GISTIC这个软件在TCGA计划里面被频繁使用者，用这个软件的目的很简单，就是你研究了很多癌症样本，通过芯片或者肿瘤外显子测序+得到了每个样本的拷贝数变化信息，一般是segment结果，可以解释为CNV...GISTIC软件的使用有两个难点，一是在linux下面安装matlab工作环境，二是如何制作输入文件。...但是考虑到大多研究者用不起matlab，或者不会用，所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题，我们仍然可以把人家写的matlab程序，在linux命令行下面，当做一个脚本来运行！...我们前面下载的GISTIC软件离线包里面是有一个 MCR_Installer 文件夹，里面就有 MCR_Installer压缩包可以解压然后安装。...如果想知道这个GISTIC软件结果图表文件的生物学含义，或者TCGA数据库的CNV文件的GISTIC软件运行方式，我们大约一个星期后继续在生信技能树写教程哈！
的东西； 我们需要找一个位置，专门放各个yml 文件 现在有一个关于pg的yml 编排文件，就是使用他去管理 找到pg 数据库的镜像名称 kartoza/postgis 里面内容是： version...f pg.yml up -d 查看日志 docker logs -f pgadmin 进入容器内部： docker exec -it 容器id /bin/bash 现在 就要进入这个数据库里面...： docker exec -it pgadmin psql -U your_username -d your_database 请将 your_username 替换为你在配置文件中设置的 PostgreSQL...用户名，将 your_database 替换为你要连接的数据库名称。...这个命令使用 docker exec 命令在正在运行的容器中执行指定的命令。
看到发表在 Cell. 2020 Mar 4....的文章的研究项目里面有 4个10X样本，题目是：Complement Signals Determine Opposite Effects of B Cells in Chemotherapy-Induced...指定基因在指定细胞系的表达量热图 适合作为学徒作业，你需要去搜索了解一下CCLE数据库，下载它的RNA-seq表达矩阵，然后根据图里面的基因名字和细胞系名字，取出需要的表达矩阵，然后热图可视化即可。...CCEL数据库介绍 需要简单注册后才能下载：https://portals.broadinstitute.org/ccle/users/sign_in 下载到需要的数据文件后可以先看看CCLE里面收集的细胞系表型信息...提到细胞系药物作用数据库，最出名的是 Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) 和 Cancer Genome Project (CGP) / Genomics
一、在 pinia 里面创建状态 在 defineStore 里面定义状态就跟在组件当中定义是一样的，使用 vue 的 ref 函数来定义，然后通过 return 来返回出去 import { ref
fix matrix for the fixed information gt matrix for the genotype information 其中meta存储着vcf的头文件，而fix存储在vcf...的固定列，gt存储在样本基因型信息。
写在前面运维的时候有时候需要连接多个mysql, 一般是选用多个窗口来做, 当然也有图形化的客户端软件.本文使用一个简单的方法: 在mysql里面连接Mysql. 听起来是不是有点怪原理1....客户端执行的新的查询就会被 中间件 发往新的server测试修改参数, 并启动脚本基本上都是根据之前的脚本修修改改....指定监听的端口, 和真实是mysql服务器(默认连接的服务), 不需要账号密码,...这里只负责转发图片图片客户端连接使用--skip-ssl 还没实现ssl-c 传递注释到servermysql -h192.168.101.21 -P3306 -p123456 --skip-ssl -c图片发现数据确实是新服务器的了...发现能解析mysql连接协议之后, 就能做很多事情了, 比如上次的读写分离, 这次的mysql里面连接mysql, 还可以做流量镜像, 审计等2....运维的时候可能有用吧, 毕竟在一个窗口就能连接多个数据库.待改进: 可以查询多个数据库的结果汇总在一起, 运维就更方便了(就像分布式数据库那样)附源码testpymysql.py见上一章.
