例如： # 为了比较两种药物不同剂量下的响应情况，我们在一幅图上展示两个点线图，并用不同类型的线（lty）和不同特征的点（pch）加以区分。...直方图和密度曲线图一般用于探索分布，很少用于报告结果。函数 hist( )可用于绘制直方图。 数据集 anorexia 位于 MASS 包中，来自一项关于年轻女性厌食症患者体重变化的研究。...该包提供的函数 pie3D( )可以绘制三维饼图，另一个函数 fan.plot( )可以绘制功能与饼图相似的扇形图，感兴趣的读者可以安装该包并查看其帮助文档。 5....如果数据是对称分布，中位数（Median）应该位于上四分位数（Upper quartile）和下四分位数（Lower quartile）的中间，即箱线图的方盒关于中位线对称。...小提琴图（violin plot）可以看作是箱线图和密度图的结合。vioplot 包里的函数 vioplot( )可用于绘制小提琴图，使用前请先安装并加载该包。
云雨图介绍 我们使用r语言中ggplot2包绘制云雨图，云雨图可以看做是核密度估计曲线图、箱线图和抖动散点图的组合图表。...我们可以使用自定义的半小提琴函数geom_flat_volin()、箱型图函数geom_boxplot和抖动散点图函数geom_jitter()叠加实现。...2.3.1绘制半提琴图 2.3.2绘制抖动散点图 2.3.3叠加箱线图 2.3.4实现坐标翻转 2.3.5去除边框调整字体等微调 theme_bw()+ theme(panel.grid.major...filename = "图1.pdf",width = 15,height = 15,device = cairo_pdf,family = "Times New Roman") 3.总结 云雨图清晰完整并美观的展示了所有数据信息...，与海盗图相比，它显得没那么冗余；与小提琴图相比，它又在核密度估计曲线图的同时，加上了抖动散点图。
4、设置参数kind为kde，绘制密度曲线图 sns.jointplot("sepal_width", "petal_length", data=iris, kind="kde", space=0, color...6、小提琴图 小提琴图是盒图与核密度图的结合 能够一次从多个维度反映出数据的分布 1、使用violinplot()函数绘制小提琴图 sns.violinplot(x=tips["total_bill...2、根据星期(day)进行分组，绘制特征账单的小提琴图 sns.violinplot(x="day", y="total_bill", data=tips) ?...4、绘制两个离散变量嵌套分组的小提琴图 palette用于指定seaborn内置颜色 sns.violinplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",data...7、点对图 刻画数据集一对变量之间相互关系，并对单变量做出分布直方图 1、使用pairplot()函数绘制点对图 sns.set(style="ticks", color_codes=True)
脊线图 (峰峦图， Ridgeline plots) 可以替代小提琴图，并且在可视化随时间变化的分布时通常很有用。 ? 3 比例 我们使用饼图、并排的条形图以及堆叠的条形图来可视化比例。...由于条形图可以分成水平也垂直的，所以也就分垂直和水平条形图了。饼图强调各个部分的总和并且可以突出显示简单的区分。但是每一部分之间的比较的话，并排的条形图可能更好一些。...如果要可视化多个分类变量的数据数据的时候，那么马赛克图(mosaic plot)、矩阵树状图 (treemaps)以及并行曲线图是很有用的可视化途径。具体的使用条件我们会在后面的几章进行讲解。 ?...另一方面，当我们要可视化两个以上的变量时，我们可以选择以相关图而不是基础原始数据的形式绘制相关系数。 ? 当x轴表示时间或严格增加的变量（例如治疗剂量）时，我们通常绘制线图。...如果我们有两个响应变量的时间序列，我们可以绘制一个连接的散点图，其中我们首先在散点图中绘制两个响应变量，然后连接对应于相邻时间点的点。我们可以使用平滑线来表示较大数据集中的趋势。 ?
