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R中按照数字大小进行排序

在R中有时会需要通过数字大小对某些数据进行排序。 不过R默认是按照字符大小顺序进行排序,如常见的OTU名称: OTU1,OTU2,OTU3,OTU10 ,OTU20......如果要按照数字排序为OTU1,OTU2,OTU10这种,可以有很多方法,本文举几种简单的例子: ---- 先读进一个OTU表~ otu = read.table(file = "otu.txt",sep...,一步到位直接对OTU名字中的数字排序: library(gtools) a = mixedorder(name) otu2 = otu[a,] 2. stringr包的str_order函数类似:...OTU名字去掉OTU只保留数字再排序: c = order(as.numeric(gsub("OTU","",name))) otu2 = otu[c,] 4.OTU名字中的OTU和数字分开,单独对数字排序...: d = order(as.numeric(sapply(strsplit(name,"Zotu"),"[",2))) otu2 = otu[d,] 5.根据OTU名字的字节数进行排序: e = name

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    脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名

    小伙伴们大家下午好,我是小编豆豆,时光飞逝,不知不觉来南京工作已经一年了,从2018年参加工作至今,今年是我工作最快乐的一年,遇到一群志同道合的小伙伴,使我感觉太美好了。...今天是2022年的最后一天,小编在这里给大家分享一个好用的脚本,也希望各位小伙伴明年工作顺利,多发pepper。‍...pip install biopython pip install pandas 查看脚本参数 python Fasta_sort_renames.py -h 实战演练 # 只对fasta文件中的序列进行命令...python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s F -a rename_fasta.fna # 对fasta文件中序列根据序列长短进行排序...,并对排序后的文件进行重命名 python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s T -a rename_fasta.fna

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    使用 Python 对波形中的数组进行排序

    在本文中,我们将学习一个 python 程序来对波形中的数组进行排序。 假设我们采用了一个未排序的输入数组。我们现在将对波形中的输入数组进行排序。...− 创建一个函数,通过接受输入数组和数组长度作为参数来对波形中的数组进行排序。 使用 sort() 函数(按升序/降序对列表进行排序)按升序对输入数组进行排序。...使用 len() 函数(返回对象中的项数)获取输入数组的长度。...例 以下程序使用 python 内置 sort() 函数对波形中的输入数组进行排序 − # creating a function to sort the array in waveform by accepting...结论 在本文中,我们学习了如何使用两种不同的方法对给定的波形阵列进行排序。与第一种方法相比,O(log N)时间复杂度降低的新逻辑是我们用来降低时间复杂度的逻辑。

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    R语言Copula对债券时间序列数据的流动性风险进行度量

    在金融市场中,债券的流动性风险一直是一个备受关注的问题。流动性风险是指在市场上,债券价格的波动程度受到市场流动性的影响,这种影响可能导致债券价格的剧烈波动,从而影响投资者的收益。...本文将帮助客户运用Copula模型,对债券的流动性风险进行度量,旨在提供一种新的方法来评估债券的流动性风险。...主要是写二元Copula,关于对债券的流动性风险来进行度量,先估计两个的边际分布,然后选择出最优的Copula函数进行联接,之后进行蒙特卡洛模拟。...数据为流动性风险,liq1,liq2,liq3,h这四个指标,h代表换手率,对选择债券的流动性风险进行度量。...##对随机数进行可视化 plot( 计算模拟数据的相关数据 估计边缘函数分布 绘制拟合值和实际值 模拟多元分布的样本进行拟合 (使用不同的df) ----

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    如何对Excel二维表中的所有数值进行排序

    在Excel中,如果想对一个一维的数组(只有一行或者一列的数据)进行排序的话(寻找最大值和最小值),可以直接使用Excel自带的数据筛选功能进行排序,但是如果要在二维数组(存在很多行和很多列)的数据表中排序的话...先如今要对下面的表进行排序,并将其按顺序排成一个一维数组 ?...另起一块区域,比如说R列,在R列的起始位置,先寻找该二维数据的最大值,MAX(A1:P16),确定后再R1处即会该二维表的最大值 然后从R列的第二个数据开始,附加IF函数 MAX(IF(A1:P300...R1,A1:P300)),然后在输入完公式后使用Ctrl+shift+Enter进行输入(非常重要) 然后即可使用excel拖拽功能来在R列显示出排序后的内容了

