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获取基因有效长度的N种方法

我总结了几种获取基因有效长度(或非冗余总外显子长度、总转录本长度)的方法,现整理如下: 一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言,RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到的上游软件就是...之前一直以为featureCounts的Length只是单纯的基因长度,后来经过多种方法比较后发现其实Length这一列就已经是基因的有效长度了...在文章后面我也会展示这几种方法比较的结果) 因此,最方便的做法就是在下游获取...首先看看从gtf文件中获取基因有效长度的两种方法是否有差异。...gtf中获取的efflen比较 总结: 获取基因有效长度的最简便方法是直接从featureCounts或salmon的输出文件中提取。...在没有上游原始输出文件的情况下,也可以采取直接从gtf文件中计算的方法,获取每个基因的非冗余外显子总长度得到基因有效长度。

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    灵动标签的使用方法 ecms通过运行sql获取须要的记录

    在某些条件下,我们要求站点的某页上显示指定的信息, 可是这样的指定假设固定去用代码写死的话,对以后的修改将会是大麻烦; 这时候sql语句的优势就凸显出来,利用sql语句仅仅须要改改数字,就能让显示的内容彻底替换...= 依照sql语句的指定,返回id编号分别为2452,2697,2299,2267的内容信息,同一时候代码后面的倒数第二个參数为24, 这样才是sql的运行。...(下面内容来自互联网说明灵动标签的使用方法) 灵动标签的使用说明: 灵动标签 (e:loop) 格式: view sourceprint?...,显示条数,操作类型,仅仅显示有标题图片,附加SQL条件,显示排序}] sql语句’) 数据表前缀可用:“[!

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    SQL 查看SQL语句的执行时间 直接有效的方法

    在MSSQL Server中通过查看SQL语句执行所用的时间,来衡量SQL语句的性能。 通过设置STATISTICS我们可以查看执行SQL时的系统情况。选项有PROFILE,IO ,TIME。...SET STATISTICS IO ON:报告与语句内引用的每个表的扫描数、逻辑读取数(在高速缓存中访问的页数)和物理读取数(访问磁盘的次数)有关的信息。 ...SET STATISTICS TIME ON:显示每个查询执行后的结果集,代表查询执行的配置文件。...语句示例: SET STATISTICS PROFILE ON; SET STATISTICS IO ON; SET STATISTICS TIME ON; GO /*--你的SQL脚本开始*/...[Source] IS NOT NULL )         ) AS [GroupBy1]; /*你的SQL脚本结束*/ GO SET STATISTICS PROFILE OFF; SET STATISTICS

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    PHP获取MySQL执行sql语句的查询时间方法

    的执行时间进行分析可以: 1,确定sql的书写是否合理,高效 2,检查字段、表的设计是否合理 方法1:在系统底层对sql操作类进行改写,通常类的结构是 业务model ---》 db类 ---》 执行sql...可能引发有些不明的错误,注意。 批注2:profile最多保存100条记录,这个要怎么解决呢?...引用2:PHP获取毫秒级时间戳的方法 java里面可以通过gettime();获取。如果是要与java写的某些程序进行高精度的毫秒级的对接通信,则需要使用PHP输出毫秒级的时间。...为获取更为精准的毫秒级时间戳可以使用下面的代码: sql语句的查询时间方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持。

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    解决 Docker 安装时“无法获取 dpkg 前端锁”错误的有效方法

    在安装 Docker 的过程中,不少用户可能会遇到“无法获取 dpkg 前端锁”的错误提示。这是一个较为常见但也令人困扰的问题。...下面为您详细介绍几种可能的解决方法:方法一:检查并终止相关进程首先,您可以通过以下命令检查是否有正在运行的与 dpkg 相关的进程:sudo lsof /var/lib/dpkg/lock-frontend...如果有进程正在占用,您可以使用以下命令终止它们:sudo kill 方法二:删除锁文件有时,删除相关的锁文件也能解决问题。...方法三:重新配置软件源错误也可能源于软件源的配置问题。您可以更新软件源列表:sudo apt update并确保软件源的设置正确无误。...总之,当遇到“无法获取 dpkg 前端锁”的错误时,不要慌张,按照上述方法逐一排查和解决

