1回答
pca.plot<-function(x){ jpeg(file=biplot, type="cairo") dev.off()这是一个简单的函数，从一个输入pca对象(使用FactoMineR包创建的
浏览 2提问于2015-05-13得票数 3
回答已采纳
7回答
我想知道是否有可能用ggplot2绘制pca双线图结果。假设我想用ggplot2显示下面的双线图结果summary(fit)任何帮助都将受到高度的感谢。
浏览 0提问于2011-07-05得票数 38
回答已采纳
new.pca <- prcomp(scaled_new, center=TRUE, scale.=TRUE)
fviz_pca_biplot(new.pca, geom = "point", habillage = new.k, repel = "TRUE")new.k1 <- new[,5]
fviz_pca_biplot(new.pca, geom = "poi
浏览 14提问于2022-06-05得票数 1
回答已采纳
我已经做了PCA，但是我尝试用冒泡图格式绘制点，根据变量值使用不同的大小：library("FactoMineR")ulva2<-c("1","1","0","2","3","2")
data<-data.frame(site,sediment,deep,ulva2
浏览 9提问于2022-03-07得票数 1
回答已采纳
3回答
我仍然是R的新手，正在尝试学习如何使用素食库，我可以使用普通的plot函数在R中轻松地绘制它。当我想要在ggplot中绘制数据时，问题就出现了。我练习的数据集可以从这里下载，我用来转换数据的代码是这样的：library(dplyr)library(grid)rownames(data2) <- data[,1]
data2 <- scale(data2, center = T, scale = apply(data2
浏览 7提问于2015-08-25得票数 2
回答已采纳
1回答
用R (USArrests)提供的一个例子，我想问一下，有没有人能告诉我自动绘图中的缩放导致了什么？我熟悉Borcard等人所描述的距离和相关性双线图。(2011)。autoplot函数使biplot变得更好，但我找不到如何使用该函数简单地区分距离和相关类型的biplot。several options: ggplot2::autoplot(stats::prcomp(USArrests, scale=TRUE), pc.biplot=TRUE, label = T
浏览 5提问于2018-05-17得票数 2
1回答
PCA双图中加载的不同颜色
、、、、
在中，我已经成功地绘制了选定的观察结果，但是，我想知道是否有可能为箭头设置不同的颜色。library(tibble)library(ggfortify) as_tibble(rownames="measurement")
pca_topmeas
浏览 6提问于2022-11-02得票数 0
回答已采纳
1回答
我怎样才能用fviz_pca做到这一点呢？还是有更好的pca包？我的代码 col.ind = groups, # color by groups
palette = c("#00AFBB
浏览 0提问于2018-10-01得票数 0
我正试着和R一起做PCA。或
Sample_scaled.2<-data.fram
浏览 0提问于2012-11-14得票数 3
回答已采纳
biplot.prcomp制作的图表实际上是这样做的，但我找不到允许调整轴的特定比率的代码。=rda(cbind(s1,s2,s3))plot(pca, xlab = "x1", ylab = "y1", ylim = c(min(pca.scoop$sites[,2]),max(<e
浏览 18提问于2016-07-04得票数 1
回答已采纳
1回答
我对5个不同样本的45000个基因进行了主成分分析( pca )，当我进行双写时，我看到的只是大量的文本(响应观察名称)，而无法看到样本的位置。是否有一种方法只绘制样本的位置，而不是在双情节中绘制观测结果？使用来自R的内置数据pca1 <- prcomp(usa)
这产生了一个双图，其中所有的状态(观察名)重叠的变量(我的不同样本)强奸等是否有可能只绘制变量(样本)，而不是状态(观察名称
浏览 1提问于2014-08-11得票数 1
回答已采纳
3回答
我想输出生成的PCA图的坐标，但我很难找到正确的坐标。我找到了results1$ind$coord和results1$var$coord，但它们看起来都不像默认的绘图。我找到了和，但都没有描述由PCA创建的变量的内容data1 <- read.table(file=args[1], sep='\t', header=T, row.names=1)
result1 <- PCA(data1,ncp = 4, graph=TRUE) # graphs generated
浏览 0提问于2012-04-21得票数 6
回答已采纳
1回答
我不想做任何复杂的事情，我只想把饼图和PCA图画在一起。我想要比PCA图更大的piechart。 我想用两个PCA图或用fviz_pca_biplot绘制饼图。下面是PCA： principal4<-PCA(ExpertWine2,scale.unit = T,ind.sup = NULL,quanti.sup =29:30,quali.sup =1,graph= T,axes = c(1,2),ncp = 3)
fviz_pca</em
浏览 13提问于2021-04-08得票数 0
2回答
我所输入的只是以下内容，其中CCFS是一个数据矩阵 r = robjects.r
r.biplot(pca,main="biplot")
r['dev.off']() #*EDIT* the problem persists我知道有一些地方需要绘制
浏览 6提问于2012-09-29得票数 1
回答已采纳
今天我必须做一个biplot，但是典型的biplot是丑陋的。有一种方法可以使它更漂亮，画椭圆等，而不使用其他软件包？PCA <- prcomp(DF[,c(1:4)], scale. = T, center = T)结果：期望的结果(用PAST3制作)
浏览 5提问于2017-11-25得票数 2
回答已采纳
我正在绘制我的PCA作为一个双情节但我不能将我的点数更改为平方(pch=15)。对于单个观察组，我使用以下代码
basic_bi_plot <- fviz_pca_biplot(res.pca, axes = c(1, 2),
浏览 5提问于2022-02-14得票数 1
它同时在PCA中进行丰度和环境数据，使用两个不同的数据框架:我被告知它将以这样的方式工作:从PCA1获得物种的坐标，然后使用第二个命令覆盖物种坐标向量，不是来自PCA 1，而是来自另一个数据集，该数据集与第一个数据集具有相同的位置不是丰富data.frame(X,Te
浏览 1提问于2018-07-23得票数 3
我一直在努力调整ggplot2/ggfortify PCA中的加载(箭头)长度。我已经广泛地寻找了这个问题的答案，我找到的唯一信息要么是编写新的biplot函数，要么是引用其他完全不同的PCA包(ggbiplot，factoextra)，这两个包都没有解决我想要回答的问题：
是否可以在下面是使用stock R函数绘制PCA的代码，以及使用autoplot/ggfortify绘制PCA的代码。我仍然希望使用ggplot2</e
浏览 2提问于2016-03-11得票数 6
1回答
library('factoextra') pca.cars <- PCA(mtcars) # samples
fill.ind =
浏览 3提问于2020-10-22得票数 2
回答已采纳
但是当我查看row‘环境’中的文件时，它已经重置了行名
model<-prcomp(tf4[,-7],scale=TRUE)站点标识符不在绘图中使用
浏览 9提问于2021-06-19得票数 0
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
云直播
对象存储
腾讯会议活动推荐
腾讯云开发者
