结果在基因敲除中重复。

基因敲除是一种基因编辑技术，通过删除目标基因的DNA序列来研究该基因在生物体中的功能。在基因敲除中重复是指在多次实验中重复使用相同的敲除方法和目标基因，以验证实验结果的可靠性和重复性。

基因敲除的分类：

体细胞基因敲除：在体细胞中对目标基因进行敲除，主要用于研究基因功能和疾病模型的构建。
生殖细胞基因敲除：在生殖细胞中对目标基因进行敲除，通过繁殖后代来研究基因在整个生物体中的功能。

基因敲除的优势：

精确性：基因敲除技术可以精确地删除目标基因的DNA序列，避免了其他基因编辑技术可能引入的随机突变。
可靠性：通过多次重复实验，可以验证基因敲除的结果的可靠性和重复性。
研究功能：基因敲除可以帮助科学家们研究目标基因在生物体中的功能，揭示其对生物体发育、生理和疾病等方面的影响。

基因敲除的应用场景：

功能研究：通过敲除目标基因，研究其在生物体中的功能和作用机制。
疾病模型构建：通过敲除与某种疾病相关的基因，构建动物模型来研究疾病的发生机制和治疗方法。
药物筛选：通过敲除特定基因，筛选出对某种疾病具有治疗潜力的药物靶点。

腾讯云相关产品和产品介绍链接地址：腾讯云提供了一系列与基因敲除相关的云计算产品和服务，包括：

人工智能平台（https://cloud.tencent.com/product/ai）
基因组学分析平台（https://cloud.tencent.com/product/ga）
生物信息学分析平台（https://cloud.tencent.com/product/bi）
数据库服务（https://cloud.tencent.com/product/cdb）
云服务器（https://cloud.tencent.com/product/cvm）
云存储（https://cloud.tencent.com/product/cos）

以上是基因敲除的概念、分类、优势、应用场景以及腾讯云相关产品和产品介绍链接地址的完善且全面的答案。

相关·内容

标书模板：结直肠癌肿瘤干细胞靶向疗法研究

除此之外，肿瘤干细胞被认为在肿瘤初始阶段获得重要癌基因或抑癌基因的突变，从而成为肿瘤发生发展中的“先头兵”，自身增殖失控的同时，重塑组织微环境，使其更利于其他肿瘤细胞的存活。...通过体内示踪体系和条件性敲除小鼠平台验证这群细胞在肿瘤发生发展中的重要作用，联合肿瘤干细胞靶向治疗和传统放化疗或免疫疗法，明确肿瘤干细胞靶向疗法的加成作用。...在细胞水平实验结果的基础上，结合最新结直肠癌类器官体外培养技术，利用crispr cas9敲除或致突变基因ABC，观察基因ABC对肿瘤类器官生长的影响，进一步评估肿瘤干细胞靶向治疗与放化疗药物共同作用对类器官的影响...同时构建基因ABC体内示踪和关键调控因子条件性敲除小鼠，建立自发结直肠癌肿瘤模型，在体评价基因ABC对肿瘤干细胞的标记能力，及其对肿瘤发生发展和药物敏感性的影响。 4....结合目前最新的肠道组织类器官培养、crispr cas9基因修饰技术、体内示踪系统和条件性敲除小鼠体系，从细胞、组织、动物、患者四个层面对肿瘤干细胞在肿瘤发生发展及治疗中的作用进行全面系统地分析，与此同时