1 分析收盘价，绘制小提琴图 小提琴图综合了箱状图与核密度图的特性，从箱状图里能看出数据的各分位数，而从核密度图里，能看出样本数据的分布情况，即每个数值点上样本的密度。...在第7行和第11行里，通过add_subplot方法，绘制了两个子图。...在第一个子图里，通过violinplot方法，根据第一个参数df[‘Close’]，绘制了基于股票收盘价的小提琴图，其中showmeans参数表示是否要绘制数据平均线，而showmedians参数则表示是否要绘制数据的中位线...，即第50的百分位数。...对比左右两个子图，能发现两者的中位线是一致的，而且左边小提琴图里，在约15.4的位置还有一条样本数据平均线的图。
sns.regplot(x,y,data)用于绘制散点+回归曲线图，默认包含置信区间，主要还是线性回归。...，关于分面后续再展开，residplot用于绘制线性回归的残差(residuals)。...，类似条形图对应柱状图，vertial=True则绘制转了90度的直方图，分面的时候用得到； 两个维度上的数据分布情况我们也很关心，seaborn也提供了相应的接口，用到的就是kdeplot，示例效果如下...小提琴图比起箱线图，更好地利用宽度的变化来展现在同一个y处数据点的分布，绘制的形状像一个小提琴因此叫小提琴图(violin)。...同样的数据列，绘制为小提琴图效果如下： sns.catplot(x='time',y='tip',data=tips,kind='violin') kind='point'绘制包含置信区间的点+折线图
Matplotlib库的名字来源于MATLAB，模仿MATLAB构建，语法也十分相似。...axis：可选，设置显示哪个方向的网格线，可以是取 ‘both’（默认），‘x’ 或 ‘y’，分别表示两个方向，x 轴方向或 y 轴方向。...图像参数还有许多，更多请参见官方手册：https://matplotlib.org/ 3.2.4 绘制图像 Matplotlib库可以绘制许多类型的图，这里以绘制曲线图为例。...除了常用的曲线图外，Matplotlib库还可以绘制许多其他种类的图： 函数 说明 plt.plot() 绘制折线图 plt.scatter() 绘制散点图 plt.bar() 绘制柱状图 plt.barh...plt.violinplot() 绘制小提琴图 plt.eventplot() 绘制尖峰栅格图 plt.hist2d() 绘制二维直方图/散点密度图 plt.hexbin() 绘制Hexbin散点图
散点图 散点图用来表征两个（如果多个就分面，如上图）数值型变量间的关系，每个点的位置（即x轴和y轴坐标）映射着两个变量的值。当然对于三个数值型变量，也有三维散点图，不过用得不多。 气泡图 ?...概率密度曲线图 ? 概率密度曲线图 概率密度曲线图本质与直方图类似，不过纵轴不是频数而是频率。正如折线图和面积图一样，概率密度曲线图也可自由选择要不要面积投影。...它用来表征各个数值型变量的分布状况，每一条横线代表分位数，盒内部的横线代表中位数，点代表异常值。 小提琴图 ?...地图的绘制原理是基于大量的散点，勾勒成曲线，再连接成多边形——其中每一块多代形代表一个地区，可以是国家、省、市、区县等。...平行坐标图 平行坐标图的优点是可以把多个变量并形排开，把每一个记录都以折线连接上。这样当数据量大的时候，其实可以很方便地观察各个变量的分布情况。 桑基图 ?
常用图形 散点图 散点图 散点图用来表征两个（如果多个就分面，如上图）数值型变量间的关系，每个点的位置（即x轴和y轴坐标）映射着两个变量的值。当然对于三个数值型变量，也有三维散点图，不过用得不多。...概率密度曲线图 概率密度曲线图 概率密度曲线图本质与直方图类似，不过纵轴不是频数而是频率。正如折线图和面积图一样，概率密度曲线图也可自由选择要不要面积投影。...小提琴图 小提琴图 小提琴图本质与直方图一样，都是表征数值型变量的分布，每一个小提琴的宽度代表它在该高度处的频率范围。...地图的绘制原理是基于大量的散点，勾勒成曲线，再连接成多边形——其中每一块多代形代表一个地区，可以是国家、省、市、区县等。...平行坐标图 平行坐标图 平行坐标图的优点是可以把多个变量并形排开，把每一个记录都以折线连接上。这样当数据量大的时候，其实可以很方便地观察各个变量的分布情况。
散点图：relplot(kind='scatter') 线图：relplot(kind='line') 注：默认情况下为散点图 举个例子： 上面加载了内置数据集-tips（小费数据集），并对total_bill...()和scatter()函数 lineplot()和scatter()分别用于绘制线图和散点图，前面说过relplot()函数已经覆盖这两个绘图功能，所以就不赘述了，有意者可以自研。...箱线图的绘制方法是： 先找出一组数据的最大值、最小值、中位数和两个四分位数； 然后， 连接两个四分位数画出箱子； 再将最大值和最小值与箱子相连接，中位数在箱子中间。...提琴图 - violinplot()函数 小提琴图结合了箱型图和密度图的特征，用于展示数据的分布形状。粗黑线表示四分数范围，延伸的细线表示95%的置信区间，白点为中位数。...小提琴图弥补了箱型图的不足，可以展示数据分布是双模还是多模。
