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Rggplot2R包开发使用

尤其是在R编程改变了从ggplot2引用函数方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2非标准求值方式。...这种tidy eval计算符号会捕捉用户提供表达式,并将其传递给使用非标准计算函数,如aes()或vars()。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格函数)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R需要类都有plot()方法,但想要依赖一个单一plot()为你每个用户都提供他们所需要可视化需求是不现实...如果没有,则会将主题对象存储在编译后字节码,而该字节码可能与安装ggplot2不一致!

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    R tips:手动获取函数源码

    R函数分为普通函数、S3方法和S4方法。 普通函数源码获取细节 普通函数源码手动获取比较简单,只需要在console输入函数名,打印一下即可。...,可以使用"::"或者":::"来获取函数源码,比如: ggplot2::aes #function (x, y, ...) #{ # exprs %、%$%等操作符都是函数,由于他们不是合法R变量名称(只包含数字、英文字母...S3方法源码 S3方法源码获取可以手动构造一下函数名称,然后在console打印它即可,之所以需要手动构造方法名称是因为一个S3泛型函数直接打印并不是真正源码细节。...* 获取S4方法源码 不同于S3方法,S4方法源码无法通过构造函数名称来获取,但是methods包(R官方S4类包,默认自动导入)中提供了getMethod方法来获取源码。

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    13.1 函数变量

    函数变量函数,我们可以看到也进行了变量使用,那函数变量函数变量到底有什么区别呢? 1.1....,在函数name输出jerry # 但是,在函数外部,我们重新打印name值,发现name值还是tom # # 此时:函数name是局部变量函数外部name是全局变量 # 如此诡异情况...函数变量隔离 如果函数没有通过global引入全局变量,但是在函数又使用了和全局变量相同名称 此时就会出现问题 name = "tom" def test(): # 这里只是想使用一下全局变量值...,首先描述一下错误出现条件 1.如果函数没有声明和全局变量名称一致局部变量函数中直接使用全局 变量值,不会出现错误 2.如果函数,一旦在任意位置定义了和全局变量名称一致局部变量函数...在局部变量声明定义之前使用这个名称变量,就会出现上述错误 这是因为,在函数,一旦声明变量并且赋值一个局部变量函数又没有通过 global引入同名全局变量,此时在函数只会存在局部变量~

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    Rsweep函数

    函数用途 base包sweep函数是处理统计量工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体例子来看 #创建一个4行3列矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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    R语言ggplot2作图如何去掉图例NA

    遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树时候,我想给进化树枝分组映射颜色,对应推文是跟着Nature Genetics学画图:R语言ggtree给进化树枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧图例最下方式有一个NA,如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...image.png 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python...做数据分析和数据可视化简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己学习笔记!

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    Rstack和unstack函数

    我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...,可以看作是一个分类变量。...,但是当group这个分组变量里面,每组数目不一样时候,你就会发现结果其实是一个列表。

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    4种方法实现ggplot2aes()变量替换

    介绍 ggplot2里aes()可以用tidyselect风格去选择变量做映射绘图,那么这种情况下如何实现「变量替换」呢? 首先说下我为什么实现「变量替换」。...我目前实际需求就是,分析代码+绘图代码篇幅太长,在封装流程时候我想要把变量提到前面,通过替换一个变量来避免后面多次修改替换变量。 方法与演示 有!!as.name()、get()、!!...sym()和.data[[]] 共计四种有效方法在aes()实现变量替换。...代码演示如下: library(ggplot2) # 创建一个包含变量数据框 data <- data.frame( x = c(1, 2, 3, 4), y = c(10, 20, 30,...40), group = c("A", "A", "B", "B") ) # 定义一个变量,用于替换图形属性 color_var <- "group" # 使用变量替换创建散点图 ggplot

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    Rgrep和grepl函数

    在日常数据分析过程,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量查找是否包含我们东西,或者向量那几个元素包含我们查找内容。...这个时候我们会用到R中最常用两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数用法。 这两个函数最大区别在于grep返回找到位置,grepl返回是否包含查找内容。接下来我们结合具体例子来讲解。...☞讨论学习Rgrepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习Rgrepl函数

