当片段离子覆盖率从100%下降到50%时,正确测序的肽段的比例从80%下降到只有20%,这表明从头测序的精度对片段离子覆盖率非常敏感,其根本原因是片段离子的缺乏使得连续氨基酸的顺序发生变化。...pNovo 3在全长肽水平上提高了29.4-96.1%,在全长肽水平上提高了2.0-20.1%。...在七个不同物种的测试数据集上,pNovo 3在全长肽水平上提高了29.4-96.1%,在氨基酸水平上提高了2.0-20.1%。...(b1þ, b2þ, ..., b1þþ, b2þ, ..., y1þ, y2þ,..., y1þ, y2þ, ...), p1, ..., pn是预测的相应离子的强度。...图2. 相似度计算公式
2.提取间隙特征,利用PSMs(倾向值匹配)中的碎片隙信息独立于设计pDeep理论谱预测的特征。当b和y离子在两个连续的氨基酸之间分裂时。