每组不能绘制一个以上的箱线图。你忘了aes(group = ...)了吗？ - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

开发者社区

文档建议反馈控制台

最新优惠活动

文章/答案/技术大牛

发布

24种R语言新手入门之箱线图（二）

一、前言箱线图一般用于可视化基因的表达情况，常化用统计学方法计算组间基因的表达差异情况。...设置为TRUE以绘制凹口 #varwidth：一个逻辑值。...设置为true以绘制与样本大小成比例的框的宽度 #names：将打印在每个箱线图下的组标签 #main：用于给图表标题 2.2 简单箱线图 #内置数据集 ToothGrowth$dose <- as.factor...() p 图片 #翻转横置 p + coord_flip() 图片 #凹形箱线图 ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot...以上代码都是导入自己的文件可直接运行的。关注公主号生信初学者回复boxplot领取示例数据和代码

1.5K4 1

ggplot2中的position参数解析

❝本节来回答一个老爷的问题，介绍常见绘图案例中几个基本参数的设置问题，主要用在柱状图与箱线图中。下面小编通过两个案例来进行展示，图形仅供展示用过程仅参考，希望各位观众老爷能够喜欢。...position_dodge2(width = 0.9, preserve = "single") 示例：假设你有一个数据集，其中有两个因素变量A和B，每个都有两个水平1和2。...), group = LETTERS[1:4]) ggplot(data, aes(x = group, y = values)) +...stat_boxplot(geom="errorbar",width=0.1)+ # 绘制箱线图的error bar geom_boxplot() +...# 绘制箱线图 stat_summary(fun = mean, geom = "point", col = "#00A08A") + # 绘制均值点 stat_summary(fun = mean

5653 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

ggvis包—数据可视化交互

简介 ggvis[1]是R的一个数据可视化包，它可以：使用与ggplot2类似的语法描述数据图形；创建丰富的交互式图形，在本地Rstudio或浏览器中使用这些图形；利用shiny的基础结构发布交互式图形...2 分组的散点图如果想要使用分组说明散点图，可以加入fill = ~factor(cyl)或者group_by(cyl)进行分布。...4 曲线图使用layer_lines()绘制曲线图，当然你可以和散点图合并，效果更好。...add_axis()可以设置坐标轴的名称等其他参数。 6 箱型图使用layer_boxplots()绘制箱型图，具体内部参数再次不做具体陈述。...小编有话说本篇推送参考ggvis cookbook[2]，小编也只是一个搬运工。这篇主要是对该包中的常见图形进行静态展示，但是其实这个包更强大的功能在于交互式。

9654 0

散点图及数据分布情况

接下来我们就连载其中一个佼佼者的系统性本书的笔记：下面是YT的分享上一个笔记是：了解绘制条形图和折线图的细节本章节内容目录如下所示，如果你觉得微信公众号排版不方便学习，也可以文末阅读原文前往电脑浏览器打开哦...即如果点太多，反正画出来也很乱，不如直接搞箱线图了。 #比如上面的数据集，我们希望把time设置为一个离散的变量，但是time却被默认为数值型变量，因此要告诉ggplot进行分组。...#与直方图类似，可以通过binwidth（）函数来控制折线图的组距 #或者通过设定每组组距将x轴分为特定数目的组 ggplot(faithful, aes(x = waiting)) + geom_freqpoly...(outlier.size = 1.5, outlier.shape = 21) *之前我们探索了一些关于箱线图的原理箱线图是由箱和须两部分组成，箱的范围是从数据的下四分位数到上四分位数，也就是四分距..., group = sex), width = .25) +#对两个箱线图操作 #这里将x变量视为数值型变量并加减一个小的数值实现箱型的左右移动，这必须指定group，否则会只绘制一个箱线图 geom_dotplot

8K1 0

mlr3的校准曲线也是一样画！

tidymodels不能画校准曲线？众所周知，tidymodels目前还不支持一键绘制校准曲线！相同类型的mlr3也是不支持的！大家多去github提issue，加速对校准曲线的支持！...今天介绍mlr3怎么画校准曲线，还是那句话，校准曲线就是散点图，你非说是折线图也行...... 加载R包首先还是加载数据和R包，和之前的数据一样的。...曲线： autoplot(rr, type = "prc") plot of chunk unnamed-chunk-10 箱线图： autoplot(rr, measure = msr("classif.auc..."dashed")+ labs(x="Predicted Probability", y= "Observed Probability")+ theme_minimal() “校准曲线，你学会了吗...生存资料的怎么搞？关于这两个问题，可以翻看我之前的推文：二分类资料校准曲线的绘制生存资料校准曲线的绘制

