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我把莫奈的配色用到了科研绘图中

莫奈是法国最重要的画家之一,印象派的理论和实践大部分都有他的推广。莫奈擅长光与影的实验与表现技法。...他最重要的风格是改变了阴影和轮廓线[3]的画法,在莫奈的画作中看不到非常明确的阴影,也看不到突显或平涂式的轮廓线。光和影的色彩描绘是莫奈绘画的最大特色。...首先,我们需要知道的是,这些配色都是离散的,适用于离散数据(分类)较为合适。这里我们利用 ggplot2 包给出一个简单的使用方法。...") + scale_fill_manual(values = cols) + theme_bw() + theme(panel.grid = element_blank()) 最后绘图结果...如果你对 R 语言的可视化不是很了解的话,建议你看我以前写的 可视化入门教程(后台输入[可视化文稿])即可获取,并结合 B 站我上的直播课程,同步学习,效果更佳!

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探究 canvas 绘图中撤销(undo)功能的实现方式

最近在做网页版图片处理相关的项目,也算是初入了 canvas 的坑。项目需求中有一个给图片添加水印的功能。...但是略麻烦的是添加水印的需求中还有一个需要实现的功能是用户能够切换水印的位置。...我们先看一下这两个 API 的描述: CanvasRenderingContext2D.restore() 是 Canvas 2D API 通过在绘图状态栈中弹出顶端的状态,将 canvas 恢复到最近的保存状态的方法...之前说过,我们通过对整个画布保存快照的方式来记录每个操作,换个角度思考,如果我们把每次绘制的动作保存到一个数组中,在每次执行撤销操作时,首先清空画布,然后重绘这个绘图动作数组,也可以实现撤销操作的功能。...this.clearCanvas(); // 删除当前操作 this.executionArray.pop(); // 逐个执行绘图动作进行重绘

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    热图中分组与聚类不匹配的问题

    分组与聚类不匹配的问题,是没错,但不好解释的问题。 期待:tumor normal 各成一簇 实际上,不一定。...成一簇:说明画热图的基因在两个分组间有明显的表达模式 不成一簇:说明画热图的基因在两个分组间表达模式不是特别明显 换一组基因或者增删基因 可能改变聚类的结果。...分组和聚类是两件独立的事情,聚类是以样本为单位,而不是以分组为单位。每个样本属于那个分组的信息是已知的。...希望各成一簇,两个选择: 1.增删、换基因 2.取消聚类- cluster_cols = F a.前提:矩阵列的顺序是先tumor后normal,或者先normal后tumor i.不聚类时,热图列的顺序与矩阵列的顺序完全匹配...# 如何调整表达矩阵列的顺序?

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    【LeetCode热题100】【栈】柱状图中最大的矩形

    柱状图中最大的矩形 - 力扣(LeetCode) 要找最大的矩形就是要找以每根柱子为高度往两边延申的边界,要作为柱子的边界就必须高度不能低于该柱子,否则矩形无法同高,也就是需要找出以每根柱子为高、往两边找更低的柱子作为当前矩形的边界...(不含) 可以用一个单调递增栈,存储下标,一直记录更高的柱子,一旦碰到低的柱子,此时栈顶可作为矩形的高,当前柱子作为右边界(不含),栈顶往下一个元素可作为左边界(不含),计算完成后弹出栈顶,这样可以以每个柱子的高度为矩形的高计算一次面积...,且边界都是尽可能延申的 class Solution { public: int largestRectangleArea(vector &heights) { int...plus.empty() && heights[i] 的了,说明找到边界 int height = heights

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    matlab绘图中被隐藏的Marker, 99.99%的小伙伴都不知道

    相信大家对plot函数并不陌生,在绘制多条数据曲线时,除了用不同颜色区分外,往往会在相应的数据点处同时加上不同的marker。...通过查询plot对应的帮助文档,不难发现,matlab提供了13种可选marker,相对来说算是少的了,而且marker是plot的私有属性,不能自定义修改。...如果你要是相信plot只有这13种marker可以使用,那你就被plot的帮助文档给忽悠了。其实,在matlab顶级图像句柄的隐藏属性中,可以自定义并启用一些内部对象的额外功能。...plot函数所属的line句柄有一个名叫MarkerHandle的隐藏属性,该属性具有极其强大丰富的功能,这里就不展开了,只用尝试与marker相关的属性设置。...,可以获得如下16种结果,前15种为plot帮助文档中给出的可用marker,对比上面的结果可以看出,多出了'hbar'和'vbar'两种类型,这就是被隐藏了的marker。

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    【科研猫·绘图】今夏最热的“热图”(带R代码分享)

    热图的本质是表现数值矩阵,色板中的每个方格都是一个数值,按照色彩变化尺的要求,根据数值大小显示出不同颜色。...如果我们要修改热图的颜色,只需要使用color这个参数就可以啦。这里给大家推荐一个网址,https://www.bootcss.com/p/websafecolors/,里面有非常多的颜色可供选择。...使用color颜色更改颜色变化尺之后的热图会更好看啦。我们可以参考文章中的绘图颜色,这样会让我们的热图更富有视觉效果。 ?...在科研做图过程中,有时候我们并不需要对基因或者样本进行聚类,那么如何调整热图中的聚类树呢,在pheatmap函数中,cluster_row参数可以控制基因的聚类,cluster_col可以控制样本的聚类...参考科研期刊中的文章热图,还有一个重要的部分,就是样本的附注,用来标注哪些样本是实验组,哪些样本是对照组。那么如何实现在热图中添加标注呢?代码如下: ? ? 本期干货 !!绘制热图代码!!

