初探mRNA、lncRNA联合分析之下游 的差异表达lncRNA共表达mRNA对应的基因 打算是进一步narrow down :一是看看PPI网络和共表达网络有什么不同,二是找出来的PPI hub gene...的overlap集中在这里,而且所有共表达的mRNA的PPI hub中5个有两个位于这里,这同时反映了表达谱特征和真实生物网络)。...看起来有点像最简单的degree 反正作者应该是直接用对整个网络找的hub,没在这之前划分子模块,所以我们后面还是对整个网络进行hub的寻找 cytoHubba: identifying hub objects...但是初始分数(log2FC的绝对值或者-lgPvalue)其实还是能在一定程度上说明节点的在真实的生物世界网络中的重要性 私以为其实可以两个都做做,先不带初始值看看hub节点是哪些,这时的hub节点都是因为在网络中占据了重要地位...但是初始分数(log2FC的绝对值或者-lgPvalue)其实还是能在一定程度上说明节点的在真实的生物世界网络中的重要性 私以为其实可以两个都做做,先不带初始值看看hub节点是哪些,这时的hub节点都是因为在网络中占据了重要地位
不可能有一种方法就可以直接解决这个问题,现在只从表达网络的角度,稍后我会写一篇多个角度如何筛选关键基因的文章。,其范围要比hub小。hub不一定关键,关键不一定hub。...这里可以看出,hub基因是是在无尺度共表达网络中存在的,对应着degree,也就是说在GCN中。...现存的方法主要关注hub基因的鉴定,基于的就是GCN中的连接度,这些技术只是凭经验选择,并没有统计学标准。另外,在文献中很少有方法发现来鉴定无尺度网络的中hub nodes。...另外,一旦hub被移走,hub-bottlenecks是破坏网络最有效的节点。...Figure3.png 这样,酵母中的相互作用网络的hub基于他们的partners‘表达谱,可以分为两类:date和party hubs。
MPLS VPN Hub and Spoke实验 实验拓扑 实验要求 1.R6与R7通信需要经过R1,不可以直通 2.HUB-CE,SPOKE-CE在同一个AS(allow -as-loop的合理使用...之间配置MP-BGP邻居关系 (减少IBGP邻居的建立使用 RR 反射器,其中R2充当反射器最为合适) 3.R2,3,4,5启用MPLS 3.SPOKE-PE配置VPN实例,并进入接口进行绑定 4.HUB-PE
Traefik Hub Traefik Hub 简介 ️Reference: 你的云原生网络平台 -- 发布和加固你的容器从未如此简单。...Traefik Hub 定位: •云原生网络平台 它有 2 大核心功能,我这次体验感觉也是如此: •(易于)发布(以网站域名的形式发布容器服务)•(易于)加固 (HTTPS + 认证) Traefik...•Traefik Hub Agent(实际上是 3 个组件)•Hub Agent Auth Server•Hub Agent Controller•Hub Agent Tunnel•当你对外发布服务的时候...Hub Agent 之间建立的安全隧道,将请求转发给 Traefik Hub Agent•Traefik Hub Agent 再将请求转发给 Traefik, 最后流转到具体的服务 Traefik Hub...Traefik Hub 支持 JSON 网络令牌(JWT)、Basic Auth. ️
在最近的一期思影fMRI培训中,我听到这样一段对话: 甲:我已经构建了脑网络,已经做了统计,也用BrainNet做了可视化。 乙:那你为啥还要参加基础班啊?(小小地惊讶。。)...乙:啊,好奇怪啊,不懂fMRI还把功能脑网络构建出来了。。 听到这里,初学者可能有一些疑惑了,这家伙甚至没做过fMRI数据的预处理,竟然已经开始做脑网络了。...我也有些好奇了,于是乎,我也掺和进来:“那你是用什么数据构建的脑网络呢?” 甲:别人给了我一些脑区的信号序列。 额,好吧。到这里,大家可能已经明白了,构建一个功能脑网络,甚至不需要我们懂fMRI!...首先,甲学员从他人那里获取了每个脑区的信号序列。其次,计算任意两个信号序列间的相关(皮尔逊相关)。这样,把脑区视为节点,相关值视为边,功能网络就构建好啦! ?...这样,包含两个节点(红色脑区和蓝色脑区)和一个连边的最小“脑网络”已经构建好了。当我们把任意两个脑区信号序列的相关计算出来后,一个完整的脑网络就计算好了! ? (这张图片是不是“正式”了很多!