7083 0

R数据科学|5.5.1 习题解答

解答可以绘制箱线图进行比较 nycflights13::flights %>% mutate( cancelled = is.na(dep_time), sched_hour =...然而，由于数据中有大量的点，我将绘制对carat进行分区的箱线图，需要注意的是，装箱宽度的选择很重要，如果宽度太大，就会模糊任何关系;如果宽度太小，箱中的值可能变化太大，无法揭示潜在的趋势： ggplot...问题三安装ggstance包，并创建一个横向箱线图。这种方法与使用coord_flip()函数有何区别？...问题四箱线图存在的问题是，在小数据集时代开发而成，对于现在的大数据集会显示出数量极其庞大的异常值。解决这个问题的一种方法是使用字母价值图。...安装lvplot包，并尝试使用geom_lv()函数来显示价格基于切割质量的分布。你能发现什么问题？如何解释这种图形？解答像箱形图一样，字母值图的箱形图对应于分位数。

2.9K4 1

R语言学习 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）

箱线图箱线图是能同时反映数据统计量和整体分布，又很漂亮的展示图。在2014年的Nature Method上有2篇Correspondence论述了使用箱线图的好处和一个在线绘制箱线图的工具。...http://www.nature.com/nmeth/journal/v11/n2/full/nmeth.2811.html 一步步解析箱线图绘制假设有这么一个基因表达矩阵，第一列为基因名字，后面几列为样品名字...绘制单个基因 (A)的箱线图为了更好的展示效果，下面的矩阵增加了样品数量和样品的分组信息。...长矩阵绘制箱线图常规矩阵绘制箱线图要求必须是个方正的矩阵输入，而有时想比较的几个组里面检测的值数目不同。...=50,hjust=0.5, vjust=0.5)) + theme(legend.position="none") p dev.off() 长表格形式自身就是常规矩阵melt后的格式，这种用来绘制箱线图就很简单了

4.4K10 0

R数据科学|5.5.3内容介绍

你可以将相关变动看作点的模式。...例如，你可以看到钻石的克拉数和价值之间存在一种指数关系： ggplot(data = diamonds) + geom_point(mapping = aes(x = carat, y = price...例如，对carat进行分箱，然后为每个组生成一个箱线图： ggplot(data = smaller, mapping = aes(x = carat, y = price)) + geom_boxplot...(mapping = aes(group = cut_width(carat, 0.1))) ?...以上示例使用了cut_width(x, width)函数将 x 变量分成等宽的分箱。如果想要体现不同数量的观测值，可以使用参数varwidth = TRUE 让箱线图的宽度与观测数量成正比。

1K2 0

如何在箱线图添加显著性--代码分享

多个水平的箱线图，可以展示不同水平的分布、平均值、方差等信息，也可以把显著性甚至多重比较加上去，R语言包这方面越来越友好了，代码都封装好了，十分流畅！...本节要实现下面截个图：「单因素二水平T检验箱线图可视化」「单因素三水平T检验箱线图可视化」「单因素三水平柱形图」「单因素三水平折线图」「二因素柱形图」「二因素折线图」 1....ggpubr包进行绘图： 1.1 绘制箱线图 library(ggplot2) library(ggpubr) ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y") 在这里插入图片描述...1.2 箱线图添加不同颜色 ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y",color = "Group") 1.3 箱线图添加散点图 ggboxplot(dd,x = "Group...aes(group=Group2), label = "p.signif") # 有误差的折线图 p = ggline(dd,x = "Group1",y = "y",add = "mean_se"

1.8K2 0

R语言箱线图添加显著性--不同水平实现方法

本节，介绍一下箱线图实现显著性添加的方法，类似这种：「单因素二水平T检验箱线图可视化」「单因素三水平T检验箱线图可视化」「单因素三水平柱形图」「单因素三水平折线图」「二因素柱形图」...ggpubr包进行绘图： 1.1 绘制箱线图 library(ggplot2) library(ggpubr) ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y") 在这里插入图片描述...1.2 箱线图添加不同颜色 ggboxplot(dd,x = "Group",y = "y",color = "Group") 1.3 箱线图添加散点图 ggboxplot(dd,x = "Group...",y = "y",color = "Group",add = "jitter") 1.4 箱线图+散点图+显著性水平这里，默认的统计方法是非参数统计Wilcoxon，如果想用t.test，见下面操作...aes(group=Group2), label = "p.signif") # 有误差的折线图 p = ggline(dd,x = "Group1",y = "y",add = "mean_se"

