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Python处理大数据,推荐4款加速神器

该工具能用于多个工作站,而且即使在单块 CPU 的情况下,它的矩阵运算速度也比 NumPy(MKL)快。 ?...项目地址:https://github.com/dask/dask 官方文档:https://docs.dask.org/en/latest/ CuPy CuPy 是一个借助 CUDA GPU 库在英伟达...基于 Numpy 数组的实现,GPU 自身具有的多个 CUDA 核心可以促成更好的并行加速。CuPy 接口是 Numpy 的一个镜像,并且在大多情况下,它可以直接替换 Numpy 使用。...只要用兼容的 CuPy 代码替换 Numpy 代码,用户就可以实现 GPU 加速。 ?...Vaex采用了内存映射、高效的外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它的磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以在瞬间打开它(0.052 秒)。

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    【科研利器】Python处理大数据,推荐4款加速神器

    该工具能用于多个工作站,而且即使在单块 CPU 的情况下,它的矩阵运算速度也比 NumPy(MKL)快。...项目地址:https://github.com/dask/dask 官方文档:https://docs.dask.org/en/latest/ CuPy CuPy 是一个借助 CUDA GPU 库在英伟达...基于 Numpy 数组的实现,GPU 自身具有的多个 CUDA 核心可以促成更好的并行加速。CuPy 接口是 Numpy 的一个镜像,并且在大多情况下,它可以直接替换 Numpy 使用。...只要用兼容的 CuPy 代码替换 Numpy 代码,用户就可以实现 GPU 加速。...Vaex采用了内存映射、高效的外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它的磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以在瞬间打开它(0.052 秒)。

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    安利一个Python大数据分析神器!

    这些集合类型中的每一个都能够使用在RAM和硬盘之间分区的数据,以及分布在群集中多个节点上的数据。...有时问题用已有的dask.array或dask.dataframe可能都不适合,在这些情况下,我们可以使用更简单的dask.delayed界面并行化自定义算法。例如下面这个例子。...Dask delayed函数可修饰inc、double这些函数,以便它们可延迟运行,而不是立即执行函数,它将函数及其参数放入计算任务图中。 我们简单修改代码,用delayed函数包装一下。...然后我们用visualizatize看下任务图。 total.visualize() ? 上图明显看到了并行的可能性,所以毫不犹豫,使用compute进行并行计算,这时才完成了计算。...因此,如果你将sklearn替换为dklearn,那么速度将会提升很多。

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    使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算的问题

    是的-Dask DataFrames。 大多数Dask API与Pandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核上并行运行。它甚至可以在集群上运行,但这是另一个话题。...今天你将看到Dask在处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。运行时值将因PC而异,所以我们将比较相对值。郑重声明,我使用的是MBP 16”8核i9, 16GB内存。...处理单个CSV文件 目标:读取一个单独的CSV文件,分组的值按月,并计算每个列的总和。 用Pandas加载单个CSV文件再简单不过了。...read_csv()函数接受parse_dates参数,该参数自动将一个或多个列转换为日期类型。 这个很有用,因为我们可以直接用dt。以访问月的值。...这是一个很好的开始,但是我们真正感兴趣的是同时处理多个文件。 接下来让我们探讨如何做到这一点。 处理多个CSV文件 目标:读取所有CSV文件,按年值分组,并计算每列的总和。

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    又见dask! 如何使用dask-geopandas处理大型地理数据

    前言 读者来信 我之前是 1、先用arcgis 栅格转点 2、给点添加xy坐标 3、给添加xy坐标后的点通过空间连接的方式添加行政区属性 4、最后计算指定行政区的质心 之前的解决办法是用arcgis 完成第一步和第二步...,虽然完成的很慢,但是看起来好像没太大问题 但是第三步用arcgis会卡死,后来用geopandas也会卡死,后来了解到dask-geopandas,但是处理了两百万个点左右好像也报错了,不知道是我写的代码有问题还是我对...('...') # 使用你的文件路径替换 '...'...python import dask.dataframe as dd import dask_geopandas 从 CSV 文件读取数据 ddf = dd.read_csv('...') # 使用你的文件路径替换...你可能需要实验不同的npartitions值来找到最佳平衡。 检查最终保存步骤 在保存结果时,如果尝试将整个处理后的数据集写入单个文件,这可能也会导致内存问题。

