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    详解马氏距离中的协方差矩阵计算(超详细)

    协方差的计算公式如下: 5.协方差矩阵 在统计学与概率论中,协方差矩阵的每个元素是各个向量元素之间的协方差,是从标量随机变量到高维度随机向量的自然推广。...协方差矩阵(Covariance matrix)由随机变量集合中两两随机变量的协方差组成。矩阵的第i行第j列的元素是随机变量集合中第i和第j个随机变量的协方差。...假设我们有三个n维随机变量X,Y,Z(一般而言,在实际应用中这里的随机变量就是数据的不同维度。切记:协方差矩阵计算的是不同维度之间的协方差,而不是不同样本之间的协方差。)...Mahalanobis)提出的,表示点与一个分布之间的距离。它是一种有效的计算两个未知样本集的相似度的方法。...3.两个样本点的马氏距离计算示例: Matlab计算协方差矩阵验算(矩阵a的列代表属性,行代表样本点): 得到协方差矩阵后,我们就可以计算出v和x之间的马氏距离了: Matlab验算:

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    机器学习中的距离计算方法

    设平面上两个点为(x1,y1)(x2,y2) 一、欧式距离 欧氏距离是一个通常采用的距离定义,指两个点之间的真实距离 二、曼哈顿距离 我们可以定义曼哈顿距离的正式意义为L1-距离或城市区块距离,也就是在欧几里德空间的固定直角坐标系上两点所形成的线段对轴产生的投影的距离总和...例如在平面上,坐标(x1,y1)的i点与坐标(x2,y2)的j点的曼哈顿距离为: d(i,j)=|X1-X2|+|Y1-Y2|....cos= 四、切比雪夫距离 切比雪夫距离是向量空间中的一种度量,二个点之间的距离定义是其各坐标数值差绝对值的最大值。...max{|x1-x2|,|y1-y2|} 国际象棋棋盘上二个位置间的切比雪夫距离是指王要从一个位子移至另一个位子需要走的步数。由于王可以往斜前或斜后方向移动一格,因此可以较有效率的到达目的的格子。...下图是棋盘上所有位置距f6位置的切比雪夫距离。

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    three.js中的矩阵计算

    行主序与列主序列 很早就知道OpenGL中使用的矩阵是列主序,而Direct3D中使用的是行主序,但是没什么具体的体会,还直接弄混淆了。...应该来说,无论Direct3D还是OpenGL,使用的矩阵应该都能线性代数中描述的矩阵是等价的,只不过存储方式不同。...矩阵在编程实现中一般会表示成数组的形式,以线性代数中描述的矩阵为标准,行主序就是依次按行存储,而列主序就是依次按列存储。...在网上找一个在线矩阵计算器,相对应的计算结果如下: ? 因此可以认为,threejs矩阵内部储存形式为列主序,表达和描述的仍然是线性代数中行主序,set()函数就是以行主序接受矩阵参数的。...对比在线矩阵计算器中的计算结果: ? image.png 3. 参考 在线矩阵计算器

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    矩阵的计算

    矩阵与常量运算 矩阵与向量运算 矩阵与矩阵运算 矩阵之间相乘,必须满足 B 矩阵列数等于 A 矩阵行数才能运算,矩阵与矩阵之间的计算可以拆分为矩阵与多个向量的计算再将结果组合,返回的结果为一个列数等于...B 矩阵、行数等于 A 矩阵的矩阵。...矩阵加减(需要前者的列数与后者的行数相等) 矩阵加减必须满足矩阵之间纬度相同,返回的结果也会是一个相同纬度的矩阵。...矩阵的乘法规律: 不满足交换律,A×B ≠ B×A 满足结合律,A×(B×C) = (A×B)×C 满足分配率,A×(B+C) =A×B + A×C 单位矩阵 任何矩阵乘以单位矩阵都等于它本身,且此处复合交换律...单位矩阵特征:主对角线元素都等于 1,其余元素都等于 0 的方阵是单位矩阵,方阵指行列数相等的矩阵。

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    【数据挖掘】聚类 Cluster 矩阵转换 数据矩阵 -> 相似度矩阵 ( 聚类数据类型 | 区间标度型变量及标准化 | 相似度计算 | 明科斯基距离 | 曼哈顿距离 | 欧几里得距离 )

    相似度计算 ( 1 ) 明科斯基距离 IX . 相似度计算 ( 2 ) 曼哈顿距离 X . 相似度计算 ( 3 ) 欧几里得距离 I ....相似度计算 ( 1 ) 明科斯基距离 ---- 1 . 对象相似度 ( 相异度 ) 计算 : 根据 两个 样本对象 之间的 距离 计算 , 通常使用 明科斯基 距离 公式进行计算 ; 2 ....相似度计算 ( 2 ) 曼哈顿距离 ---- 1 ....曼哈顿距离 与 明科斯基距离 : ① 去掉了外层 q 次方跟计算 : q = 1 时 , 外层开 1 次方根 , 直接将 q 次方根计算的根号去掉即可 ; ② 去掉了样本差的指数计算 :...欧几里得距离图示 :从 A 点到 B 点的实际直线距离 , 即 z 距离 ; 欧氏空间 : 可以计算欧几里得距离的空间 , 叫做欧氏空间 ; 4 .