前情提要 上次给大家简单整理了一下细胞鉴定曲线图理解，里面使用nCount_RNA或者nFeature_RNA在R语言里面绘制细胞鉴定曲线，找到一个合适的cutoff值，进行了一个初步的质控。...colSums(sce@assays$RNA$counts) #nFeature_RNA：总的基因数目 colSums(sce@assays$RNA$counts>0) 可视化及阈值判断 可以使用小提琴图来简单可视化一下...细胞降维聚类分群中应用 在选择对应的阈值进行可视化的时候，我们会用到check-all-markers.R脚本，基于常见Marker基因进行一下可视化，以及绘制umap图 在check-all-markers.R...具体推文：如何排除双细胞 我们在进行亚群简单命名的时候，一般选择比较低的分辨率0.1，那在GSE208706数据的0.1分群中，我们可以很明显的看到第9群比较狭长，且包含了两个不同细胞亚群的Marker...并且提高分辨率之后，发现9群被细分为两个亚群，也不是双细胞。 一般我们会根据中位线以及最高值来进行判断，再提高分辨率看亚群有没有分开，再确定是否是双细胞。
如果想将marker一起展示，就需要使用stack参数绘制堆叠小提琴图 2....分组小提琴图 分组小提琴图是一种用于展示不同组别中数据分布情况的可视化图表，当有两个组别时可以很好的展示基因在两个组间的差异 使用split.by参数可选择按照某一分组变量（这里是 'stim'）来分割数据...分组分半小提琴图 也可以在同一个图形中绘制多个分组的分布，可以直观地比较不同组之间的数据分布情况，以便进行统计分析和推断。...group.by = "celltype", cols = c("#78C2C4","#C73E3A"), split.plot = T) 将分组以及分组且分半小提琴图拼图...或者提取需要的数据，使用ggplot2直接绘制小提琴图 1.
我们经常使用 PCA 或 t-SNE 来降维并绘制它。在降维的情况下，可能会丢失大量信息。在某些情况下，我们需要考虑所有特征， 平行坐标图有助于做到这一点。 上面的图片。...我们这里绘制了两个变量 sepal_width 和 sepal_length 的密度。 当然，也可以使用其他库，如seaborn、matplotlib等。...在 QQ 图中，两个 x 轴值均分为 100 个相等的部分（称为分位数）。如果我们针对 x 和 y 轴绘制这两个值，我们将得到一个散点图。 散点图位于对角线上。这意味着样本分布是正态分布。...在小提琴图中，小提琴中间的白点表示中点。实心框表示四分位数间距 (IQR)。上下相邻值是异常值的围栏。超出范围，一切都是异常值。下图显示了比较。...7、点图 下图中有一些名为误差线的垂直线和其他一些连接这些垂直线的线。让我们看看它的确切含义。
小提琴图 小提琴图是箱线图与核密度图的结合，箱线图展示了分位数的位置，核密度图则展示了任意位置的密度，通过小提琴图可以知道哪些位置的数据点聚集的较多，因其形似小提琴而得名。...当使用带有两种颜色的变量时，将split设置为 True 则会为每种颜色绘制对应半边小提琴。从而可以更容易直接的比较分布。...属于同一类别的样本的曲线通常会更靠近在一起并形成较大的结构。...平行坐标 平行坐标[4]是一种用于绘制多元数据的绘制技术 。平行坐标允许人们查看数据中的聚类，并直观地估计其他统计信息。使用平行坐标点表示为连接的线段。每条垂直线代表一个属性。...然后，假设数据集中的每个样本都通过弹簧连接到这些点中的每个点，弹簧的刚度与该属性的数值成正比（将它们标准化为单位间隔）。样本在平面上的沉降点（作用在样本上的力处于平衡状态）是绘制代表样本的点的位置。
箱线图 箱线图（又称为盒须图）通过绘制连续型变量的五数总括，即最小数、下四分位数、中位数（第50百分数）、上四分位数（第75百分数）以及最大值，描述了连续型变量的分布。...小提琴图 小提琴图是箱线图与核密度图的结合。可以使用vioplot 中的vioplot()函数绘制它。...,names=,col=) 其中x1, x2, ...表绘制的一个或多个数值向量(将为每个向量绘制一幅小提琴图)。...小提琴图基本上是核密度图以镜像方式在箱线图上的添加。在图中，白点是中位数，黑色盒型的范围是下四分位点到上四分位点，细黑线表示须，外部形状即核密度估计。...ggplot绘制箱线图和小提琴图 简单箱线图 >install.packages("ggplot") >library(ggplot2) > p <- ggplot(mpg, aes(class,hwy