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    GEO2R:对GEO数据库中的数据进行差异分析

    GEO数据库中的数据是公开的,很多的科研工作者会下载其中的数据自己去分析,其中差异表达分析是最常见的分析策略之一,为了方便大家更好的挖掘GEO中的数据,官网提供了一个工具GEO2R, 可以方便的进行差异分析...从名字也可以看出,该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中,然后进行差异分析,本质上是通过以下两个bioconductor上的R包实现的 GEOquery limma GEOquery...在网页上可以看到GEO2R的按钮,点击这个按钮就可以进行分析了, 除了差异分析外,GEO2R还提供了一些简单的数据可视化功能。 1....点击Sample values, 可以看到对应的表达量值,示意如下 ? GEO2R进行差异分析的步骤如下 1....第一个参数用于选择多重假设检验的P值校正算法,第二个参数表示是否对原始的表达量进行log转换,第三个参数调整最终结果中展示的对应的platfrom的注释信息,是基于客户提供的supplement file

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    【Leetcode -147.对链表进行插入排序 -237.删除链表中的节点】

    Leetcode -147.对链表进行插入排序 题目: 给定单个链表的头 head ,使用 插入排序 对链表进行排序,并返回 排序后链表的头 。...插入排序 算法的步骤 : 插入排序是迭代的,每次只移动一个元素,直到所有元素可以形成一个有序的输出列表。...每次迭代中,插入排序只从输入数据中移除一个待排序的元素,找到它在序列中适当的位置,并将其插入。 重复直到所有输入数据插入完为止。...改变它们的相对位置,还要保持原链表的相对位置不变; 假设链表的值为:5->3->1->4->2->NULL 第一次迭代: 第一次迭代排序好的链表: 第二次迭代: 第二次迭代排序好的链表...注意,删除节点并不是指从内存中删除它。这里的意思是: 给定节点的值不应该存在于链表中。 链表中的节点数应该减少 1。 node 前面的所有值顺序相同。 node 后面的所有值顺序相同。

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    怎样在 SQL 中对一个包含销售数据的表按照销售额进行降序排序?

    在当今数字化商业的浪潮中,数据就是企业的宝贵资产。对于销售数据的有效管理和分析,能够为企业的决策提供关键的支持。而在 SQL 中,对销售数据按照销售额进行降序排序,是一项基础但极其重要的操作。...如果能够快速、准确地按照销售额从高到低进行排序,那么您就能一眼看出哪些产品是销售的热门,哪些可能需要进一步的营销策略调整。 首先,让我们来了解一下基本的 SQL 语法。...“ORDER BY”子句用于指定排序的依据,“sales_amount”就是我们要依据的销售额列。而“DESC”则明确表示降序排序,如果要升序排序,可以使用“ASC”。 但这只是基础的一步。...DESC LIMIT 10; 或者,您可能需要根据多个条件进行排序,比如先按照销售额降序排序,如果销售额相同,再按照销售量升序排序: sql 复制 SELECT * FROM sales_data...无论是为了制定销售策略、评估市场表现,还是优化库存管理,都能从有序的数据中获取有价值的信息。 总之,SQL 中的排序操作虽然看似简单,但却蕴含着巨大的能量。

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    Top 6 常见问题关于Java中的Map1 将Map转换成一个List2 遍历map中的键值对3 根据Map的key值排序4 根据Map的value值排序5 初始化一个静态的不可变的Map6 Has

    遍历一个map中的键值对是最基本的操作。...为此,在java中,所有这些键值对都存储在Map.Entry的实例中,我们调用Map.entrySet() 就会返回一个存储着所有键值对的对象,然后遍历循环就可以得到了。...Map的key值排序 根据map的key值将map进行排序是一个很常用的操作。...Map的value值排序 第一种方法也是将map转换成一个list,然后根据value排序,方法与key的排序是一样的。...hashMap和HashTable迭代是,是无序的,无法预测会以特定的顺序进行迭代。但是treemap迭代的时候,是有序的,会按照key的comparator给定的排序规则进行排序。

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    C#排序算法小结

    它的工作原理是通过构建有序序列,对于未排序数据,在已排序序列中从后向前扫描,找到相应位置并插入。...3.使用插入排序为一列数字进行排序的过程 最差时间复杂度 最优时间复杂度 平均时间复杂度 4.C#实现 /// ...一个更好理解的希尔排序实现:将数组列在一个表中并对列排序(用插入排序)。重复这过程,不过每次用更长的列来进行。最后整个表就只有一列了。...选择排序每次交换一对元素,它们当中至少有一个将被移到其最终位置上,因此对n个元素的表进行排序总共进行至多n-1次交换。在所有的完全依靠交换去移动元素的排序方法中,选择排序属于非常好的一种。...4.持续每次对越来越少的元素重复上面的步骤,直到没有任何一对数字需要比较。

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    数据结构 纯千干千干货 总结!

