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    【免费】站长线下课:用STAR去Mapping~~~~

    结合小站之前的教程这一步应该插在STAR Mapping之后从零到壹:10元~Mapping神器STAR的安装及用随便选一个样本,在样本文件夹里找到bam文件,然后用samtools index建立baibam与bai要在一个目录下,载入到IGV软件中,就是视频那个样子啦。位置信息是chr12:123,406,542-123,416,558首先看是不是链特异性,右键选color alignments by first-of-pair strand如视频那样,红蓝分布,就是链特异性再看是什么样的链特异性在链特异性那个样本右键选color alignments by read strand鼠标放在红或者蓝的read上,看信息。显示first of pair那个read的箭头方向与基因的方向相反,这就提示是dUTP建库的方法。知道这些有啥用呢?在STAR运行结束后的ReadsPerGene.out.tab文件中非链特异性的要选第二列那个数而dUTP链特异性建库要选第四列那个数所以批量处理counts数教程中"站长,Mapping之后counts怎么合并成一个表?"df.use <- data.frame(v1 = df.read 这句代码中V4就是第四列,选择这个是针对dUTP链特异性建库测序的,如果是非链特异性建库图中那个位置应该改成V2就可以啦~~

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    Linux环境下SVN代码库从旧服务器迁移到新服务器的步骤详解

    曾几何时我也是个能糊弄就糊弄的小白,不知道是年级大了还是其他什么别的原因所致,遇到问题不在敷衍,总想着解决问题,就好比这次,因为旧主机磁盘已满想着续费不划算就趁着阿里搞活动新购一台,但是之前的数据多而杂且项目带有SVN库,如果是简简单单迁移还好说,毕竟备份恢复就完成了,这次我想着能不能把SVN也备份到新服务器直接使用,最终在我测试了36个小时之后得到的答案是【可以】,不然也不会有这篇文章了吧,哈哈~可能是因为比较笨,用时较长,哎反正不管怎么说这次SVN的备份和迁移算是尘埃落地,以下是我此次备份和迁移的过程。

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