1.8K3 0

NCB | CRAD控制的细胞骨架失调通过β-catenin引发粘液性结直肠癌

3521 0

Nature｜单细胞多组学绘制小鼠新皮质发育图谱

结果 1.综合图谱绘制小鼠整个皮质发生期包括：对称分裂的神经上皮细胞阶段(E10.5和E11.5)、生第6层和第5层兴奋性神经元产生阶段(E12.5和E13.5)、第4层和2/3兴奋性神经元产生阶段...和CThPN的模块中，Fezf2是排名靠前的基因(图 5a)，且这些模块基因中约有 70%是在敲除组中被特异性下调的(图 5b)。...然而，在Fezf2敲除组中唯一显着上调的基因模块与任何E15.5野生型模块都不匹配。这种敲除特异性模块富含轴突发育和引导基因，与突变细胞中的异常轴突投影一致。...在Fezf2敲除小鼠中，深层神经元SCPN和CThPN被基因敲除特异性群体取代(图5c、d)。...敲除特异性CThPN样细胞上调CPN的基因，敲除特异性 CPN样细胞与对照组深层CPN和SCPN明显不同。

7961 0

新版TCGA中RNAseq数据基因名居然有重复？！

☞ TCGA数据库悄咪咪更新了—RNAseq没有HTSeq-Counts了小编也针对新版TCGA数据库格式，为各位小伙伴提供了两种合并新版TCGA中RNAseq表达谱数据的方法 ☞R代码合并新版TCGA...一顿操作猛如虎，基因名字数一数。这一数还真有重复。这个文件原本基因名字是没有重复的，只是在我们处理的过程中产生的重复。怎么听起来这么像鲁迅先生的说过的一句话。问题的元凶长这样的。...都会用到我们前面介绍过的正则表达式 ☞正则表达式 ☞R中的替换函数gsub 1）正向筛选，筛选匹配ENSG+数字+.+数字的基因名，保留。 2）反向筛选，筛选以_PAR_Y为后缀的基因名字，删除。...但是小编可以负责人的告诉大家，目前TCGA中RNAseq的数据，只有这44个基因是幺蛾子，所以两种方法的结果是一样的。筛选前基因总数60660，删选之后基因总数60616，正好差值44。...删除重复基因之后，可以顺利读到R里面，基因名作为行名。注意：小编已经更新了R代码和零代码合并工具，已付费用户可以原链接下载更新后的代码和工具，链接参考下面两篇文章。

5091 0

父母均为教授的小学生都做肿瘤基因敲除的研究！还只拿了三等奖…

近日，一项名为「C10orf67 在结直肠癌发生发展中的功能与机制研究」的全国青少年科技创新大赛的获奖作品引发广泛关注。 ?...图源：全国青少年科技创新大赛官网作品介绍：高原哺乳动物（包括人类）的机体对高原适应主要表现之一就是低氧适应，而低氧在人类疾病包括实体瘤中也常发生。...利用高原适应与肿瘤细胞适应的相似性，本项目前期利用遗传学比较分析了高原家养哺乳动物和对应平原物种的基因组和转录组，发现了高原哺乳动物低氧适应受选择的关键突变基因C10orf67，并构建了C10orf67...基因敲除小鼠，通过细胞生物学，生物化学、动物模型、临床样本分析等方面对C10orf67在结直肠癌发生发展中的作用进行解析，发现C10orf67在结直肠癌中高表达，敲低其表达可以显著抑制细胞的增殖，将细胞阻滞在...因此，对C10orf67在结直肠癌中的功能解析，有望为结直肠癌的诊断和治疗提供新的生物标志物和药物靶点。小小年纪，就有如此成就！让各大网友直呼敬佩且想哭。

4342 0

IF>10 家系研究 | OGDHL变异导致神经发育谱系疾病，表现为癫痫、听力与视力障碍等

结果临床表现作者通过全外显子组测序 (WES)鉴定了来自8个家系的9个个体携带OGDHL基因的双等位变异。...为了确定所识别的变异体在神经系统中的特异性影响，为此开发了一种新的CRISPR-Cas9介导的组织特异性基因敲除(ko)的方法和cDNA挽救系统。...CRISPR-Cas9介导的神经元特异性dOgdh基因敲除和cDNA挽救系统为了确定神经元敲除dOgdh的影响，培育出携带dOgdh (gRNAdOgdh)gRNA的转基因果蝇，由U6：3启动子广泛表达...Neurons lacking functional OGDHL leads to defects in mitochondrial metabolism 结论总而言之，本研究在八个家系中识别了...在功能研究中，一种新的CRISPR-Cas9介导的基因敲除和cDNA挽救系统显示8个OGDHL错义突变是功能缺失型。进一步分析来自成纤维细胞的转录组分析表明家族2中的同义突变破坏了OGDHL的剪接。

