有没有办法跟踪不同树中进程的资源(我假设没有)？另一种选择是qsub一个脚本，该脚本首先启动docker守护进程，然后运行所需的docker run命令，以便所有进程都位于SGE启动的同一进程
浏览 1提问于2016-02-10得票数 3
在使用torque的情况下，如果我使用特定的参数使用qsub运行作业，作业将完成，并发生三件事。我希望将此状态信息放在.oXXXX和.eXXXX文件旁边的文件中，因为要将100s的电子邮件与100s的作业输出文件关联起来太难了，尤其是在几天后。我找不到这样的内置功能。然而，我注意到我可以使用"qstat -f job-id“来获取与电子邮件中的信息非常相似的信息。但是我在文档中没有看到允许我运行qstat的
浏览 7提问于2018-03-30得票数 2
我正在使用qsub命令在集群中运行PBS作业(python)。我很想知道如何从失败的步骤重新启动相同的作业？任何类型的帮助都将受到高度赞赏。
浏览 2提问于2018-12-12得票数 2
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自动通知qsub作业完成状态
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第一个脚本在集群中创建了50个qsub作业。单个作业的执行时间从几分钟到一小时不等。我需要知道所有50个作业何时完成，因为在完成所有作业后，我需要运行第二个脚本。如何查看是否所有的qsub作业都完成了？一种可能的解决方案是使用无限循环，通过使用带有作业ID的qstate命令来检查作业状态。在这种情况下，我需要不断地检查作业状态。这不是一个很好的解
浏览 3提问于2015-07-28得票数 1
我正在尝试调整一些bash脚本，使它们在()集群上运行。然而，有些工作取决于其他工作在开始之前要完成。到目前为止，这是通过主脚本中的wait语句实现的。但是使用网格引擎做这件事的最好方法是什么呢？难道没有办法等待我所有的工作完成(比如qwait -u &
浏览 6提问于2013-08-26得票数 5
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现在，我想使用一个qsub在我的所有节点上提交作业。我用：但似乎只有一个节点在做这项工作。我想知道如何为所有节点提交作业。命令是什么。我指的是这个
浏览 3提问于2015-05-07得票数 0
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在Linux中，我很难从父目录提交作业。假设在我的父目录中，有1000个名为1、2、3……、1000的子目录，其中所有子目录都有一个提交脚本submit.sh。我需要对父目录中的所有脚本执行qsub操作，这样所有的计算和输出都会被转储到相应的子目录中，而不是分别访问每个子目录和qsub，这当然会花费我大量的时间。有没有办法做到这一点？
我非常感谢你的帮助。
浏览 2提问于2016-03-07得票数 0
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我正在向Sun Grid Engine提交一个作业(脚本)。该作业是一个python程序。问题是SGE正在缓冲输出，并且只在最后写入文件，这意味着我不能在屏幕上看到输出，也不能实时尾随文件。我只能在作业完成后才能知道状态。有没有办法通过配置SGE (qsub等)来解决这个问题？
浏览 4提问于2014-10-31得票数 3
我在一台高性能计算机上运行我的程序，通常使用不同的参数作为输入。这些参数通过参数文件提供给程序，即qsub文件如下所示qstat -f $PBS_JOBID有没有
浏览 0提问于2018-03-08得票数 2
在不使用任何环境变量的情况下使用qsub提交时，有没有办法在终端上打印脚本的用法？ 例如，我有一个脚本"script.sh“，它应该接受4个变量"var1，var2，var3和var4”。所以脚本应该以qsub -v var1=a,var2=b... script.sh的形式提交。我想打印什么var1，var2..如果用户尝试在没有任何变量的情况下提交作业，请参阅。我知道我可以在脚本中</
浏览 10提问于2019-05-20得票数 0
我使用Sun Grid Engine运行了很多作业。由于这些是作业(~100000)，我想使用数组作业，这在队列中似乎更容易。另一个问题是，每个作业都会生成一个stdout和stderr文件，我需要它们来跟踪错误。如果我在qsub -t 1-100000 -o outputdir -e errordir中定义它们，我最终会得到包含100000个文件的目录，这太多了。有没有办法让每个作业将输出文件写入
浏览 0提问于2010-09-14得票数 6
1回答
我已经向qsub提交了很多作业，我想取消所有当前未运行的作业。有没有一种方法可以在不知道所有jobID的情况下做到这一点？中的答案促使我尝试但这不起作用，我不想意外删除我当前正在运行的作业。
浏览 47提问于2020-12-14得票数 0
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