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    【Python 数据科学】Dask.array:并行计算的利器

    Dask.array将数组拆分成多个小块,并使用延迟计算的方式来执行操作,从而实现并行计算。这使得Dask.array能够处理大型数据,同时充分利用计算资源。...5.2 数组合并和拆分 在Dask.array中,我们可以使用da.concatenate函数将多个数组沿指定的轴合并成一个数组: import dask.array as da # 创建多个Dask...((1000, 1000), chunks=(100, 100)) # 原地操作:将数组中的值加1 def add_one(block): block += 1 return block...# 使用map_blocks函数进行原地操作 arr = da.map_blocks(add_one, arr) 在这个例子中,我们使用da.map_blocks函数对数组进行原地操作,将数组中的值加...实际应用案例 10.1 用Dask.array处理图像数据 在图像处理中,我们经常需要处理大量的图像数据。Dask.array可以帮助我们高效地处理图像数据。

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    全平台都能用的pandas运算加速神器

    本文要介绍的工具modin就是一个致力于在改变代码量最少的前提下,调用起多核计算资源,对pandas的计算过程进行并行化改造的Python库,并且随着其近期的一系列内容更新,modin基于Dask开始对...图1 2 基于modin的pandas运算加速 modin支持Windows、Linux以及Mac系统,其中Linux与Mac平台版本的modin工作时可基于并行运算框架Ray和Dask,而Windows...平台版本目前只支持Dask作为计算后端(因为Ray没有Win版本),安装起来十分方便,可以用如下3种命令来安装具有不同后端的modin: pip install modin[dask] # 安装dask...GO的一些玩家行为数据,因为体积过大,请感兴趣的读者朋友自行去下载: 图2 为了区分他们,在导入时暂时将modin.pandas命名为mpd: 图3 可以看到因为是Win平台,所以使用的计算后端为Dask...modin中组织数据的形式与pandas不相同,所以中间需要经历转换: 图7 这种时候modin的运算反而会比pandas慢很多: 图8 因此我对modin持有的态度是在处理大型数据集时,部分应用场景可以用其替换

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    再见Pandas,又一数据处理神器!

    Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库,使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...此外,cuDF还支持用于十进制、列表和“结构”值的特殊数据类型。 缺失值: 与Pandas不同,cuDF中的所有数据类型都是可为空的,意味着它们可以包含缺失值(用cudf.NA表示)。...在比较浮点结果时,建议使用cudf.testing模块提供的函数,允许您根据所需的精度比较值。 列名: 与Pandas不同,cuDF不支持重复的列名。最好使用唯一的字符串作为列名。...Dask-cuDF: 当您希望在多个GPU上分布您的工作流程时,或者您的数据量超过了单个GPU内存的容量,或者希望同时分析许多文件中分布的数据时,您会希望使用Dask-cuDF。

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    让python快到飞起 | 什么是 DASK ?

    Dask 包含三个并行集合,即 DataFrame 、Bag 和数组,每个均可自动使用在 RAM 和磁盘之间分区的数据,以及根据资源可用性分布在集群中多个节点之间的数据。...该单机调度程序针对大于内存的使用量进行了优化,并跨多个线程和处理器划分任务。它采用低用度方法,每个任务大约占用 50 微秒。 为何选择 DASK?...鉴于 Dask 的性能和可访问性,NVIDIA 开始将其用于 RAPIDS 项目,目标是将加速数据分析工作负载横向扩展到多个 GPU 和基于 GPU 的系统。...DASK 用例 Dask 能够高效处理数百 TB 的数据,因此成为将并行性添加到 ML 处理、实现大型多维数据集分析的更快执行以及加速和扩展数据科学制作流程或工作流程的强大工具。...因此,它可以用于 HPC 、金融服务、网络安全和零售行业的各种用例。

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    cuDF,能取代 Pandas 吗?

    Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库,使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...此外,cuDF还支持用于十进制、列表和“结构”值的特殊数据类型。 缺失值: 与Pandas不同,cuDF中的所有数据类型都是可为空的,意味着它们可以包含缺失值(用cudf.NA表示)。...在比较浮点结果时,建议使用cudf.testing模块提供的函数,允许您根据所需的精度比较值。 列名: 与Pandas不同,cuDF不支持重复的列名。最好使用唯一的字符串作为列名。...Dask-cuDF: 当您希望在多个GPU上分布您的工作流程时,或者您的数据量超过了单个GPU内存的容量,或者希望同时分析许多文件中分布的数据时,您会希望使用Dask-cuDF。

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    再见Pandas,又一数据处理神器!

    Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库,使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...此外,cuDF还支持用于十进制、列表和“结构”值的特殊数据类型。 缺失值: 与Pandas不同,cuDF中的所有数据类型都是可为空的,意味着它们可以包含缺失值(用cudf.NA表示)。...在比较浮点结果时,建议使用cudf.testing模块提供的函数,允许您根据所需的精度比较值。 列名: 与Pandas不同,cuDF不支持重复的列名。最好使用唯一的字符串作为列名。...Dask-cuDF: 当您希望在多个GPU上分布您的工作流程时,或者您的数据量超过了单个GPU内存的容量,或者希望同时分析许多文件中分布的数据时,您会希望使用Dask-cuDF。

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    (数据科学学习手札86)全平台支持的pandas运算加速神器

    本文要介绍的工具modin就是一个致力于在改变代码量最少的前提下,调用起多核计算资源,对pandas的计算过程进行并行化改造的Python库,并且随着其近期的一系列内容更新,modin基于Dask开始对...图1 2 基于modin的pandas运算加速 modin支持Windows、Linux以及Mac系统,其中Linux与Mac平台版本的modin工作时可基于并行运算框架Ray和Dask,而Windows...平台版本目前只支持Dask作为计算后端(因为Ray没有Win版本),安装起来十分方便,可以用如下3种命令来安装具有不同后端的modin: pip install modin[dask] # 安装dask...图3   可以看到因为是Win平台,所以使用的计算后端为Dask,首先我们来分别读入文件查看耗时: ?...图8   因此我对modin持有的态度是在处理大型数据集时,部分应用场景可以用其替换pandas,即其已经完成可靠并行化改造的pandas功能,你可以在官网对应界面(https://modin.readthedocs.io

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    仅需1秒!搞定100万行数据:超强Python数据分析利器

    GitHub:https://github.com/vaexio/vaex 3 Vaex vs Dask、Pandas、Spark Vaex与Dask不同,但与Dask DataFrames相似,后者是在...Vaex和Dask都使用延迟处理。唯一的区别是,Vaex在需要的时候才计算字段,而Dask需要显式地使用compute函数。 数据需要采用HDF5或Apache Arrow格式才能充分利用Vaex。...df.info(memory_usage='deep') 把它保存到磁盘,这样我们以后可以用Vaex读取它: file_path = 'big_file.csv' df.to_csv(file_path...这是因为Vaex只记得定义它们的表达式,而不预先计算值。这些列仅在必要时才被延迟计算,从而保持较低的内存使用率。...在创建过滤后的数据流时,Vaex会创建一个二进制掩码,然后将其应用于原始数据,而不需要进行复制。这类过滤器的内存成本很低: 过滤10亿行数据流需要大约1.2 GB的RAM。

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    【Python篇】深入挖掘 Pandas:机器学习数据处理的高级技巧

    Pandas 作为 Python 中最流行的数据处理库,为开发者提供了非常强大的工具集,能够在数据处理、特征生成、时序分析等多个方面发挥重要作用。...1.1 缺失值处理 数据中的缺失值常常会影响模型的准确性,必须在预处理阶段处理。Pandas 提供了丰富的缺失值处理方法: 删除缺失值:可以删除包含缺失值的行或列。...填充缺失值:可以使用均值、中位数、最常见值或自定义值填充缺失值。...用均值填充缺失的数值 df_filled = df.fillna({'Age': df['Age'].mean(), 'Salary': df['Salary'].mean()}) print(df_cleaned...8.3 使用 explode() 拆分列表 如果某一列包含多个元素组成的列表,你可以使用 Pandas 的 explode() 方法将列表拆分为独立的行。

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    告别Pandas瓶颈,迎接Dask时代:Python数据处理从此起飞!