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    彻底搞懂 Kafka 消息大小相关参数设置的规则

    根据 Kafka 消息大小规则设定,生产端自行将 max.request.size 调整为 4M 大小,Kafka 集群为该主题设置主题级别参数 max.message.bytes 的大小为 4M。...从上面例子可看出,Kafka 消息大小的设置还是挺复杂的一件事,而且还分版本,需要注意的参数巨多,而且每个都长得差不多,不但分版本,还需要注意生产端、broker、消费端的设置,而且还要区分 broker...本文通过相关参数的解析说明,再结合实战测试,帮助你快速搞明白这些参数的含义以及规则。...以上源码可以看出 message.max.bytes 并不是限制消息体大小的,而是限制一个批次的消息大小,所以我们需要注意生产端对于 batch.size 的参数设置需要小于 message.max.bytes...可以得出结论,max.message.bytes 参数校验的是批次大小,而不是消息大小。

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    绘制热图,无需代码,快速完成发表级别科研绘图

    下面我们以最常用的热图绘制工具给大家进行演示一下如何在Hiplot Pro平台快速绘制热图。...此外,如果你对某个工具使用有更好的建议,也可以直接写在评论中哦。热图工具使用示例接下来,我们就分步骤逐步演示如何使用Hiplot Pro中的热图绘制工具。...在这里给大家做个一简单的介绍,Hiplot Pro中参数通常分为三大类:数据参数通常用以指明用作绘图的数据列特殊参数是指对于该绘图/分析工具特定的参数,比如热图中聚类的参数,高低数值对应颜色的参数等。...通用参数往往是指那些在大部分绘图中都会用到的参数,比如图形的宽高,图例的大小,标题的字体、大小等等。设置好参数后,我们点击“提交”即可完成分析。...此外,我们还提供了快捷的参数导入/导出服务,也就是说你这次设置好的绘图参数,可以导出保存。下次还要接着用时,直接导入即可。

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    R 语言绘制热图的 10 种方法

    heatmap 的使用格式如下: 其中括号中的都是可调整的参数,初步统计了一下,至少包含 23 项参数,但是每一次绘制热图时,其实只需要部分参数即可完成绘图。...矩阵和数据框的差异请参照R语言的相关教程。 对于一个热图而言,有三个参数至关重要:1. 用来绘图的矩阵是必须的;2. 热图最令人称赞的就是它绚丽的颜色了,因此颜色参数不可或缺;3....热图中的色块以小格子呈现,与小格子相关的默认参数有:border_color = "grey60", cellwidth = NA, cellheight = NA;如果我们不想让每个格子都具有灰色的边框...用 heatmap.2 绘制的热图 我们发现,图中多了很多绿色的线,这是什么呢?...用 heatmaply 绘制的热图 这里新出现的 fontsize_row、fontsize_col 和 margins 参数分别表示行标签字体大小、列标签字体大小以及边界(下、左、上、右)。

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    如何在 Python 中的绘图图形上手动添加图例颜色和图例字体大小?

    散点图没有大小或颜色信息,也不会显示悬停信息。绘图标题设置为“我的标题”。...数据帧中的“考试 1 分数”和“考试 2 分数”列分别用作 x 轴和 y 轴。“性别”列用于使用颜色参数对图中的标记进行颜色编码。 ...legend_font_color参数设置为“=red”以更改图例文本的颜色,legend_font_size参数设置为 14 以增加图例文本的字体大小。...“size”列被指定为标记的大小,“color”列被指定为变量,用于根据支付账单的人的性别为标记着色。绘图的标题设置为“提示数据”。...这些参数控制图上显示的图例的颜色和字体大小。 最后,使用 Plotly 中的 show() 函数显示绘图。

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    画图手册 | ImageGP:今天你“plot”了吗?

    前言 刚刚结束了本年度的最后一次扩增子课程和宏基因组课程(都是爆满,2020年的课程提前开始报名了。就看后面的转录组和单细胞课程的参与度了),数据分析得到的大部分结果都可以用ImageGP绘图展示。...参数属性设置:除了PiCrust,LEfSe,Bugbase和FAPROTAX(可参照示例数据使用),其他的每种绘图页面的最上端都有一个使用示例的图示,右边展示的是结果,左边是制作结果的导入数据和参数设置...绘图前一定要知道自己想要的图长什么样,横轴是哪一列信息,纵轴是哪一列信息,颜色代表哪一列信息,大小代表哪一列信息,想好了,也就选出来了。...,说明相应位置对应的信息 线图; Modify plot titles(修改图的标题) 修改主图和图中X,Y轴的标题 线图;GO富集泡泡图;箱线图;散点图;柱状图;火山图;曼哈顿图;直方图;韦恩图;密度图...参数中的variable输入的是列的名字,对大小写敏感 (现在采用了下拉框形式,没有烦扰了)。 ?

