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Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

什么是JSON文件 JSON文件是一种轻量级的数据存储和交换格式,其实质是字典和列表的组合。这在定义生信分析流程的参数文件中具有很好的应用。...JSON是通过如下代码完成的 import json file_fh = open("test2.json") ajsonD = json.load(file_fh) ajsonD {'公众号': {'...Python解析PSIBLAST的JSON输出结果 BLAST的输出结果可以有多种,在线的配对比较结果,线下常用的表格输出,这次尝试的是JSON的输出,运行命令如下 psiblast -db nr -out...JSON结果获取匹配的蛋白的名字和序列,JSON文件解析的关键是知道关注的信息在哪个关键字下可以找到,然后需要怎么操作进入到关键字所在数据层,具体操作见如下视频,视频中一步步尝试如何不断试错,解析JSON...文件,获得想要的Python脚本和解析结果。

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    Go Web编程--解析JSON请求和生成JSON响应

    因为在结合可读性、编码数据大小和开发者使用难度上都JSON格式是一个比较好的选择,所以接口的数据格式通常都采用JSON,即前端在发送POST,PUT,PATCH请求添加,更改数据时会把数据以JSON格式放到请求的...之前也写过两篇关于用Go语言解码和编码JSON数据的文章 如何控制Go编码JSON数据时的行为 学会用Go解析复杂JSON的思路 那么针对Web编程我们其实只要关注怎么从HTTP请求的Body中读取到JSON...从请求体读取JSON数据 关于这部分内容其实在之前的文章深入学习解析HTTP请求里有说过。...我们需要把请求体作为json.NewDecoder()的输入流,然后将请求体中携带的JSON格式的数据解析到声明的结构体变量中 //handler/parse_json_request package...JSON 数据解析到结构体中 // 发生错误,返回400 错误码 err := json.NewDecoder(r.Body).Decode(&p) if err !

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    Golang HTTP请求Json响应解析方法以及解析失败的原因

    一、Golang HTTP请求Json响应解析方法 在Golang Web编程中,json格式是常见的传输格式,那么json数据要怎么解析呢?...例如下面请求地址 http://api.open-notify.org/astros.json 响应数据如下: { "number": 3, "message": "success", "people..."ISS", "name": "Anatoly Ivanishin" }, { "craft": "ISS", "name": "Ivan Vagner" }] } 下面是一个http请求并解析...= nil { log.Fatal(jsonErr) } fmt.Println(people1.Number) } 按照以上的方法可以正确解析数据 二、Golang json解析失败示例与原因...,无法正常解析了 原因 其实原因很简单,golang首字母大小写意味着改变了成员的访问权限,小写就变成私有的了,不同package是无法访问其他package的私有成员的,导致json.Marshal

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    iOS 自己封装的网络请求,json解析的类

    楼主封装的网络请求类,包括自己写的http请求和AFNetWorking的请求,代码简单,主要是框架搭建。简单来说,就是一个请求类,一个解析类,还有若干数据类。...以下代码以公开的天气查询api为例: 1.网络请求类 我把常用的网络请求方法都封装好了,你只需要写自己的接口,传递apiName,params等参数就可以。...: -(void)getWeatherCallBack:(CallBack)callback{ //选择需要的请求方式,我们采用非第三方的get请求,具体情况选择不同的请求方式,都是异步请求...解析 weather* weatherInfo = [WTParseWeather parseWeatherByWeatherDic:obj]; //返回解析后的数据...callback(weatherInfo); }]; } 2 解析类,这个不同的数据要不同的解析类,自己写,这个是天气的例子: +(weather *)parseWeatherByWeatherDic

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    Influxdb中的Series file解析

    SeriesFile 解析 SeriesFile是什么 SeriesFile其实叫SeriesKeyFile比较合适,里面存储了当前DB下的所有series key; 其中的series key = (...measurement + tag set) SeriesFile的持久化 它对应于磁盘上的若干文件, 每个database都有自己的一组SeriesFile, 其目录为: [influxdb data...influxdb_series_file.png SeriesSegment 定义: 由seriese entries的log会组成磁盘文件, 这个类就负责读写这个磁盘文件 type SeriesSegment...influxdb_series_file_format.png 其中的flag有两个可能的值: SeriesEntryInsertFlag:表示当前写入的SeriesKey是有效的; SeriesEntryTombstoneFlag...,对外屏蔽了SeriesPartition和SeriesSegment的存在; 我们在这里讲一下series id的产生规则 Influxdb将paritition数量定死了为 8, 就是说所有的serieskey

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    Tomcat源码解析(七):底层如何获取请求url、请求头、json数据?