2.3K3 0

数据处理神器tidyverse（2）ggplot2

例如，如果你想在x轴上绘制带有gdpPercap的散点图，在y轴上绘制lifeExp，那么你可以添加一个带有相关美学函数的geom_point（）几何图层： # describe the base ggplot...我们还可以将points geom图层与line geom图层或任何其他类型的geom图层组合在一起。线图适用于绘制时间序列，因此下面我们使用点和线图层绘制平均预期寿命。...如果你想在我们每个大陆的地块上有一条单独的线（而不是所有大陆的聚合线），你不需要为每个大陆添加一个单独的层来得到以下图： ? 相反，当您按年计算平均预期寿命时，首先按“大陆”分组。.../地区年份分组数据框架上绘制一条线，则会得到一个奇怪的锯齿形图案。...对于上面的线图示例，我们绘制了每个大陆的平均预期寿命时间线，而不是指定“group”参数，您可以将colour参数指定为continent。这将由continent自动分组和着色。

2.1K3 0

技术解析｜如何绘制密度分布图

前言在前几天对数据分析师与算法工程师进行岗位对比分析的文章中，我们使用了密度分布图和箱线图对薪资水平与学历对薪资的影响进行了分析，那么早起就对这两种图形的绘制方法进行解析，也借着这个机会讲一下我最喜欢的绘图包...这条曲线排除了由于取样不同和测量不准所带来的误差，能够精确地反映总体的分布规律，密度分布图其实就是密度分布曲线的填充。原文的的密度分布图的绘制软件为R，为啥不用Python？...OK，成功对不同岗位进行了区分，只剩下最后一步填充，并且有没有发现坐标轴是以科学计数法呈现的，我们也对这一块处理一下 options(scipen=200) p + geom_density(aes(fill...= mean, aes(xintercept = salary,color=professional),linetype="dashed") 来看看最终效果，学会了吗 ?...结束语以上就是使用R绘制漂亮的密度分布图过程，我已将原始数据放在公众号后台回复招聘获取，感兴趣的读者可以利用原始数据自己使用python进行处理得到我们需要的数据格式再绘制，最后留一个问题，怎样绘制学历关于薪资的箱线图

2.6K1 0

「R」ggplot2误差棒快速指南

给直方图和线图添加误差棒准备数据这里使用ToothGrowth 数据集。它描述了维他命C对Guinea猪牙齿的生长影响。...0.5 ## 6 10.0 VC 0.5 len :牙齿长度 dose : 剂量 (0.5, 1, 2) 单位是毫克 supp : 支持类型 (VC or OJ) 在下面的例子中，我们将绘制每组中牙齿长度的均值...标准差用来绘制图形中的误差棒。...注意，你可以选择只保留上方的误差棒： # Keep only upper error bars ggplot(df2, aes(x=dose, y=len, fill=supp)) + geom_bar...有误差棒的线图 # Default line plot p<- ggplot(df2, aes(x=dose, y=len, group=supp, color=supp)) + geom_line

8512 0

一行代码绘制出朋克风格可视化作品！？除了Python,这个技巧也可以~~

当然有啦，今天小编就给大家推荐一个可以绘制赛博朋克风的优秀第三方R包-ggCyberPunk，今天推文的主要内容如下： R-ggCyberPunk包简介 R-ggCyberPunk包实例演示 R-ggCyberPunk...geom_glowing_line()：绘制赛博朋克风发光线图(line plot )。 geom_linesaber():绘制赛博朋克风激光剑外观线图(line plot)。...", values_to = "count") #可视化绘制 plot01 <- ggplot(data = df,aes(x=Time, y = count, color = group, fill...R-ggCyberPunk包三个绘图函数，接下里，我们使用改包主题对常见图表进行朋克风格图表绘制，如下：「geom_boxplot」:箱线图 plot4 <- ggplot(mpg, aes(class...如果你不喜欢R绘制类似的图表，你可以试试python的可视化库－mplcyberpunk，更多关于mplcyberpunk库的详细内容大家可参考：python－mplcyberpunk库[2] 总结本期这篇推文

4182 0

R语言ggplot2分组的小提琴图加箱线图简单小例子

作图是用groups做x轴，type填充颜色，每个group分为A，B两组作图的时候和普通的箱线图小提琴图是一样的代码 ggplot(data = df, aes(x = groups, y =...image.png 箱线图的宽度有点大，盖住了背后的小提琴图，把宽度设置的小一点，需要加width参数 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value, fill...image.png 这样就好了，上图每组的小提琴图之间的距离好像有点大，这个也可以用position这个参数调节 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value,...欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本另外还遇到一个问题是 R语言ggplot2作图如果文字标签包含罗马数字，如何输出pdf呢？...image.png 写代码有时候还挺无聊的，找一些有意思的代码自娱自乐一下，上面的视频是一个玫瑰花的代码，大家感兴趣可以自己试一下呀！大家记得关注我的视频号呀！