8153 0

利用单细胞转录组研究发现促进胆管癌生长的癌症相关成纤维细胞亚群

scRNA-seq证实，在四个鼠ICC样本中91.9%±2.8%的泛CAF表达HSC的基因标记，并发现，在肿瘤微环境(TME)中HSC分化为更高活化水平的HSC-CAF。...然而，在ICC模型的HSC-CAF中敲除Col1a1，尽管刚性和机械敏感信号降低，但并未抑制肿瘤的生长，敲除胶原受体编码基因Ddr1也是同样的结果。...着眼于myCAF中差异表达的基质基因，确定了透明质酸合酶2(Has2)是myCAF中上调最多的基因之一，CellPhoneDB分析显示，在各种细胞类型上有多种HA受体。...接下来，在ICC小鼠模型中敲除CAF中的Hgf，显示出ICC进展减少；敲除肝细胞/肿瘤区室中HGF的受体Met，发现ICC的生长显著降低。...结论该研究确定了ICC中CAF的来源和功能，并发现了不同的CAF亚群，这些CAF亚群可通过不同的介质促进ICC的生长。因此，CAF及其介质可作为ICC的治疗靶点。参考文献 1.

1.2K2 0

一个基因上面有多个探针最后只能选一个吗

最近学员提出来了一个蛮古老的表达量芯片数据集的讨论，因为它是做了这个PPARα的基因敲除，但是学员在分析表达量矩阵做差异的时候发现PPARα本身其实并没有统计学显著的差异表达。...为否，即取出不重复的项，去除重复的gene ，保留每个基因最大表达量结果s dat=dat[ids$probe_id,] #新的ids取出probe_id这一列，将dat按照取出的这一列中的每一行组成一个新的...dat rownames(dat)=ids$symbol#把ids的symbol这一列中的每一行给dat作为dat的行名 dat[1:4,1:4] #保留每个基因ID第一次出现的信息 dat['Actb...PPARα的基因敲除意味着表达量芯片或者转录组测序里面，它表达量都会下降吗？...学徒作业找到同一个基因敲除的表达量芯片和转录组测序数据，一般来说只能是从明显基因里面找啦，下载其对应的表达量芯片和转录组测序数据做差异分析，看看作者敲除的基因是否确实有表达量下降的情况发生！

7202 0

文献读不懂？四步套路法带你快速领悟Nature文章精髓！

前文第1部分研究中提及，菌群亦可影响结肠Treg细胞，此部分研究即为研究者通过敲除部分菌株胆汁酸转化基因的手段验证，当抑制生物转化时，胆汁酸代谢物是否仍可调控结肠RORγ+Treg细胞，结果显示菌群可调节结肠...其次分别敲除小鼠9中胆汁酸受体，观察小鼠结肠RORγ+Treg细胞变化（悄咪咪地说土豪~），发现GPBAR（G蛋白偶联胆汁酸受体）敲除小鼠RORγ+ Treg 细胞无变化，VDR或FXR（法尼醇受体）敲除小鼠...重复B机制发现，VDR敲除小鼠给DSS时，肠炎更重；VDR敲除小鼠造成遗传易感性肠炎模型，肠炎亦更重。 Part 3. 总结至此，文章的思路已经很清楚了。...比如补充胆汁酸反向验证时，设计多种胆汁酸Mix；构建联合基因敲除小鼠，明确主要作用受体。补充生信数据：第3研究论点中补充了RNA测序的结果。...当然表述方式也可能存在一点差异，比如A基因通过B通路调控C疾病的D方面表型、A药物通过B通路影响C疾病的D表型、A药物通过B基因调节C通路影响D疾病的E表型……，但大概是这么个模式。