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    机器学习中“距离与相似度”计算汇总

    欧几里得距离 在数学中,欧几里得距离或欧几里得度量是欧几里得空间中两点间“普通”(即直线)距离。欧几里得距离有时候有称欧氏距离,在数据分析及挖掘中经常会被使用到,例如聚类或计算相似度。 ?...赛切比雪夫距离 切比雪夫距离起源于国际象棋中国王的走法,国际象棋中国王每次只能往周围的8格中走一步,那么如果要从棋盘中A格(x1,y1)走到B格(x2,y2)最少需要走几步?...马氏距离也可以定义为两个服从同一分布并且其协方差矩阵为Σ的随机变量x与y的差异程度: ? 如果协方差矩阵为单位矩阵,马氏距离就简化为欧氏距离;如果协方差矩阵为对角阵,其也可称为正规化的欧氏距离。 ?...坐标轴扩展的量是协方差矩阵的逆的特征值(平方根),同理的,坐标轴缩小的量是协方差矩阵的特征值。所以,点越分散,需要的将椭圆转成圆的缩小量就越多。...杰卡德距离用两个集合中不同元素占所有元素的比例来衡量两个集合的区分度。

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    ML中相似性度量和距离的计算&Python实现

    前言 Github: https://github.com/yingzk/MyML 博客: https://www.yingjoy.cn/ 在机器学习中,经常需要使用距离和相似性计算的公式,在做分类时,...这篇文章中曼哈顿距离,欧式距离,明式距离,切比雪夫距离的区别 给了一个很形象的解释如下: 比如,有同样两个人,在纽约准备到北京参拜天安门,同一个地点出发的话,按照欧式距离来计算,是完全一样的。 ​...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 马氏距离的优缺点:量纲(scale)无关,排除变量之间的相关性的干扰。...Python 实现 : 相关系数可以利用numpy库中的corrcoef函数来计算 例如 对于矩阵a,numpy.corrcoef(a)可计算行与行之间的相关系数,numpy.corrcoef(a,rowvar...=0)用于计算各列之间的相关系数,输出为相关系数矩阵。

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    投影矩阵的计算_投影矩阵的几何意义

    在进行迭代重建的过程中,我们首先需要求出投影矩阵之后才能进行其他后续的操作,在迭代重建中起到了基石的作用。...并且在前面的文章中《迭代重建算法中投影矩阵的计算》已经给出了一种方法,但是我发现在程序的运行过程中存在一些未知的bug,导致程序在计算某些角度的投影矩阵时出现错误。...由于一直没有找到出现bug的原因,因此我改变了计算思路,找到了下文中正确的计算方法。 首先需要证明一条直线与一个正方形相交。...然后通过两点之间的坐标公式计算所截线段的长度。 最后通过代码实现上述的数学思想,并将其写成一个函数文件,方便以后调用。...meshgrid(x,y),y,'k'); % axis([-N/2-5,N/2+5,-N/2-5,N/2+5]); % text(0,-0.4*delta,'0'); % end %%==投影矩阵的计算

    1.4K10

    ML中相似性度量和距离的计算&Python实现

    点击这里查看PDF版本 Github: https://github.com/yingzk/MyML 博 客: https://www.yingjoy.cn/ 前言 在机器学习中,经常需要使用距离和相似性计算的公式...这篇文章中曼哈顿距离,欧式距离,明式距离,切比雪夫距离的区别 给了一个很形象的解释如下: 比如,有同样两个人,在纽约准备到北京参拜天安门,同一个地点出发的话,按照欧式距离来计算,是完全一样的。...:根据公式求解 S = np.cov(X) #两个维度之间协方差矩阵 SI = np.linalg.inv(S) #协方差矩阵的逆矩阵 #马氏距离计算两个样本之间的距离,此处共有...Python 实现 : 相关系数可以利用numpy库中的corrcoef函数来计算 例如 对于矩阵a,numpy.corrcoef(a)可计算行与行之间的相关系数,numpy.corrcoef(a,rowvar...=0)用于计算各列之间的相关系数,输出为相关系数矩阵。

