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每个簇的样本数在R中变化的采样
在R中进行聚类分析时,每个簇的样本数可能会发生变化,这通常是由于以下几个原因:
基础概念
聚类算法
:聚类是一种无监督学习方法,用于将数据点分组到不同的簇中,使得同一簇内的数据点相似度高,而不同簇之间的相似度低。
簇的大小变化
:不同的聚类算法可能会导致簇的大小(即每个簇中的样本数)发生变化。
相关优势
灵活性
:允许簇的大小变化可以更好地适应数据的分布特性。
发现不同规模的群体
:在实际应用中,不同群体的规模可能差异很大,允许簇大小变化有助于发现这些群体。
类型
K-means聚类
:这是一种常见的聚类算法,通过迭代优化簇中心来划分数据。
层次聚类
:通过构建层次结构来组织数据点,可以生成不同大小的簇。
DBSCAN
:基于密度的聚类算法,能够识别任意形状的簇,并且对噪声数据具有较好的鲁棒性。
应用场景
市场细分
:在市场营销中,不同客户群体的规模可能差异很大。
生物信息学
:基因表达数据的聚类分析,不同基因簇的大小可能不同。
图像处理
:在图像分割中,不同区域的大小可能不同。
问题原因及解决方法
原因
初始簇中心选择
:K-means等算法对初始簇中心的选择敏感,可能导致不同运行结果中簇的大小变化。
数据分布不均
:如果数据在空间上分布不均匀,某些区域的数据点可能更密集,导致形成较大的簇。
噪声和异常值
:噪声和异常值可能影响聚类结果,使得某些簇的样本数异常。
解决方法
多次运行
:对于K-means等算法,可以通过多次运行并选择最优结果来减少随机性带来的影响。
多次运行
:对于K-means等算法,可以通过多次运行并选择最优结果来减少随机性带来的影响。
预处理数据
:去除噪声和异常值,或者使用标准化/归一化方法使数据分布更加均匀。
预处理数据
:去除噪声和异常值,或者使用标准化/归一化方法使数据分布更加均匀。
选择合适的算法
:根据数据特性选择合适的聚类算法,例如DBSCAN适用于发现任意形状的簇。
选择合适的算法
:根据数据特性选择合适的聚类算法,例如DBSCAN适用于发现任意形状的簇。
可视化分析
:通过可视化工具(如t-SNE或PCA)观察数据的分布,帮助理解簇的形成原因。
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:通过可视化工具(如t-SNE或PCA)观察数据的分布,帮助理解簇的形成原因。
通过上述方法,可以更好地理解和控制聚类过程中每个簇的样本数变化。
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R:在图的顶部叠加簇
如何在R中获取热图的每个簇中的基因列表
R中KNN团簇的外观控制
如何获取R中像素簇的大小
R中的状态变化
在pandas数据帧中找到每个簇的平均值并分配最好的簇
R中ROSE的过采样和欠采样问题
标记R中的K-means中的特定簇
计算r中簇内的平均值
如何在矩阵(R)中获取簇的大小
R中的有效子集和采样
R-矩阵中的“逐行”采样
R中的有条件采样
跟踪R中序列的变化
在pandas中对每个组中的数据进行重新采样
在python中替换示例,并限制每个类的样本数
如何获取R中微小簇(几个像素)的大小
获取R (Package seqHMM)中混合隐马尔可夫模型的每个簇内的观测值
R中的MCMC Gibbs采样器
R中data.frame的嵌套采样
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2
回答
每个
簇
的
样
本数
在
R
中
变化
的
采样
、
1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11),score=c(1,3,5,7,3,4,7,1,2,6,3),cluster=c(1,1,2,2,2,2,3,3,3,3,3)) 我还有一组集群‘d和
每个
集群
中
我想要
的
样
本数
量, sample_sizes<-data.frame(cluster=c(1,2,3),samples=c(1,3,2)) 我希望有一个样
本数
据帧,由根据sample_sizes数据帧中指定
的
样
本数
量选择
的
样本组成例如,下表
浏览 10
提问于2019-01-10
得票数 1
2
回答
引导分层/多级数据(重
采样
集群)
、
、
为了简单起见,假设数据是平衡
的
:我们对
每个
集群有6个观察。因此,24只猫
中
的
每只都由6只猫(即n_cluster = 6和n = 144)组成。也就是说,如何在集群级别重
采样
?I希望用替换
的
方法对集群进行
采样
,并在
每个
选定
的
集群
中
设置原始数据集中
的
观测值(即用替换
簇
进行
采样
,而不替换
每个
集群内
的
观测数据)。这是戴维森提出
浏览 3
提问于2012-12-30
得票数 14
回答已采纳
1
回答
如何对GMM发行版
的
不同组件进行
采样
?