由此可见，想要网站保持稳定的速度，那就要使用cdn加速，如果加了cdn还是发现网站打开速度慢，那就是cdn出现了异常，那么如何修复cdn服务器异常？...image.png 如何修复cdn服务器异常 如果发现大型网站已经添加了cdn加速服务却还是发现打开的访问速度很慢，那就要进行排查看是哪个环节出了差错。...cdn服务商哪里找 很多大型的网站为了提高网站访问的速度，都会给自己的网站添加一些cdn加速服务，而cdn的服务上在网上有很多家，每一家都有每一家的优势，在选择之前还是要做好调查，避免自己的盲目选择而导致网站的速度越来越慢...以上就是关于如何修复cdn服务器异常的相关处理讲解，但愿能帮助到各位站长解决到问题。...cdn加速服务器一般都是用在大型的网站中，目的就是为了内容分发承载大量的信息资源，让网站的访问速度得到很好的平稳运行。
在pom里面配置打包方式
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君 在ubuntu安装vscode和可视化的代码跟踪调试 在ubuntu安装vscode 一、命令安装 1....在命令行安装： 3. 在命令行执行： 二、汉化 在ubuntu中用vscode编译调试C\C++ 一、 安装插件 二、编译运行程序 在ubuntu安装vscode 一、命令安装 1....在命令行安装： sudo dpkg -i code_1.51.0-1604600753_amd64.deb （如果出现错误，提示：dpkg: 处理软件包XXX时出错：依赖关系问题，仍未被配置 使用如下命令...在命令行执行： code 二、汉化 在ubuntu中用vscode编译调试C\C++ 一、 安装插件 1.安装vscode的C\C++插件 在搜索框上输入C/C++，并下载，等待安装完成 2....安装vscode的Code Runner插件 在搜索框上输入Code Runner，并下载，等待安装完成 二、编译运行程序 使用之前安装好的Code Runner插件一键编译运行程序 点击：
随着研究的深入，新的免疫检查点靶点不断涌现，其中，CD40、CD27、4-1BB、OX40及VISTA等在实体瘤治疗中具有良好前景。具体大家可以看综述获得相关背景知识。...既然作者选择了CD24，就需要挖掘公共数据库来证明它的确很重要咯，下面我们来看作者的表演： CD24比其它免疫检查点在癌症表达量上调更多 首先可以看表达量变化指标 Heat map of CD24 tumour...上面的表达矩阵，都是可以在UCSC的XENA浏览器方便下载，批量分析，建议大家看B站视频： ? 在OV和BRCA表达量 这个分析就非常简单了，加上一点点临床信息即可 ?...使用的TCGA数据库样本 附件列的清清楚楚，包括： ? 文章也描述了，就是从UCSC的XENA数据库下载 ?...2019年3月4日，研究人员在科学杂志《自然医学》上发表了一篇关于这一主题的文章。
在GitHub里面如何删除库1.先进入个人仓库里面编辑2.点击进入你想要的删除的库编辑3. 在详情页中找到“setting”设置，下拉至最后可以看到删除选项。编辑4.按照提示就可以删除啦编辑
众所周知，堡垒机主机的功能是很强大的，那么在堡垒机里面怎么关闭服务器呢？ 在堡垒机里面怎么关闭服务器？ 下面一起来看一看在堡垒机里面怎么关闭服务器。...堡垒计算是一个服务器控制系统和入口，每一台堡垒机主机可以连接数台不同系统的服务器，也可以对这些服务器进行远程桌面操作。...上面已经介绍了，在堡垒机里面怎么关闭服务器，那么堡垒机还有哪些操作呢？...首先指导堡垒机是一台主机控制系统，堡垒机可以远程关闭服务器，堡垒机也远程地开启开启服务器，并且可以在相应的远程服务器里面进行一些文件的修改传输以及其他的远程操作。...同时堡垒机还能发挥它自动监控服务器任何操作步骤的功能。 以上就是在堡垒机里面怎么关闭服务器的相关知识，堡垒机的作用是数不胜数的，只要认真钻研，会发现堡垒机可以为公司网络系统安全带来很大的帮助。
在 JavaScript 中使用 WebSocket 的基本步骤如下： 1：创建 WebSocket 对象：使用 new WebSocket() 构造函数创建 WebSocket 对象，并传入要连接的...WebSocket 服务器的 URL。...：一旦连接建立，用 WebSocket 对象提供的方法进行与服务器的通信。...主要的方法是 socket.send()，用于向服务器发送消息。 socket.send('Hello, server!')...WebSocket 连接的创建和事件处理程序的监听是异步的，因此要确保在连接建立后才发送消息或进行其他操作。