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    R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置

    image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现,这个是箱线图和热图的拼接,右侧的热图可以借助geom_point()函数实现,将点的形状改为正方块,数值按照正负来映射颜色,按照一定的数值来映射大小...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 将图例放到右上角 通过 legend.justification 参数来实现 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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    使用日历热图进行时序数据可视化

    相信很多人都会在 Github 中看到这么一个热图,该热图记录的是 Github 平台使用的日常贡献。在每个日历年的热图中以天为单位采样的时间序列数据。...GitHub 的贡献图表示用户在过去几年中所做的贡献数量。色块表示贡献的数量,如色标下方所示。从这张热图中,我们可以检测到每天的贡献模式。...它在日历视图中显示每天事件的相对数量。每天按周排列,按月和年分组。这使你能够快速识别每天和每周的模式。 Calplot 可视化是深入了解数据的好方法。...none-any.whl (8.2 kB) Installing collected packages: calplot Successfully installed calplot-0.1.7.4 基本绘图...该参数接受一个字典,可以设置颜色,大小等样式。

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    Sharded:在相同显存的情况下使pytorch模型的参数大小加倍

    Sharded是一项新技术,它可以帮助您节省超过60%的内存,并将模型放大两倍。 深度学习模型已被证明可以通过增加数据和参数来改善。...即使使用175B参数的Open AI最新GPT-3模型,随着参数数量的增加,我们仍未看到模型达到平稳状态。 对于某些领域,例如NLP,最主要的模型是需要大量GPU内存的Transformer。...微软的Zero论文介绍了称为Sharded的最新技术,他们开发了一种技术,可以使我们接近1万亿个参数。...除了仅针对部分完整参数计算所有开销(梯度,优化器状态等)外,它的功能与DDP相同,因此,我们消除了在所有GPU上存储相同的梯度和优化器状态的冗余。...因此,每个GPU仅存储激活,优化器参数和梯度计算的子集。 使用分布式模式 ? 通过使用这些优化方法中的任何一种,可以通过多种方法来压缩分布式训练中的最大效率。

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    R语言之 ggplot 2 和其他图形

    1.初识 ggplot2 包 ggplot2 包提供了一套基于图层语法的绘图系统,它弥补了 R 基础绘图系统里的函数缺乏一致性的缺点,将 R 的绘图功能提升到了一个全新的境界。...例如,用上图中的散点拟合曲线。...,图中的纵坐标是计数的绝对大小。...3.3 热图 热图(heatmap)是将一个矩阵中的元素数值用不同颜色表达,并对矩阵的行或列进行层次聚类的一种颜色图。通过热图,我们不仅可以直接观察矩阵中的数值分布状况,还可以知道聚类的结果。...以 RNA-seq 为例,热图可以直观地呈现多样本或多个基因的全局表达量的变化,还可以呈现多样本或多个基因表达量的聚类关系。 stats 包里的函数 heatmap( )可用于制作热图。

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    Matplotlib入门

    如果需要同时绘制多个图表的话,可以给figure传递一个参数制定图表的序号,如果所指定序号的绘图对象已经存在的话,将不创建新的对象,而只是让它成为当前绘图对象, figsize:制定绘图对象的宽度与高度...直方图.png 4.5 绘制饼图plt.pie 适用场景:显示各项的大小与各项总和的比例。适用于简单的占比比例图,在不要求数据精细的情况适用。...在plt.pie中,参数slices是每个部分的相对大小,数据类型为列表list; 参数colors指定每个部分对应切片的颜色列表,数据类型为列表list; 参数startangle是饼图开始的角度...,即图中的15W、20W、18W、25W。...image.png 让柱形图按照y轴值的大小排序后画出,因为网站传回的数据已经排序好,只需要按x标签顺序画图即可。

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    灵活的热图谁不喜欢?

    首先让我们试试默认的绘图 library("heatmaply") heatmaply(mtcars) 相关性热图 heatmaply 包括 heatmaply_cor 函数,可以进行相关性热图的绘制...", ylab = "Features", k_col = 2, k_row = 2 ) 很多情况下,我们在相关性热图中还要体现p值,也可以做一个更高级的相关热图,将p值映射到点大小: r...#seriate = "GW" #seriate = "mean" #seriate = "none" ) 使用 dendextend 自定义树状图 用户可以使用 Rowv 和 Colv 参数为热图的行...cellnote 参数,可以显示覆盖在热图上的字符值。...R包中的一员,heatmaply可以绘制交互式的热图,其许多参数设置也和ggheatmap、pheatmap等常用的R包有联动,在色彩的美观度上也是非常优越,通过zoom in/zoom out也可以让我们方便的查看热图的细节

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