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OpenMM.No.2.可视化界面以及力场

OpenMM-Setup是一个图形应用程序,可引导完成加载输入文件和设置选项的整个过程。 然后,它会生成一个完整的脚本,甚至可以直接运行。 ?...这是快速完成所有必要准备和设置的非常简单的方法。 openmm强烈建议所有新手到专家使用OpenMM-setup。 我这里使用的是chrome 比较容易使用,会单独出一章 ?...可以通过三种方式选择平台: 1.默认情况下,OpenMM将尝试选择最快的可用平台。 通常,它的选择是比较合理的,但是有时需要自定义。...2.或者,可以将OPENMMDEFAULTPLATFORM环境变量设置为要使用的平台的名称。 这将覆盖默认选项。 3.最后,在创建模拟时,可以在脚本中显式指定Platform对象。...在大多数情况下,只需包含该文件,再加上一个水模型,例:charmm36 / water.xml,它指定了默认的CHARMM水模型(TIP3P 的修改版)和离子: forcefield = ForceField

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新的Feren OS做得更好

对于死硬的肉桂用户来说,在Feren OS Classic和新的Feren OS之间选择KDE桌面可能是一个艰难的选择。修改后的等离子设计可能会软化一些谁否则不喜欢等离子环境肉桂桌面的损失。...另一个例子是简单菜单,等离子弹弓式菜单。它是默认ferenos(aka KDE)布局的默认菜单。这绝对是一个不同的菜单体验比主要的肉桂菜单。...布局选项 其他发行版使用的KDE集成中我不喜欢的一件事是对样式和布局选项以及系统设置的混乱处理。在新的Feren-OS等离子体方案中对这些布局的改进是受欢迎的。...开发人员将可用布局的数量显著减少到六种样式选择。我喜欢重质量轻数量。它驯服了血浆中令人眩晕的设置。 这六种布局涵盖了最常见的布局样式。布局选项是一个很好的改进,比肉桂桌面上的几个默认选项。...因为我熟悉Plasma环境,所以我在重新调整软件选择方面取得了领先。如果你不熟悉KDE软件家族或等离子桌面,你可以期待更长的学习曲线。 另一个主要的问题是我花了大量的时间来浏览大量的设置面板。

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    原创 | codeforces 1425E,一万种情况的简单题

    还有一个特殊的性质就是这些离子之间带有连带关系,默认的连带关系是第i个离子与第i+1个离子连带。当i离子跃迁的时候,即使i+1的离子没有吸收能量也会发生跃迁。其中第N个离子无法建立连带关系。...现在这个人获得了K次改变离子之间连带关系的能力,它必须要严格改变K个离子的连带对象。除此之外我们可以自由选择任意个离子进行激活,请问我们最多能够获得多少能量收益?...情况1成立是有前提的,前提就是我们选择的激活的离子不能是最后一个,因为最后一个离子没有连接。很有可能前面N-1个离子的代价都大于收益,只有第N离子的收益是正的。...如果激活的话,我们就获得所有离子的收益,也可以不激活。 所以我们又得到了两种情况,分别是情况3和情况4。...情况4是在情况3的基础上再激活一个i+1离子,情况4: ,我们再分析一下会发现我们可以通过选择i,让D[i+1]也尽量小,小到成为全局倒数第二小。

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    致命缺陷!谷歌实现量子霸权的超导量子比特,或将败于光子量子比特

    新智元报道 来源:arstechnica 作者:CHRIS LEE 编译:肖琴 【新智元导读】声称已经实现了量子霸权的谷歌,以及IBM等都选择了相同类型的硬件作为其量子计算工作的基础。...与上述声明无关,值得注意的是,谷歌以及其批评者IBM都选择了相同类型的硬件作为量子计算工作的基础。还有一家规模较小的竞争对手Rigetti也是如此。...这个列表是不完整的,但是,这些选项中的大多数是一潭死水,有很充分的理由可以这样说。...虽然量子比特的行为是由单个量子比特级的物理决定的,但一旦考虑到可扩展性,工程就真的很重要,而且这些选项中很多不太适合可扩展性。...事实上,该位置是由光学定义的,聚焦于用于设置和读取量子态的光。 从本质上讲,量子比特状态是由与晶体内的许多离子相互作用的光脉冲设置的。要产生更多的量子比特需要相当复杂的光学装置。