本文记录下最近在学习Docker容器技术时遇到的一些问题,以此记录下问题分析排查过程 故障问题: 通过docker pull 从公共仓库Docker Hub下载镜像失败 [root@node-11 ~]...f2F6AyfnoYFmLid5sV4H3c0PS2csSFWD7pvvzxEh0Mma8d-kHbWqm7Xa6GCcRM5tgaXXClIZB56HYSa11rZgaofqz6A_&Key-Pair-Id=APKAJECH5M7VWIS5YZ6Q: net/http: TLS handshake timeout 因为本人办公区网络不能再吐槽...,导致无法去Docker Hub仓库下载镜像。...signature-verification=false 后面添加国内的docker镜像源--registry-mirror=http://f2d6cd40.m.daocloud.io 添加后重启docker 服务,即可解决网络影响下载问题
图论方法在大脑网络中的应用 大脑网络结构、功能和控制的物理学 脑网络研究中的图论指标详解 从宏观尺度脑网络的角度看结构--功能关系 图论在静息态和动态脑连接评估中的应用:构建脑网络的方法 脑网络组织的经济性...DMN:大脑的默认网络 脑网络核心节点的发育 抑郁症,神经影像学和连接组学 PLOS Biology:重度抑郁症多成像中心的泛化脑网络标志物 Biological Psychiatry:精分患者大脑的组织体积变化与脑网络...Neuron:从简单映射到多维网络 脑网络视角下的精神分裂症 基于人脑连接组学将疾病症状映射于脑网络 大脑连接障碍中跨脑疾病的连接 现代物理评论:大脑网络中的动力学控制 图论在识别人脑网络连通性模式中的应用...但是小世界脑网络并不是天然的网格,如果它们严格地通过计算布线成本以最小化布线成本,那么脑网络就会受到拓扑惩罚,失去由增加的特征路径长度索引的综合能力,从而降低小世界属性(也就是距离较远的节点会有更长的路径长度...加权网络的小世界 尽管到目前为止二值网络分析在脑网络分析中占据了主导地位,但这并不能代表图论对连接组学存在方法论上的限制。
孔乙己知道自己不能与众人聊天,只好和我这年轻人攀谈起来,“小兄弟,你可知道不同模态脑网络有四种构建方式?”我说,“当然知道啊,刚才还讨论过功能脑网络呢。”...当我们把所有脑区间的GMV相关计算出来后,就得到了所谓的结构共变脑网络。只不过,这个脑网络一组被试才能构建一个。” ?...那么对每个被试的红蓝脑区,可分别计算出12个GMV值,对红蓝脑区的12个GMV值做相关即得到红蓝脑区间的连接值。通过这种方式,每个被试都可以得到对应的结构脑网络,是不是很类似于功能脑网络?”...同样地,每个人都可以得到一个纤维束脑网络,是不是也很简单?” ? (加权脑网络的邻接矩阵表示) “至此,你已经知道了4种脑网络构建方式。这里我再补充一个概念:加权网络和二值网络。...每个脑网络都可以表示为邻接矩阵的形式,参考上图,横轴和纵轴都是脑区编号,横纵交叉的地方就是相应脑区间的连接值(颜色随连接值大小变化),这种网络就是加权网络。” ?
available models in hub through torch.hub.list(), show docstring and examples through torch.hub.help...() and load the pre-trained models using torch.hub.load()torch.hub.list(github, force_reload=False)[source...The locations are used in the order ofCalling hub.set_dir()$TORCH_HOME/hub, if environment...$XDG_CACHE_HOME/torch/hub, if environment variable XDG_CACHE_HOME is set.~/.cache/torch/hubtorch.hub.set_dir...Hub uses the cache by default if it already exists in hub_dir.Users can force a reload by calling hub.load
不太长的总结版本,基因的蛋白互作网络图可以类比于人群社会关系连接图,然后子网络hub基因,类似于人群里面的不同派系,各个派系的首脑人物!...,暂且记住,返回网络图再把它们找出来加深对于图的理解。...8 这就是一个漂亮的网络图了,再对这个图进行探索。...在网络中占有重要权重以及其与GAL4的关系。...21 一起来理解子网络及hub基因 就好比这次新型冠状病毒疫情那么严重,其它省市兄弟医院从2万个医生中选出1000个医生支援武汉(差异分析提取差异基因1000个),但是如果新闻稿单单写1000个医生支援武汉未免显得单薄不能突出重点
我编制的脑图上的每一个联系都直接来自我必须回顾的数千项神经科学研究。因此,这项工作总结了一百多年的研究。您看到的点对点连接代表了数百到数百万条平行的轴突纤维(线)为相同的区域供电。...这看起来只是脑图上的一个连接。随意查看这些脑图并使用它们来了解我们的想法。您将很快了解我们的大脑电路实际上是多么有条理,并且可能会像我一样问自己,它到底是如何连接的?