2K2 0

结直肠癌m6A干湿结合发10分+

METTL3通过mA-IGF2BP2促进结直肠癌的肿瘤进展。...所以作者做了两组不同的MeRIP-seq的分析，一组是SW480 vs SW620，另外一组由于METTL3在SW620当中表达高，所以就做了SW620 VS 敲除METTL3的SW620细胞系（这个分组的...既然知道干细胞分化了，那就要看里面都有说明基因了，所以作者查看了分析结果发现，在干细胞分化里面有SEMA3A、BCHE、ZFP36L2以及SOX2这三个基因，所以下一步就要看这几个基因的具体结果了。...最后就是一顿敲除验证来说明SOX2、IGF2BP2以及METTL2之间的关系的实验 ?...结肠癌中METTL3，SOX2和IGF2BP2的临床相关性基本实验做完了，为了丰富内容可以再到临床验本里面观察最后发现的这些相互调控基因的相关性，所以作者就又在临床数据里面做了相关的实验和分析。 ?

8902 0

Nature Plants | 中国科研团队利用CRISPRCas系统实现水稻内源基因敲高 ,创造新型抗除草剂水稻

目前，通过基因编辑技术来精准诱变基因的应用主要集中在两个场景：一是对基因敲除，这是目前基因编辑在育种方面最普遍的应用，上面提到的大豆和番茄就是基因敲除的两个例子。...许多研究很早就发现，Cas9同时在一个基因的不同位置切割时，会造成删除、倒位、重复等基因组结构变异。...此次研究中，该团队设计了能够上调基因表达的倒位、重复等基因组结构变异，成功实现了对目标基因的敲高。...因此，无需人工DNA模板，Cas9不仅能够敲除基因，还可以创制点突变和敲高基因，是名副其实的全功能基因及基因组编辑工具。...因此，基因组结构变异是物种演化的重要推动力，是自然界中的普遍现象。通过基因编辑技术创制预期的结构变异，是以自然为师而已！

6713 0

2018国内基因编辑技术走势

同时我们在原代T细胞和表达嵌合性抗原受体的T细胞（CART）中建立了高效的单基因和多基因敲除技术，为细胞免疫治疗研究提供了工具。...杨辉，中科院上海神经所基因编辑在疾病模型建立及疾病治疗中的应用基因修饰动物是研究在发育和疾病中基因功能的重要工具。CRISPR/Cas9系统有效的应用于构建基因敲除和敲入小鼠。...然而，该方法获得的基因修饰动物存在严重的嵌合体现象，即动物个体的一部分细胞被基因编辑，而另一部分则没有。通过交配方法获得纯合的基因敲除小鼠需要很长的时间和花费，这在获得多基因敲除小鼠中尤为明显。...此外，利用基因编辑对胚胎特定基因集进行敲除操作，造成相应基因在胚胎中的缺失，可深入研究人类胚胎早期发育中的功能、作用机理，帮助人类了解生物体的基本功能，也可以推动人类健康事业的发展,从根源上清除遗传疾病...张淑君华中农业大学建立和利用猪全基因组基因敲除CRISPR/Cas9技术筛选鉴定猪流感病毒感染相关的宿主（猪）基因在猪PK15细胞系中，证实了CRISPR/Cas9系统在猪细胞系中能高效地诱导猪基因敲除