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    代谢组数据分析一:从质谱样本制备到MaxQuant搜库

    质谱上机质谱仪的构成简要图(Figure 4) 质谱仪元件离子源 [Ion Sources make ions from sample molecules.]基质辅助激光解吸电离(MALDI)电喷雾电离...DIA数据非依赖采集,在一级图谱扫描过程不对碎裂母离子做筛选,而是设置窗口(窗口大小依据仪器和软件设定),落在该窗口内的母离子全部进入二级碎裂得到二级图谱。优点:全面获取所有离子的碎片信息。...":MaxQuant会自动选择机器类型,也可以手动修改,参数选择软件默认的即可;"digestion":选择默认的Trypsin/P;"Label-free quantification":选择LFQ及其默认参数...Global parameters:(其他参数选择默认参数即可,也可根据实际情况自行设置)"Sequence":选择"Add"导入蛋白质fasta文件,并点"Identifier",选择"Up to first...在设置完所有参数后,点击上面File选择保存parameters files,方便下次重复运行。 完成保存设置参数文件后,最左下方提供选择CPU数目,一般设置电脑total(CPU) -1的数目。

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    恒电流间歇滴定法GITT测试教程-测试狗科研测试

    图6 新威恒电流充放电测试仪操作软件图7 新威恒电流充放电测试仪主界面(2)选择一个测试通道,右键进入测试程序编辑界面。...为了恒电流间歇式作用于测试电极(图8),将测试工步按照图9(正极)和图10(负极)设置工步。...图8 GITT测试电流-时间曲线图9 典型正极材料的设置程序图10 典型负极材料的设置程序GITT测试时“先放电还是先充电” 应与恒流充放电测试一致,如S、V2O5、FePO4正极材料与Li配对时,需要先放电才能进行充电...图14 四种电极的GITT曲线(a-d)及锌离子扩散系数(e-h)[4]5.参考文献[1] 郑浩, 高健, 王少飞,等. 锂电池基础科学问题(Ⅵ)——离子在固体中的输运[J]....锂离子电池基础科学问题(ⅫⅠ)——电化学测量方法[J]. 储能科学与技术, 2015, 4(001):83-103.[3] Li H, Peng L, Wu D, et al.

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    这期Nature封面「雪崩」了!

    接下来,在激发态吸收(ESA)步骤中,激发离子吸收更多的光,从而进入更高能量的激发态。光频率的选择是为了确保这种激发的光被强烈吸收。 ? 光子雪崩的机制。...研究人员现在已经在纳米晶体中获得了光子雪崩,这些纳米晶体中含有比以前研究中更高比例的镧系离子。更具体地说,作者研究了氟化钇钠(NaYF4,该领域的主力材料)的纳米颗粒,其中部分钇被铥离子取代。...由NaYF4或其他材料制成的纳米晶体,含有这些镧系元素的高浓度,可能会产生与Lee等人观察到的不同频率的雪崩发射,可能具有更大的非线性响应。 尖端的建模研究可能会促进这种搜索。...李教授等人使用方程4对雪崩过程进行了建模,这些方程对相邻离子之间的平均能量转移率进行了一些近似描述。...作者的成像设置是简单的相比,其他超分辨率技术2,10,只需要一个单一的激光波长和不到十分之一的激光功率。

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    等离子清洗工艺在芯片键合前的应用

    氧气氧离子在反应仓内与有机污染物反应,生成二氧化碳和水。清洗速度和更多的清洗选择性是化学等离子清洗的优点。氢气氢离子发生还原反应,去除工件表面氧化物。...物理等离子清洗工艺模式采用的仓体压力较小。物理等离子清洗工艺要求被激发的离子轰击工件表面。...加大等离子体射频功率是增加等离子的离子能量来加强清洗强度。离子能量是活性反应离子进行物理工作的能力。...射频功率的设置主要与清洗时间达到动态平衡,增加射频功率可以适当降低处理时间,但会导致反应仓体内温度略有升高,所以有必要考虑清洗时间和射频功率这两个工艺参数。...等离子体清洗模式主流的等离子清洗机有三种类型的电极载物板,用作设备的阳极、阴极以及悬浮极。根据工件的不同,调节电极载物板能够产生两种模式的等离子体,命名为直接等离子体模式和顺流等离子体模式。