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    linux利用read命令获取变量

    前言 本文主要给大家介绍了关于linux利用read命令获取变量中值相关内容,分享出来供大家参考学习,下面话不多说了,来一起看看详细介绍吧。...read常用用法如下: read -[pstnd] var1 var2 ......-p提示语句 -n 字符个数 -s 屏蔽回显 -t 等待时间 -d 输入分界 read来获取变量,是通过屏幕中等待用户输入,如果是用read命令从已知变量获取如何操作呢?...比如说: input_ips=’127.127.127.10-127.127.127.14’,通过read命令分别读取到start_ip, end_ip两个变量?...,希望本文内容对大家学习或者工作能带来一定帮助,如果有疑问大家可以留言交流,谢谢大家对ZaLou.Cn支持。

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    python函数序列传参,列表拆解参、字典拆解

    知识回顾: 可变参数 应用场景:在不确定函数参数到底有多少个时候,使用可变参数。使用符号星号* 混合运用场景:根据可变参数在自定义函数不同位置来做不同情况调用。很有可能结合关键字参数。...---- 本节教程视频 一、函数列表参 列表举例 [“a”,”b”,”c”] 其实在使用列表时候比较简单,只需要将实际列表作为参数传入到调用函数时候,在列表变量前加上一个星号*即可把某个列表拆分成多个参数传入到自定义函数...其实在这里,我们如果想要将列表拆解成多个参数进行传入时候,我们必须就是定义一个可变参数,而定义可变参数时候,我们必须要加上一个* 本质:列表拆解传入时候 ,自定义函数参数个数必须要支持实际拆解参调用函数...): name=老刘 work=程序员 微信公众号=编程创造城市 ---- 相关文章: python函数可变参数 python函数关键字参数与默认值 pythonlambda表达式与函数函数参...、引用、作用范围、函数文档 python函数概述,函数是什么,有什么用 python字典赋值技巧,update批量更新、比较setdefault方法与等于赋值 python字典删除,

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    详解JavaScript变量提升函数提升

    什么是变量/函数提升 包括变量函数在内所有声明都会在任何代码被执行前首先被处理,这种现象称为提升。...var a = 200, 所以 var a会被提升到fn作用域顶端,第一输出则为undefined 下面这段代码,由于es6之前,js是没有块级作用域,所以 if 声明a变量会被当成全局变量处理...a没有使用var定义,会造成zxx函数没有变量声明,所以zxx里面访问变量a,其实都是访问全局变量a,a = 20 又相当于给全局变量a重新赋值20 函数声明提升 通过function声明函数,...ReferenceError, 而是 TypeErr var zxx = function () { console.log('zxx is a great girl') } 这段程序变量标识符...当前函数声明和变量声明使用同一个变量名称时,函数优先级高于变量优先级 console.log(zxx) // 会输出zxx定义函数 function zxx () {

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    Shell编程关于数组作为参数传递给函数若干问题解读

    3、 数组作为参数传递给函数若干问题说明以下通过例子来说明参数组遇到问题以及原因:第一、关于$1 问题[root@iZuf6gxtsgxni1r88kx9rtZ linux_cmd]# cat...linux_cmd]# sh fun_array.sh The parameter array is :1我们看脚本位点1 ,我们对函数pro_arr 参了 ${arr[*]} ,即参了1 2...第二、关于$@问题$@表示获取脚本所有参数,而以下例子:[root@iZuf6gxtsgxni1r88kx9rtZ linux_cmd]# cat fun_array.sh #!...第三、为何在有newarray=(`echo "$@"`) 和 arg1=$(echo ${myarray[*]}) 差异讲清楚这里区别,其实我们还是先回归到基础知识点上,关于命令输出赋给变量两种方式...(echo ${myarray[*]}) 是将数组写成n1 n2 n3 n4 n5 ...形式,如下:对函数参数 $arg2形式:[root@iZuf6gxtsgxni1r88kx9rtZ linux_cmd

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