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(2929)
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沙龙
1
回答
函数来创建和保存图形。
、
、
pca
.plot<-function(x){ jpeg(file=
biplot
, type="cairo") dev.off()这是一个简单的函数,从一个输入
pca
对象(使用FactoMineR包创建的
浏览 2
提问于2015-05-13
得票数 3
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7
回答
用
ggplot2
绘制
主成分分析图
、
、
、
我想知道是否有可能用
ggplot2
绘制
pca
双线图结果。假设我想用
ggplot2
显示下面的双线图结果summary(fit)任何帮助都将受到高度的感谢。
浏览 0
提问于2011-07-05
得票数 38
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1
回答
如何将多个fviz_
pca
_
biplot
合并成一个图
、
new.
pca
<- prcomp(scaled_new, center=TRUE, scale.=TRUE) fviz_
pca
_
biplot
(new.
pca
, geom = "point", habillage = new.k, repel = "TRUE")new.k1 <- new[,5] fviz_
pca
_
biplot
(new.
pca
, geom = "poi
浏览 14
提问于2022-06-05
得票数 1
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1
回答
如何在r中
绘制
PCA
气泡图?
我已经做了
PCA
,但是我尝试用冒泡图格式
绘制
点,根据变量值使用不同的大小:library("FactoMineR")ulva2<-c("1","1","0","2","3","2") data<-data.frame(site,sediment,deep,ulva2
浏览 9
提问于2022-03-07
得票数 1
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3
回答
在ggplot中
绘制
RDA (素食)
、
、
、
我仍然是R的新手,正在尝试学习如何使用素食库,我可以使用普通的plot函数在R中轻松地
绘制
它。当我想要在ggplot中
绘制
数据时,问题就出现了。我练习的数据集可以从这里下载,我用来转换数据的代码是这样的:library(dplyr)library(grid)rownames(data2) <- data[,1] data2 <- scale(data2, center = T, scale = apply(data2
浏览 7
提问于2015-08-25
得票数 2
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1
回答
使用autoplot的相关性和距离双线图?
、
、
、
、
用
R (USArrests)提供的一个例子,我想问一下,有没有人能告诉我自动绘图中的缩放导致了什么?我熟悉Borcard等人所描述的距离和相关性双线图。(2011)。autoplot函数使
biplot
变得更好,但我找不到如何使用该函数简单地区分距离和相关类型的
biplot
。several options:
ggplot2
::autoplot(stats::prcomp(USArrests, scale=TRUE), pc.
biplot
=TRUE, label = T
浏览 5
提问于2018-05-17
得票数 2
1
回答
PCA
双图中加载的不同颜色
、
、
、
、
在中,我已经成功地
绘制
了选定的观察结果,但是,我想知道是否有可能为箭头设置不同的颜色。library(tibble)library(ggfortify) as_tibble(rownames="measurement")
pca
_topmeas
浏览 6
提问于2022-11-02
得票数 0
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1
回答
如何调整fviz_
pca
轴的尺寸?
、
、
、
我怎样才能用fviz_
pca
做到这一点呢?还是有更好的
pca
包?我的代码 col.ind = groups, # color by groups palette = c("#00AFBB
浏览 0
提问于2018-10-01
得票数 0
1
回答
PCA
Biplot
:一种隐藏向量以清晰看到所有数据点的方法
我正试着和R一起做
PCA
。或 Sample_scaled.2<-data.fram
浏览 0
提问于2012-11-14
得票数 3
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1
回答
如何始终在RStudio中使两个轴在0处交叉(甚至在调整绘图设备的大小时)
、
biplot
.prcomp制作的图表实际上是这样做的,但我找不到允许调整轴的特定比率的代码。=rda(cbind(s1,s2,s3))plot(
pca
, xlab = "x1", ylab = "y1", ylim = c(min(
pca
.scoop$sites[,2]),max(<e
浏览 18
提问于2016-07-04
得票数 1
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1
回答
PCA
双图一变量显示R
、
我对5个不同样本的45000个基因进行了主成分分析(
pca
),当我进行双写时,我看到的只是大量的文本(响应观察名称),而无法看到样本的位置。是否有一种方法只
绘制
样本的位置,而不是在双情节中
绘制
观测结果?使用来自R的内置数据
pca
1 <- prcomp(usa) 这产生了一个双图,其中所有的状态(观察名)重叠的变量(我的不同样本)强奸等是否有可能只
绘制
变量(样本),而不是状态(观察名称
浏览 1
提问于2014-08-11
得票数 1
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3
回答
主成分分析FactoMineR图数据
、
、
、
我想输出生成的
PCA
图的坐标,但我很难找到正确的坐标。我找到了results1$ind$coord和results1$var$coord,但它们看起来都不像默认的绘图。我找到了和,但都没有描述由
PCA
创建的变量的内容data1 <- read.table(file=args[1], sep='\t', header=T, row.names=1) result1 <-
PCA
(data1,ncp = 4, graph=TRUE) # graphs generated
浏览 0
提问于2012-04-21
得票数 6
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1
回答
有没有一个R函数可以让我把两个图组合起来?