、
、
我使用sklearn高斯混合模型算法对我
的
数据(12000, 3)进行聚类。我有3个
簇
。我
的
数据
中
的
每个
点都代表了一个分子结构。我想知道如何对
每个
簇
进行
采样
。我尝试过这个函数:gmm.sample(n_samples=20) 但它确实对整个分布进行了
采样
,但我需要
每个
组件
的
采样
。
浏览 0
提问于2018-03-29
得票数 0
1
回答
在
SAS中用PROC SURVEYSELECT为重复单元创建唯一
的
标签
、
、
我需要从一个真实
的
(集群)试用数据集中重新
采样
。到目前为止,我
在
SAS中使用了以下PROC SURVEYSELECT程序来对10个
簇
进行替换,其中50%来自控制臂,50%来自治疗臂。但是,
在
输出resamples数据集中
的
每个
复制
中
,我还没有找到一种方法可以轻松地为出现不止一次
的
集群分配唯一标识符。如果一个
簇
在
一个复制
中
采样
m次,则该
簇
内
浏览 3
提问于2022-07-11
得票数 0
回答已采纳
1
回答
在
每次更新期间迭代绘制图形
、
数据集由三个
簇
混合而成,
每个
簇
来自由mu_k和sigma_k参数化
的
高斯密度函数,k= 0,1,2。现在我需要更新指示变量z,这就是高斯混合模型
的
Gibbs
采样
。. % Operations update zplt.sho
浏览 0
提问于2013-07-15
得票数 1
1
回答
具有动态上限
的
Simulink“反限制”块
Simulink库块“计数器限制”(Simulink/Sources/Counter )从零计算到指定
的
上限。然后将其包装为零,并计数回来。这是按规定
的
速率(抽样时间)进行
的
。掩模参数为“上限”和“
采样
时间”。问题:有人知道如何使掩码参数“上
浏览 5
提问于2015-10-04
得票数 0
回答已采纳
3
回答
音频单位
采样
率和缓冲区大小
、
、
、
当我用remoteIO对iphone
的
音频进行
采样
时,我遇到了一个真正
的
误解。这意味着5ms
的
缓冲区大小-which意味着
每个
回调缓冲区
中
的
44*5=220<e
浏览 1
提问于2012-01-05
得票数 1
1
回答
如何使用Python
中
的
"imblearn“库为
每个
类指定精确
的
欠
采样
/过
采样
数量?
、
、
、
、
我正在使用"imblearn“库进行欠
采样
。我
的
数据集中有四个类,
每个
类有20、30、40和50个样
本数
据(因为它是一个不平衡
的
类)。选择这些样
本数
是为了方便地描述问题,这些样
本数
在
实际应用
中
并不是有效
的
数量。 我想对
每个
有10个样
本数
据
的
类进行欠
采样
。有没有可能我可以用"imblearn“来做呢?目前,我正在使用以下代码对<
浏览 28
提问于2020-06-01
得票数 1
回答已采纳
1
回答
基于时间聚类
的
推荐算法
、
、
、
我对基于时间
的
集群并不是很了解,我想知道是否有任何算法适合我
的
用例。我
的
问题是,我想找出在时间间隔上存在主要努力差异
的
时间点。我会确切地知道他们应该有多少个分组(例如5个独立
的
集群),但不知道一个集群在哪里结束,下一个集群从哪里开始。 在这种情况下有没有好
的
算法?我在看K-Means,但它似乎
在
不考虑时间
的
情况下非常擅长聚类,我更多地是
在
寻找边界,查看消耗数据。
浏览 3
提问于2018-11-12
得票数 4
1
回答
linux记录:计数(-c)和频率(-F)选项之间
的
差异
、
、
、
我正在运行以下命令:和尝试不同
的
频率和计数值。我得到
的
结果是
在
第一个表
中
,我设置了频率,
在
第二个表
中
,设置了计数。次数和计数如何影响事件
的
数量?我认为事件
的
数量是独立于频率和计数
的
,但显然不是这样。perf实际上是做什么
的
?