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    等离子清洗技术在DCDC混合电路中的应用

    2.去除厚膜基板导带上的有机沾污选择氩气/氧气混合气作为清洗气体,清洗功率200~300W,清洗时间300~400s,气体流量500sccm, 可以有效去除金导体厚膜基板导带上的有机沾污3.去除外壳表面氧化层通过氩气或氢气作为清洗气体的射频等离子清洗...由于等离子体在清洗舱内分布较为均匀,可以实现复杂结构及狭小部位的清洗,选择氢气作为清洗气体时,清洗功率200~300W,清洗时间400~600s,气体流量200sccm,经过射频等离子清洗后, 焊料在管壳上浸润性良好...4.提高油墨与盖板的浸润性选择氩气或氩氢混合气作为清洗气体,选择氩气作为清洗气体时,清洗功率100~200W,清洗时间50~100s,气体流量300sccm,经过射频等离子清洗处理后,油墨与盖板表面的浸润性明显提高...,没有出现团聚现象5.提高陶瓷材料表面活性选择氩氧混合气作为清洗气体,清洗功率100~200W,清洗时间50~100s,气体流量200sccm,经过射频等离子处理光耦陶瓷粘接面后,粘接剂在陶瓷界面有了明显的残留...6.提高铝丝与焊盘相互扩散选择氩氧混合气作为清洗气体,清洗功率200~300W,清洗时间200~300s,氩气/氧气混合气流量200sccm,经过射频等离子清洗后,芯片上焊盘活性提高,硅铝丝在芯片焊盘上出现良好的功率扩散圈

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    AI成功预测等离子体撕裂登Nature,清洁能源「圣杯」更近一步

    图3:基于AI能的撕裂规避实验 图4a展示了应用不同设置阈值的控制器进行的三场实验,分别为0.2、0.5和0.7。...其中,当阈值设为0.5和0.7时,等离子体能够稳定持续,直到实验结束都没有出现破坏性的不稳定现象。 图4b至4d展示了三次实验后分析得到的撕裂倾向情况。...可以看到,不同的阈值设置会让AI控制展现出不同的行为特征。 图4b的分析显示,撕裂预测模型能在不稳定发生前300毫秒预警,控制器也试图进一步减少束流功率。...在图4c中,设置了k = 0.5的AI控制器通过提前采取措施,主动避免触及阈值,以应对不稳定性的警告。...图4:不同阈值设置的对比实验 点亮未来之路 研究人员指出,虽然这项工作成功证明了AI在有效控制聚变反应方面的潜力,但这只是推动聚变研究领域的第一步。

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    PLC(光分路器)技术以及制作工艺大全

    在生活体验中,离我们最近的就是,入户调制解调器的“猫”尾巴,由早期的双绞线升级至目前的光纤跳线,就是引自PLC光分路器的一个端口,光纤入户通常能支持100-200M的网速,这比电缆所能支持的4M传输速率高得多...浸泡在溶液中进行离子交换; 4)通过电场驱动,将分布在表层的交换离子驱动到一定深度,形成波导结构。...实际工艺中,为了更好的保证离子交换效果,上述3-4两步需要同时进行,这有赖于具体的工艺设计。...1.jpg 为了提高离子交换效率并获得良好的光波导特性,需要适当选择两种相互交换的离子,优化玻璃配方,控制溶液的浓度和温度,并适当的施加电场。...3.jpg 4) 火焰水解法 火焰水解法FHD制备光波导的工艺流程与化学气相沉积CVD类似,差别仅在生成薄膜层的工艺条件不同。

