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NAR |非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0

该数据库系统地收录了绝大多数种类非编码RNA的相互作用,并对相互作用以及相关分子进行了详细的注释以及可视化,提供了一个全面、系统的非编码RNA相互作用的研究平台。 ?...非编码RNA对生物分子的调控作用,一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中,非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用,调控复杂生物过程。...比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。...此次的v4.0更新,整合了近几年来发表的非编码RNA相互作用文献(如何快准狠地找到相关领域的经典文献?)...以及高通量RNA相互作用测序数据,环状RNA(circRNA)的相互作用和ChIRP-seq获得的非编码RNA-基因组的相互作用首次被收录进来。总数据量上升到11万条,涵盖了35个物种。

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癌症中的长非编码RNA与RNA结合蛋白的相互作用

这包括长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA、微小RNA(miRNA)、piwiRNA等等。...RNA结合蛋白(RBPs)是一组蛋白质,通过结构基序和结构域与不同类别的RNA结合,包括长链非编码RNA(lncRNAs)。这种相互作用会影响lncRNA的加工、修饰、稳定性和功能。...LPIs影响长链非编码RNA(lncRNA)和/或RNA结合蛋白(RBP)的稳定性 为了使长链非编码RNA(lncRNA)和RNA结合蛋白(RBP)能够发挥它们的功能,各个组成部分的稳定性对于过程的效率至关重要...研究人员通过实验,鉴定了与EZH2相互作用以调控其稳定性的长链非编码RNA(lncRNAs),作为促使Cyclin-dependent kinase 1(CDK1)与EZH2增加相互作用的催化剂,并随后促进其在...解析RBPs的结构域对于更好地理解它们与长链非编码RNA(lncRNAs)的相互作用以及进行潜在的计算预测至关重要。

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Nucleic Acids Res | 基于卷积自动编码器的RNA表征及相互作用研究

该研究提出了一种基于卷积自动编码器表征RNA及其相互作用分子的新方法CORAIN,提供了全面的RNA编码特征,并基于卷积自动编码器自动提取并整合RNA编码特征来准确表征RNA相互作用,能够针对多种不同的...RNA通过与其他分子相互作用,在多种生理和病理过程中发挥重要作用。人们构建了各种计算方法来识别RNA相关的相互作用。然而,现有工具提供的编码功能仅限于某些类型,这限制了编码功能的全面性。...换句话说,迫切需要一种RNA编码方法,不仅提供全面的编码特征覆盖,而且还提供一种连接策略,使不同特征维度的相互作用分子能够对下游分类器起到相同的贡献。...因此,本研究开发了一种针对RNA和RNA相关相互作用的编码方法,如下图所示。该方法的独特之处在于通过引入大量新特征实现RNA的全面编码,以及基于自动编码器生产特征实现特定任务的相互作用分子集成。...该方法的创新之处在于通过引入许多新特征实现全面的RNA特征编码,以及使用自动编码器生成特征实现相互作用分子的准确预测。

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香农编码的gui编码_香农编码

香农编码 概念: 香农编码是是采用信源符号的累计概率分布函数来分配字码的。香农编码是根据香农第一定理直接得出的,指出了平均码长与信息之间的关系,同时也指出了可以通过编码使平均码长达到极限值。...香农编码属于不等长编码,通常将经常出现的消息变成短码,不经常出现的消息编成长码,从而提高通信效率。 香农编码严格意义上来说不是最佳码,它是采用信源符号的累计概率分布函数来分配码字。...可以看出,编码所得的码字,没有相同的,所以是非奇异码,也没有一个码字是其他码字的前缀,所以是即时码,也是唯一可译码。 特点: 香农编码的效率不高,实用性不大,但对其他编码方法有很好的理论指导意义。...香农编码作为最简单的是可以根据老师ppt给的算法直接完成的,包括:概率排序,累加概率,由概率算码字长度,由累加概率编码即可,清晰明白。...算术编码作为限失真编码,我感觉很像香农编码,如果符号序列因为各种原因未出现某符号,两者才会有区别。 ppt: 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。

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字节码:ASCII编码:单字节编码,ANSI编码:多字节编码,UNICODE编码:宽字节编码

编码是大家对计算机如何使用字节来表示一个字符的约定,可分为ASCII编码,ANSI编码(本地化编码),UNICODE编码(国际化编码)三种。 1.ASCII编码:单字节编码。...后来ISO国际标准组织以ASCII编码为基础,约定了ISO 8859-1编码,又称Latin1编码。(Mysql的默认存储编码) 2.ANSI编码:多字节编码。...3.UNICODE编码:宽字节编码 (一)“字节”的定义 字节(Byte)是一种计量单位,表示数据量多少,它是计算机信息技术用于计量存储容量的一种计量单位。...ANSI编码有很多种,但是都只是规定自己国家的语言,这时候出现了UNICODE编码,该编码类似于ANSI,使用多个字节表示一个字符,UNICODE编码把世界上各种主要语言都进行了编码,当然UNICDOE...编码也出现了很多种编码方案,比如使用8个二进制位的UTF8以及使用16个二进制位的UTF16等等。

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字节码:ASCII编码:单字节编码,ANSI编码:多字节编码,UNICODE编码:宽字节编码

编码是大家对计算机如何使用字节来表示一个字符的约定,可分为ASCII编码,ANSI编码(本地化编码),UNICODE编码(国际化编码)三种。 1.ASCII编码:单字节编码。...后来ISO国际标准组织以ASCII编码为基础,约定了ISO 8859-1编码,又称Latin1编码。(Mysql的默认存储编码) 2.ANSI编码:多字节编码。...ANSI编码有很多种,但是都只是规定自己国家的语言,这时候出现了UNICODE编码,该编码类似于ANSI,使用多个字节表示一个字符,UNICODE编码把世界上各种主要语言都进行了编码,当然UNICDOE...编码也出现了很多种编码方案,比如使用8个二进制位的UTF8以及使用16个二进制位的UTF16等等。...python3 中编码 在py3里,只有 unicode编码格式 的字节串才能叫作str。

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labview霍夫曼编码_香农编码与霍夫曼编码

一.香农-范诺编码 香农-范诺(Shannon-Fano)编码的目的是产生具有最小冗余的码词(code word)。其基本思想是产生编码长度可变的码词。...霍夫曼编码则是另一个改进的例子。 二.霍夫曼编码 霍夫曼(Huffman)编码属于码词长度可变的编码类,是霍夫曼在1952年提出的一种编码方法,即从下到上的编码方法。...编码结果被存放在一个表中: w(A)=001, w(B)=1, w(C)=011, w(D)=000, w(E)=010 图03-02-2 霍夫曼编码例 霍夫曼编码器的编码过程可用例子演示和解释。...霍夫曼编码树 在霍夫曼编码理论的基础上发展了一些改进的编码算法。其中一种称为自适应霍夫曼编码(Adaptive Huffman code)。...当然,霍夫曼编码方法的编码效率比香农-范诺编码效率高一些。 采用霍夫曼编码时有两个问题值得注意:①霍夫曼码没有错误保护功能,在译码时,如果码串中没有错误,那么就能一个接一个地正确译出代码。

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