    、StandardWrapper Tomcat源码解析(六):Connector、ProtocolHandler、Endpoint Tomcat源码解析(七):底层如何获取请求url、请求头、json数据...SocketState state = SocketState.OPEN; // 处理来自此套接字的请求 if (event =...,包括请求方式、请求url及参数、请求头、post方式的json请求体(下面讲如何获取) // Http11InputBuffer类方法 private boolean fill(boolean block.../json Accept:*/* 解析请求头(跳过/r(回车)): C 解析请求头key: C 解析请求头key: o 解析请求头key: n 解析请求头key: t 解析请求头key: e 解析请求头...ByteBuffer缓冲区中 先解析请求行,包括请求方式、请求url、请求协议 再解析请求头的name和value 解析都是通过byte chr = byteBuffer.get();每个字节逐一解析的

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    AI搜索的查询结果都来自哪里?

    其实,AI搜索平台之所以这么聪明,是因为它们背后有着庞大的内容来源。作者:刘鑫炜互联网品牌内容营销专家蚂蚁全媒体总编今天,我们就来一起揭开AI搜索平台背后的神秘面纱,看看那些搜索结果都来自哪些平台。...第一个是文心一言的搜索结果,其中显示参考4条信息源,主要来自新浪财经、简书、百家号和CSDN等。第二个是天工AI的搜索结果,其中显示参考知乎专栏、网易、搜狐等信息源。...第三个是KIMI的搜索结果,参考来源比较多,28条,信息源比较综合。第四个是豆包的搜索结果,其中显示搜索来源来自网易、头条号、格隆汇等。...第五个是腾讯元宝的搜索结果,它引用了5篇资料作为参考,3篇来自微信公众号,一篇来自搜狐,一篇来自数英网。通过多次测试梳理,我们发现,各个AI搜索的来源虽然各异,但是大体的信息来源基本相似。...值得注意的是,AI搜索平台在整合政府与企业网站信息时,会运用先进的自然语言处理技术和语义理解算法,对信息进行深度解析和智能分类,确保搜索结果的准确性和相关性。

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    JSON的解析

    json是一种数据格式,结构主要为 名称:值。 在开发中基本都会用到json来进行传输数据,为前后台数据的交互提供了很大的帮助。 使用时主要会涉及到json格式的互转,有对象,数组,集合,map等等。...即使会了过一过眼也是好的,加深印象。 本篇文章将介绍几种常用的json解析。 首先,先下载依赖包,也就是解析json格式的时候需要的工具类。可以到网上下载,有很多。...下面是常见json使用到的demo: 实体类对象 ? 1.json字符转换成java对象 ? ? 2.json数组转换成java数组 ? ? 3.java对象转换成json格式 ? ?...4.Map转换成json格式 ? ? 5.List转换成json格式 ? ? 6.json数组转换成List ? ? 以上为主要常见的,其实都大同小异,见招拆招。

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    在线请求天气API,并解析其中的json数据予以显示

    Android网络与数据存储 第二章学习 ---- 在线请求天气API,并解析其中的json数据予以显示#### 概要: 请求互联网信息提供商并取得返回的数据使用到HttpURLConnection,...等待数据下载成功得到的Json,把它 解析成程序可利用的数据,使用到JSONObject ---- 使用和风天气的API作为范例,只要注册就可免费用的还凑合的天气预报平台 http://www.heweather.com...商提供给我们的是Json文件,Json文件并不会直接被系统识别,需要解析出其中的每一项,然后利用起来; 我们可以将对数据库进行的操作封装为一系列方法,如下: 4.看看Json的格式: {"HeWeather...json文件都是以键值对进行保存“键:值”,而如果值是个数组,则按如下表示 {Key:["status":"ok","city":"大连"]} 稍加观察,并不复杂 5.解析数据: public class...于是省了一步…… 因为json里的数据名有重名的,我稍微利用for循环和switch进行重命名,数据库不接受数字开头的字符串当列名…… ?

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    Android网络请求与数据解析,使用Gson和GsonFormat解析复杂Json数据

    二:前言 在开发中我们要面对很复杂的操作,那么今天的网络请求与数据解析也是对于学习Android开发者来说,需要解决的难题,我只是讲解一下知识内容,用于理解这方面的知识点。...三:HttpUrlConnection和JSON数据解析 网络请求有两种类型,一个是get,另一个是post。...对于json解析,官方的原生解析和Gson解析,JSON是一种轻量级的数据交换格式,有很好的可读性和快速编写的特点。建议你可以下载一个Google插件,JSON Viewer可以便于看起来舒服点。...我们开发app会不断向服务器发送请求,那么返回到APP的是json数据的字符串,我们需要对json数据进行解析才能显示到app客户端上。...,添加jar包 //1.解析普通的json对象 //2.解析json数组 //参数1:满足json数组形式的字符串 //参数2:Type对象,泛型将会决定,你的json字符串最后被转化成的类型 ArrayList

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