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    一种改进的深度极限学习机预测锂离子电池的剩余使用寿命

    该方法使用基于自适应正常云模型的灰狼优化算法来优化深度极值学习机的偏差、输入层的权重、激活函数的选择和隐藏层节点的数量。...锂离子电池广泛应用于许多领域。锂离子电池的RUL预测已成为研究热点,锂离子电池RUL预测也成为研究热点。...锂离子电池的SOH和RUL预测进行了改进的高斯过程回归。针对长期预测精度低、模型输出不稳定、关键参数选择复杂等问题,使用一种自适应差分进化算法来优化单调回波状态网络的预测方法。...然而,DELM超参数的选择影响其预测效果,超参数的不当选择会导致预测精度差。...1.ELM的网络结构 2.DELM模型的训练过程 3.灰狼优化器地位 4.灰狼追踪猎物的机制 5.基于自适应正态云模型的灰太狼优化算法 6.CGWO-DELM流程 在电池的实际工作中,很难获得容量和内阻等直接参数

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    Nature Plants|​中国农大蒋才富课题组揭示重要抗盐机制

    过去几十年的研究表明,Na+选择性离子转运蛋白在Na+稳态维持过程发挥着重要作用,并且鉴定了两类具有重要生理功能的Na+选择性离子转运蛋白,一类是以AtSOS1为代表的NHX家族蛋白,另一类是以AtHKT1...family Na+ transporter confers natural variation of salt tolerance in maize” 的研究论文,报道了第三类具有重要抗盐生理功能的Na+选择性离子转运蛋白...该研究通过GWAS和QTL分析从玉米中克隆了一个与盐胁迫下地上部Na+含量显著相关的位点ZmNC2,它编码HAK家族离子转运蛋白ZmHAK4。...ZmHAK4是一个Na+选择性离子转运蛋白,主要定位在根中柱细胞(如木质部薄壁细胞)的质膜上,推测它能将木质部中的Na+吸收到周围薄壁细胞中,从而减少Na+由根向地上部运输,维持地上部Na+稳态。...该研究还发现从包括苔藓到高等开花植物在内的绝大部分植物都有ZmHAK4的直系同源基因,并且小麦和水稻的ZmHAK4直系同源基因的表达模式和离子转运特性与ZmHAK4相似,推测ZmHAK4可能揭示了一种进化上保守的

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    离子注入工艺的设计与计算

    介绍工艺之前,我们先聊一下昨天一个朋友提到的日本日新的离子注入设备。日本日新是全球3大离子注入设备商之一。 1973年的时候,该公司就开始做离子注入的工艺设备。 目前的主要业务设备如上表。...重点介绍激光领域用到的一款设备: 主要是注入H离子用的,可以达到400KeV的H+离子注入。...日新株式会社将在扬州经济技术开发区投资兴建离子注入机设备生产厂。 离子注入工艺参数 00 离子注入就像上图一样,把离子砸到晶圆中。涉及到使用的力度、数量、角度,砸进去的深度等。...设备可以选择工艺需要的价态离子进行注入。 如果单电荷可以做到400KeV的能量的话,对应3+离子可以做到1200KeV,可以直接倍速关系。...如果我们只知道需要掺杂的剂量,和离子能量,如何计算注入离子在靶材中的浓度和深度 例如一个140KeV的B+离子,注入150mm的6寸硅片上,注入剂量Q=5*1014/cm2,衬底浓度2*1016

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    化合物纯度、溶剂溶解度检测 | MedChemExpress