给大家讲解并绘制了箱线图，画出来的图是这样子的。 ? 昨天的箱线图出来后，很多同学觉得还不够过瘾，想知道有没有更炫酷的画法来表征不同组别间的统计数据呢，当然有！...解读：小提琴图是【箱线图】与【核密度图】的结合，箱线图展示了分位数的位置，核密度图则展示了任意位置的密度，通过小提琴图可以知道哪些位置的数据点聚集的较多，因其形似小提琴而得名。...绘制方法：使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图，为了更好地表征数据分布，再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。...绘图操作：使用科研猫提供的提琴图·R代码，只要提供几个参数即可： （1）设置用来绘图的数据文件； （2）设置小提琴的颜色，可以是red、blue、green等各种颜色，当你想绘制多种颜色时，使用“random...），并多次操刀设计Journal封面绘图。
小提琴图 该函数是用来绘制箱形图和核密度估计组合图。...如果是四分位数，则绘制分布的四分位数。如果point或stick， 则显示每个基础数据点。...使用None将绘制未经修饰的小提琴 split : bool 当使用带有两个级别的变量的色调嵌套时， 将split设置为True将为每个级别绘制一半小提琴。这样可以更容易比较分布。...两类变量进行分组 绘制垂直方向的小提琴图 """ sns.violinplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",data=tips...matplotlib.pyplot as plt sns.set(style="whitegrid") # 读取数据 tips = sns.load_dataset("tips") """ 案例7： 将四分位数绘制为水平线
其他介绍 百度地图底图样式一键修改 累计新增： 相关系数热力图(Vega图表)和小提琴图(其他图表) 历史版本介绍 EasyShu3.5版本 新增：排序散点路径图、分类排名Bump图、环状柱形图...、分类毛毯图、数据分布曲线图、数据分布QQ图。...1.图表主题模块 包括背景风格与颜色主题两个控件，可以一键切换图表的颜色主图与背景风格。...取色器】可以供用户拾取电脑屏幕内任意处的颜色数值，并可以以该颜色填充图表图形区域或者设定文本；同时也提供了“颜色模板”不同颜色主题方案的颜色供用户直接使用； 【数据标签】可以帮助用户添加数据系列的标签，并设定其数值单位与格式...同时也可以设定饼图与圆环图的数据标签排布格式，包括按标签位置切线与射线排布两种方式； 【数据小偷】可以以半自动的方式，帮助用户直接提取图片中图表内容的数据，从而可以获取原图表的数据系列数值； 【多图神器】可以以分面的形式一键绘制多个数据格式相似的图表
和之前学习Pandas一样，我们继续以宝可梦数据集作为学习可视化的例子，进而梳理Python绘图的基本操作，主要涉及seaborn以及matplotlib两个可视化库。...上半篇我们主要使用matplotlib来进行柱状图、散点图、饼图折线图等的绘制，下半篇主要使用seaborn来进行箱线图、小提琴图、分簇散点图、热力图等的绘制。本文是下半篇，上半篇链接在这里。...这里我们绘制不同类型的宝可梦的攻击力值小提琴图。...我们可以清楚地看到有一部分电系宝可梦的攻击力在60左右，小提琴图有明显的膨胀部分；而岩石系的宝可梦的攻击力分布较为平均，小提琴图呈长窄形状。...我们对不同代目的宝可梦绘制了总属性值的小提琴图，并且将是否为神兽区分开来。
Seaborn使我们的图表和绘图看起来很吸引人，并支持一些常见的数据可视化需求(比如将颜色映射到变量或使用分面(faceting))。从根本上说，它使数据可视化和探索变得很容易。...用分类数据绘图 抖动图 Hue图 箱线图 小提琴图 Pointplot 在上面的小节中，我们了解了如何使用不同的视图表示来显示多个变量之间的关系。我们绘制了两个数值变量之间的关系图。...使用seaborn绘制小提琴图 我们也可以通过使用小提琴图来不同地表示上述变量。...小提琴图结合了箱线图和核密度估计程序，以提供更丰富的值分布描述。四分位数值显示在小提琴内部。当色调语义参数是二值时，我们还可以拆分小提琴，这也可能有助于节省绘图空间。...使用Seaborn绘制Pointplot 另一种类型的图是pointplot，这个图指出估计值和置信区间。Pointplot连接来自相同色调类别的数据。这有助于识别特定色调类别中的关系如何变化。
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