1.2K4 0

基因敲除小鼠一只竟值11723 元

「基因敲除小鼠」为何热？报道称，一只「基因敲除小鼠」可以卖到11723元，毛利率接近95%。这位南大高翔教授，可以批量生产实验小鼠，2021年全年创收3.94亿元。...在这份科研项目申报书中，关于小鼠购买的经费预算分出了普通小鼠和「基因敲除小鼠」，一只普通小鼠是25元，而一箱（20只）「基因敲除小鼠」的报价是3000元，也就是说，平均每只「基因敲除小鼠」需要150元，...「基因敲除小鼠」的价格昂贵自有其因，因为敲除每一个小鼠的基因都涉及到一系列「复杂的工程」。...所谓基因敲除，就是用含有一定已知序列的DNA片段，去和受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组，整合至受体细胞基因组中。...基因敲除之后，可以改变生物的遗传基因，令特定的基因功能丧失作用，从而使部分功能被屏蔽。直接购买还是划算的，假如你想要自建实验室，自己培养小鼠，并进行基因敲除，这恐怕成本更大。

6573 0

干扰MYC-WWP1通路重新激活PTEN的抑癌活性——3步搞定GSEA分析

本次我们复现的图是Fig4F：野生型和Wwp1敲除小鼠RNA-seq的GSEA分析图，用于说明Wwp1敲除影响PI3K-AKT信号通路。 ? Fig4 Step1....}) df <- do.call(cbind, expr) rownames(df) <- df[,1] df <- df[,seq(2,ncol(df),by=2)] #去掉重复读取的基因名...=0,] #去掉在所有样本中count都为0的基因 grouplist <- c(rep("KO",3),rep("WT",3)) #记录下分组信息 expr <- df save(expr,grouplist...差异表达分析上一步中得到的是原始的count，可以直接用Deseq2进行差异分析，用edgeR或limma中的voom方法也是可以的，但是要记得标准化表达数据。...GSEA分析 GSEA：Gene Set Enrichment Analysis，一种基于基因集的富集方法，简单来说就是使用预定义的基因集（一般来自MSigDB数据库），将基因按照某种指标排序，查看这些基因在关注的基因集中是否出现显著统计学富集

1.1K3 0

ceRNA研究思路！

ceRNA（竞争性内源RNA）是近几年的研究热点，已知microRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默，而ceRNA可以通过竞争性地结合microRNA来调节基因表达。...图1：LUSC中目标circRNA分析流程图 lncRNA UCA1通过miR-143/MYO6轴促进结直肠癌进展 ?...目标ceRNA锁定思路：研究人员前期的研究表明miRNA-422a在胶质母细胞瘤中具有重要的作用，因此研究人员想要了解是否有上游调控因子参与调控miRNA-422a的作用，因此研究人员通过敲除胶质母细胞瘤组织中的...目标ceRNA锁定思路：基于已有研究成果，即miR-34a在HCC细胞中参与调控β-catenin的，Cyclin A2是USP7的重要下游靶基因，USP7/ Cyclin A2信号通路的激活促进了乳腺癌的进展...然而，目前circRNA在结直肠癌(CRC)中的分子机制尚清楚。本文研究的目的是试图从circRNA-microRNA(MiRNA)-mRNA相互作用的角度为结直肠癌的靶向治疗提供新的依据。

9363 0

盘点一下表达矩阵中重复基因的处理方法！~

今天的教程是相对比较基础的了，分享一下我处理Expression matrix时经常遇到的一个小问题，就是重复基因名或者探针名的问题。...接着是今天的正文，盘点一下我个人常用的几种处理重复基因的方法！...LETTERS, 30, replace=T)) exprSet <- data.frame(genes,exprSet) DT::datatable(exprSet) ---- 看一下有几个重复的基因吧...table(duplicated(exprSet$genes)) 4方法一（取高值）这里需要注意一下哦，对于相同的基因，应该挑选行平均值大的一整行，而不应该打乱。...exprSet_ordered$genes) exprSet_max <- exprSet_ordered[keep,] DT::datatable(exprSet_max) ---- 再看一下重复的基因去掉了没有