4.6K3 0

ggplot2|从0开始绘制折线图

话说“一图胜千言”，在各类数据分析报告中经常会看见各种各样的图形，例如折线图、条形图、箱线图、点图等。...其中折线图可以反映某种现象的趋势，本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘制各式各样的线形图。...head(df) dose len 1 A 5.16 2 B 10.10 3 C 30.00 1.1 绘制基本的折线图 ggplot(data=df, aes(x=dose...注：因为横坐标的属性为因子（离散型的字符转换为因子），所以需要添加‘group = 1’的设置。...2.0 26.06 2.655058 4 VC 0.5 7.98 2.746634 5 VC 1.0 16.77 2.515309 6 VC 2.0 26.14 4.797731 绘制添加误差棒的折线图

3.5K3 0

qqboxplot--实现Q-Q plot和箱型图的整合！

导语 GUIDE ╲ qqboxplot作为ggplot的扩展，可以实现q-q箱线图的绘制。背景介绍箱形图（Box-plot）又称为盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。...今天小编给大家介绍的qqboxplot，正是整合了这两类图形，将Q-Q plot的尾部信息合并到传统箱线图中，并显示尾部的置信区间，qqboxplot对于大型数据集具有更高的可靠性。...R包安装 BiocManager::install("qqboxplot") library(qqboxplot) 可视化介绍 01 比较箱线图、q-q图和 q-q箱线图使用来自一名自闭症患者和一名对照患者的随机基因样本...rep("t distribution, df=8", 1000), rep("t distribution, df=32", 1000))) 使用模拟数据绘制箱型图...： simulated_data %>% ggplot(aes(factor(group, levels=c("normal, mean=2", "t distribution, df=32", "

5742 0

ggplot2分组条形图饼图箱线图

三、箱线图 head(ToothGrowth) ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose) #按提供药物种类分组 ggplot(data = ToothGrowth...,aes(x=supp,y=len,fill=supp))+geom_boxplot() #按剂量分组 ggplot(data = ToothGrowth,aes(x=dose,y=len,group=...') + theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5)) + theme(legend.position = 'bottom') ggplot2 绘制箱线图加抖动的点...(palette = 'Set1')+ facet_grid(~ supp,scales = 'free') ggplot2 绘制分面箱线图写在最后：有时间我们会努力更新的。...大家互动交流可以前去论坛，地址在下面，复制去浏览器即可访问，弥补下公众号没有留言功能的缺憾。 bioinfoer.com 有些板块也可以预设为大家日常趣事的分享等，欢迎大家来提建议。

7331 0

R绘图 | 表达矩阵画箱线图

箱式图用于多组数据平均水平和变异程度的直观分析比较。每组数据均可呈现其最小值、最大值、平均水平，最小值、最大值形成间距都可以反映数据的变异程度。主要函数为geom_boxplot()。...1 原始数据常规的表达矩阵每一行为一个基因，每一列为一个样本，如果拿到的数据不符合上述规则，首先需要对数据进行调整。如果每一行为一个样本，每一列为一个基因则需要使用t()进行转置。...|” as.data.frame() %>% # 只有数据框才能使用将行名变成一列的命令 rownames_to_column() %>% # 将行名变成一列 mutate(group...= rep(c("control","treatment"),each = 4)) # 新增group列转置后的表达矩阵 2.2 宽数据转换长数据宽数据是比较常用的数据收集与储存样式，而长数据常用于画图...3 作图 library(ggplot2) p = ggplot(pdat,aes(gene,count))+ geom_boxplot(aes(fill = group))+ # 绘制箱线图

2.2K2 0

可视化绘制技巧｜对多图合理排版布局

图1 合并多幅图形上面的代码中，首先绘制了三幅图形，箱线图，点图和时间序列图。然后使用cowplot包中的plot_grid函数将三幅图形合并到一幅图当中。...使用ggExtra包可以非常轻松的在图形中添加边缘分布图，可以添加的图形包括直方图，箱线图和密度图。下面的代码首先绘制了一幅散点图，然后添加了边际图形，如图7所示。...在散点图中添加一个关于x轴的箱线图。使用annotation_custom()函数函数添加图形元素，由于添加一个箱线图会与原来的图形有一些点重叠，因此可以调整图形的透明度。如下图8所示。...() # 箱线图 p3 <- ggplot(df2, aes(factor(1), y))+ geom_boxplot(width=0.3,color = 'red')+ theme_ipsum() #...图8 添加图形元素上面的代码首先使用散点图中x轴对应的数据创建了一幅箱线图，然后使用y轴对应的变量绘制了一幅箱线图。然后将图形使用ggplotGrob函数转换成为一个图形元素（grob对象）。

2.5K2 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

活动名称

广告关闭