、
、
、
我不想做任何复杂的事情,我只想把饼图和
PCA
图画在一起。我想要比
PCA
图更大的piechart。 我想用两个
PCA
图或用fviz_
pca
_
biplot
绘制
饼图。下面是
PCA
: principal4<-
PCA
(ExpertWine2,scale.unit = T,ind.sup = NULL,quanti.sup =29:30,quali.sup =1,graph= T,axes = c(1,2),ncp = 3) fviz_
pca</em
浏览 13
提问于2021-04-08
得票数 0
2
回答
用
rpy制作的情节突然接近X11?
、
、
、
我所输入的只是以下内容,其中CCFS是一个数据矩阵 r = robjects.r r.
biplot
(
pca
,main="
biplot
") r['dev.off']() #*EDIT* the problem persists我知道有一些地方需要
绘制
浏览 6
提问于2012-09-29
得票数 1
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1
回答
如何在不使用外部包的情况下在R中制作一个漂亮的双情节图?
、
、
、
今天我必须做一个
biplot
,但是典型的
biplot
是丑陋的。有一种方法可以使它更漂亮,画椭圆等,而不使用其他软件包?
PCA
<- prcomp(DF[,c(1:4)], scale. = T, center = T)结果:期望的结果(
用
PAST3制作)
浏览 5
提问于2017-11-25
得票数 2
回答已采纳
1
回答
在fviz_
pca
_
biplot
中改变点的形状
、
、
我正在
绘制
我的
PCA
作为一个双情节但我不能将我的点数更改为平方(pch=15)。对于单个观察组,我使用以下代码 basic_bi_plot <- fviz_
pca
_
biplot
(res.
pca
, axes = c(1, 2),
浏览 5
提问于2022-02-14
得票数 1
1
回答
如何在具有丰富数据的表格上执行
PCA
,但将其与R中站点的环境参数向量叠加?
、
、
、
它同时在
PCA
中进行丰度和环境数据,使用两个不同的数据框架:我被告知它将以这样的方式工作:从
PCA
1获得物种的坐标,然后使用第二个命令覆盖物种坐标向量,不是来自
PCA
1,而是来自另一个数据集,该数据集与第一个数据集具有相同的位置不是丰富data.frame(X,Te
浏览 1
提问于2018-07-23
得票数 3
1
回答
是否使用
ggplot2
/ggfortify更改
PCA
图中的载荷(箭头)长度?
、
、
、
我一直在努力调整
ggplot2
/ggfortify
PCA
中的加载(箭头)长度。我已经广泛地寻找了这个问题的答案,我找到的唯一信息要么是编写新的
biplot
函数,要么是引用其他完全不同的
PCA
包(ggbiplot,factoextra),这两个包都没有解决我想要回答的问题: 是否可以在下面是使用stock R函数
绘制
PCA
的代码,以及使用autoplot/ggfortify
绘制
PCA
的代码。我仍然希望使用
ggplot2</e
浏览 2
提问于2016-03-11
得票数 6
1
回答
双图R中特定点的文本标号
、
、
library('factoextra')
pca
.cars <-
PCA
(mtcars) # samples fill.ind =
浏览 3
提问于2020-10-22
得票数 2
回答已采纳
2
回答
无法将
PCA
prcomp中的标签从行号更改为站点名称
、
、
但是当我查看row‘环境’中的文件时,它已经重置了行名 model<-prcomp(tf4[,-7],scale=TRUE)站点标识符不在绘图中使用
浏览 9
提问于2021-06-19
得票数 0
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