1.1K4 0

过表达一个基因和敲除它的作用一定是相反的吗

而对基因的干扰，其实有正向和反向两个路线，就是敲除一个基因以及过表达它。以我们朴素的思维来说，这两个完全相反的干扰设计理论上会造成起码是相反的效果！...小细胞肺癌（small cell lung cancer，SCLC）其中SCLC约占全部肺癌的15%~20%，SCLC的发病与吸烟密切相关，生物学特征为分化程度低、恶性程度高、倍增时间快、侵袭性强、预后差，中位生存期才...那我们该如何去对比说明过表达一个基因和敲除它的作用一定是相反的吗？...敲除组相当于对照组，上下调各自基因列表这个时候你有4个基因列表，如果你做交集某些基因在两次差异分析都是上调某些基因在两次差异分析都是下调某些基因在过表达组是上调，在敲除组是下调某些基因在过表达组是下调...，在敲除组是上调你会如何解释这4种情况的不同基因集？

1.4K3 0

时间序列数据分析的部分综述

结果，在时间系列这个实验中，共显著差异探针集4163个（<0.1%）。其中有3892个有匹配的gene IDs，去重复后有2914个gene。...在静态表达实验中，不同样本之间的gene表达情况做一简要说明，但是在时间系列试验中，时间过程被测量。...基因相互作用和基因敲除 WT野生型时间系列实验，对决定一个系统中发挥作用的gene set非常有用，并且可以确定他们的作用顺序？为了研究单个gene的功能，我们需要进行敲除实验。...在敲除实验中，这个gene从基因组中被删除，删除后的strains使用表达实验被研究。这样的实验允许我们来确定这个敲除gene的下游效应，这可以用来鉴定靶基因并构建基因相互作用网络。...人们做了很多静止状态下的gene敲除实验。近来，时间系列的gene敲除实验也开始进行。这包括细胞周期double knockouts和压力情况下的敲除。

9814 0

这个网站提供了多种数据分析工具——增强子，非编码RNA转录信息等

用超级增强子在基因调控中的潜在功能对数据库进行注释。SEdb的当前版本记录了来自542个样本的总共331，601个超级增强剂。此外，SEdb提供了关于超级增强子的详细遗传和表观遗传注释信息。...:http://www.licpathway.net/TRlnc)，收集了大量可用的lncRNA转录调控区资源，并注释和说明它们在细胞类型特异性方式中在lncRNA调控中的潜在作用。...KnockTF TF敲除/敲除的全面的人类基因表达谱数据库(KnockTF)，该数据库提供了与TF敲除/敲除相关的人类基因表达谱数据集的大量可用资源，并以组织/细胞类型特定的方式注释TF及其目标基因。...当前版本的KnockTF具有570个手动策划的RNA-seq和微阵列数据集，这些数据集与通过不同敲除/敲除技术和跨多种组织/细胞类型而中断的308个TF相关联。...ENDB ENDB当前发布的文献737份经实验验证的增强子及其相关信息，包括384个靶基因，263个TF，110种疾病和人类和小鼠中的153种功能。

1.8K2 0

转录组和代谢组联合分析思路

（来源于百迈客公司转录组和代谢组联合分析的结题报告）这里，先给大家分享一篇发表在Cell Commun Signal（2区，IF=8.4）期刊上的文章《Slc2a6 regulates myoblast...同样发现，糖酵解/糖异生为Slc2a6敲除后主要影响的代谢途径之一，并证明了其对乳酸水平的影响。...最后，为了确定哪个基因介导 Slc2a6 敲低后乳酸水平的升高，作者利用Genecard 数据集中4750 个乳酸代谢相关基因与 Slc2a6 敲低后的 RNA-seq 数据中190 个显着下调基因进行...当我们拿到公司的结题报告时，不妨先大致看一下自己的数据。一般地，公司会给到大家利用两组学共同富集到的KEGG pathway绘制而成的气泡图。...通过这气泡图我们不难发现共享通路中的代谢物和差异基因之间的关联很是微弱！

1.1K1 2

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云