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    记录如何用php做一个网站访问计数器的方法

    简介创建一个简单的网站访问计数器涉及到几个步骤,包括创建一个用于存储访问次数的文件或数据库表,以及编写PHP脚本来增加计数和显示当前的访问次数。...方法以下是使用文件存储访问次数的基本步骤:创建一个文本文件来存储计数:在网站的根目录下创建一个名为 counter.txt 的文件,这个文件将用于存储访问次数。...($counterFile, 'c+');if (flock($handle, LOCK_EX)) { // 读取当前的计数 clearstatcache(); // 清除统计缓存以获取最新值...使用数据库:如果你希望使用数据库来存储访问次数,你需要创建一个数据库表,通常包含一个字段来存储计数。然后,你可以使用SQL语句来增加计数。...这种方法更适用于流量较高的网站,因为它可以提供更好的并发处理能力和数据的持久性。PS:请记住,这个简单的计数器主要用于教学目的。

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    《收获,不止SQL优化》 - 获取执行计划的方法对比

    《收获,不止SQL优化》,对这几种方法,从获取步骤、优缺点、应用场景等方面,做了系统整理,可以比较学习, 方法 获取步骤 优点 缺点 应用场景 explain plan for 步骤1:explain...无法控制输出记录展现与否,而autotrace和traceonly可以控制不将输出记录打屏;3....看不出递归调用的次数,看不出物理读的数值; 要想获取表被访问的次数,只能使用方法3 dbms_xplan.display_cursor select * from table(dbms_xplan.display_cursor.../rdbms/admin/awrsqrpt.sql;步骤2:选择你要的断点(begin snap和end snap);步骤3:输入你的sql_id; 可以方便地看到多个执行计划; 获取的过程比较麻烦;...想观察某条SQL的多个执行计划用该方法 为了获得最准确的执行计划,最重要的一点,就是这条SQL是否真正执行过,只有真正执行过,相应的执行计划才是最真实的,否则通过预估得到的,就会存在偏差的可能, 为了方便编辑

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    SQL Server数据库获取TEXT字段的内容长度的方法

    SQL Server数据库如何获取TEXT字段的内容长度呢?...本文我们就来介绍一下SQL Server数据库如何获取TEXT字段的内容长度的方法,是通过DATALENGTH函数来实现的,接下来我们就通过DATALENGTH函数的语法及使用实例来了解一下这部分内容...DATALENGTH用来返回任何表达式所占用的字节数。 语法:DATALENGTH ( expression ) 参数:expression,任何类型的表达式。...NULL 的DATALENGTH 的结果是 NULL ---- 返回字符表达式中的字符数。如果字符串中包含前导空格和尾随空格,则函数会将它们包含在计数内。...LEN 对相同的单字节和双字节字符串返回相同的值。 LEN(character_expression),字符串类型的表达式

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    四种使用物联网和人工智能加速获取价值的有效方法

    通过了解Twitter,linkedIn和许多与IoT相关的网站,不难发现与物联网(IoT)价值相关的生动对话。但是最近,话题转向企业如何才能更快,更有效地获取和利用物联网计划的见解。...通过更有效,更准确,更主动地为相连的车辆提供服务,从而缩短车辆在路上的时间,并最大程度地减少服务中断的成本。 沃尔沃卡车的远程诊断程序监视每辆卡车的数据,以查找主要系统出现故障时触发的故障代码。...如果对时间的敏感度较低或不存在潜在的伤害,则计划在最合理的情况下进行维修。 将传感器数据和IoT技术与包括AI在内的高级分析进行配对的结果令人印象深刻。...这种现实要求以不同的方式将分析应用于不同的目的,即多阶段方法。例如:高性能分析对静态数据,云计算或存储中的静态数据起到了很大的作用。...结合AI技术 为了实现AIoT的最高回报,除了部署单一的AI技术外,还需要更多。采用平台方法,多种AI功能一起工作,例如机器学习和深度学习,以实现自然语言处理和计算机视觉。

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    备忘单:提升你的 MariaDB 和 MySQL 数据库技能