    Dask的作用 Dask的主要作用是提供并行和分布式计算能力,以处理超出单个机器内存容量的大型数据集。...它与NumPy、Pandas和Scikit-Learn等流行库无缝集成,允许开发者在无需学习新库或语言的情况下,轻松实现跨多个核心、处理器和计算机的并行执行。...Dask的核心组件与语法 Dask由几个核心组件组成,包括动态任务调度系统、Dask数组(dask.array)、Dask数据框(dask.dataframe)和Dask Bag(dask.bag)。...深入探索 安装Dask 首先,确保你已经安装了Dask及其所有依赖项。...()) # 删除缺失值 df = df.dropna() # 计算某一列的均值 mean_value = df['column_name'].mean().compute() print(f'均值:

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    使用Dask,SBERT SPECTRE和Milvus构建自己的ARXIV论文相似性搜索引擎

    Milvus Vector是一个矢量数据库,我们也可以使用其他矢量数据库,如果使用其他库替换的话,有许多步骤完全相同并且改动并不复杂。 设置环境并从Kaggle下载ARXIV数据。...为了处理这样大的数据,我们选择使用DASK将数据分为多个分区,并且仅将一些需要处理的分区加载到内存中。 Dask Dask是一个开源库,可以让我们使用类似于PANDA的API进行并行计算。...Dask Bag:使我们可以将JSON文件加载到固定大小的块中,并在每行数据上运行一些预处理功能 DASK DATAFRAME:将DASK Bag转换为DASK DATAFRAME,并可以用类似Pandas...的API访问 步骤1:将JSON文件加载到Dask Bag中 将JSON文件加载到一个Dask Bag中,每个块的大小为10MB。...Bag转换为DASK DATAFRAME 数据加载的最后一步是将Dask Bag转换为DASK DATAFRAME,这样我们可以使用类似Pandas的API进行访问。

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    分布式计算框架:Spark、Dask、Ray

    值得注意的是,Spark是用Scala编写的,后来又增加了对Python和R的支持,因此与它互动一般不会有Pythonic的感觉。...Dask的最初目的只是为了将NumPy并行化,这样它就可以利用具有多个CPU和核心的工作站计算机。与Spark不同,Dask开发中采用的最初设计原则之一是 "无发明"。...独特的基于actor的抽象,多个任务可以在同一个集群上异步工作,从而实现更好的利用率(相比之下,Spark的计算模型不太灵活,基于并行任务的同步执行)。 弊端: 相对较新(2017年5月首次发布)。...为了让事情变得更加复杂,还有Dask-on-Ray项目,它允许你在不使用Dask分布式调度器的情况下运行Dask工作流。...它是用Python编写的,这使得它易于安装和调试,但也会引入通常与Python搭配使用的标准性能考虑因素。

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    Spark vs Dask Python生态下的计算引擎

    Spark vs Dask 首先先上Dask和Spark的架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态中的 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好的兼容性,并且在...性能 Dask 中的 dataframe 基本上由许多个 pandas 的 dataframe 组成,他们称为分区。...或者不希望完全重写遗留的 Python 项目 你的用例很复杂,或者不完全适合 Spark 的计算模型(MapReduce) 你只希望从本地计算过渡到集群计算,而不用学习完全不同的语言生态 你希望与其他...如果你已经在使用大数据集群,且需要一个能做所有事情的项目,那么 Spark 是一个很好的选择,特别是你的用例是典型的 ETL + SQL,并且你在使用 Scala 编写程序。...Dask 更轻量、更容易集成到现有的代码里。

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