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    跟着Nature Genetics学数据分析~SNP数据计算距离矩阵然后构建NJ树

    今天的笔记记录的是SNP数据计算距离矩阵,然后用距离矩阵构建进化树的过程。...那接下来我们就可以试一下了 首先是下载数据 wget ftp://bioinfo.bti.cornell.edu/pub/Apple_genome/variome/SNP.vcf.gz 这个数据集稍微有点大 接下来是计算距离矩阵...image.png 使用VCF2Dis这个软件计算距离矩阵 软件用起来也很简单,直接指定vcf格式的文件,压缩文件也可以 ..../VCF2Dis-1.43/bin/VCF2Dis -InPut SNP.vcf.gz -OutPut p_dis.mat 运行过程顺利,没有遇到报错 得到距离矩阵文件 p_dis.mat ?...image.png 这个软件的主页还很贴心写了如何利用距离矩阵构建NJ树的方法 为了省事就直接使用在线程序了 http://www.atgc-montpellier.fr/fastme/ ?

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    通过经纬度计算距离的公式是什么_excel经纬度计算距离公式

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 在去年cosbeta曾经发布了一个网页计算工具,这个作用就是根据地球上两点之间的经纬度计算两点之间的直线距离。...经纬度到距离的计算在通信工程中应用比较广泛,所以cosbeta通过搜索找到了一个js的计算脚本(其实是google map的计算脚本,应该算是比较准确了),做成了这个经纬度算距离的工具。...今天有人给cosbeta发邮件,询问计算的公式是什么样的。其实,若是把地球当作一个正常的球体(其实它是椭球)来说,球面两点之间的距离计算并不复杂,运用球坐标很容易就能计算出两点之间的弧长。...当然这都是高中的知识,我和你一样,也没有那个耐心来将其推导,所以我就利用google map的经纬度到距离计算的js脚本,将球面弧长的公式给还原出来(估计这个公式是经过部分修正的) 对上面的公式解释如下...: 公式中经纬度均用弧度表示,角度到弧度的转化应该是很简单的了吧,若不会,依然请参考这个这个经纬度算距离的工具; Lat1 Lung1 表示A点经纬度,Lat2 Lung2 表示B点经纬度; a=

    1.2K20

    OpenCV图像哈希计算及汉明距离的计算

    OpenCV均值哈希与感知哈希计算,比对图像相似度,当计算出来的汉明距离越大,图像的相似度越小,汉明距离越小,图像的相似度越大,这种没有基于特征点的图像比对用在快速搜索引擎当中可以有效的进行图像搜索....下面附上Mathmetica代码 设X (n) 是一个长度为M的有限长序列,则定义X (n) 的N点离散傅里叶变换为 X (k) = DFT[x (n)] = \!...//第i行j列的图像灰度值 dIdex[k] = dst.at(i, j); //计算均值,此均值相对于8*8矩阵的总像素点的均值...mean += dst.at(i, j) / 64; k++; } } // 第五步,计算哈希值 //遍历像素矩阵,当矩阵的灰度值大于均值的时候哈希为.../** 汉明距离函数取哈希字符串进行比对,两字符串长度必须相等才能计算准确的距离 */ int HanmingDistance(string &str1, string &str2) { //

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    基于图卷积神经网络的分子距离矩阵预测

    该模型以简化的分子输入线输入系统(SMILES)转换成的图形表示作为输入,预测分子中原子之间的成对距离,用于分子几何结构的重建或分子性质的预测等下游任务。...3.4 性质预测对比 为了表明所提方法的有效性,我们使用文献[25]中的方法,分别根据QM9数据集[20]计算出的分子距离矩阵和我们的方法预测的分子距离矩阵来预测分子的性质。...然后我们在测试集上使用训练好模型来计算分子的距离矩阵,然后将测试集中的数据按照8:2分为训练集和测试集来对文献[25]中的模型进行训练,以预测分子的性质,如最高占据分子轨道的能量(ϵHOMO)、最低非占据分子轨道能...可以看出,基于我们模型预测的分子距离矩阵得到的性质预测结果(Predicted)与基于QM9数据集计算的分子距离矩阵得到的性质预测结果比较接近。...表6 使用QM9中的原子距离矩阵和预测的原子距离矩阵进行性质预测的误差对比 4 结论 本章提出了一种基于图卷积网络的双分支DMGCN模型,以解决传统计算方法在确定分子结构时实验成本高、计算成本高的问题

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