    这就是设计数据库的目的,而 MariaDB(由 MySQL 的原始开发人员开发的一个分支) 是一个极佳的选项。在本文中我使用的是 MariaDB,但这些信息同样适用于 MySQL。...如果你还没有安装 MariaDB,请查阅我的文章 在 Linux 上安装 MariaDB。如果你没有使用 Linux,请参照 MariaDB 下载页面提供的指导方法。...学习 SQL 基本知识 结构化查询语言是基于它们的能力定义的:一种通过有规则且一致的语法来查询数据库中的内容以得到有用的结果的方法。SQL 看起来像是普通的英文语句,有一点点生硬。...为了数据的多样性,在四行记录中分配三个不同的值。 连接表 现在这两个表彼此有了关联,你可以使用 SQL 来展示关联的数据。数据库中有很多种连接方式,你可以尽请尝试。...通过使用多个表中独立却有关联的数据,你可以保证数据的一致性和有效性,使用 SQL 你可以动态地关联它们。

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    数据访问函数库的使用方法(二)—— 获取记录集和使用事务的方法

    使用SQL语句来获取记录集的方法 string sql = "select col1,col2,col3  from TableName where ";             //获取DataTable...[1];    //TableName2 的记录             //ds.Tables[2];    //TableName3 的记录             //只获取一条记录,记录保存到...string[] values1 = dal.RunSqlStrings(sql);                          //只获取一条记录,记录保存到 DataRow 里面。...可以通过字段名称来获取             DataRow dr = dal.RunSqlDataRow(sql);             //只获取第一条记录的第一个字段的值             ... ";             string colValue = dal.RunSqlGetID(sql);             //获取每一条记录的第一个字段的值。

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    为什么MariaDB更优于MySQL

    语法分析器以一种MySQL引擎能够理解的形式分解从调用程序接收到的SQL命令。“查询优化器”简化执行组件使用的语法,然后为查询执行准备最有效的计划。...作为数据库系统,许多功能有助于MariaDB的普及。其速度是其最显着的特点之一。MariaDB也具有很强的可扩展性,能够处理数万张表和数十亿行数据。...另一个与前任不同的特点是专注于安全。MariaDB的内置功能包括操作和格式化文本,业务和统计计算,记录时间顺序信息, MariaDB服务器是世界上最流行的开源数据库之一。...MariaDB通过引入微秒级精度和扩展用户统计数据提供更好的监控。...MariaDB通过引入微秒级精度和扩展用户统计数据提供更好的监控。 MariaDB的最新功能(如GIS,动态色谱柱支持等)使其成为更好的选择。

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    构建高大上的MySQL监控平台

    MySQLD Exporter中返回的样本数据中通过mysql_slave_status_slave_sql_running来获取主从集群的健康状况。...通常来说我们可以根据mysql 的插入、查询、删除、更新等操作来 为了获取吞吐量,MySQL 有一个名为 Questions 的内部计数器(根据 MySQL 用语,这是一个服务器状态变量),客户端每发送一个查询语句...下面我们通过命令获取插入的情况: MariaDB [(none)]> SHOW GLOBAL STATUS LIKE "Com_insert"; +---------------+-------+ |...MySQL还提供了一个Slow_queries的计数器,当查询的执行时间超过long_query_time的值后,计数器就会+1,其默认值为10秒,可以通过以下指令在MySQL中查询当前long_query_time...Innodb_buffer_pool_reads即记录了从磁盘读取数据的请求数量。

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    MySQL 存储过程与函数(精简笔记)

    MySQL 是最流行的关系型数据库管理系统之一,在 WEB 应用方面,MySQL是最好的 RDBMS (Relational Database Management System,关系数据库管理系统)...《MySQL5.7从入门到精通》 - 刘增杰 简单的说,存储过程就是一条或者多条SQL语句的集合,可以理解为脚本,但是起作用不仅限于批处理,下面我们将重点学习如何使用创建存储函数和过程,变量的调用查看等...创建带参存储过程: 创建一个存储过程,查询lyshark表中记录,过程名称为CountProc,并使用count(*)计算后把结果放入参数param1中,SQL语句如下: MariaDB [lyshark...------+ 1 row in set (0.00 sec) 创建存储函数 存储函数的使用方法与MySQL内部函数的使用方法是一样的,在MySQL中,用户自己定义的存储函数与MySQL内部函数是一个性质的...| +-------+ | 40 | +-------+ 1 row in set (0.00 sec) 使用数据光标 查询语句可能返回多条记录,如果数据量非常大,需要在存储过程和函数中使用光标来逐条读取查询结果集中的记录

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