目录 1 mysql 2 pg 1 mysql ifnull(字段，0) 2 pg coalesce (字段，0)
元组在Scala语言中是一种十分重要的数据结构，类似数据库里面的一行记录（row），它可以将不同类型的值组合成一个对象，在实际应用中十分广泛。...先来看一个简单的tuple定义： 上面的第二种例子中，可以直接通过name和age来访问单个tuple的元素 例子（1）： 一个简单的模式匹配 例子（2）： 根据类型匹配 注意上面的代码里面case后面的如果有...的例子： 表(pet)结构： 统计SQL语句： Scala完整代码如下： 其实，核心代码只有中间的这一部分： 最终结果： 简单解释一下核心部分的代码含义： 首先执行了一个groupBy函数，对元组里面的第一个元素也就是宠物名进行...分组，分组之后，每个宠物名一样的数据会聚合在一起，然后执行一个map函数，对里面的valueList进行各种运算，得出来我们 需要的结果后，最终再以Map的数据结构返回，因为Map本身是没法排序的，所以我们得先需要转成...Seq类型，最后再执行sortWith方法对value里面的最大次数进行降序排，如果是升序排，只需要把大于号该成小于号即可。
1.在/bin/bash脚本内使用expect命令格式如下 示例： #!/bin/bash expect 在bash脚本中嵌套 expect 命令以 在bash脚本中嵌套 expect 命令以 ！ 结束 2.一个简单的脚本嵌套expect例子 #!...10.1.0.42:/home/ > /dev/zero" ⬆#此处为expect执行的命令 expect "password:" #监测spawn返回的信息里面是否包含...'password:' send "123456\r" #如果上一条里面包含'password:'那么输入123456,\r 是换行 #expect eof #执行完 spawn...结束 3.注意事项 如果 expect 命令里面包含 通配符，例如上面的例子里面的 * ,这时需要在 spawn 后面加上 bash -c 参数即可，反之亦然。
Socket：厕所就是服务器，坑就是端口！队列：上厕所叫入队列，先进先出！栈：去厨房叫进栈，后进先出！架构：三居的格局叫MVC，四居的格局叫DDD！理论：系统结构设计定的好，有点bug没问题，能改。...其次，所有的 key 都是刻意选出来的，因为他们在 HashMap 计算下标时，下标值都为0，idx = (size - 1) & (key.hashCode() ^ (key.hashCode() >...那么这样就可以在HashMap中建出来很多这样耗时的碰撞链表，当然要满足0.75的负载因子，不要让HashMap扩容。...因为后++，是先用结果，在++操作，不会给赋值。正确写法是：num = ++ num；点评：这种错误就跟开车闯红灯似的，轻则扣分罚款，重则倾家荡产。5....ArrayList 在随机访问的实现，LinkedList 是没有。同时也可以使用增强的for循环或者Iterator进行遍历。点评： 根基不牢，地动山摇！一知半解，坑了老铁！
], // products数组存放的是所有商品 products: [ { id: 1, price: 208, // 与上面variations的对应关系在每个商品的...variationMappings里面 variation www.laipuhuo.com Mappings: [ { name: '颜色', value: '限量版574白粉
关于 grange对象 三年前我在生信菜鸟团博客就多次强调过这个重点了，在R里面处理生物信息学数据是躲不过这个定义的，有点类似于各式各样的生物信息学文件格式，是一个标准。...返回外显子的起始终止位点，长度，以及其它信息，也是一个对象class 'IRanges' [package "IRanges"] with 6 slots strand(exon_txdb)返回外显子的正负链信息，要么在正链要么在负链...union,intersect,setdiff,pintersect,psetdiff 关于 `findOverlaps`函数 本来应该是ChIPpeakAnno包带有的一个非常实用的peaks分析小工具，在我的...GitHub很早以前关于ChIP-seq分析流程代码分析里面有提到。
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