浏览 0
提问于2018-11-23
得票数 8
回答已采纳
2
回答
文本聚类
的
K-均值
、
我试图实现文本聚类
的
k-均值,特别是英语句子。到目前为止,对于
每个
文档(句子),我都有一个术语频率矩阵。我对文
本数
据上k均值
的
实际实现有点困惑。这是我对它应该如何工作
的
猜测。计算出所有句子
中
唯一
的
单词数(一个大
的
数字,叫它n)。 创建k n维向量(集群)并使用一些随机数填充k向量
的
值(如何确定这些数字
的
界限?)确定从
每个
q语句到随机k
簇
、重新定位
簇
等之间<em
浏览 1
提问于2016-11-03
得票数 0
回答已采纳
1
回答
在
使用
R
进行K均值聚类后,检索最接近
每个
聚类质心
的
100个样本
、
、
、
我试图通过首先在
R
中
执行K-means聚类,然后
在
每个
代表性聚类
中
采样
50-100个样本来减少输入数据大小,以便进行下游分类和特征选择。 原始数据集被分割为80/20,然后80%进入K均值训练。从标签栏
中
,我知道有7种不同
的
药物治疗方法。同时,我测试了肘部方法,以找到聚类数
的
最佳K,它约为8。因此,我选择了10个,以便有更多
的
数据
簇
可供下游
采样
。由于我只需缩放数值变量即可
浏览 30
提问于2020-11-02
得票数 0
回答已采纳
1
回答
重叠聚类
的
结果
、
、
、
、
我使用Matlab
中
的
函数fcm进行重叠聚类。该函数
的
输出是一个大小为kxn
的
矩阵,其中k是聚类
的
数量,n是示例
的
数量。非常感谢。
浏览 1
提问于2017-03-01
得票数 1
2
回答
有效动态聚类
、
、
、
、
我有一组来自单元间隔
的
数据点(即具有数值
的
一维数据集)。我在网上收到了一些额外
的
数据点,而且某些数据点
的
值可能会动态
变化
。我正在寻找一个理想
的
聚类算法,它可以有效地处理这些问题。我知道会处理新实例
的
添加,我认为只要稍加修改,它就可以处理动态实例值(即首先从相应
的
集群
中
获取已修改
的
实例,然后更新集群
的
平均值,最后将修改后
的
实例作为算法
的
输入,就像添加一个未见实例一<
浏览 5
提问于2014-07-08
得票数 0
1
回答
Python + Scipy:如何设置光谱图
的
时间框架?
、
、
、
我试着用计算音频信号
的
谱图。作为一个项目规范,需要时间间隔为20 As,但我无法找到设置它
的
方法。
在
稍微调整noverlap之后,我能够得到
的
最大值是一个非精确
的
5ms。
浏览 1
提问于2017-10-08
得票数 2
回答已采纳
1
回答
你能在大样本上使用隔离林算法吗?
、
、
、
、
我一直
在
使用scikit学习隔离林
的
sklearn.ensemble.IsolationForest实现来检测数据集中
的
异常,这些异常范围从1000行到数百万行不等。它似乎运行得很好,我已经将max_samples重写为一个非常大
的
整数来处理一些较大
的
数据集(本质上不使用次抽样)。我注意到,指出,较大
的
样本大小会造成沼泽和掩蔽
的
风险。如果隔离林看起来工作正常,那么
在
大样本上使用它可以吗?我试着用一个较小
的
max_samples进行训练
浏览 3
提问于2020-06-16
得票数 0
回答已采纳
1
回答
聚类中心与聚类手段
的
差异
下面是我从一个集群模型
中
得到
的
集群中心
的
输出(kms-6集群)然而,
在
将数据分割成6个组并取6个组
中
每个
组
的
平均数据之后,我得到了与上面的组不同
的
一组数字。3.7、3.6、3.6、3.8、4.2、3.3为什么我会得到不同
的
价值观?
浏览 0
提问于2019-03-19
得票数 3
1
回答
WAV
的
“数据”子块是如何构造
的
?
、
、
我正在编写一个C#应用程序来处理WAV文件,并且我已经完成了足够
的
代码来读取任何文件
的
块(即格式化元数据和所有其他块,准备使用这些信息处理数据)。如果可能的话,你能不能回答上
的
链接/信息只数据块,而不是一般
的
WAV文件是如何构造
的
。谢谢!
浏览 2
提问于2018-10-27
得票数 1
回答已采纳
2
回答
如何使用Python
在
一组点上绘制多边形(部分向内弯曲)边?
、
、
、
、
我正在尝试
在
如下所示
的
K均值聚类上绘制多边形(凹)边(fig_1)。
在
@ypnos
的
帮助下,这段代码可以绘制除边缘之外
的
所有内容。plt.ylim(0, 0.8)plt.scatter(new_centroids[:,0], new_centroids[:,1], c='
r
'points) plt.plot(poi
浏览 4
提问于2019-06-19
得票数 3
2
回答
我能比目标帧缓冲器
在
样本缓冲器中有更低
的
颜色位深度吗?
、
、
、
、
我正在调查在多次抽样中使用大量样本
的
情况。如果我有一个RGBA8帧缓冲区并使用多个样本呈现给它,比如说32,
在
每个
样本级别上抖动会在解析后从32个4位颜色样本
中
得到一个相当精确
的
8位颜色。规范(4.5)似乎有点吓人,尽管(glBlitFrameBuffer): 如果读取帧缓冲区是多
采样
的
(其SAMPLE_BUFFERS
的
有效值为1)而绘制帧缓冲区不是(其值为SAMPLE_BUFFERS为0),则在写入目的地之前,将源
中
每个</
浏览 0
提问于2016-11-03
得票数 2
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