    我们根据元素的一些特征把元素分配到不同的链表中去,也是根据这些特征,找到正确的链表,再从链表中找出这个元素。...希尔排序也称为“缩小增量排序”,基本原理是:首先将待排序的元素分为多个子序列,使得每个子序的元素个数相对较少,对各个子序分别进行直接插入排序,待整个待排序序列“基本有序后”,再对所有元素进行一次直接插入排序...(3)每趟排序,根据对应的步长ti,将待排序的序列分割成ti个子序列,分别对各个子序列进行直接插入排序。...原理:对于一组给定的记录,通过一趟排序后,将原序列分为两部分,其中前部分的所有记录均比后部分的所有记录小,然后再依次对前后两部分的记录进行快速排序,递归该过程,直到序列中的所有记录均为有序为止。...对于给定的一组记录,经过第一轮比较后得到最小的记录,然后将记录与第一个记录的位置进行交换;接着对不包括第一个记录以外的其他记录进行第二轮排序,得到最小的记录并与第二个记录进行位置交换;重复该过程,直到进行比较的记录只有一个为止

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    python技术面试题(十五)--算法

    我们可以将列表中左侧第一个和第二个数字先进行比较,将较小的排在左侧;然后再比较第二个和第三个数字,较小的排在左侧,再比较第三个和第四个......将列表中的数字第一轮比较完之后,最大的数,排在了列表的最尾端...希尔排序的基本思想是:将数组列在一个表中并对列分别进行插入排序,重复这过程,不过每次用更长的列(步长更长了,列数更少了)来进行。最后整个表就只有一列了。...这时10已经移至正确位置了,然后再以3为步长进行排序: 10 14 73 25 23 13 27 94 33 39 25 59 94 65 82 45 再次对列进行排序,变为下面这样: 10 14 13...如果有多于一个记录被分到同一个桶中,需要进行桶内排序。最后依次把各个桶中的记录列出来就得到有序序列。...接下来我们完整的对归并排序进行描述: 有一个列表,我们将其对半分,不断的重复这个过程,问题的规模就越来越小,直到分成了一个一个的数字(一个数字就相当于排好序了),接下来呢,就是类似于上面的过程了,两两合并

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    SQL命令 ORDER BY(一)

    ASC DESC - 可选-按升序(ASC)或降序(DESC)排序。 默认为升序。 描述 ORDER BY子句根据指定列的数据值或以逗号分隔的列序列对查询结果集中的记录进行排序。...(由于明显的原因,不能按列别名或列号排序,除非排序列位于选择项列表中。)...默认情况下,字符串值的排序是根据创建时为order -item字段指定的排序规则进行的。...但是,%PLUS排序函数将所有非数字字符视为0。 因此,要正确地以数字序列对混合数字字符串进行排序,需要多个排序项。 例如,在Sample中。...SELECT子句列表中第三个列表项(C)的数据值按升序排序; 在这个序列中,它按降序对第7个列出的项(J)值进行排序; 在其中,它按升序对第一个列出的项(A)值进行排序。

    2.6K30

    cut-sort-uniq

    在生物信息分析中排序也是非常重要的工作,我们常常需要根据基因组的坐标位置进行排序,例如在利用短序列比对进行变异检测的过程中,首先就需要进行排序,例如 bwa比对之后,利用 samtools 对 bam...排序主要可以分为三种情况,第一种是最常见的根据数字大小进行排序,例如根据坐标位置大小进行排序,根据比对的分值大小排序结果;第二种是根据根据字符大小进行排序,比如abcdef 这种顺序,或者根据基因名字进行排序...sort 命令用于对文本内容进行再排序,语法格式为“sort [参数] 文件名称”。有时文本中的内容顺序不正确,一行行地手动修改实在太麻烦了。...2.2使用案例 #1 排序 sort scores.txt #默认按第一列排序 cut -A scores.txt #查看有几列,^为制表符,$为结尾 sort -r scores.txt #默认按第一列排序倒序...awk '{print $2,$3}' scores.txt | sort #2 按第二列数字大小排序 awk '{print $2,$3}' scores.txt | sort -n -k 2

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