    HNMR 核磁氢谱谱图解析: 1、产品结构式,分子式及分子量,通过分子式判断 H 原子总数; 2、H 原子化学位移,体现的是 H 原子种类,化学位移单位为 ppm; 3、样品检测用的氘代试剂溶剂峰; 4、...H]+,[2M+Na]+,[M+H]/2+ 等; 3、加有缓冲溶液或溶剂的体系还可引进 [M+X+H]+,(X=溶剂或缓冲溶液中的阳离子) 如:用碱性体系方法分析时常见的加合离子有 [M+NH4]+ (...如碱性体系用的铵盐缓冲溶液); 4、负离子检测时,一般 MS 图谱中的分子离子峰的值应为 EM-1 (Exact Mass),即 [M-H]-;加有缓冲溶液或溶剂的体系还可引进 [M+X-H]-,(X=...针对不同的产品,我们根据结构性质来选择合适的方法,包括是否有紫外吸收,是否含手性中心,不同溶剂溶解性如何等等。...部分产品如金属络合物、聚合物、无机盐等不适合以上常规方法检测,可以参考相关文献测定红外、紫外吸光度、滴定或者选择其它检测方式

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    二次离子质谱SIMS:原理与基本概念-测试狗

    ;SIMS通过高能量的一次离子束轰击样品表面,使样品表面的原子或分子溅射出二次离子,然后通过质谱仪分析这些二次离子,从而获得样品表面的化学成分信息。...一次离子束轰击一次离子:一次离子通常是一些高能量的离子束,如氧离子、铯离子、氩离子等,这些一次离子的能量一般在几百电子伏特(eV)到几十千电子伏特(keV)之间。...二次离子:二次离子可以是正离子或负离子,包括单原子离子、分子离子和簇离子;二次离子的产额通常非常低,但在特定条件下(如使用氧离子或铯离子作为一次离子)可以显著提高。3....影响因素:溅射产额受一次离子的能量、入射角度、样品材料性质等因素的影响。例如,氧离子作为一次离子可以显著提高正离子的产额,而铯离子可以提高负离子的产额。3....4. 生物学:SIMS可以分析生物细胞的化学成分,揭示细胞的代谢过程和结构;SIMS可以检测药物在细胞中的分布,评估药物的效果和安全性。测试狗科研测试平台

    21110

    小型等离子清洗机结构组成

    小型等离子清洗机结构要点 传统的电容耦合式等离子清洗机结构,即内平行极板。...系统由三大部分组成包括真空系统、放电系统和控制系统 在容性耦合等离子产生装置下,电子密度与极板间距成正比例关系,平均电子温度与极板间距成反比关系,其均匀性与极板间距成正比关系即随着间距的增大均匀性变好...卧室电容耦合等离子清洗机,可以直接将工件放在下电极上,但是研究发现,等离子体密度最大区域,是在等离子区域2-8cm 之间,因此可以使用一个高度为3cm的支座,支座的放置也便于工件的取放。...因为支座要放置在极板上,极板温度在放电过程中会持续增高,所以在支座材料选择上面选择了不易氧化的材料。 为了满足不同工艺的需求,需要向反应腔体内部充入不同的气体。...电容耦合式等离子清洗机反应室本身为不锈钢管构成,电容极板位于真空室内, 因为金属本身对于辐射具有很好的屏蔽效果,所以不需要在对装置设置单独的屏蔽 装置,辐射和干扰都非常小,不会对控制系统造成干扰。

    20910

    高通量筛选——离子化合物 | MedChemExpress

    离子通道 离子通道 (Ion Channel) 是一类跨膜的大分子孔道蛋白,可允许特定类型离子在电化学梯度驱动下穿过细胞膜,从而完成信号传导、细胞兴奋性调节等生理功能,已成为当前药物研发中仅次于蛋白激酶...离子通道分类 离子通道的开放和关闭,称为门控 (Gating)。...离子通道筛选方法 电生理膜片钳 (Patch clamp technique) 是一种通过记录离子通道的离子电流,反映细胞膜上单一 (或多个) 离子通道分子活动的技术。...,经验丰富的专业人员操作; ◎筛选范围广:600 万+现货化合物; ◎ 筛选费用低:提供虚拟筛选供选择,虚拟筛选后可以大大提高阳性率,降低筛选费用; ◎ 离子通道类型多样:氯通道、钠通道、钾通道、钙通道...离子通道 离子通道筛选询价及订购 MCE 一站式药物筛选平台包括计算机虚拟筛选、化合物活性筛选、基于离子通道的化合物筛选、化合物定制合成等。具体项目需经评估后确定对应的方案和价格。

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