上海交通大学吴奇团队联合东南大学基于不同认知状态下对应激活的脑区,建立了一种飞行过程脑机接口系统,由彩色脑功率图谱和认知状态监测脑网络组成。...BPM的构成 疲劳指标和脑功率图获得 大脑疲劳指标通过EEG获取,用功率谱密度(PSD)表示脑电信号能量强弱,脑电频率由低到高一般分为δ、θ、α、β四个节律,在不同的工作状态下各节律PSD曲线呈现各自差异...BPM网络训练 深度网络的构建需要与实际问题相一致,才能揭示实际问题的运行机制。例如使用Lenet处理手写数字识别,使用Alexnet处理Cifaar10的分类问题。...结论 本研究提供的航空脑机接口应用主要由两部分组成,一是大脑认知地图的生成,二是认知网络的建立。...该认知检测模型充分考虑了脑功率图的特点,具有良好的检测性能;最后,开发了Bayesian-OGNV方法作为参数推理工具,以减少Bpmnet网络的过拟合。此外,采用了加入动量参数等更多的优化技术。
虽然屡屡受挫,但 Sci-Hub 依旧以各种方式顽强地存活了下来。...在网站域名屡次被撤销之后, Sci-Hub 创始人 Alexandra Elbakyan 在分布式域名网络 Handshake 上注册了新的网站。...Namebase 则是为用户提供访问 Handshake 网络的平台,这个名字对于国内开发者来说不算陌生。...像 Handshake 这样的分布式(decentralized)域名系统,可能会成为分布式网络的标志性胜利。...正如 Sci-Hub 的经历所证明的问题一样,分布式的网络是出于去平台化的担忧而构建的。
在网站域名屡次被撤销之后, Sci-Hub 创始人 Alexandra Elbakyan 在分布式域名网络 Handshake 上注册了新的网站。...此前,Sci-Hub 被多次撤销域名,推特账户又被封禁且无法申诉,传统域名系统显然不那么满足这个「盗版学术论文数据库」的需求,能够对抗审查的 DNS 成为 Sci-Hub 保持可访问状态的方法之一。...Namebase 则是为用户提供访问 Handshake 网络的平台,这个名字对于国内开发者来说不算陌生。...像 Handshake 这样的分布式(decentralized)域名系统,可能会成为分布式网络的标志性胜利。...正如 Sci-Hub 的经历所证明的问题一样,分布式的网络是出于去平台化的担忧而构建的。
近日,PyTorch 社区发布了一个深度学习工具包 PyTorch Hub,PyTorch Hub 由一个预训练模型仓库组成,可用于提高研究工作的复现性以及新的研究。...在更新之前,优先看一下hub代码,发现其是一个独立的python文件,没有任何关联代码,于是单独下载该文件,即可以实现对应功能。如下图所示。 ?...由于没有集成到torch包中,需要单独引用hub包,然后进行加载。...Example: 'pytorch/vision[:hub]' model: Required, a string of entrypoint name defined in repo's...通过上述考虑,完全可以通过修改下载包地址到指定网址或者文件夹目录来实现离线hub的设置。
图1 脑网络通信模型的核心概念。人类连接组是由白质束(网络连接)相互连接的灰质区域(网络节点)组成的宏观连接网络。是什么原理指导信号通过复杂的大脑连接进行多突触传播?...图2脑网络通信模型和措施的分类。当前的大脑网络通信模型可以分为三大类——扩散过程、参数模型和路由协议——从分散(上)到集中(下)策略。...成功的网络导航必须由一个距离度量来指导,这个距离度量反映了节点对形成连接的概率导航宏观脑网络的一个简单方法是考虑节点之间的欧几里得距离。...更广泛地说,网络通信的研究补充了其他脑功能模型的研究,如网络控制理论和神经动力学的生物物理模型。5.3 脑网络通信模型的应用和验证建议网络通信模型已经在神经科学研究的各种途径中发现了效用。...例子包括脑刺激因果效应的记录,神经退行性疾病进展的纵向成像,以及脑损伤或脑断连后结构和功能重构的评估。这些现象提供了一个机会,将注意力从对大脑网络的描述转向机械和预测的模型。
在 https://hub.docker.com 免费注册一个 Docker 账号 $ docker login 退出 docker hub 可以使用以下命令: $ docker logout 拉取镜像...推送镜像 用户登录后,可以通过 docker push 命令将自己的镜像推送到 Docker Hub。 以下命令中的 username 请替换为你的 Docker 账号用户名。
物接入(IoT Hub)是面向物联网领域开发者的全托管云服务,通过主流的物联网协议(如MQTT)通讯,可以在智能设备与云端之间建立安全的双向连接,快速实现物联网项目。...数据型项目 适用场景 无设备概念或深度依赖数据流的场景,需使用者有较强的软硬件开发能力 特性描述 支持自定义 Topic,需对协议有较好了解 需开发者搭配规则引擎或自行处理数据流转及存储 物接入IoT Hub...用户(thing) 表示物接入IoT Hub 的用户,用户可以在每个endpoint项目中创建一个或多个用户thing。...目前基于MQTT协议,IoT Hub 支持创建发布 Publish 和订阅 Subscribe 两种权限。 ?
本研究建立在前人对双相障碍脑结构和功能连接以及脑网络组织的研究基础上,旨在进一步阐明双相障碍神经生物学中尚未解决的问题。...局部连接障碍,以及全脑连接的减少,将支持双相障碍的神经解剖缺陷可能局限于特定解剖亚网络的假设。2. ...图1 网络分析方法学利用加权结构矩阵得到了BD网络全脑连接特性的全局参数,包括度、特征路径长度、局部和全局效率以及聚类系数;作为各自90个区域估计的平均值计算。...在全脑层面,与对照组相比,患者显示出更长的路径,并在其网络中保持全局效率。路径长度在很大程度上受网络中较长的路径的影响,而全球效率主要受较短路径的影响。...参考文献:Aberrant Subnetwork and Hub Dysconnectivity in Adult Bipolar Disorder: A Multicenter Graph Theory
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